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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000096_pilon:878538..883877+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12661.2.p2 ID=MSTRG.12661.2.p2|Name=MSTRG.12661.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5340bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000096_pilon:878538..883877+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
agttaaaagaattgaaaaaagtaaataaagtaaaaaagattgaaattacA
ACACTAAATGGAAGATTCAGAATTGCTCGAAGATTTGAAATGTGGGATTT
GCTTGGAGTTACTGGTGGACCCAACTTCATTATCTTGTGGACACACAGTT
TGCCGCTATTGTCTTGCTCAATGGTGGGTTAAATCCAGGAAGCGTATCTG
TCCTCAATGTCGCCAGCAATGGTCAGGATTTCCAAAAGTTAATGTTACAC
TAAGGTGTGTCAATTATTTCGTGAAATATTGCTTGTGAACTGTTTTAAGT
GTCTCTTTGAGTCGTTgagaaattttgatgttcaGCCTTGCTTTTCCGCT
GTTCTCCCAGTGACGACACTTATGTGTTAATGTATACATTATATGGTTAA
GTCCCAAAGTATCAGTAATCCTGTCAACTTTTCTGACATTAACTGAATGT
TGATAATTGACAGGCAACTGGAGAACTAATTTTGATCTACCTTATTACAG
CAAAATAAGTAGACACATGATTGGCGGCCTTGAAATTAGCatgcaaaaaa
ttttatttgctttttcaaggacaccactgCTGGTTTTCATTAAAAGAGTT
TTAATTAACACAAAATTTCTTAATTCACGTTAATTCCTTGTCTATTATTT
TTGTGTAATAAGTTATTTATAAAAAGCTGAGTAGGCAATGTAATAGAACA
TGCATTAGTTTAAGTCTTTTGATTGCCTTTTAGAAATACCATCGTATCTC
TATACAAATCACAGTCCAAGGAAAAACTAGACTCACTGAAAAGTGATCCT
ACATATGATGATATAATGAATAAGTTTGAATTGTTGGGAAATGTTGAAAA
TAGAAACTCCAGGAATAATAACAGCAGATTCTCGTGGACTGGATTTTGCA
TATTGTTTGCAATAGCAGTTGGCCTTGTTGTGGTTAGTGAACAAGCTAAT
GGCTTATTTTACTAATTAATTTATCACTTGATAGAAAAACCCCTATTGAA
GCTCCctttcaaaattctttgaatcCGTACTTTAACTCTCCAGACAGCtt
ttttaaaaaggattttgagatttttctgtTCTCTATACAAATCAGTATAT
TTTTAATCAAGAATGATGTTAATGTGAAATTTGAATTAATATTCTCGGTA
TAATTGATAATCTTCACTTACTTTGTATTTTTGCCAATCTTTTTGATACA
ACTTTGTTTATTCAGATTGTTTCTCTTGGCTTCAAAAACATGGGTGGGTT
GTCCAAAGAAAGTTTGAAATCAAAAGCTCTTGAACATTGGACTGTGCATG
ATGTTGGCTTTTGGGTTGGAACTCTTGGTGATTGGGCTTctgtttatcaa
aataattttgttaatgCAGGTAGTTAAATTGCTTTTATTTCACATAAGGA
CATTGGTTTGATACCCTACTTTCCTTTGGGTCACATATCATTATTTACCA
GCCTTGTTTGTCCCTCTTTTAATAACTTATCAGATAATAAAAGTTTAGAC
ACCCTTCCCAATAATCTGGTCAGTTCAATACAGATTTCAAAGTTGTATTT
TACAGGCATCAATGGAGACCTTTTGGGATTATTTTCAAACCATGCAGAAT
TGGAGGATCCAAAAATTAACATGACTGTCAAAATACATCAAACCAAATTC
CTGAACGAATTGAAAATTCTAAAGGAAACATTACCTGCTTCCTCTTTTGA
TATTTGGAGCTACAAGGTGAGAGTATGACCATTTTTGGCAAACAACTTTA
AACACCTAGAGAAATCACCAGCTTTAAGGCTTGTCTcaacttgcgcgcgc
tgcgatcgcactttttcgagcaaagcacgctattggtcaaaagaaaaaca
aagcaaTTCCATTAGCGCGATCtaacgtaacggttgaaaaaagttgaaat
gtgttcaactttttttcgagtacgcgctacatttttataacataatcctt
tttccaagcaaaaaggattgaagccaaaaagtgtgATTGCAGCGCGCGCA
GGTGGATACCGGCCTTTATACTCAGAATATACTCATACGAAAAAATTCCT
TcgtttcatcaattttttgcttCTGAAATATATTGTGCAATGAAATGATT
