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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000095_pilon:832004..843785+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12567.1.p3 ID=MSTRG.12567.1.p3|Name=MSTRG.12567.1.p3|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11782bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000095_pilon:832004..843785+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TAGCCctaattttaaaagaaaggaaaagggTTTTGACTTCTGATAAATTG
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tATCCTTCCTTATCCTCGCTTGTTTCGAAACATGTGAAAGACAGTGATAA
AGGATTTGTGACTGGTGTTGTTTTCTCTGGATGTTCAATTGGAACCATCG
CCACTGGGTTTTTCGGTTCGATCATAATGGAGCACACTAGTTGGAGAttt
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AGGTGCATCAACGACTTATGTACGAAAACTTTATGCTGCTATGCTCTTCC
TTGGCACTGGATTATTTTCCTTGCTTTTAAATACAGTGGAATCATTCCAG
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GTATATTTGACTGGGTGGATCCTTGAACACTCTGGGCGTTGGTCGTATGT
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TTGCTTTAGTAAGCCGAGTTCCCGAGTTCAATTTGTATGTAGTgggtttt
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TTATATCATTTCTATTACACGATTTCTTCtatgttttctcattttcgtTT
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ATTACTTATTTTATTGGGACATTTTTCGTCTATTGCGTTCGATCTGCTAT
GTCGATTTGTGTTCCAGCCATCGCCAAAGAAATGGGTTGGAGTAAACAAA
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ATCATCGGTGGATATCTTGCGGACCGCCATGGGGGAGAGCGGATGATTAT
TTATTCGGCTACCGTATGGTCGGCCTGCACCCTCCTCCTTCCTTTCGTTG
CTGAGAACCCAGCCCTTCTATACTCTGGAACATTTGCGATATTTGGAGCC
CGCTTTTTCACTGGAATGGCTCAAGGATTTTACTTTCCATCACAGGCGAC
TATTTTTGCTAAACATGTTCCCGTTAAGGAAAAAGGATTTATTTCTGGGT
TTTCTTATTCCGGATCCTCCGTAGGGACAATTATGACGGGTTTCGTTGGT
TCTCTTATCATTGAAATGTTTGATTGGGAGATGGTATTTATCGTTATTGG
TATTCCCGCCCTTTTATGGGTGTATTGGATGAAGCGTTTATACAACAGTA
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GATCGCTTATTTTTGCAGTGGGTTTGTATTCTTCAACCTCCTATCTTGGA
CACCTATTTATTTCCACGATGTTTTTCCACAAAGCAAAGGATGGGTGTTT
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TTATGCAAACGTGCTACTTAGTAGCGGTACATCTGTCACAGCATTGAGAA
AATCCTATTCCGCTATATTTTTTCTGGGTGGAACGTTATTTTCTGTGTTA
TTGACAGTCGTCGAAACTTTCAAACAAGCTTTATTTGTAATGAGCTTGAA
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GCGGCCTTGGCGGGAATAATGGGTGTTTATGTGACAGGATACATCTTGGA
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TGTTAAAGGGCCCgtttggagctaaatttagcattttccactaaaaataC
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AGACCTAGGAACATAAAATAACCTCATGAAGTTCTGTTCAATTATGTATC
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TTTTGGTCCATTTAACTATGACAAAGACCACAGAAAAGACTTTTTAAGCT
