MSTRG.12661.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12661.1.p1
Unique NameMSTRG.12661.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000096_pilon:875992..883877+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12661.1.p1 ID=MSTRG.12661.1.p1|Name=MSTRG.12661.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7886bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000096_pilon:875992..883877+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CCTCAAAAGCTTACCAATCTAAGGAGTGATaggtcttttttattttattt ctgttATATTACAGGACGTGGAAAGAACTACAAGGGGCGAACTCGCCATT TCACCTCAGCAGAAGAAATTGATCGCCAGATGAACGATGACAAATGGAGG GTGAGTGTTATGAAGCAATatgatatgaaaaaaataaaatttgtatttta tttagatactaaagtttatttatcattttttcatacataaaaattattta ctttactttCCTGTTCATTTTAGAAAACAAGAGAAGAAGCTGAAGATTCT GAAGAATCTGATTCTGACGAGGTTTGAgatggaaaaaaattcatattttc tttttattattatttctaaTTTGATGCTTTGCgtgtttttaaaaagtgaa tttGTGTCAGCATGAAAATTTGGAAGGCTTGCTTCTTTCTGTGTTGGTAG GGTTGCTTTCTGTCTGATAACGAATCTCAACTTGAAGCTGTGGTACATTC AGTTAGGCGCTGTGTTAAAGGTATAGCGGCCATTGACTTGCTGTTGCTAC ACAGGTAGCTGAAGTTTGATTCCCACTCGCTGGAgatcacttggcaagtg aatgaacctttaCCTGAcagggcgctcattgaaagtcACTGTAGTTGTGA AAATGGGCATCAGAGCCCCCTACAACTCAACCAATAGAATAGAAATAGAT TTAAACAAAGATCATAACTAactgataaattttttttctgtaatattatt tttataggaAGAGGGGGGTAAGAAAGGAGGTGTCATTGACATTGCAAATC CTAATCgagttcaaaataaaatgaagaaagttACAGAGCTTGAGGATGGA GATCAATCTGGAAAACCAGAATTGACCAGAAGGGAAAGgtataatttttt gtaaaaatacacgtggttctttttgttttattattattattgtcttTATA TAATCATAGCattatgataaaattttctGATTCATGATTTATTATGATGT TGTTTCCTTTTTGATAGCATTTACAATGGGGTTGTATTTTCTATTCTATA CTTTTTATGATTGTTGTGGTTGGTTTTAccaattatttttagttttcaat atGTTACATTACTAGGgctattttcatcttcaatgtATTTTTCTAGGGAA GCAATAGAAAAAGAACAAGCCAGACAGAAGTATGAAAAATTACATGCTGA AGGCAAGACAGACGAAGCCAGAGCTGATTTAGCACGGTTAGCAATCGTCA AGAAGCAACGAGAAGAAGCTGCTAAGAAAAAGGATCAAGAAAAGAAAGGT TATTATAATAACACTACTGAAACCACTTttgatgagattttttttttctt gctgCTTTCCATTGTACTGTTTGGCTCTGCTCtcgattttaaaagaaatt gtcagGAAGAATGATTGacattaggcgagaccaatttaatttgttgttct acgggcccgaccgaccctatttttgctaaattcaaaaaaataataatatt gaatttccaatacaatatattttacacactagttgtttgtaagaatcaaa tttgaataaagctgaaaattaattcaagaaattgaaaaatttagaaaatc aagcattccgtacactaagattttatcatgatcttaatcaaagattaaaa aaatgaatttttgaaccagatgttttttggaaaacattttcggtacttta acaaccctgataaatgaaaaatttatttttattttaccgaccgaccgacc catattttgctaacgatctgcccgtagaacaacaaattaaattggtctca ccTTATTGACACAATGTTCTTCCGACCAAGGCACAAAAGAGAAAATTCTT CTCTAATCTTTACCATATACATCAGGTTAAAAAAGGATTCTTATCTCATT TAGGAGATGGggttcaatttcaaaacataattttctgGTTGTTTCtgatg tgaattttttttctggcaAGAGATTTGATTAAGCTGTAGAATAAAGCAAC ACAATATCTATCAAATCTCATTCTCCCTCTAACTCCATCATCATATCACT TTTTAGATAAAGAGGCTAAACTAGTTGAAGCTGAAAAAGCAAGAAAAGCT GCAATGGAAGCACAAGCTAGTGCTCCTAAACCTGGTGGTCGAAAGAGAGG GAAACGGTGATCTTGTGAAAAGTCATCTTGGAAAGTCATGTCAACGAAAG AATTTGCCCGGAACACTCCCAGCTGAACAGACAGAGCTTCAAAATGGTGA