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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000095_pilon:543860..553802- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12546.3.p2 ID=MSTRG.12546.3.p2|Name=MSTRG.12546.3.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9943bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000095_pilon:543860..553802- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) GTTTTGATTTCTTTTAAAATTATTTCTTTCTAGAAAAAAAAAACACAAAA
ATAAATTATTTTGAAAATGAATCTGTCGTAATCATAAATTTTTATTTTCT
TGAATTGAAATAATGGATAGTGGAAAATCAAGTCCATCCAATCTTGTGCG
CTCACAATCACTCAGATTATCAAATTTTAACCGAACATCATTAGTACGTA
GAAACCAAAGTGTAAGTGCAAAACAAGTGAAATTCTTTCGGAATGGCGAT
CAATATTTTTCTGGTTTGAGACTTGCTGTTTCCATTGATCGTTACAAGGA
ATTTGAATCATTGTTAACAGAGTTGTCGTCAAAATTGAATTTACCTACTG
GAGCAGTTAGATATCTTTTCAATGCAGATGATGGATCTTTAGTATCAGAT
GTATCTCAACTGCAAAATGGAATTTCTTATGTTTGTTCATCTTCTGCATC
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ATAGAGAATTCTTTTCGTCTGGATAGTAGTAAAGACTTTATTAAACCCAA
ATTGGTGACGGTAATAAGAAATGGGAAACCACCGCAGAGAAAAGTAACTC
TGTTATTGAATAATAAGACAGCAATATCATTGGATCAAGTACTTGACCAA
CTGTCAGCAAAGGGATCGTTAGGGAAGGTGGATAAACTTCATACTACATC
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TATTTTATGTGAAAAGAAATGTTCAGACCATTTTTCATGGGATTATATTG
AAATTTTAAAAATTGATGAGCTAGAGACTAATGGAAGGAGGTTTTTTGCT
ATAGAATATTTTATGAATACTATCTCTATGAATGAGCAAACTGTTTGGTT
TTGAAATTATTTTTTTCTTTACAAGACAGTTGGAGTTCAAGGAGATTATT
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GTCAATCAACGGTCCTCTTTTGCTTTCCAAACAGGAGAGTAGTAAAATTT
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TTTGATTAGTAAGGTTCTATCTGTTTCCCTTTTTAAAGCCTATTAAAACA
TTGATGTCATCATTTGACCAAGCTCTAAACTATTTCAACGTTTCTCCTTT
AAATTCCTAAAATCATTATATGCGTCTGAAAAATGGTAGATCAGTGTTGC
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ATCCTGTCCTGAAAAAAATTGTCTTTTTTTTTTGAAAATCATTGAGACTA
TTATGCAAATTTGGACGAATTCAATGATTTTGATTCTTATATAAAAACCC
CAAAAATCAATAAAAAGATTTTTCGACACATCTGATTTTATCATGATACT
ATGTTTTCAACAAGTCATTATAACTCATGTATGTTAACCAATATTGTATA
AACATGATTGAAAATACCACATAAAACGTTATTAATACATCATTTAAGTA
