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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000096_pilon:713138..723369+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12650.3.p1 ID=MSTRG.12650.3.p1|Name=MSTRG.12650.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10232bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000096_pilon:713138..723369+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTCATAGGTTCTATTGAATGAATAATTAATTGCTTCAAAGGTTGTTGAAG
TCCTTGCTGTTTGATTCTGCTGCTCGTAAGCATCTCGCTTCAGAAGACTC
AGGTATCCTTTGTCGATGTCAGCGatattttcatccaaaaagaaatCCTT
GTTCTTGATTCTAAAAATACTGTCTGTCCTCACCGGATGCAAATTGTAAG
GAGTTGACAATCGATGAAGATTCTTGCCAGATTGCAAGTTCATGTCACAT
ATACATAACTTCAGGTCTTTGGACTTTGTGTCACTACAATTTTGATAACC
GTTGTATGAAGAGATTCGTGAATAAGATATGAGTTTTGTACTTAATGTTT
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TTGTTACTAGATCCAGCTCCTGGGTTCGCCAATACATCAAACGAGAAGTC
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AGCTGTCCTACTGCAAACTCAACAAAGGGCCAAAATGAAGTGTTGTTTTG
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TTATGATAACTAGAGTTTACCAGATACTTGATAGTGTGGTGAACATCTAT
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TCCCGATTTTCTCGATAACTTTTCCTGGTAAAATTGCAAAGAAATGAGGA
TTGAACTGTTCATGACGTCCGTCTAACCAACCGGCGTAACGTGTATACGT
GTTGCCGTGATCCGCAAATAGGAGCGTGATCGTGTTCTCAAGCTGGCTCA
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CGGCGTGGCTTTAAGTTTCTTTGCGATATGACGTACGTAATACGTATTGT
AGTTCAGGCCGTTGTAACAAAAATCTCCCGTACCACTAAAAATATTACGA
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aaataacattttttaattcgtttttttttaagaaccttccaatcaaattt
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aaaactagcttcttaaaaaaaacgtgtagctaaTTCGAAAAAGTACTCTG
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TTTTTCCACTTTCCATGAGATTTTGAGATGCTATTGAAACCCCATCCTCC
TTTATAGCACATGTCCTCCTGGTAGATATTCCGGTAACCAGCTTGTCTTG
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TGAGCCTTTAAAACGCGCCCTTCAAAGAAAGCGATCAAATTATGGTGCGT
GTGTCCATCGACTGCTTGCAtcatttcaaaatctaaaatttcagttttgg
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GAACGATAAAAATGGCGACGTGATAGTGAATCCATCcaaattatatttat
gtttattttaCTGGTTTTTGGATGGGATTCTCTTTTGGTATTTTGATCCT
TGACATCTTTGAGATATGTTGAATCAAAATGGACTAGTTGTGTTCTTGTC
TTATTCTCACCGCAACTTAAGAAAGCAAAATCTTgtgcaattttcaattt
cttgacaTGTTCTAGTAAAGCCTCTTCCAGTGATTTAGAGTCATTAAATA
CTGGTCTCACGACTTCGTACCATCCTGTATCATCCTTAAAAACATGTATG
AAAATACTTTGATTGCCATCGCATGCTTTAGAATTGCATTTAAATCGAAC
ATCTTTTTCAATGAATTGGCAAATATTGACCGTTTCTGTCTCATCTTTTT
CTGTCCCACATTTATGTTCTTGATATTTATAAGTATATGACCTTGACACA
TAACTGCAAGATTTCGTTGTTAACGTGTGAGGTTTGCAAGTggtttgttc
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CAGGTTGTTTTGTGCTCAttggttttgatgtttttgaaggTGCTGGTGTC
AGGGGAATGGATTTCGTTTGTAATGGCGTGTTTTTGGATAGAGTGGGCGT
TGTTTTTGGTGTTACTGGTTGAGTGGAGATTTTCGTTTTGATCTTTTGTC
TTGTTGTTGCTTTTACTGATGGAGATGTTTTTGTTGCCGTAGGTTTTGTC
TCTGTTACTCTTAATGTTGTAATTATTTGTGTAGGGAGAGCTGGGCTTGA
TGTGGGTTTTATTGTCGAAGTTGTTGTGAGAAGCTTTTTGGCGGTTGATC
GTTTCTTGGTAGATGTTCCTGCTGTGATAAAGGATACAGTAGGTTTCTTG
GTTGACATTGAAGTCAATTCTTTGTCTTTTGATTTCCCACTTTTAGTCCT
TGTTGGTGTTGTTGAAACCAGATCTTTAGTtgcttttgttgaaaatttcg
tTTTGATTGATTGCTGAGCGGGTTTTTTCTTGGATAGTTGAAGCTAACGT
ACTTTGAATTTGAGTCGTAGTTTTCGGTGAAGTTCGAGGAGTACTGAAAG
ATTTGCTGTCGATCATTAAATCTTTGTTAACTGTGGCTTTCTCTTGTGGT