ATGGTTTCATCTTAAATACTCGTCGATTGATCAAAGTTCACAGGGGAATG TTGAGGAgtgcaaatattttttctatgaAAGAATTCAATTTTGGTTTTGG AAATAGAGATCAAGtttttttCTCTAATGCAATTTAATTAATATTATTTA AATAATAGTGTTACTTAAAATACTtggaaaagatattttttgtacatgtg tttttttttttgaatttcctgaTTTCTGCTCAAAACCTGAACTTACTTTT gaataagtttttttgaaaccttctacaaaatttcatatttttttccagtt aaaagaattgaaaaaagtaaataaagtaaaaaagattgaaattacAACAC TAAATGGAAGATTCAGAATTGCTCGAAGATTTGAAATGTGGGATTTGCTT GGAGTTACTGGTGGACCCAACTTCATTATCTTGTGGACACACAGTTTGCC GCTATTGTCTTGCTCAATGGTGGGTTAAATCCAGGAAGCGTATCTGTCCT CAATGTCGCCAGCAATGGTCAGGATTTCCAAAAGTTAATGTTACACTAAG GTGTGTCAATTATTTCGTGAAATATTGCTTGTGAACTGTTTTAAGTGTCT CTTTGAGTCGTTgagaaattttgatgttcaGCCTTGCTTTTCCGCTGTTC TCCCAGTGACGACACTTATGTGTTAATGTATACATTATATGGTTAAGTCC CAAAGTATCAGTAATCCTGTCAACTTTTCTGACATTAACTGAATGTTGAT AATTGACAGGCAACTGGAGAACTAATTTTGATCTACCTTATTACAGCAAA ATAAGTAGACACATGATTGGCGGCCTTGAAATTAGCatgcaaaaaatttt atttgctttttcaaggacaccactgCTGGTTTTCATTAAAAGAGTTTTAA TTAACACAAAATTTCTTAATTCACGTTAATTCCTTGTCTATTATTTTTGT GTAATAAGTTATTTATAAAAAGCTGAGTAGGCAATGTAATAGAACATGCA TTAGTTTAAGTCTTTTGATTGCCTTTTAGAAATACCATCGTATCTCTATA CAAATCACAGTCCAAGGAAAAACTAGACTCACTGAAAAGTGATCCTACAT ATGATGATATAATGAATAAGTTTGAATTGTTGGGAAATGTTGAAAATAGA AACTCCAGGAATAATAACAGCAGATTCTCGTGGACTGGATTTTGCATATT GTTTGCAATAGCAGTTGGCCTTGTTGTGGTTAGTGAACAAGCTAATGGCT TATTTTACTAATTAATTTATCACTTGATAGAAAAACCCCTATTGAAGCTC CctttcaaaattctttgaatcCGTACTTTAACTCTCCAGACAGCtttttt aaaaaggattttgagatttttctgtTCTCTATACAAATCAGTATATTTTT AATCAAGAATGATGTTAATGTGAAATTTGAATTAATATTCTCGGTATAAT TGATAATCTTCACTTACTTTGTATTTTTGCCAATCTTTTTGATACAACTT TGTTTATTCAGATTGTTTCTCTTGGCTTCAAAAACATGGGTGGGTTGTCC AAAGAAAGTTTGAAATCAAAAGCTCTTGAACATTGGACTGTGCATGATGT TGGCTTTTGGGTTGGAACTCTTGGTGATTGGGCTTctgtttatcaaaata attttgttaatgCAGGTAGTTAAATTGCTTTTATTTCACATAAGGACATT GGTTTGATACCCTACTTTCCTTTGGGTCACATATCATTATTTACCAGCCT TGTTTGTCCCTCTTTTAATAACTTATCAGATAATAAAAGTTTAGACACCC TTCCCAATAATCTGGTCAGTTCAATACAGATTTCAAAGTTGTATTTTACA GGCATCAATGGAGACCTTTTGGGATTATTTTCAAACCATGCAGAATTGGA GGATCCAAAAATTAACATGACTGTCAAAATACATCAAACCAAATTCCTGA ACGAATTGAAAATTCTAAAGGAAACATTACCTGCTTCCTCTTTTGATATT TGGAGCTACAAGGTGAGAGTATGACCATTTTTGGCAAACAACTTTAAACA CCTAGAGAAATCACCAGCTTTAAGGCTTGTCTcaacttgcgcgcgctgcg atcgcactttttcgagcaaagcacgctattggtcaaaagaaaaacaaagc aaTTCCATTAGCGCGATCtaacgtaacggttgaaaaaagttgaaatgtgt tcaactttttttcgagtacgcgctacatttttataacataatcctttttc caagcaaaaaggattgaagccaaaaagtgtgATTGCAGCGCGCGCAGGTG GATACCGGCCTTTATACTCAGAATATACTCATACGAAAAAATTCCTTcgt ttcatcaattttttgcttCTGAAATATATTGTGCAATGAAATGATTAAAG TCACTTTCTTGGAAAGAAATGATAAGATTTACTCTGATTAGTAGTTGAAG TTTATCACTATCAGCTCACTAACTCACATCTTTAATCTTCTCATGCTTAA TCTTATtgtatcaaaaaaaaacttactatGATTTTTCACCTTGTTGTAGG AACGGAAGAATGAAATGGCAATGTTTATAATGCTTGGTGTGCGAGAATTT CCACGTGCAACTGTTGTATATTTATACCTGTTCAACTATTGGGATACTTT CCTACCCtttttttCTGCATGTGTTAAACACGAGGAAGACTATACTACTA