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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000095_pilon:832004..843785+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12567.1.p2 ID=MSTRG.12567.1.p2|Name=MSTRG.12567.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11782bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000095_pilon:832004..843785+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TAGCCctaattttaaaagaaaggaaaagggTTTTGACTTCTGATAAATTG
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GGTGAACGAATGATCATGTACTCATCCACTATATGGGCTACATTAACTGT
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tATCCTTCCTTATCCTCGCTTGTTTCGAAACATGTGAAAGACAGTGATAA
AGGATTTGTGACTGGTGTTGTTTTCTCTGGATGTTCAATTGGAACCATCG
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GTATATTTGACTGGGTGGATCCTTGAACACTCTGGGCGTTGGTCGTATGT
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TTCGGCAACGTAGAACAATTTAGTTGGAACTCTTCTCTGTGTAAATTGCT
TTGCTTTAGTAAGCCGAGTTCCCGAGTTCAATTTGTATGTAGTgggtttt
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GTGTACATGAATTTTATatgattgaaaaaattaatgacagTTCACATTCT
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ATTACTTATTTTATTGGGACATTTTTCGTCTATTGCGTTCGATCTGCTAT
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ATCATCGGTGGATATCTTGCGGACCGCCATGGGGGAGAGCGGATGATTAT
TTATTCGGCTACCGTATGGTCGGCCTGCACCCTCCTCCTTCCTTTCGTTG
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CGCTTTTTCACTGGAATGGCTCAAGGATTTTACTTTCCATCACAGGCGAC
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TTTCTTATTCCGGATCCTCCGTAGGGACAATTATGACGGGTTTCGTTGGT
TCTCTTATCATTGAAATGTTTGATTGGGAGATGGTATTTATCGTTATTGG
TATTCCCGCCCTTTTATGGGTGTATTGGATGAAGCGTTTATACAACAGTA
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GATCGCTTATTTTTGCAGTGGGTTTGTATTCTTCAACCTCCTATCTTGGA
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AGACCTAGGAACATAAAATAACCTCATGAAGTTCTGTTCAATTATGTATC
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TTTTGGTCCATTTAACTATGACAAAGACCACAGAAAAGACTTTTTAAGCT
TCGTGAATGATCCAAGCATCAAATAGCGCCTAAATGAGCTATGAAATAAC
AATAACCTTcgggttttcaaattttagcataAAGACATGGCCTTAAAGAA
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GCTTTATATCGGCCAAATTtggtttttctatctttttgaatGCCTCAAGT
ATACATAATATCAATATCATAgttcttttgtgtttatcttaACTGTGCTG
GTGGATTaaaaaaaaGCCACACCCAATGCTAAAAACATGCTCATAATGGG
ACCATACAACCATTTTTAGTGATTGCTTATGTTGGTATATTGATCTTATA
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GAGAGATACAAGCCTCTAAATCCAAATGCTAAGTATTTGCTCCTACTAAA
ATGCTAAGTATTGGCTCATTTTTGGACCGCACTTTGTTGAAGCATAAGTC
ATGAcagatttaagctttagaaaaaattattttaaatttttaaagttcat
ctTTTCCACGCAACCATCATCAGGGCATAATTTTAGTTCATTCATTATAT
TAGAAATGAATGATGATTTCCCAAGACCCctaaaaacgaaacaattaaaa
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GAAGTGTTTTTACTATGTATCatgcatacacgctttttttttataagaat
acactttataagaatgtccatgataaaaatggccaaaaaatgaagaatat
gctcagaatatcaccatcatagaattttgctaccCAAGCTACGAATGCCA
TTTTAGACCATTTTTTagtcaattaggatcctaacctaagaatgctgtaa
gaatattccaggatgattttcccaaaaaagttaagaatatccatgatgaa