TCGTGAATGATCCAAGCATCAAATAGCGCCTAAATGAGCTATGAAATAAC
AATAACCTTcgggttttcaaattttagcataAAGACATGGCCTTAAAGAA
CTTTAAGTCCAGTcaatgctaaatttttgctcATAAAAGGACCCTGGAAT
GCTTTATATCGGCCAAATTtggtttttctatctttttgaatGCCTCAAGT
ATACATAATATCAATATCATAgttcttttgtgtttatcttaACTGTGCTG
GTGGATTaaaaaaaaGCCACACCCAATGCTAAAAACATGCTCATAATGGG
ACCATACAACCATTTTTAGTGATTGCTTATGTTGGTATATTGATCTTATA
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GAGAGATACAAGCCTCTAAATCCAAATGCTAAGTATTTGCTCCTACTAAA
ATGCTAAGTATTGGCTCATTTTTGGACCGCACTTTGTTGAAGCATAAGTC
ATGAcagatttaagctttagaaaaaattattttaaatttttaaagttcat
ctTTTCCACGCAACCATCATCAGGGCATAATTTTAGTTCATTCATTATAT
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GAAGTGTTTTTACTATGTATCatgcatacacgctttttttttataagaat
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gctcagaatatcaccatcatagaattttgctaccCAAGCTACGAATGCCA
TTTTAGACCATTTTTTagtcaattaggatcctaacctaagaatgctgtaa
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ATTTATTGTATTGTTCTCTTTTCCAGATATCTCGAAGCTTGTGCCACTCA
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GGACTTCTTATACACGAATATTTTGATCAAGTATATAAGAAATATTCACA
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CTTTTAAAGACAAAAATAACCCGTATGCTGACGctgttaaaaagtttaaa
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CAGAATATGAGCGTCCAACTGTACCTCCCTTATCAGAAATTCAAACACCA
GCAGATGTTGATGATTCAGATAATTTGTATGATGGAGATAATATACAATT
GGATATCGATGGAGATGATGATGGGGataattttaatgaatttaaGTAGT
GAATGACACACAATTTTGTATATAATTTTTCTAGTTTCTTTAAAAGAAAG
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GTAGGAGTGAAGGTATTTAGGACACATTAAAGGTGCGAATCTAAAAAGTA
GACGCTAGCTTTCCAAACCATTTATAAGCAATCTTATAGGCGTTGGTGGT
TTAAGCCCAAACAATTTGCTTCTTGAAACAATTTTAATAAGTTGTAATAA
AATGTTAAATGTTATGATTTGTGAATTGATAATTTTATTAAGTTCGAAGT
ATTATGGTTTcatcatttttcttaaaataactcCAAAACCACCAAAATGT
ATAAACTTCTGACATTAAAATGAGAAGGAAGTCCCTATTCCTTTGATTCA
TTTGCGTTCATTAAGAGAATTTGTGTCGTCATCATGACGTTTCGCGTGTC
ACAAATTAACACCTCTCCTTAGCCCTTTGTCGAGAAGCAAACTCACTCCA
GGTTCAAACttctacattttttataagcaatcagTTGGCTAAGGCTCCAA
GGCTCAAACTTGccaatttatttttcatctcg Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000095_pilon:832004..843785+ >MSTRG.12567.1.p3 ID=MSTRG.12567.1.p3|Name=MSTRG.12567.1.p3|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2580bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000095_pilon:832004..843785+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTACTGGAAGAAATCTTTCCTAAGCCAACTAGAACAAACTATTGGAG
CGAACATGAGAAATGGAAATGGACTATCAATCTTTGTATTGGCTCAGTTC
TATTATTTTCCACCAGGAACTCAATGGCCGTATGTGTGCCTGCTATAAGT
AAAGAACTTGGATGGGATAAAGAAATTTCTGGCACTGCTTTGTCATCCTT
CTTTGTAGGATACATTGGTTCTAACCTAGTTGGTGGTTCTTTTGCAGATC
