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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000095_pilon:603660..608245- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12550.1.p1 ID=MSTRG.12550.1.p1|Name=MSTRG.12550.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4586bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000095_pilon:603660..608245- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) GGAGTCCTTAAATGGTATTGCAGCTCTTCTTAGGGTATTTATCCTGATTT
ATTAGTCATTTAAGTCTGTCTTTTTTGTAGAACCGGAGGCTTTATAGACC
TTACTAACAAAGTTTGCTTCGAAATTTCTGAAAACATTAGCTGCTTTTGA
ATAGAAAATACTTATTGATTTCAATTTTATTTTTATCATTTCGACTGGTC
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GTTAGGTTGTGACATTGGATGGTTTTCAAAGAATGGTAATGACAATCAAC
GACACAGTTCCTGGTCCACCTTTGATCGTGTATGAAGGTCAACGAGTCAT
TATACGACTTCATAACCATTTGTTGAGCGATACAGTGACTATTCATTGGC
ATGGTTTACACCAAAGAGGTACTCCATGGATGGATGGTGTCGGCTATGTA
TCACAATGTCCTATTGGTGCTGGCGAAATCTATGTTTATAACTTCACGGT
AAGTAACAGACTAGGATACACCATCCCTTTCGTTTAGAGCTTGCCTTGAA
CTATCTCTAGTGAAGATACGATACTTTCAGAAGTTTGTCTGAAATTTGTC
TTAAACCTAGTAATATCTATTGTACTTATCAGCATAATCATAACTTCCTA
TTTCTTCTAGGCTTCACCGAAAGGAACATATTGGTATCATAGTCACATGG
GTGCACAAAGGACAAATGGTTTATATGGTGCATTTGTGATCAAGGAGCGC
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AGATTGGACACACGACCGTTCTGAAGAGGTATTAACTATATAATCAATCC
ACTGATCATCTGGCTAATCCATTTATATCAAATAAAGTGCTTGTAAAAAA
CATATGATTGAAGACATGCTTCACTATAAGGTCATCGAGCATTTTGATTA
CTTTTTACCAACTATCTTTTTGACGTTTTAAAAAGTCATTGCTGAATTCA
TCCATTTTCAGTTGAGTTATTTCACCGTGACAAAACTAATTTCACTGAGT
AGTTAGTGGTGAAGACAACTTTCAGATCAATTTTTGTCTCACAGTCAGCT
AAGATGAAACGAATTTTCAGATTGTAATTTTTATCATAGGTTTACAAAAA
AATGATGTCCACAAATTATTACAACTCTTCAAAAAGTCCAGACAATGCAA
TCATTGATGCTGTCCCTTGGGATTCTGCTCTCATAAATGGAAGAGGCCGA
TACTATGATAAAAAGACAGGTATAATTTTGAATAGTTCATACCCGTACAC
TTCGACCAAAGATGGTTATACAAGCTGACAATCGATTCGGTCAACCCTAT
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TTGAATGTTCTAGCGATGCAATAAATTGAGAATTTATACCATCTTCAAGA
TAAGAAGAAATTAGCTTTAACCGTTTTTCCAAACTGTAATAGAAAGCTTT
ATGGTCTTTAAAACTCCATCTGGTTAGATAATCAAACTAACACATCGTTT
TATTTTATAACTCCTACCAAAAGTGAAAATTACGTTGGTTAAATAATCGT