atggatttacaccattcttataaaaaaaagcgtgtagtattGTTGACAAG
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ATTTTGTAGCAGACACAGCTGGTATCGGAGATTTTGACCCTGAGAAAAAT
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GTATAAGAAATTCTCTGAACTTCAAGATGAACATATTTTAATGGTGGATC
CTTTTAAAGACAAAAATAACCCGTATGCTGACGctgttaaaaagtttaaa
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aaaatcggggaaCAATGACGCCCGATTTCAATTAGACTCTGCAGAGGTTG
CAGAATATGAGCGTCCAACTGTACCTCCCTTATCAGAAATTCAAACACCA
GCAGATGTTGATGATTCAGATAATTTGTATGATGGAGATAATATACAATT
GGATATCGATGGAGATGATGATGGGGataattttaatgaatttaaGTAGT
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GACGCTAGCTTTCCAAACCATTTATAAGCAATCTTATAGGCGTTGGTGGT
TTAAGCCCAAACAATTTGCTTCTTGAAACAATTTTAATAAGTTGTAATAA
AATGTTAAATGTTATGATTTGTGAATTGATAATTTTATTAAGTTCGAAGT
ATTATGGTTTcatcatttttcttaaaataactcCAAAACCACCAAAATGT
ATAAACTTCTGACATTAAAATGAGAAGGAAGTCCCTATTCCTTTGATTCA
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ACAAATTAACACCTCTCCTTAGCCCTTTGTCGAGAAGCAAACTCACTCCA
GGTTCAAACttctacattttttataagcaatcagTTGGCTAAGGCTCCAA
GGCTCAAACTTGccaatttatttttcatctcg Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000095_pilon:832004..843785+ >MSTRG.12567.1.p2 ID=MSTRG.12567.1.p2|Name=MSTRG.12567.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1335bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000095_pilon:832004..843785+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAGAGTAAACAAACCAACCTTAATATCGAAGAAGATCCAAGTGGTAA
AAACAAATTGAACAATGAAAAATTACACGGAGAAAACACTGATTTACACT
GGAGTAAACCGCTACGTTTGCGATGGACTATTACTTATTTTATTGGGACA
TTTTTCGTCTATTGCGTTCGATCTGCTATGTCGATTTGTGTTCCAGCCAT
CGCCAAAGAAATGGGTTGGAGTAAACAAACATCAGGAATGGCTCTTTCCG
CTTTTTTCTGTGGTTACGTTTCAACAAATATCATCGGTGGATATCTTGCG
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GGCCTGCACCCTCCTCCTTCCTTTCGTTGCTGAGAACCCAGCCCTTCTAT
ACTCTGGAACATTTGCGATATTTGGAGCCCGCTTTTTCACTGGAATGGCT
CAAGGATTTTACTTTCCATCACAGGCGACTATTTTTGCTAAACATGTTCC
CGTTAAGGAAAAAGGATTTATTTCTGGGTTTTCTTATTCCGGATCCTCCG
TAGGGACAATTATGACGGGTTTCGTTGGTTCTCTTATCATTGAAATGTTT
GATTGGGAGATGGTATTTATCGTTATTGGTATTCCCGCCCTTTTATGGGT
GTATTGGATGAAGCGTTTATACAACAGTACAACGAAATTCAAGAATACAA
aggaaaagaaatttataaaaatgaaagagccagTACCGTGGAGGAAGATG
GCTTCAAGGAAACCATTCTGGGGGCTGATGATCGCTTATTTTTGCAGTGG
GTTTGTATTCTTCAACCTCCTATCTTGGACACCTATTTATTTCCACGATG
TTTTTCCACAAAGCAAAGGATGGGTGTTTAATGTTATACCATGGGCGGTT
AATTTCATCATCACTAACGTCTCTAGTTATTATGCAAACGTGCTACTTAG
TAGCGGTACATCTGTCACAGCATTGAGAAAATCCTATTCCGCTATATTTT
TTCTGGGTGGAACGTTATTTTCTGTGTTATTGACAGTCGTCGAAACTTTC
AAACAAGCTTTATTTGTAATGAGCTTGAATATTGGTATACAGGCATTCGC
TAGCTGCTCCATCAATTTGAATTCACAAGATTTATGCCCCCAGCACGCGG
GTGCCCTTCATGGCTTGATCAATAGTGTGGCGGCCTTGGCGGGAATAATG
GGTGTTTATGTGACAGGATACATCTTGGAAACAACGGGGCATTGGTTTTC
AGTGTATGCGCTAACTGCGTTTGTCTCATTCTTAGGTTTCTTAGCTTTTC
AGTTATTTGGATCGGGTGAACAATTGAATATTTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000095_pilon | genome | sc0000095_pilon:832004..843785 + |
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