AACAACTCATCGATTTGGTAAGTGCAacgtaagaacaaactatataagaa catatctctttaatagccaaaatattaagaacaagttaagaatattttaa gactttgtggacTCTTAAACACTCGATTGGTGcttcttttttgacagcct ttttcttcatggatttttccacttaccctttttacttATCGAACATTGAG TACCATTTTTGAAGCATTAATTGGGATTGAATCCACAACACTGTGCACCA ATGAAGTATAATCCCGAAGAGCTAGAAtcaaatctttaacctttctcagg caagaaaaagtgaagcctttaaaaatatgcgccgtatttttgatgacgga ttgaatctaacgattcctttgttttcgagtgttattattttcgaaattta tgtgtaagttttagtttcaatctgtcgtttttgtaaaaaaaaatagacAG ACCGCGCTAGACCGCGCAACTTTGTTTCGATTtggttggcttcaaatcct accaaggagattcgattctagctcTTTGGGATTATACTTCATTGCTGTGC ACCTCCTGCCTTTAAGATTTCTGCCTTATTCCTTCAAGCTAAGAAGTTAC CTCTTTTTGTACGCACtaaaaaagttgtctttttaatATTAAAGGATGAG AACCCAACTGTAAACCAATGGTTGGAGTTTATACCTTGGCTCATTATTGC GCCTTATGGTTTGATCGCCAAATTTGCATACAACTTTTTAGAGCAACACT ATTGGACCTCACGAGTGGTCATCATGCATGCTTTCTTTATGACTCTAACT GAATTTGCAAAGTATCCTGGTATTGTTTCATCACGTGATGCAAGGTTTGA TTATTTTACCCATTGTTGGTGTCCCTTTAGAGAACACACAATAAAAGCCT TTTTATAATATTGACTGGAGGCTCAAGGAATGCAGattttttgttgtgac ttttgtgattttaagacagtattttataataagaaatattttaattttat cttcattttatttCAGACGGGTGCACATCAAAGCGTTGAAATACTTTGGT TTCGTCCTCATCTcatcatttttcttcaaaatcttcTGGTCTTTCATTCC AATGTTCATTGCTGATTGTATCTTCTACTGGATGTTGTATGTCAGCCCAT TTGATGCTGCTAATAGGCTCATAAAAAGGTATTGCTGTAACtcggtctaa tgtcgacatccctcttctaatcccGACactcttctttagagataggaata gtaGAAAGATCGGAATCCACTTATGGGaactatatttctttgcttagcga ccggagaggaaaaaatcttttgtctatcagtgattctgaccttactATTG TTCCCATCTCTAAAActgggtgtcagaattagaagagggatgttgacagt agactaggctgcacgcatcccctctgatatgatttgatataggggatgcg tatcgtctaaGATATTACTGTCCCagcttacccccgtcttttcttttctc ttttttgattatgtgtCACATCTGTACAACgacttctctttttctttgtt taatgaatgaaaatttataattatgaaagcaataacacaatgacgtcatt tttctctttctgtgaTTGGATGTaacaaaattatgtaaatttatgcaact ttcggttaccccaaatttgaggtaactctcggacgagaatttcatacacg ttacgcatcccctataacaaaataaattctggggatgcgtgcagcctaac aGTAGACTAACTTACGATAGTGGTCACAAAGTATCTGTGGTCAGGTAGCT CATTTGGTAAAGCATTCGCCTTGCAACCCAAGGGTTGTGTTGTACATCAT GCTCATTTATACATGCGCATAAATGCGAGTTTAGACTCCCCTGTTTGTTT GGTTAGAAATTTAAATAacgtttttttgtttctgttaatattattgttgt tgttctCTGTTGAAAATGACCACTACTGGGAGCTTTTCTTTTGCTGCTTT ATAAACCTACTGACTTCTTCAGAGTATGTATAAACTCGTAACGTATTATC GTACAttgtaatgtttttattttaatcaaAAGGATGTTCAGAGCACGAAG AGTTGAAGATCATGCAGCAAGTGATGAGCAGGTGGTGGATGATACAGGAA CTGAAGTTCATcaacaccaacaccaacaccatcaccaacaacaacaacaa caacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaagctgGCGGTAGTCGTGG ATGGCATTTCAATTTCCACTGGAGCTCCCATGATCATTAAAAGTCTTTAG ACTTATAACTTGATGTTATAAAAACACCACAGAAAGGCATTGGTTCCTTT CCCGTTTCTTGCCCATAACACGTCGAAACAATGTTGCCTGTCTTTGTAGC TAATATTACGTgtcttgttttaaaaaattcataacTTTGGACtttttttC GCATAATACAACCTCAGGGTCTTGCTTGTTAATTTTCTTCAGCCTATAAA TAtggttttttatttcattatctGGCACGAAGACGAAGGTTTGATTGCAA CACTTCACACCattatccattgttttcaagtttaGTATTTTTTAACCGCG GTTTTGTAACAAGATGTTTATGGGAGCGCAAACAGTCCTGATAGCCCTTA ATTCATTTCGACCTCGATACCACCTATATGTGGTATTTGGTTCTTTATGA GATGGACCAAAATTTTTAACGACATAATTTTTAATTAGTTGTTAGATCAC CAAAAAACGAAATTATAATTGGAATAgattaaattttattattgtaatat ttgaaagagtcttttattttttattaaaaaattagactgattattttacc tcttatttaCATAGATGATACACTGTAAGATATTTATATgtaattttaaa tgtttcttgaaaagaaaattttatttctctCTGCTT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000096_pilon:875992..883877+