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TGGTCAAAAGCTCCCTTAGAAAAATTTGAAGTTGAACAAAACAAAAAATA
TCGCTTTCGTGTTATCAATGTTGGTACCATGTACCAATTAAGGGTTTCTG
TGGATGACCACAAGCTCAGTGTCATGGCAACAGATGGATTTGATATCAAA
CCATGGGAAGTTCAATCATTTATCATCAACCCAGGTGAACGTTATGATTT
CATGTTGACCGCCAATCAAAAGGTGGATAATTATTGGATCAGAGTCAAGT
CCATTCAAGTAAGCAATTCTTTTAGTCCTTATACCCCGAAACCGCAAATA
TAACGAAAATATATCGAAAAATAACAAAGGGCCCTATTCTTAGTCAGGCC
AGATATATAAAGCTGTGCATTTATATGGTAAAAAAAGAGGTTGAGAGAAA
GAAGATTTAAGACGTATTTCCCAATTATAAAATTAAGTAAAAAGTGGAGC
GATGGCCGAGTTGTCTAAAGTGTTAACGCCATCGATTTCAAATACCCATT
CCTCCAAACGTTGTTTCAGCTCCAGGTTGTCGAGCTGGCTTTACGTGAAC
CACATTTAAAAATCGACAGACTTTCTGAAAGTCCTAGATTACAGTTGACC
CTGTCCAAATCAATCGAATTTCATCCAAGTTGTTTGTAATCTCGGATATT
TTGTAACTAATCCTAATATCCTTTGTGTTAATACAGGTTGGTGAGGAATA
CAAGCGCAATTACGCCTTGGCAATATTGCATTACAAAGGTAGTGGTGTGC
ACGATGAACCAACAACACAAGAACAGGATTGTGTGAGAGATGGCTGCAAA
GTGATCAATTGTCCCTTTAAATATTACAAGAGTGATGAAAATACGGAATG
CATAACCATAGATGAATTAGAGAATGCAAATGCAGCTGATGTGCCACCAG
AATACATTCAAGACGATAGTATGGAACATTTCCTGAATTTCGGATTCCCT
GAATCTGATGGTCAATCACCAGGAGCAGTCAATGGTAAAAAGTTCAAATT
CCCAGCAGTGGATCCTTTGATACAATGGTCACCTAATTGTGCACGAAAGG
AATGTGGACCATCAAAAACATGTTATTGCCAACACGAGCTGATTCTTCCT
TACAATAAAACCGTGCAGATTGTGATGACAAATGTTGGTAATGGTGCAGG
CTTGTCACATCCTATTCACATGCATGGACATCAATTCTATGTCATGAAGA
TGGGATATGCAAATCAAAACAAAACAACAGGTATAGTCAGTAATTACTAC
TTACAAAACAACACAGATATCTACTGTAGTACTGCCCAATGTAACGACCC
AGCATGGGCAAATTCAACATGGCGACATGGCCATGTACCAGACATGAATA
AATATCCACCTCGCAAAGATACGCTAATGATCCCAACAGGTGGGTATGCT
GTGGTACGGATACGCGCAAATAATCCGGGCTGGTGGTTTATGCATTGTCA
TATTGAAATGCATTTGTTGGCTGGAATGGCATTGATGATAAATGAAGCAC
CAAACGAATTGCTAAAAATTACACGACCAACTGATCTTCCAAAATGTGAA
AATTTGGTCAAGCTTACATGGAATATAACAGCAGCATCAACAACACAAGC
AACACGTAAGTTTTACTTTACCCACCCTCTAGAATGATTACTTCCTCGAA
AGCATATTCAAAATTTCTCCTTGATACATCTTTGTTCCCATATTTTCAGA
TAGAGATAAAGTTATCTTGGTTAAAACAAACTGTAAACAAAGCAGGGCAA
ATTAATTTAGTTGGGGCGTTCCTTTGCTTATAGTGATATTGTGATAAAGC
CTGATACAGTCAACATTGGATCTGTCAACTTAATATTGTTTATTTTCTTT
TAGCGCTAGCAGAGTCTTCCCAAGGTGAAAATGGAGACGATTGGAAAGAT
GCAACGATTATAGTAGCAGTTATTGCTGGTGTAGTGTTGATCATTTTGAT
CGTTTTCATTGTCTATACTTGTTGTTGTAGAAGAACGAAAGGCAAAGAAA