GGAATGAAGTGTTTCAATCTGGTAGAATCAAAAGTTTCATTTCCAGTGAT
GTAGACaggaaacaaataaaaaaatccataaGCGACAAACACCAGtgcca
aaaaaaagaaatatttcttaaCACTCATGGCTTTTTACAAGGATATCCGA
TCCAAATAAAAATAGGCAATCAAATTATTTGTTAATACATCTAAAAGTAC
AAAATTCTTTAACCATTCCTTCTATTActttatgattataaaattTTCCC
TTCCAATCTTATATGAAGGTTCATATATCATATATCCGTCTGATACCGTT
AATTGATAAATAATTACGTTATTAACTCCGCCTTAGCGAAAGCATTACAA
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TCACACTAATGAGTTGGTTGAGATAAGCGTAATCACCTAATATGgataat
atacctttcggtttCTAGTTAGTtactttcggtaattagttcttacaaag
tagaCATGGGACTACTGGATACCAGTTTTTAGTATGGCTCATCCTCGCTT
ATCCATTATAAAAATGACTGTGTCTAAATCATTTCTCATGACTCGAccta
aaccttttttttctaATCCATCTCGTATTTTTCTTAACAGCTTTTTCAGA
GCCGGCATTTTAGCATACTTCTTACCAATatttggcgaaattttcgactt
caagtcgtcttgttgattttttaatcaaattgatAATCgtcattgatttt
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TTTTAGCTATATACAGCTACagattttcattaatttaattaatcaggttt
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TGCTTTCGTatattttattgacaaaaatcaGTTCGGTAAAGTGCATAGTT
CCTCAGCCGTGTAGTTTGTGACCGAAAATTATGAACTCAAAgtagttttt
tttgaaatttttcttgaattttgaaataaatcagGCTTATTGTCAAAAGC
GATTGTGAAGAAGAGAAGTCCAGGAGCAGTCTTAGTTGACAAAGTCCCTT
TGgacttcaaaaaaatctttgccAAGTTGGCTAAGCAGAGAAAAGTTTAC
TAAGTAGTTTCAAAAAGGGTAGAGTCATTTGGCTTAGAGACCCTTAGATA
ATcactttttaaagttcatttttACAAAAGCTAATTTGTAAAACTAACCT
AACTACCTAATTTGGTTAACTTCTACCACCGAATAGAAGACAGTTTACCG
TCGGGCACTTATTATCACCCACGCAATGTTATAAGAATATCTCACATAAT
TTTGGATGTCACTTGGTTCCTGACACCCACTGGGACACAAGCGTGttaat
taagaaaaattatcgTTCTAATACTAGTTCTTAATTAACCTAAAAACCGT
TATAACGACTTTCGATTCAGACGGTTCACATGGGTCACTTTAGAATACAC
ATAGAGCTTTATTGGATTAGTTAAGCAAGAATAAGAATACGCAGGCTACT
GATGATAGATAATTATTTCTGCAGATTACATATCTCCATCAATAAGATAA
CTCAATTAATATTGGCTTTGATGTAATTATGAGAAGTGCTTTCTTTCATT
CCATTAATAGCTGATTTGAAAACACGAATTTATCATCTTTATTGCCCCAC
AGATGCTTAGTTCGCTTCGACATTATTAGCGAGATTAAATACCAATAGAT
AAAAATCATAACGCCGGACAATTTAGCTCTCGCTTTCGTCACAGCACTTT
ATCAAAAGGCTAATTGGGAAAGCGCTAGGAATAGGAATAGGAATCttttt
tctcaagcaagaaaaattttaagcctTAAGATTTACCccgcatttagaaa
ttttgtttgaaaacctACGATAAACGAGTTTTCATTGACATCAATGAAAG
CAAGGTCACTTACCCCGCATCGTATATCCGCTATAAGTTAATAAGAAGTT
AGTTTCTTCGATATACTTAACCTCGCTATAGTCGACATTCCCAAATTAAA
AACTTCTTTGGAAATAGAAATTACCTCTGTCATGTGGGCCACTTAGCttt
ttttAGTCGCCGAACGACGCGCACGGCTcgattattgcataaattaaata
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GACTTctccttggaaaactagaccttttttggttggaaatttgtgtttct
ccaaacagtttggaaaacattaaaaatccatgtggaaattacatttttgt
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agtcaagctgtaagtttccgtcaggtgaggcgtccctTCGGCCTCAGTCA
GTcacagtgagttcgcacagtgaagcacatagggtacttgtgtcatagtt
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CGCCACATCTctatttggattttggcttttttcaacctggagttttgaaa
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TTTCCAGGtcggattttccattggatttctTCTATTTTCCAATTCAGAAA
TCTTGTAATTTCCGACCttggaaattttttcctgtgtttatCATGTACAA
TTGCTTTTGTTTGGATTTTCTCTTACGTgcaacttttttctgattttcaa
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CGACCAAAAAAGCTAAGTGGACCACGAGGTTAATACATTCACGGagcgtt
tttttttacatacagATGCCTTATAGGTCTAAGCACCACGGAAAAATCGC
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AAGGCTAACGGAAAGCGTCAAGACTGGGCAAACAAAAATGCGAGCTCCTA
ATTCTCTGCGGATATTAATCCCAATACTTGGAGTAATTTTACTTTtgagt
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GGAGTATGCAAGAATTGAGAGAaatgattgacaaaaattcactctCGCTT