>MSTRG.12661.1.p1 ID=MSTRG.12661.1.p1|Name=MSTRG.12661.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=11592bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000096_pilon:875992..883877+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAGATTCAGAATTGCTCGAAGATTTGAAATGTGGGATTTGCTTGGA
GTTACTGGTGGACCCAACTTCATTATCTTGTGGACACACAGTTTGCCGCT
ATTGTCTTGCTCAATGGTGGGTTAAATCCAGGAAGCGTATCTGTCCTCAA
TGTCGCCAGCAATGGTCAGGATTTCCAAAAGTTAATGTTACACTAAGAAA
TACCATCGTATCTCTATACAAATCACAGTCCAAGGAAAAACTAGACTCAC
TGAAAAGTGATCCTACATATGATGATATAATGAATAAGTTTGAATTGTTG
GGAAATGTTGAAAATAGAAACTCCAGGAATAATAACAGCAGATTCTCGTG
GACTGGATTTTGCATATTGTTTGCAATAGCAGTTGGCCTTGTTGTGATTG
TTTCTCTTGGCTTCAAAAACATGGGTGGGTTGTCCAAAGAAAGTTTGAAA
TCAAAAGCTCTTGAACATTGGACTGTGCATGATGTTGGCTTTTGGGTTGG
AACTCTTGGTGATTGGGCTTctgtttatcaaaataattttgttaatgCAG
GCATCAATGGAGACCTTTTGGGATTATTTTCAAACCATGCAGAATTGGAG
GATCCAAAAATTAACATGACTGTCAAAATACATCAAACCAAATTCCTGAA
CGAATTGAAAATTCTAAAGGAAACATTACCTGCTTCCTCTTTTGATATTT
GGAGCTACAAGGAACGGAAGAATGAAATGGCAATGTTTATAATGCTTGGT
GTGCGAGAATTTCCACGTGCAACTGTTGTATATTTATACCTGTTCAACTA
TTGGGATACTTTCCTACCCtttttttCTGCATGTGTTAAACACGAGGAAG
ACTATACTACTAAACAACTCATCGATTTGGATGAGAACCCAACTGTAAAC
CAATGGTTGGAGTTTATACCTTGGCTCATTATTGCGCCTTATGGTTTGAT
CGCCAAATTTGCATACAACTTTTTAGAGCAACACTATTGGACCTCACGAG
TGGTCATCATGCATGCTTTCTTTATGACTCTAACTGAATTTGCAAAGTAT
CCTGGTATTGTTTCATCACGTGATGCAAGACGGGTGCACATCAAAGCGTT
GAAATACTTTGGTTTCGTCCTCATCTcatcatttttcttcaaaatcttcT
GGTCTTTCATTCCAATGTTCATTGCTGATTGTATCTTCTACTGGATGTTG
TATGTCAGCCCATTTGATGCTGCTAATAGGCTCATAAAAAGGATGTTCAG
AGCACGAAGAGTTGAAGATCATGCAGCAAGTGATGAGCAGGTGGTGGATG
ATACAGGAACTGAAGTTCATcaacaccaacaccaacaccatcaccaacaa
caacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaagctgGCGG
TAGTCGTGGATGGCATTTCAATTTCCACTGGAGCTCCCATGATCATTAAA
TGGAAGATTCAGAATTGCTCGAAGATTTGAAATGTGGGATTTGCTTGGAG
TTACTGGTGGACCCAACTTCATTATCTTGTGGACACACAGTTTGCCGCTA
TTGTCTTGCTCAATGGTGGGTTAAATCCAGGAAGCGTATCTGTCCTCAAT
GTCGCCAGCAATGGTCAGGATTTCCAAAAGTTAATGTTACACTAAGAAAT
ACCATCGTATCTCTATACAAATCACAGTCCAAGGAAAAACTAGACTCACT
GAAAAGTGATCCTACATATGATGATATAATGAATAAGTTTGAATTGTTGG
GAAATGTTGAAAATAGAAACTCCAGGAATAATAACAGCAGATTCTCGTGG
ACTGGATTTTGCATATTGTTTGCAATAGCAGTTGGCCTTGTTGTGATTGT
TTCTCTTGGCTTCAAAAACATGGGTGGGTTGTCCAAAGAAAGTTTGAAAT
CAAAAGCTCTTGAACATTGGACTGTGCATGATGTTGGCTTTTGGGTTGGA
ACTCTTGGTGATTGGGCTTctgtttatcaaaataattttgttaatgCAGG
CATCAATGGAGACCTTTTGGGATTATTTTCAAACCATGCAGAATTGGAGG
ATCCAAAAATTAACATGACTGTCAAAATACATCAAACCAAATTCCTGAAC