GTCAAAGTCATGAAATGCGATAACTTGCGAAAAACTGATTATGGAATACA
TAAATTAAAGTAAATCATACAGAAAATAACCATATTTTATATGATATATG
ATTGTGGTTATACCATCTTATTTTTATTTTTTATTTTCTTCTCACTTGTT
CTGGACAAGACTTGTTCTGATTTTGCACCAATTTATGCCTGGTAGTTTTC
ATTATATATTCTGATTGATAGTTTAGTCCTTTTCCAAAATTTTATTTGAC
TTTTAAAAATGTATAAAATTTATCAAAATTGAAGAACATTACGTACTACA
TTACTTCAAGTTTTGTGCCTTACTAAAGCCATCAAACGTTTATAATCCAA
AAGAATTAAATAGATGTATTTTTTTACTATTAATTC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000095_pilon:603660..608245- >MSTRG.12550.1.p1 ID=MSTRG.12550.1.p1|Name=MSTRG.12550.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=14910bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000095_pilon:603660..608245- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) CGCTAGCAGAGTCTTCCCAAGGTGAAAATGGAGACGATTGGAAAGATGCA ACGATTATAGTAGCAGTTATTGCTGGTGTAGTGTTGATCATTTTGATCGT TTTCATTGTCTATACTTGTTGTTGTAGAAGAACGAAAGGCAAAGAAAGTC AAAGTCATGAAATGCGATAAGTTGGTGAGGAATACAAGCGCAATTACGCC TTGGCAATATTGCATTACAAAGGTAGTGGTGTGCACGATGAACCAACAAC ACAAGAACAGGATTGTGTGAGAGATGGCTGCAAAGTGATCAATTGTCCCT TTAAATATTACAAGAGTGATGAAAATACGGAATGCATAACCATAGATGAA TTAGAGAATGCAAATGCAGCTGATGTGCCACCAGAATACATTCAAGACGA TAGTATGGAACATTTCCTGAATTTCGGATTCCCTGAATCTGATGGTCAAT CACCAGGAGCAGTCAATGGTAAAAAGTTCAAATTCCCAGCAGTGGATCCT TTGATACAATGGTCACCTAATTGTGCACGAAAGGAATGTGGACCATCAAA AACATGTTATTGCCAACACGAGCTGATTCTTCCTTACAATAAAACCGTGC AGATTGTGATGACAAATGTTGGTAATGGTGCAGGCTTGTCACATCCTATT CACATGCATGGACATCAATTCTATGTCATGAAGATGGGATATGCAAATCA AAACAAAACAACAGGTATAGTCAGTAATTACTACTTACAAAACAACACAG ATATCTACTGTAGTACTGCCCAATGTAACGACCCAGCATGGGCAAATTCA ACATGGCGACATGGCCATGTACCAGACATGAATAAATATCCACCTCGCAA AGATACGCTAATGATCCCAACAGGTGGGTATGCTGTGGTACGGATACGCG CAAATAATCCGGGCTGGTGGTTTATGCATTGTCATATTGAAATGCATTTG TTGGCTGGAATGGCATTGATGATAAATGAAGCACCAAACGAATTGCTAAA AATTACACGACCAACTGATCTTCCAAAATGTGAAAATTTGGTCAAGCTTA CATGGAATATAACAGCAGCATCAACAACACAAGCAACACGTCTTTGGTCA AAAGCTCCCTTAGAAAAATTTGAAGTTGAACAAAACAAAAAATATCGCTT TCGTGTTATCAATGTTGGTACCATGTACCAATTAAGGGTTTCTGTGGATG ACCACAAGCTCAGTGTCATGGCAACAGATGGATTTGATATCAAACCATGG GAAGTTCAATCATTTATCATCAACCCAGGTGAACGTTATGATTTCATGTT GACCGCCAATCAAAAGGTGGATAATTATTGGATCAGAGTCAAGTCCATTC