MSTRG.12622.3.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12622.3.p1
Unique NameMSTRG.12622.3.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000096_pilon:270293..283707+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12622.3.p1 ID=MSTRG.12622.3.p1|Name=MSTRG.12622.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13415bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000096_pilon:270293..283707+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CATTAATGACGTGTATATGTACGACTCCAAGCTCAATTTctcttttctga aaatgaaaatatctcaagatttcataatttttcttatGCTAGGCCTTCTA GAAGTTCAAttcattccagaaaaaaaaattggaggtTTTCATCTGTGTTT TTCAGGACTTTATCACTACTTTTTACTTTAAGAAGTCCAGCCAGCGCCTT ATATAACAAGAACGCTTTAAAAAAGGCTTGAAAAATGATCTGGCAAAGTT AAATACAAAGTGCTCAAGACGATGTTTGCTTATGAAGTAATACGCAATCT AGCACGTTCAAATACTATTTCCTTCAATTAGTGGGCGCTCTTAAAACCGC AGTATGTACAGTTCAAAAAGGGCTGGCCGTCTAAGTCTTTGATTGTCATT CTCTTTGACctcatttttactttttctttggaaGCAGAGCAGTGACTTTG CATTGATAACGGAACTTCAGAAATTTGGCAAAAGAACTAACGAGACCGTC AtacaaaaaaagtgttaaaaagaTGACGGTTATGCGAAAACCGTATGCCG GATCTTTAAATGACTTATTAATGACGGCAACAAGTGAAAAAGACGATAAC GacgacgtcatttttcattcgtCATTAAGTGTGCACTGATATATTGTGTC GGTATttatataatgtttttttgttattgtttttcttaaaattctttctt tttataagaaatagaAGAATATGTTCTTCGCCTACTCAGGGACTCTATCT ATCTACGTAATACATTTTCCATTCGTCTCATTAAGCTAAGGATTTTTGAC CTTGCATATGAAATATGTAAGGTCGACTATTTAGTTGAAAAAGGGACAAT CTCAAAGTTTAAGGTTAGCAAATATGTTAGTTTTTCAGacattatttttg acatttggcCTTTTGATGTTAGTAGGttgatattttattgttttcatttc 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000096_pilon:270293..283707+

>MSTRG.12622.3.p1 ID=MSTRG.12622.3.p1|Name=MSTRG.12622.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4950bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000096_pilon:270293..283707+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTGTTGCAGTAATGGAATAACTACAGCGAAGAATTGTTGgttgttttt
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TGTACGAACCTCCATTTCAACACCATCCGTCGTTGATTTTCGGAATCACG
ATTTTGCatacgaaaatatttttgatcccgATGAGATATCGCTATCAACT
CGTTTTACGACGTTATCACGAGTTTATCCAGATAATATAAGTAATATTGC
TACCATAGCAACACCATATGATGCACAGGACCGATGGTTGTCGCCTTTCG
ATGTAAACAGATATTCGGCGAGACGAGAATCGTCGGATCAATTTTCAACG
CTGACGAGTAGCGACTTTTCGAGCGTCTCGCAACACAATACAATCGATCG
TTTTTACGTCCGAGAGCACCAAACCTTACCACGTGGGCTTCAATGGTTGT
CGCCAGGCACTCGCcgacaaatatttttctcgGCAGCCGACGCAGAAACG
AAAAACGAAAATGGAAGATTGTCGGTAAACGAGGATAATCGTTTTTCTGA
TTATTATCGTCATGATGTCGATGGTCATTTACATAAAACGCCAATGAACG
GGAAAGATTTCACGCCGCCGGCTTACGTAGCTCGAAATTCCCGGAAGACG
TCGTCGAATTCCGACGACGGTGAATTGTCGGACTCTGGTAATTATTCGGA
CCCAAGAGAATTGGATTCTAGCACGCTTTCGTTGTTCAAAGATGAATTGC
TGAAACGAAACTCGAACGCCTCTTTTTATGAGATCGCAACAAaagtttaa
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12622MSTRG.12622Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12622.3.p1.exon1MSTRG.12622.3.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12622.3.p1.exon2MSTRG.12622.3.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12622.3.p1.exon3MSTRG.12622.3.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12622.3.p1.exon4MSTRG.12622.3.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12622.3.p1.exon5MSTRG.12622.3.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12622.3.p1.exon6MSTRG.12622.3.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12622.3.p1.exon7MSTRG.12622.3.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12622.3.p1MSTRG.12622.3.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000096_pilongenomesc0000096_pilon:270293..283707 +