ACCCTATGTTATTGCAATGAAACTCGCATTTTCACTCGTCACAATAACAG
TATTTTGGCATTCATTTCTCAAATATTTTAATGCCACTGTGTTCAGTTTC
ACCGGTTTCACCACCGATGGTTTAGTTTTTGCTTTTTAACATTGCCTTGA
ACAAACTCCCTGACCCTTCCTGACAGAAGAATATTTGATATTCACAAATG
TTTTCTTTTAAGGATTTAACATCAGACTTTTACCACACAATTGTCAATGG
GGTTTTATTTCGGAGTACAGACAGACCCTGCACAACTTGGAGAGTGTCGA
TAACTCAGGGAAACCCAGGGCAATTTATTTTCCAGATTCCACGGAAAACA
TTTTCTTGAATACCGTCATTCTTCTAATTTAATCCGTCCTCTAATTAGTA
CGAATTAATTATTTTGGCAAAATGAAATAATTTATCTAACTCTAATTATT
AGTACGAGTCCATGATCACGAATTTCTGATTTTCCTCTAATTTAGTACGA
TAAAGGTCAAATTTTCCTCTAATTATAGTACGAATAGTAAAAATAAACGA
ATTTTTTTTGTTTCAAAGACACTTCAAAGACAAGGAGGTATGGAGATACC
AGCTGATTTCATATTCAAAACGGTCAATGCAAAACTTTACAGTCAATGAG
AGAGAAAGTTCTCAAGGAACTGGAAACTTTTGAAGAAAAGAGAAAAGTTG
GTCAAAATAAGAGTTTGAAAAAGAAAGAAAAAATAAATAAAAAGTACCAA
AAAGTGTGTTTTTAATTTTTCAACCCCTAATTTAATACGATTTGATATCT
CTTTTACTCTAATTATTAGTACGACAATCAACGTCAATTTCCAAGGTATT
TTATTTCCTCTTATTATTAGTACGACCCCTTCAAAATAATTATTTTTTCC
GGAGGATTAAATTAGAAGAATGACGGTAGCATTCAAAAATTTGTTAATTT
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AGTTCTTAACGAAAATACATCTCGATTTGCTCAAAGCCGCAGGGAAATGC
AGGGAATATTATTTTTGCTTCCTCTATCTGAATCTTCCATTTGGAAGTTA
AGAAAACAATCGAGGTTTTGCAAAGTATATTTTTTAAACACGCAGTAATA
TATAACTTGTTTGTTTTCATTCAAAACCCATTATCGAATGCAGTCAGCGT
TACCATAATTTTTCCTCAATGAAATTTTCAGACAAATTAGTATGAGTAAT
TACTACTAGCTTTAAACTGTCTAAACACTTAATGAAAGTTCCGGATCAAA
GTCTTTCCTGTTATGTAACGCAGAGAGAATCTGCACAAATGATTTAAATG
CTCCCTGATCCTTATGAAGTGTCCAATGATTAACTATTTCATCATCTTAT
TCCCTGCTAATTTTACGCTCGCAAGTGTCCTATTCGTAATAATTATTTAG
TAAGAATCAACACAGATCCATAACAGAAGAGAGTGTCTCGAACTCCCGTT
CCTGCCATTCCATGTTCAATTGAATGTAGATAAAACTGTCCTAAGTAAAT
TAATGACCTATCAATATCAATTATGAACGCCACATTATATCTCTCAACCC
TACAGAAAAGGACCTTCTTTCCGGTTTTAATAAATACTTGATCTTCATGA
CGTAATCTTTCATACGGAAACACCCGAAAGCACCGGGCGTTTGCCACCAG
TTTTGAATTTAAAAACAATGAAGCTGGTGGCAAACGCCCGGTATTTTTTT
GTGTGTATATCAAGAATTGGGTTATTACATGTGATGAAATCAAAATATTC
TCAACTTCAGTAGTTGAGCTAGAATCTGACAATTTGTGTCTATGTCTGTG
TGTCACAAAAACAATAGGGCTGTCTGGAGACTTCAAAAATGGTCGGATTC
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TTATTTATCAAAAATTTTGACTTTCAAGGCCTGGGCACTTATCTTTTTGT