GAATTGAAAATTCTAAAGGAAACATTACCTGCTTCCTCTTTTGATATTTG
GAGCTACAAGGAACGGAAGAATGAAATGGCAATGTTTATAATGCTTGGTG
TGCGAGAATTTCCACGTGCAACTGTTGTATATTTATACCTGTTCAACTAT
TGGGATACTTTCCTACCCtttttttCTGCATGTGTTAAACACGAGGAAGA
CTATACTACTAAACAACTCATCGATTTGGATGAGAACCCAACTGTAAACC
AATGGTTGGAGTTTATACCTTGGCTCATTATTGCGCCTTATGGTTTGATC
GCCAAATTTGCATACAACTTTTTAGAGCAACACTATTGGACCTCACGAGT
GGTCATCATGCATGCTTTCTTTATGACTCTAACTGAATTTGCAAAGTATC
CTGGTATTGTTTCATCACGTGATGCAAGACGGGTGCACATCAAAGCGTTG
AAATACTTTGGTTTCGTCCTCATCTcatcatttttcttcaaaatcttcTG
GTCTTTCATTCCAATGTTCATTGCTGATTGTATCTTCTACTGGATGTTGT
ATGTCAGCCCATTTGATGCTGCTAATAGGCTCATAAAAAGGATGTTCAGA
GCACGAAGAGTTGAAGATCATGCAGCAAGTGATGAGCAGGTGGTGGATGA
TACAGGAACTGAAGTTCATcaacaccaacaccaacaccatcaccaacaac
aacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaagctgGCGGT
AGTCGTGGATGGCATTTCAATTTCCACTGGAGCTCCCATGATCATTAAAT
GGAAGATTCAGAATTGCTCGAAGATTTGAAATGTGGGATTTGCTTGGAGT
TACTGGTGGACCCAACTTCATTATCTTGTGGACACACAGTTTGCCGCTAT
TGTCTTGCTCAATGGTGGGTTAAATCCAGGAAGCGTATCTGTCCTCAATG
TCGCCAGCAATGGTCAGGATTTCCAAAAGTTAATGTTACACTAAGAAATA
CCATCGTATCTCTATACAAATCACAGTCCAAGGAAAAACTAGACTCACTG
AAAAGTGATCCTACATATGATGATATAATGAATAAGTTTGAATTGTTGGG
AAATGTTGAAAATAGAAACTCCAGGAATAATAACAGCAGATTCTCGTGGA
CTGGATTTTGCATATTGTTTGCAATAGCAGTTGGCCTTGTTGTGATTGTT
TCTCTTGGCTTCAAAAACATGGGTGGGTTGTCCAAAGAAAGTTTGAAATC
AAAAGCTCTTGAACATTGGACTGTGCATGATGTTGGCTTTTGGGTTGGAA
CTCTTGGTGATTGGGCTTctgtttatcaaaataattttgttaatgCAGGC
ATCAATGGAGACCTTTTGGGATTATTTTCAAACCATGCAGAATTGGAGGA
TCCAAAAATTAACATGACTGTCAAAATACATCAAACCAAATTCCTGAACG
AATTGAAAATTCTAAAGGAAACATTACCTGCTTCCTCTTTTGATATTTGG
AGCTACAAGGAACGGAAGAATGAAATGGCAATGTTTATAATGCTTGGTGT
GCGAGAATTTCCACGTGCAACTGTTGTATATTTATACCTGTTCAACTATT
GGGATACTTTCCTACCCtttttttCTGCATGTGTTAAACACGAGGAAGAC
TATACTACTAAACAACTCATCGATTTGGATGAGAACCCAACTGTAAACCA
ATGGTTGGAGTTTATACCTTGGCTCATTATTGCGCCTTATGGTTTGATCG
CCAAATTTGCATACAACTTTTTAGAGCAACACTATTGGACCTCACGAGTG
GTCATCATGCATGCTTTCTTTATGACTCTAACTGAATTTGCAAAGTATCC
TGGTATTGTTTCATCACGTGATGCAAGACGGGTGCACATCAAAGCGTTGA
AATACTTTGGTTTCGTCCTCATCTcatcatttttcttcaaaatcttcTGG
TCTTTCATTCCAATGTTCATTGCTGATTGTATCTTCTACTGGATGTTGTA
TGTCAGCCCATTTGATGCTGCTAATAGGCTCATAAAAAGGATGTTCAGAG
CACGAAGAGTTGAAGATCATGCAGCAAGTGATGAGCAGGTGGTGGATGAT
ACAGGAACTGAAGTTCATcaacaccaacaccaacaccatcaccaacaaca
acaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaagctgGCGGTA
GTCGTGGATGGCATTTCAATTTCCACTGGAGCTCCCATGATCATTAAATG
GAAGATTCAGAATTGCTCGAAGATTTGAAATGTGGGATTTGCTTGGAGTT
ACTGGTGGACCCAACTTCATTATCTTGTGGACACACAGTTTGCCGCTATT
GTCTTGCTCAATGGTGGGTTAAATCCAGGAAGCGTATCTGTCCTCAATGT
CGCCAGCAATGGTCAGGATTTCCAAAAGTTAATGTTACACTAAGAAATAC
CATCGTATCTCTATACAAATCACAGTCCAAGGAAAAACTAGACTCACTGA
AAAGTGATCCTACATATGATGATATAATGAATAAGTTTGAATTGTTGGGA
AATGTTGAAAATAGAAACTCCAGGAATAATAACAGCAGATTCTCGTGGAC
TGGATTTTGCATATTGTTTGCAATAGCAGTTGGCCTTGTTGTGATTGTTT
CTCTTGGCTTCAAAAACATGGGTGGGTTGTCCAAAGAAAGTTTGAAATCA