AAGTTTACAAAAAAATGATGTCCACAAATTATTACAACTCTTCAAAAAGT CCAGACAATGCAATCATTGATGCTGTCCCTTGGGATTCTGCTCTCATAAA TGGAAGAGGCCGATACTATGATAAAAAGACAGGCTTCACCGAAAGGAACA TATTGGTATCATAGTCACATGGGTGCACAAAGGACAAATGGTTTATATGG TGCATTTGTGATCAAGGAGCGCCCAAAACCAGGTGCCAGTGAACCACCAG AAGAACGGATTATGGCAGTAGGAGATTGGACACACGACCGTTCTGAAGAG GTTGTGACATTGGATGGTTTTCAAAGAATGGTAATGACAATCAACGACAC AGTTCCTGGTCCACCTTTGATCGTGTATGAAGGTCAACGAGTCATTATAC GACTTCATAACCATTTGTTGAGCGATACAGTGACTATTCATTGGCATGGT TTACACCAAAGAGGTACTCCATGGATGGATGGTGTCGGCTATGTATCACA ATGTCCTATTGGTGCTGGCGAAATCTATGTTTATAACTTCACGATGAAAA TGATCTATCAACGTTCGGGTGTAATGTATTTCTTAATAGCAGCATTTTGG TTGATTGTCACAACAAATGGTCAATATACCAAACAACAGGAATGCAAGCC ACCACCAAATGAAGTTTGTGAATATTGGTGGTATGTGAGTACAAGAATGT CTATGGAATATCAATATCAACATTTGAAGTGGAATGAACAACAACATCAA TTCTACAACATATCCAATATACCGGTTAATCGCTAGCAGAGTCTTCCCAA GGTGAAAATGGAGACGATTGGAAAGATGCAACGATTATAGTAGCAGTTAT TGCTGGTGTAGTGTTGATCATTTTGATCGTTTTCATTGTCTATACTTGTT GTTGTAGAAGAACGAAAGGCAAAGAAAGTCAAAGTCATGAAATGCGATAA GTTGGTGAGGAATACAAGCGCAATTACGCCTTGGCAATATTGCATTACAA AGGTAGTGGTGTGCACGATGAACCAACAACACAAGAACAGGATTGTGTGA GAGATGGCTGCAAAGTGATCAATTGTCCCTTTAAATATTACAAGAGTGAT GAAAATACGGAATGCATAACCATAGATGAATTAGAGAATGCAAATGCAGC TGATGTGCCACCAGAATACATTCAAGACGATAGTATGGAACATTTCCTGA ATTTCGGATTCCCTGAATCTGATGGTCAATCACCAGGAGCAGTCAATGGT AAAAAGTTCAAATTCCCAGCAGTGGATCCTTTGATACAATGGTCACCTAA TTGTGCACGAAAGGAATGTGGACCATCAAAAACATGTTATTGCCAACACG AGCTGATTCTTCCTTACAATAAAACCGTGCAGATTGTGATGACAAATGTT GGTAATGGTGCAGGCTTGTCACATCCTATTCACATGCATGGACATCAATT CTATGTCATGAAGATGGGATATGCAAATCAAAACAAAACAACAGGTATAG TCAGTAATTACTACTTACAAAACAACACAGATATCTACTGTAGTACTGCC CAATGTAACGACCCAGCATGGGCAAATTCAACATGGCGACATGGCCATGT ACCAGACATGAATAAATATCCACCTCGCAAAGATACGCTAATGATCCCAA CAGGTGGGTATGCTGTGGTACGGATACGCGCAAATAATCCGGGCTGGTGG TTTATGCATTGTCATATTGAAATGCATTTGTTGGCTGGAATGGCATTGAT GATAAATGAAGCACCAAACGAATTGCTAAAAATTACACGACCAACTGATC TTCCAAAATGTGAAAATTTGGTCAAGCTTACATGGAATATAACAGCAGCA TCAACAACACAAGCAACACGTCTTTGGTCAAAAGCTCCCTTAGAAAAATT TGAAGTTGAACAAAACAAAAAATATCGCTTTCGTGTTATCAATGTTGGTA CCATGTACCAATTAAGGGTTTCTGTGGATGACCACAAGCTCAGTGTCATG GCAACAGATGGATTTGATATCAAACCATGGGAAGTTCAATCATTTATCAT