GTTTTTTTGCTACAATCGGGCCTATGAATAATTTTACCCATTTGAAATCC
AAATTTTACAAAGACTTAAAATCATAATGATCTCAAGCAAGATTGTAGAT
GCTTCCTGTTATAAATTTGTGGTCCTCTAGTAGATATCCTCACTGTCAAA
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GTCCGGATTGAATCGAACCATTAAAGCAAATATCCCCCCTCTAATTCCAT
CCTATATCACATTTCAGTTTATTATACTGGAATGAAAAAGTATACTGGAA
TGCTAATTAGCAGTCCTTATTATTGATATGAAAATTGATGTTTTATCTCT
CGTTTAGATACGTGCGTTACGAGATTTATTCGACGATAACACTGTTTTTA
TCGCGCTTTCCACAAACGAAAAGTTCCCTGATGATGGAATTGAACTTGAC
CCTAACAGTAAGTCCTCTAATTGCTTTGATATTAATCCCCAAGTCCAAAA
GTTTCAGCTCTATATTTTCGACTCTCTAGTCTACCGATGCACTGTTTGAA
AATTTGCATAAAGAAATCGACAAATAATTGTGTCCAGTTGTGTCCTAGTA
ATGGTTTCTTCGCATGGTCTTTTTAGCTTTTTGGTTAGATTAACTCATAC
TGTCATAAACCAAACACCGAATGTTACTTGTTTTTTATCTCTCTATAGTT
TAAATATAATCTCTGGCTTTAAACCAAGAAAATACTGTTTGAATTTTTGG
CGGTTAAGTTTAGTTGTAATAACAACGGTCATTTCAGATTTACGAAAAAG
AAAAGGGTTTATCTGCCTTATTCAATGCGTTTGGAATTTTAAGACGTAGA
TATTTTCTATTATGAACGACTCGTCATCAATGATATAAGTTGTACAATCT
CTCCTAATATGCTTTCATAAAATCCCCTTAGGTTGGATTTCTCGTGATGT
ATGTGTGCCCTACAAGTATTAATACTAGATCTGTAGTTATTCAGAGCAAA
AATATCATCGGGGTACTGTATCACAATTTCAAGGTAGAAAATCCGTCATC
GAAATTGAACAAATTCAAAGTAGTGTTTTGAACTAATGTTTCACTGGTCA
TAATTGTGTTCCTCTTTTTACTTTTAAAAAAAGCACGAGGAAAGACTTTC
GGTTCTCAAAAATGAATTATATGACTAGATCACGAGGAAGTGGTACAACT
CTGCCAAACGCAATATCAATCAAAACTAGTTATTAAAGCACCACGCGTTT
AATTATATGTACAGAAATTATATACCCTTGTTGTTGATGTTTTTTATCAA
TGTATAGATAGTCTCTTGATTTGTTTTCTTACCGAGAGATTTGTGTATTT
CATTGGCAGGTTATCGCATCACACCGTACCGTGAAATGAAGAAATCGAAC
CAGATGGCTGTCAGAAGATCGAACTCCTTGAGACACAACATGAGATATAA
AGATGAAAACGAAAATATGTCTCGTAAGTCTCATTATTTCACTTACTCGT
ATTTAGGTATATTTTTGAGTCTGTCTCTACTGTTTAAACCAGTATTTTAA
CTATAGTAAAGATCGTTTAGCCATCTATTTCCACGCAAATGGCAAGGCCG
TTGGCTAGAGTCTCTCTGGATCCGTTGGTTTTCGAAGCAAGGGATTGGAG
GTTGTTCAGCACTCATGACTTTTTAGTTCAAAATTTTACTCTTGTGAAAG
TGTCTGCTGTAACTAGATTGCTATAGACACTCAGGGTCGGCTTCATTCTA
CGCTGCATGCAATCAACGAGTTGTTGAATTGTGCATGCAGGTTTTCAGCA
GGCAATATGTAAATGGTTGTTTTAAAGTTTATATTGATTCCGGATCTTTT
TTTTTCAGTATCAAATATTCGAAATTTAAAGAATGGTGCATTGCCTAAGG
TATGTTTTGCCTAAAGTTCTCTTTATTTTGTATCACTTGAATAAATTTTA