AAAGCTCTTGAACATTGGACTGTGCATGATGTTGGCTTTTGGGTTGGAAC
TCTTGGTGATTGGGCTTctgtttatcaaaataattttgttaatgCAGGCA
TCAATGGAGACCTTTTGGGATTATTTTCAAACCATGCAGAATTGGAGGAT
CCAAAAATTAACATGACTGTCAAAATACATCAAACCAAATTCCTGAACGA
ATTGAAAATTCTAAAGGAAACATTACCTGCTTCCTCTTTTGATATTTGGA
GCTACAAGGAACGGAAGAATGAAATGGCAATGTTTATAATGCTTGGTGTG
CGAGAATTTCCACGTGCAACTGTTGTATATTTATACCTGTTCAACTATTG
GGATACTTTCCTACCCtttttttCTGCATGTGTTAAACACGAGGAAGACT
ATACTACTAAACAACTCATCGATTTGGATGAGAACCCAACTGTAAACCAA
TGGTTGGAGTTTATACCTTGGCTCATTATTGCGCCTTATGGTTTGATCGC
CAAATTTGCATACAACTTTTTAGAGCAACACTATTGGACCTCACGAGTGG
TCATCATGCATGCTTTCTTTATGACTCTAACTGAATTTGCAAAGTATCCT
GGTATTGTTTCATCACGTGATGCAAGACGGGTGCACATCAAAGCGTTGAA
ATACTTTGGTTTCGTCCTCATCTcatcatttttcttcaaaatcttcTGGT
CTTTCATTCCAATGTTCATTGCTGATTGTATCTTCTACTGGATGTTGTAT
GTCAGCCCATTTGATGCTGCTAATAGGCTCATAAAAAGGATGTTCAGAGC
ACGAAGAGTTGAAGATCATGCAGCAAGTGATGAGCAGGTGGTGGATGATA
CAGGAACTGAAGTTCATcaacaccaacaccaacaccatcaccaacaacaa
caacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaagctgGCGGTAG
TCGTGGATGGCATTTCAATTTCCACTGGAGCTCCCATGATCATTAAATGG
AAGATTCAGAATTGCTCGAAGATTTGAAATGTGGGATTTGCTTGGAGTTA
CTGGTGGACCCAACTTCATTATCTTGTGGACACACAGTTTGCCGCTATTG
TCTTGCTCAATGGTGGGTTAAATCCAGGAAGCGTATCTGTCCTCAATGTC
GCCAGCAATGGTCAGGATTTCCAAAAGTTAATGTTACACTAAGAAATACC
ATCGTATCTCTATACAAATCACAGTCCAAGGAAAAACTAGACTCACTGAA
AAGTGATCCTACATATGATGATATAATGAATAAGTTTGAATTGTTGGGAA
ATGTTGAAAATAGAAACTCCAGGAATAATAACAGCAGATTCTCGTGGACT
GGATTTTGCATATTGTTTGCAATAGCAGTTGGCCTTGTTGTGATTGTTTC
TCTTGGCTTCAAAAACATGGGTGGGTTGTCCAAAGAAAGTTTGAAATCAA
AAGCTCTTGAACATTGGACTGTGCATGATGTTGGCTTTTGGGTTGGAACT
CTTGGTGATTGGGCTTctgtttatcaaaataattttgttaatgCAGGCAT
CAATGGAGACCTTTTGGGATTATTTTCAAACCATGCAGAATTGGAGGATC
CAAAAATTAACATGACTGTCAAAATACATCAAACCAAATTCCTGAACGAA
TTGAAAATTCTAAAGGAAACATTACCTGCTTCCTCTTTTGATATTTGGAG
CTACAAGGAACGGAAGAATGAAATGGCAATGTTTATAATGCTTGGTGTGC
GAGAATTTCCACGTGCAACTGTTGTATATTTATACCTGTTCAACTATTGG
GATACTTTCCTACCCtttttttCTGCATGTGTTAAACACGAGGAAGACTA
TACTACTAAACAACTCATCGATTTGGATGAGAACCCAACTGTAAACCAAT
GGTTGGAGTTTATACCTTGGCTCATTATTGCGCCTTATGGTTTGATCGCC
AAATTTGCATACAACTTTTTAGAGCAACACTATTGGACCTCACGAGTGGT
CATCATGCATGCTTTCTTTATGACTCTAACTGAATTTGCAAAGTATCCTG
GTATTGTTTCATCACGTGATGCAAGACGGGTGCACATCAAAGCGTTGAAA
TACTTTGGTTTCGTCCTCATCTcatcatttttcttcaaaatcttcTGGTC
TTTCATTCCAATGTTCATTGCTGATTGTATCTTCTACTGGATGTTGTATG
TCAGCCCATTTGATGCTGCTAATAGGCTCATAAAAAGGATGTTCAGAGCA
CGAAGAGTTGAAGATCATGCAGCAAGTGATGAGCAGGTGGTGGATGATAC
AGGAACTGAAGTTCATcaacaccaacaccaacaccatcaccaacaacaac
aacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaagctgGCGGTAGT
CGTGGATGGCATTTCAATTTCCACTGGAGCTCCCATGATCATTAAATGGA
AGATTCAGAATTGCTCGAAGATTTGAAATGTGGGATTTGCTTGGAGTTAC
TGGTGGACCCAACTTCATTATCTTGTGGACACACAGTTTGCCGCTATTGT
CTTGCTCAATGGTGGGTTAAATCCAGGAAGCGTATCTGTCCTCAATGTCG
CCAGCAATGGTCAGGATTTCCAAAAGTTAATGTTACACTAAGAAATACCA