CAACCCAGGTGAACGTTATGATTTCATGTTGACCGCCAATCAAAAGGTGG ATAATTATTGGATCAGAGTCAAGTCCATTCAAGTTTACAAAAAAATGATG TCCACAAATTATTACAACTCTTCAAAAAGTCCAGACAATGCAATCATTGA TGCTGTCCCTTGGGATTCTGCTCTCATAAATGGAAGAGGCCGATACTATG ATAAAAAGACAGGCTTCACCGAAAGGAACATATTGGTATCATAGTCACAT GGGTGCACAAAGGACAAATGGTTTATATGGTGCATTTGTGATCAAGGAGC GCCCAAAACCAGGTGCCAGTGAACCACCAGAAGAACGGATTATGGCAGTA GGAGATTGGACACACGACCGTTCTGAAGAGGTTGTGACATTGGATGGTTT TCAAAGAATGGTAATGACAATCAACGACACAGTTCCTGGTCCACCTTTGA TCGTGTATGAAGGTCAACGAGTCATTATACGACTTCATAACCATTTGTTG AGCGATACAGTGACTATTCATTGGCATGGTTTACACCAAAGAGGTACTCC ATGGATGGATGGTGTCGGCTATGTATCACAATGTCCTATTGGTGCTGGCG AAATCTATGTTTATAACTTCACGATGAAAATGATCTATCAACGTTCGGGT GTAATGTATTTCTTAATAGCAGCATTTTGGTTGATTGTCACAACAAATGG TCAATATACCAAACAACAGGAATGCAAGCCACCACCAAATGAAGTTTGTG AATATTGGTGGTATGTGAGTACAAGAATGTCTATGGAATATCAATATCAA CATTTGAAGTGGAATGAACAACAACATCAATTCTACAACATATCCAATAT ACCGGTTAATCGCTAGCAGAGTCTTCCCAAGGTGAAAATGGAGACGATTG GAAAGATGCAACGATTATAGTAGCAGTTATTGCTGGTGTAGTGTTGATCA TTTTGATCGTTTTCATTGTCTATACTTGTTGTTGTAGAAGAACGAAAGGC AAAGAAAGTCAAAGTCATGAAATGCGATAAGTTGGTGAGGAATACAAGCG CAATTACGCCTTGGCAATATTGCATTACAAAGGTAGTGGTGTGCACGATG AACCAACAACACAAGAACAGGATTGTGTGAGAGATGGCTGCAAAGTGATC AATTGTCCCTTTAAATATTACAAGAGTGATGAAAATACGGAATGCATAAC CATAGATGAATTAGAGAATGCAAATGCAGCTGATGTGCCACCAGAATACA TTCAAGACGATAGTATGGAACATTTCCTGAATTTCGGATTCCCTGAATCT GATGGTCAATCACCAGGAGCAGTCAATGGTAAAAAGTTCAAATTCCCAGC AGTGGATCCTTTGATACAATGGTCACCTAATTGTGCACGAAAGGAATGTG GACCATCAAAAACATGTTATTGCCAACACGAGCTGATTCTTCCTTACAAT AAAACCGTGCAGATTGTGATGACAAATGTTGGTAATGGTGCAGGCTTGTC ACATCCTATTCACATGCATGGACATCAATTCTATGTCATGAAGATGGGAT ATGCAAATCAAAACAAAACAACAGGTATAGTCAGTAATTACTACTTACAA AACAACACAGATATCTACTGTAGTACTGCCCAATGTAACGACCCAGCATG GGCAAATTCAACATGGCGACATGGCCATGTACCAGACATGAATAAATATC CACCTCGCAAAGATACGCTAATGATCCCAACAGGTGGGTATGCTGTGGTA CGGATACGCGCAAATAATCCGGGCTGGTGGTTTATGCATTGTCATATTGA AATGCATTTGTTGGCTGGAATGGCATTGATGATAAATGAAGCACCAAACG AATTGCTAAAAATTACACGACCAACTGATCTTCCAAAATGTGAAAATTTG GTCAAGCTTACATGGAATATAACAGCAGCATCAACAACACAAGCAACACG TCTTTGGTCAAAAGCTCCCTTAGAAAAATTTGAAGTTGAACAAAACAAAA AATATCGCTTTCGTGTTATCAATGTTGGTACCATGTACCAATTAAGGGTT