AAAGTCACTTTCTTGGAAAGAAATGATAAGATTTACTCTGATTAGTAGTT
GAAGTTTATCACTATCAGCTCACTAACTCACATCTTTAATCTTCTCATGC
TTAATCTTATtgtatcaaaaaaaaacttactatGATTTTTCACCTTGTTG
TAGGAACGGAAGAATGAAATGGCAATGTTTATAATGCTTGGTGTGCGAGA
ATTTCCACGTGCAACTGTTGTATATTTATACCTGTTCAACTATTGGGATA
CTTTCCTACCCtttttttCTGCATGTGTTAAACACGAGGAAGACTATACT
ACTAAACAACTCATCGATTTGGTAAGTGCAacgtaagaacaaactatata
agaacatatctctttaatagccaaaatattaagaacaagttaagaatatt
ttaagactttgtggacTCTTAAACACTCGATTGGTGcttcttttttgaca
gcctttttcttcatggatttttccacttaccctttttacttATCGAACAT
TGAGTACCATTTTTGAAGCATTAATTGGGATTGAATCCACAACACTGTGC
ACCAATGAAGTATAATCCCGAAGAGCTAGAAtcaaatctttaacctttct
caggcaagaaaaagtgaagcctttaaaaatatgcgccgtatttttgatga
cggattgaatctaacgattcctttgttttcgagtgttattattttcgaaa
tttatgtgtaagttttagtttcaatctgtcgtttttgtaaaaaaaaatag
acAGACCGCGCTAGACCGCGCAACTTTGTTTCGATTtggttggcttcaaa
tcctaccaaggagattcgattctagctcTTTGGGATTATACTTCATTGCT
GTGCACCTCCTGCCTTTAAGATTTCTGCCTTATTCCTTCAAGCTAAGAAG
TTACCTCTTTTTGTACGCACtaaaaaagttgtctttttaatATTAAAGGA
TGAGAACCCAACTGTAAACCAATGGTTGGAGTTTATACCTTGGCTCATTA
TTGCGCCTTATGGTTTGATCGCCAAATTTGCATACAACTTTTTAGAGCAA
CACTATTGGACCTCACGAGTGGTCATCATGCATGCTTTCTTTATGACTCT
AACTGAATTTGCAAAGTATCCTGGTATTGTTTCATCACGTGATGCAAGGT
TTGATTATTTTACCCATTGTTGGTGTCCCTTTAGAGAACACACAATAAAA
GCCTTTTTATAATATTGACTGGAGGCTCAAGGAATGCAGattttttgttg
tgacttttgtgattttaagacagtattttataataagaaatattttaatt
ttatcttcattttatttCAGACGGGTGCACATCAAAGCGTTGAAATACTT
TGGTTTCGTCCTCATCTcatcatttttcttcaaaatcttcTGGTCTTTCA
TTCCAATGTTCATTGCTGATTGTATCTTCTACTGGATGTTGTATGTCAGC
CCATTTGATGCTGCTAATAGGCTCATAAAAAGGTATTGCTGTAACtcggt
ctaatgtcgacatccctcttctaatcccGACactcttctttagagatagg
aatagtaGAAAGATCGGAATCCACTTATGGGaactatatttctttgctta
gcgaccggagaggaaaaaatcttttgtctatcagtgattctgaccttact
ATTGTTCCCATCTCTAAAActgggtgtcagaattagaagagggatgttga
cagtagactaggctgcacgcatcccctctgatatgatttgatatagggga
tgcgtatcgtctaaGATATTACTGTCCCagcttacccccgtcttttcttt
tctcttttttgattatgtgtCACATCTGTACAACgacttctctttttctt
tgtttaatgaatgaaaatttataattatgaaagcaataacacaatgacgt
catttttctctttctgtgaTTGGATGTaacaaaattatgtaaatttatgc
aactttcggttaccccaaatttgaggtaactctcggacgagaatttcata
cacgttacgcatcccctataacaaaataaattctggggatgcgtgcagcc
taacaGTAGACTAACTTACGATAGTGGTCACAAAGTATCTGTGGTCAGGT
AGCTCATTTGGTAAAGCATTCGCCTTGCAACCCAAGGGTTGTGTTGTACA
TCATGCTCATTTATACATGCGCATAAATGCGAGTTTAGACTCCCCTGTTT
GTTTGGTTAGAAATTTAAATAacgtttttttgtttctgttaatattattg
ttgttgttctCTGTTGAAAATGACCACTACTGGGAGCTTTTCTTTTGCTG
CTTTATAAACCTACTGACTTCTTCAGAGTATGTATAAACTCGTAACGTAT
TATCGTACAttgtaatgtttttattttaatcaaAAGGATGTTCAGAGCAC
GAAGAGTTGAAGATCATGCAGCAAGTGATGAGCAGGTGGTGGATGATACA
GGAACTGAAGTTCATcaacaccaacaccaacaccatcaccaacaacaaca
acaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaagctgGCGGTAGTC
GTGGATGGCATTTCAATTTCCACTGGAGCTCCCATGATCATTAAAAGTCT
TTAGACTTATAACTTGATGTTATAAAAACACCACAGAAAGGCATTGGTTC
CTTTCCCGTTTCTTGCCCATAACACGTCGAAACAATGTTGCCTGTCTTTG
TAGCTAATATTACGTgtcttgttttaaaaaattcataacTTTGGACtttt
tttCGCATAATACAACCTCAGGGTCTTGCTTGTTAATTTTCTTCAGCCTA
TAAATAtggttttttatttcattatctGGCACGAAGACGAAGGTTTGATT
GCAACACTTCACACCattatccattgttttcaagtttaGTATTTTTTAAC
CGCGGTTTTGTAACAAGATGTTTATGGGAGCGCAAACAGTCCTGATAGCC
CTTAATTCATTTCGACCTCGATACCACCTATATGTGGTATTTGGTTCTTT
ATGAGATGGACCAAAATTTTTAACGACATAATTTTTAATTAGTTGTTAGA
TCACCAAAAAACGAAATTATAATTGGAATAgattaaattttattattgta
atatttgaaagagtcttttattttttattaaaaaattagactgattattt
tacctcttatttaCATAGATGATACACTGTAAGATATTTATATgtaattt
taaatgtttcttgaaaagaaaattttatttctctCTGCTT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000096_pilon:878538..883877+ >MSTRG.12661.2.p2 ID=MSTRG.12661.2.p2|Name=MSTRG.12661.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1323bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000096_pilon:878538..883877+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCATGCTTTCTTTATGACTCTAACTGAATTTGCAAAGTATCCTGGTAT
TGTTTCATCACGTGATGCAAGACGGGTGCACATCAAAGCGTTGAAATACT
TTGGTTTCGTCCTCATCTcatcatttttcttcaaaatcttcTGGTCTTTC
ATTCCAATGTTCATTGCTGATTGTATCTTCTACTGGATGTTGTATGTCAG
CCCATTTGATGCTGCTAATAGGCTCATAAAAAGGATGTTCAGAGCACGAA
GAGTTGAAGATCATGCAGCAAGTGATGAGCAGGTGGTGGATGATACAGGA
ACTGAAGTTCATcaacaccaacaccaacaccatcaccaacaacaacaaca
acaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaagctgGCGGTAGTCGTG
GATGGCATTTCAATTTCCACTGGAGCTCCCATGATCATTAAATGCATGCT
TTCTTTATGACTCTAACTGAATTTGCAAAGTATCCTGGTATTGTTTCATC
ACGTGATGCAAGACGGGTGCACATCAAAGCGTTGAAATACTTTGGTTTCG
TCCTCATCTcatcatttttcttcaaaatcttcTGGTCTTTCATTCCAATG
TTCATTGCTGATTGTATCTTCTACTGGATGTTGTATGTCAGCCCATTTGA
TGCTGCTAATAGGCTCATAAAAAGGATGTTCAGAGCACGAAGAGTTGAAG
ATCATGCAGCAAGTGATGAGCAGGTGGTGGATGATACAGGAACTGAAGTT
CATcaacaccaacaccaacaccatcaccaacaacaacaacaacaacaaca
acaacaacaacaacaacaacaacaagctgGCGGTAGTCGTGGATGGCATT
TCAATTTCCACTGGAGCTCCCATGATCATTAAATGCATGCTTTCTTTATG
ACTCTAACTGAATTTGCAAAGTATCCTGGTATTGTTTCATCACGTGATGC
AAGACGGGTGCACATCAAAGCGTTGAAATACTTTGGTTTCGTCCTCATCT
catcatttttcttcaaaatcttcTGGTCTTTCATTCCAATGTTCATTGCT
GATTGTATCTTCTACTGGATGTTGTATGTCAGCCCATTTGATGCTGCTAA
TAGGCTCATAAAAAGGATGTTCAGAGCACGAAGAGTTGAAGATCATGCAG
CAAGTGATGAGCAGGTGGTGGATGATACAGGAACTGAAGTTCATcaacac
caacaccaacaccatcaccaacaacaacaacaacaacaacaacaacaaca
acaacaacaacaacaagctgGCGGTAGTCGTGGATGGCATTTCAATTTCC
ACTGGAGCTCCCATGATCATTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000096_pilon | genome | sc0000096_pilon:878538..883877 + |
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