TCGTATCTCTATACAAATCACAGTCCAAGGAAAAACTAGACTCACTGAAA
AGTGATCCTACATATGATGATATAATGAATAAGTTTGAATTGTTGGGAAA
TGTTGAAAATAGAAACTCCAGGAATAATAACAGCAGATTCTCGTGGACTG
GATTTTGCATATTGTTTGCAATAGCAGTTGGCCTTGTTGTGATTGTTTCT
CTTGGCTTCAAAAACATGGGTGGGTTGTCCAAAGAAAGTTTGAAATCAAA
AGCTCTTGAACATTGGACTGTGCATGATGTTGGCTTTTGGGTTGGAACTC
TTGGTGATTGGGCTTctgtttatcaaaataattttgttaatgCAGGCATC
AATGGAGACCTTTTGGGATTATTTTCAAACCATGCAGAATTGGAGGATCC
AAAAATTAACATGACTGTCAAAATACATCAAACCAAATTCCTGAACGAAT
TGAAAATTCTAAAGGAAACATTACCTGCTTCCTCTTTTGATATTTGGAGC
TACAAGGAACGGAAGAATGAAATGGCAATGTTTATAATGCTTGGTGTGCG
AGAATTTCCACGTGCAACTGTTGTATATTTATACCTGTTCAACTATTGGG
ATACTTTCCTACCCtttttttCTGCATGTGTTAAACACGAGGAAGACTAT
ACTACTAAACAACTCATCGATTTGGATGAGAACCCAACTGTAAACCAATG
GTTGGAGTTTATACCTTGGCTCATTATTGCGCCTTATGGTTTGATCGCCA
AATTTGCATACAACTTTTTAGAGCAACACTATTGGACCTCACGAGTGGTC
ATCATGCATGCTTTCTTTATGACTCTAACTGAATTTGCAAAGTATCCTGG
TATTGTTTCATCACGTGATGCAAGACGGGTGCACATCAAAGCGTTGAAAT
ACTTTGGTTTCGTCCTCATCTcatcatttttcttcaaaatcttcTGGTCT
TTCATTCCAATGTTCATTGCTGATTGTATCTTCTACTGGATGTTGTATGT
CAGCCCATTTGATGCTGCTAATAGGCTCATAAAAAGGATGTTCAGAGCAC
GAAGAGTTGAAGATCATGCAGCAAGTGATGAGCAGGTGGTGGATGATACA
GGAACTGAAGTTCATcaacaccaacaccaacaccatcaccaacaacaaca
acaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaagctgGCGGTAGTC
GTGGATGGCATTTCAATTTCCACTGGAGCTCCCATGATCATTAAATGGAA
GATTCAGAATTGCTCGAAGATTTGAAATGTGGGATTTGCTTGGAGTTACT
GGTGGACCCAACTTCATTATCTTGTGGACACACAGTTTGCCGCTATTGTC
TTGCTCAATGGTGGGTTAAATCCAGGAAGCGTATCTGTCCTCAATGTCGC
CAGCAATGGTCAGGATTTCCAAAAGTTAATGTTACACTAAGAAATACCAT
CGTATCTCTATACAAATCACAGTCCAAGGAAAAACTAGACTCACTGAAAA
GTGATCCTACATATGATGATATAATGAATAAGTTTGAATTGTTGGGAAAT
GTTGAAAATAGAAACTCCAGGAATAATAACAGCAGATTCTCGTGGACTGG
ATTTTGCATATTGTTTGCAATAGCAGTTGGCCTTGTTGTGATTGTTTCTC
TTGGCTTCAAAAACATGGGTGGGTTGTCCAAAGAAAGTTTGAAATCAAAA
GCTCTTGAACATTGGACTGTGCATGATGTTGGCTTTTGGGTTGGAACTCT
TGGTGATTGGGCTTctgtttatcaaaataattttgttaatgCAGGCATCA
ATGGAGACCTTTTGGGATTATTTTCAAACCATGCAGAATTGGAGGATCCA
AAAATTAACATGACTGTCAAAATACATCAAACCAAATTCCTGAACGAATT
GAAAATTCTAAAGGAAACATTACCTGCTTCCTCTTTTGATATTTGGAGCT
ACAAGGAACGGAAGAATGAAATGGCAATGTTTATAATGCTTGGTGTGCGA
GAATTTCCACGTGCAACTGTTGTATATTTATACCTGTTCAACTATTGGGA
TACTTTCCTACCCtttttttCTGCATGTGTTAAACACGAGGAAGACTATA
CTACTAAACAACTCATCGATTTGGATGAGAACCCAACTGTAAACCAATGG
TTGGAGTTTATACCTTGGCTCATTATTGCGCCTTATGGTTTGATCGCCAA
ATTTGCATACAACTTTTTAGAGCAACACTATTGGACCTCACGAGTGGTCA
TCATGCATGCTTTCTTTATGACTCTAACTGAATTTGCAAAGTATCCTGGT
ATTGTTTCATCACGTGATGCAAGACGGGTGCACATCAAAGCGTTGAAATA
CTTTGGTTTCGTCCTCATCTcatcatttttcttcaaaatcttcTGGTCTT
TCATTCCAATGTTCATTGCTGATTGTATCTTCTACTGGATGTTGTATGTC
AGCCCATTTGATGCTGCTAATAGGCTCATAAAAAGGATGTTCAGAGCACG
AAGAGTTGAAGATCATGCAGCAAGTGATGAGCAGGTGGTGGATGATACAG
GAACTGAAGTTCATcaacaccaacaccaacaccatcaccaacaacaacaa
caacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaagctgGCGGTAGTCG
TGGATGGCATTTCAATTTCCACTGGAGCTCCCATGATCATTAAATGGAAG
ATTCAGAATTGCTCGAAGATTTGAAATGTGGGATTTGCTTGGAGTTACTG
GTGGACCCAACTTCATTATCTTGTGGACACACAGTTTGCCGCTATTGTCT
TGCTCAATGGTGGGTTAAATCCAGGAAGCGTATCTGTCCTCAATGTCGCC
AGCAATGGTCAGGATTTCCAAAAGTTAATGTTACACTAAGAAATACCATC
GTATCTCTATACAAATCACAGTCCAAGGAAAAACTAGACTCACTGAAAAG
TGATCCTACATATGATGATATAATGAATAAGTTTGAATTGTTGGGAAATG
TTGAAAATAGAAACTCCAGGAATAATAACAGCAGATTCTCGTGGACTGGA
TTTTGCATATTGTTTGCAATAGCAGTTGGCCTTGTTGTGATTGTTTCTCT
TGGCTTCAAAAACATGGGTGGGTTGTCCAAAGAAAGTTTGAAATCAAAAG
CTCTTGAACATTGGACTGTGCATGATGTTGGCTTTTGGGTTGGAACTCTT
GGTGATTGGGCTTctgtttatcaaaataattttgttaatgCAGGCATCAA
TGGAGACCTTTTGGGATTATTTTCAAACCATGCAGAATTGGAGGATCCAA
AAATTAACATGACTGTCAAAATACATCAAACCAAATTCCTGAACGAATTG
AAAATTCTAAAGGAAACATTACCTGCTTCCTCTTTTGATATTTGGAGCTA
CAAGGAACGGAAGAATGAAATGGCAATGTTTATAATGCTTGGTGTGCGAG
AATTTCCACGTGCAACTGTTGTATATTTATACCTGTTCAACTATTGGGAT
ACTTTCCTACCCtttttttCTGCATGTGTTAAACACGAGGAAGACTATAC
TACTAAACAACTCATCGATTTGGATGAGAACCCAACTGTAAACCAATGGT
TGGAGTTTATACCTTGGCTCATTATTGCGCCTTATGGTTTGATCGCCAAA
TTTGCATACAACTTTTTAGAGCAACACTATTGGACCTCACGAGTGGTCAT
CATGCATGCTTTCTTTATGACTCTAACTGAATTTGCAAAGTATCCTGGTA
TTGTTTCATCACGTGATGCAAGACGGGTGCACATCAAAGCGTTGAAATAC
TTTGGTTTCGTCCTCATCTcatcatttttcttcaaaatcttcTGGTCTTT
CATTCCAATGTTCATTGCTGATTGTATCTTCTACTGGATGTTGTATGTCA
GCCCATTTGATGCTGCTAATAGGCTCATAAAAAGGATGTTCAGAGCACGA
AGAGTTGAAGATCATGCAGCAAGTGATGAGCAGGTGGTGGATGATACAGG
AACTGAAGTTCATcaacaccaacaccaacaccatcaccaacaacaacaac
aacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaagctgGCGGTAGTCGT
GGATGGCATTTCAATTTCCACTGGAGCTCCCATGATCATTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12661MSTRG.12661Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12661.1.p1.exon1MSTRG.12661.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12661.1.p1.exon2MSTRG.12661.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12661.1.p1.exon3MSTRG.12661.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12661.1.p1.exon4MSTRG.12661.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12661.1.p1.exon5MSTRG.12661.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12661.1.p1.exon6MSTRG.12661.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12661.1.p1.exon7MSTRG.12661.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12661.1.p1.exon8MSTRG.12661.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12661.1.p1.exon9MSTRG.12661.1.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12661.1.p1.exon10MSTRG.12661.1.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12661.1.p1.exon11MSTRG.12661.1.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12661.1.p1.exon12MSTRG.12661.1.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12661.1.p1MSTRG.12661.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000096_pilongenomesc0000096_pilon:875992..883877 +