TCTGTGGATGACCACAAGCTCAGTGTCATGGCAACAGATGGATTTGATAT CAAACCATGGGAAGTTCAATCATTTATCATCAACCCAGGTGAACGTTATG ATTTCATGTTGACCGCCAATCAAAAGGTGGATAATTATTGGATCAGAGTC AAGTCCATTCAAGTTTACAAAAAAATGATGTCCACAAATTATTACAACTC TTCAAAAAGTCCAGACAATGCAATCATTGATGCTGTCCCTTGGGATTCTG CTCTCATAAATGGAAGAGGCCGATACTATGATAAAAAGACAGGCTTCACC GAAAGGAACATATTGGTATCATAGTCACATGGGTGCACAAAGGACAAATG GTTTATATGGTGCATTTGTGATCAAGGAGCGCCCAAAACCAGGTGCCAGT GAACCACCAGAAGAACGGATTATGGCAGTAGGAGATTGGACACACGACCG TTCTGAAGAGGTTGTGACATTGGATGGTTTTCAAAGAATGGTAATGACAA TCAACGACACAGTTCCTGGTCCACCTTTGATCGTGTATGAAGGTCAACGA GTCATTATACGACTTCATAACCATTTGTTGAGCGATACAGTGACTATTCA TTGGCATGGTTTACACCAAAGAGGTACTCCATGGATGGATGGTGTCGGCT ATGTATCACAATGTCCTATTGGTGCTGGCGAAATCTATGTTTATAACTTC ACGATGAAAATGATCTATCAACGTTCGGGTGTAATGTATTTCTTAATAGC AGCATTTTGGTTGATTGTCACAACAAATGGTCAATATACCAAACAACAGG AATGCAAGCCACCACCAAATGAAGTTTGTGAATATTGGTGGTATGTGAGT ACAAGAATGTCTATGGAATATCAATATCAACATTTGAAGTGGAATGAACA ACAACATCAATTCTACAACATATCCAATATACCGGTTAATCGCTAGCAGA GTCTTCCCAAGGTGAAAATGGAGACGATTGGAAAGATGCAACGATTATAG TAGCAGTTATTGCTGGTGTAGTGTTGATCATTTTGATCGTTTTCATTGTC TATACTTGTTGTTGTAGAAGAACGAAAGGCAAAGAAAGTCAAAGTCATGA AATGCGATAAGTTGGTGAGGAATACAAGCGCAATTACGCCTTGGCAATAT TGCATTACAAAGGTAGTGGTGTGCACGATGAACCAACAACACAAGAACAG GATTGTGTGAGAGATGGCTGCAAAGTGATCAATTGTCCCTTTAAATATTA CAAGAGTGATGAAAATACGGAATGCATAACCATAGATGAATTAGAGAATG CAAATGCAGCTGATGTGCCACCAGAATACATTCAAGACGATAGTATGGAA CATTTCCTGAATTTCGGATTCCCTGAATCTGATGGTCAATCACCAGGAGC AGTCAATGGTAAAAAGTTCAAATTCCCAGCAGTGGATCCTTTGATACAAT GGTCACCTAATTGTGCACGAAAGGAATGTGGACCATCAAAAACATGTTAT TGCCAACACGAGCTGATTCTTCCTTACAATAAAACCGTGCAGATTGTGAT GACAAATGTTGGTAATGGTGCAGGCTTGTCACATCCTATTCACATGCATG GACATCAATTCTATGTCATGAAGATGGGATATGCAAATCAAAACAAAACA ACAGGTATAGTCAGTAATTACTACTTACAAAACAACACAGATATCTACTG TAGTACTGCCCAATGTAACGACCCAGCATGGGCAAATTCAACATGGCGAC ATGGCCATGTACCAGACATGAATAAATATCCACCTCGCAAAGATACGCTA 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CATTTGAAGTGGAATGAACAACAACATCAATTCTACAACATATCCAATAT ACCGGTTAAT
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000095_pilon | genome | sc0000095_pilon:603660..608245 - |
|