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AAAAACCCAACGTTAAACTACTTAACGAAgaagatttgaaaacatttgac
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GTAGCCGACAAAATTAAAAAGGCGAAAGAAGAATCAAAAACACACAGAGA
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AGCAGAATTCGTACTGGATTACACTGGGGCCGTTTGTAATCATTATAAAA
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CACTAGATTGtaagcaaaaataaaatggGACCCAAAAATGGGGCATTGCT
GCGTTTACATTTTACCGTCAATTCACCTAAGATTTCTTAAGATTTCCGGA
ATGTTTTCGCTAGTTATTTTCTGGACCAGCTAGCTGGTTAAAGTAAAAGG
TTACATCCAGAGACACCAGATGCAATGATTAGCACGGTCTAATCGAGAGA
CTGGCTAACTttaagttaatttttcaaactgtcggaactttttgtctttt
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AGCTTTCTATAAATTACTTCATATTGTACTCAAAGCCATCGAAAGCTGAG
CCAGAAGTATACTTAGTCTAGTATTACATTGCATTCCTTTATGGTAAGct
ttaatctttttcttttcgtgTATTGAAAGACTTACCGAAAAATGTCAATC
ACCGAGTCATGCAAAAACTAATTTGTTAAACATGTGTTTTAAGTAACTCT
TATATGAGAAAAGTCTGTATTGACGATGTCTACTTTAaattaaaactttg
aatttgagATCTGGCGTAGAGTTTagccaaggatttattatacactggat
atacaagtaacagatttttgccgatttctcgtgtactagctatgtccgca
gtaatgatgttattgttcactctccctccctcattaaatattttttcgaa
gcattttcattgcatttcttatcgaaaatcactcatccaattcccaaaag
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tgtgtataagaaattgaatgttgacaccggaaattttcaaacttcaacct
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ggacagtcttggaaagatatttccaattgaaaatttcgtgtcactataag
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acaaatgcatccggcttggtattctagccttactttcaaagttttttccc
tgcaaaggtacgaaaagaaaacgctagagaacttttttaaaatgaattAA
TAAAGATTTCTCAAAATCAGATACAtttgagc Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000096_pilon:713138..723369+ >MSTRG.12650.3.p1 ID=MSTRG.12650.3.p1|Name=MSTRG.12650.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1140bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000096_pilon:713138..723369+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCGAGCTCCTAATTCTCTGCGGATATTAATCCCAATACTTGGAGTAAT
TTTACTTTtgagtttgtttacattcaagGATAGCTCTTACATAAGATTCA
CTCCGACCAACACCCAATCGAATGATTTGAATGATGTCAAAATAATACAC
GAAGAAGAACTTCGGAGTATGCAAGAATTGAGAGAaatgattgacaaaaa
ttcactctCGCTTGGTCAAATTGCAAAATCTTTGAATGTCTCACTTGACA
ACAAATCCAGACAGAAAAAGATGGACACCATTGACAAACAAAGCCCTCGT
GTTTCTGGAAACGAAAAACCCAACGTTAAACTACTTAACGAAgaagattt
gaaaacatttgacggtcaaattttgtttcttgtcttttccCATATTGGAA
ATGTCGATAGGCGCACAGCGATTCGACGTACTTGGGGGGCACCAATGAAT
TTCCCTAAACAAAGAGCAATGTTTAAAAATGCAACATACAAAGTACTCTT
TATAACTGGTTTTGTAGCCGACAAAATTAAAAAGGCGAAAGAAGAATCAA
AAACACACAGAGACATGTTGATTACCAACCGAACTGAAAATTATTTCGAT
ATTTCACGAAGAACACAATTTGGTATACATTGGACAATCAGAAATTGcaa
atttgactttttctttaaaaCCGATGATGATGTCTTTGTAAGTATTCCAA
AcacttataattttttttacaaagacCCTTTTGCTGTTGAGCACAAGACT
TCTTTATATGCTGGTTTAATGCATATGCGTGGTGGCCCGAATCGAAACAA
AAATTCCAAATGGTATATTGACAAAAAGAGATGGGGACAGACAGTATACG
CTCCATTTGCTACTGGGATGGCTATCATATTATCGAGAAATGTTGCTGAG
CGTATTGAACCATATTTCCAATGGGAAAATGTTTTCCCACTTGAAGATGT
CAATATTGGCTTCtatgtttttgttgcaaaagtCCCAAATATTGGAGTGA
GGCCGTCCAAAGGAGCAGAATTCGTACTGGATTACACTGGGGCCGTTTGT
AATCATTATAAAAGGAAAACTATCACTATGCACTCTGTGAAGACTGAAGC
TTGTATGAAAAAGTTGATGCAGGAAAGCTTAAAGTATTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000096_pilon | genome | sc0000096_pilon:713138..723369 + |
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