GATTTGGTGGCgcaaaaacaattttgtatTCTTCCCTTGTCTGGTCCTCA
CTGACTATTGTATTGCCTATTTTTGCAAATTCACAGGGTATTTTCACATC
TAGcaattatgatatttttgctatTAGATTTTTGACAGGATGCTCTCAAG
GTTTTTACTACACTTCATTTGCTGCCTTGATTTCAAGGTATGTGAGAACT
GATGATAAAGGACTTATTGCTGGTATCGTTTATTCTGGATGTGCTGTTGG
TATTATTCTGACCGGGTTTTTTGGATCACTTTTAATAGAAGCTGGTCATT
GGTCTTATGTCTTCACAATAAGTGGATTTTCTTCATTGTTATGGCTTATT
TGGTTCCAAAACCTCTCAAGAGAGACAATTCAAAaagaaacaatagaaaa
tttcaACTCTGGTAATGAAGCTGTCGATACCAGGAAATTCATAAAAAGTA
TACTATGCGAGAGATCAATTCTGGCACTTTTAATTGCTTACTTCGGGTCA
GGCTGTACATATGGCGTTTTGAATTCTTGGACCCCTGTATATTTTCATGA
TATGTTTCCGAACAGTAAAGGATGGATATTCAATGTTATACCATGGTtga
caagttttatttttgagcttGTAACTGGATACTTTGCAAATAATCtgcta
aaaaatggaaaatctgtATTATTTGTACGCAAAACATATGCTGCTTTTCT
TTTTCTAGGAACAGCatttttttcaatacttttAACCAAAGTGAAGATAT
TCGAACATGCTTTACTTTTGATGAGCTTAGTCGCTGGATTTTCTGCTTTT
GGCTCAAGCTCATTATGTCTGAATCCTCAAGATGTTTGTCCAAACAAAGC
TGGTTCTTTATATGGATTAACACATGCTGTAGGATCTTTTGGAGGTACTA
TTGGTGTTTATCTCACTGGACTGGTATTGGAAACCAATAATAACTGGTCA
TTGatttttatttgtaatgcaataatatcaattttatcatttttagtttt
tcaattattCGGCTCCACTAAGCCAATTGATAACTTATAGATGGTACTGG
AAGAAATCTTTCCTAAGCCAACTAGAACAAACTATTGGAGCGAACATGAG
AAATGGAAATGGACTATCAATCTTTGTATTGGCTCAGTTCTATTATTTTC
CACCAGGAACTCAATGGCCGTATGTGTGCCTGCTATAAGTAAAGAACTTG
GATGGGATAAAGAAATTTCTGGCACTGCTTTGTCATCCTTCTTTGTAGGA
TACATTGGTTCTAACCTAGTTGGTGGTTCTTTTGCAGATCGATTTGGTGG
CgcaaaaacaattttgtatTCTTCCCTTGTCTGGTCCTCACTGACTATTG
TATTGCCTATTTTTGCAAATTCACAGGGTATTTTCACATCTAGcaattat
gatatttttgctatTAGATTTTTGACAGGATGCTCTCAAGGTTTTTACTA
CACTTCATTTGCTGCCTTGATTTCAAGGTATGTGAGAACTGATGATAAAG
GACTTATTGCTGGTATCGTTTATTCTGGATGTGCTGTTGGTATTATTCTG
ACCGGGTTTTTTGGATCACTTTTAATAGAAGCTGGTCATTGGTCTTATGT
CTTCACAATAAGTGGATTTTCTTCATTGTTATGGCTTATTTGGTTCCAAA
ACCTCTCAAGAGAGACAATTCAAAaagaaacaatagaaaatttcaACTCT
GGTAATGAAGCTGTCGATACCAGGAAATTCATAAAAAGTATACTATGCGA
GAGATCAATTCTGGCACTTTTAATTGCTTACTTCGGGTCAGGCTGTACAT
ATGGCGTTTTGAATTCTTGGACCCCTGTATATTTTCATGATATGTTTCCG
AACAGTAAAGGATGGATATTCAATGTTATACCATGGTtgacaagttttat
ttttgagcttGTAACTGGATACTTTGCAAATAATCtgctaaaaaatggaa
aatctgtATTATTTGTACGCAAAACATATGCTGCTTTTCTTTTTCTAGGA
ACAGCatttttttcaatacttttAACCAAAGTGAAGATATTCGAACATGC
TTTACTTTTGATGAGCTTAGTCGCTGGATTTTCTGCTTTTGGCTCAAGCT
CATTATGTCTGAATCCTCAAGATGTTTGTCCAAACAAAGCTGGTTCTTTA
TATGGATTAACACATGCTGTAGGATCTTTTGGAGGTACTATTGGTGTTTA
TCTCACTGGACTGGTATTGGAAACCAATAATAACTGGTCATTGattttta
tttgtaatgcaataatatcaattttatcatttttagtttttcaattattC
GGCTCCACTAAGCCAATTGATAACTTATAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000095_pilon | genome | sc0000095_pilon:832004..843785 + |
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