AAAAGTTAAAGGGCGACCTCTGCTAAATGTATCTTTTCAAAAGTGTGCAA
AAACATAAAAGGGATGGGGGTACATTTTGACGAAGTTAACAAGGTTAACG
ATTTCTTAGCAATCTGTTTTTTTTACCTTCATGTCTATAACTCTTTTGTC
GATGAAAATCTCTTTTGTATTTCAACATGTCATGTTTACGGTCAATTTGT
TTACAGCATGCACTGTCAGCACGACAAAGTGTACAGCCAAGAATACGAAC
CACGTCACGTAAAGAAGAACAGAAAAATAAAGAAGAATTGTAAGTGACCT
TCAGTTGTATTTCACTATTTTCTATAAGAACCAATAACATGTTGATGACC
CGTCCGTTCTTTCATTTGACGTACTCTTAGCCTCAAAGTATTCTAAATTT
GAGCTATTCATACCCTATGTTTATTAAAATTTTGAGCCTTACCGTCTTGT
TCTTAAGAGTTAGGCAATACAGGTTCTGGGTTGTTTTTTGGTTTCATTTC
TAAGCCCCATTGTTCTTACAAAGCTTTTCTAATAAAAAAGTGTGCCAGAT
CCACTCACTCTTTGTGCGACAACATTTTTGTCATTGCTGGACCTTGACAG
TCTTGACAACCTTTGAAAATCTTTGCATTTGTTTTAAGTATCTATTCCGT
AACGGTATTTCTTGTCTTTGTTTTATTAGATATCCGACGTCCGTCTTCGC
AAGCGACTCTGAATCAGGTACATACTATTTTCTTCTAAATTTTTTAATTC
ACGCTGGATGTGTGTACTTAAGCCGAAATGAGCAGTTTCAAAAGTTTTTG
AGTTTTGAAGATAATTATAACCGCAATTAACTTTCTTAAGAGCCATTTTT
TTTAAAAACCTTCAGAATAAAGAAAGTCTGATACCTCACCCTCTTAGATT
TTGATGAAATTTTGACCAAATGATCTATCACACAAGAAAATAAGACTCTG
AAAATTTCACCTTGATATCTCAAGTAGTTTTGAAGATACAACGTCTCAAA
GATGGGCTACTAAGCGAAAATTGACCCCTAAAAATCATGAACTCTGGTGG
GGAGCAGATTTTGAAAGCCAATGAGTTTTATTCAAGTACATTAGAAAGCT
GATTTACAGTGGATTTCAAGAACTTTTTGTAGGGAATCAGAAAAAATCAA
ATTCAGTCTCCAAAATTTTCCCCGAAAATCTCTAGCACCTCCTGTAGAGG
GCTTCAAACTTTGCGTAATCTGGGTTTGGAAGCACTTTTAGCTGGCTGCT
GATGGTCCTTGGGACTTTTTTGAAGTAAACTTTTGACCTGGAGTGGTTTA
CTGGTGGGTTTTGGCCACAAAAATAACATTTTCAGGATTTCCATCTTTGC
GTAACCGTCAAAAATGGCCGAAAAAATTGCTATTTTGGCAGACCTGGAGC
AAAATTCAAGATGGCGTATCTTTTTAAGGCAACACCAAATTTTTTTGAAA
TTTTCAGCAAGGCTTCCTTAGTAGGTCTAGTTTATAGCCTCAAAAAAATC
TCAATGGGCTTTTGAAGTCTCTTAAAGATATGCAAAATATAAAGATACGC
AAAATTTCTAAGTCCAAGTGTCGTGATTAGCTTTTAGACTGTCCAATATC
TCTATAATAGTGTACACTAACAGTCTTACTTGTTGATTCTTAAATAACTA
GGCAAAATTACTAGGGTGATAATTTATGAGATACTGCAAACAATGCTGTT
TAAATCTTCTGGACAAGAAATATTGGACAGTCTAAAGCTAATCAAAACAC
TTGGACTTAGAAATTTTGCGGTAAAGCGCAAATTATTGTCAAAGTAGGAT
TTCTGAATGAGTCTAAAAAGTTTTTGAATAGGAATTAAGTACTGTTAAAC
CCATTTAGTTGAAGTAGCCTGCTTATATTTAAGATTACTATTCACCAAAC
TGTGAAAGGTTGAGGCGTTTCCTGGAAATATGGGCTCTGGAATGGTAGGA
AAGGCCAGATGCCAGTCTCATTTTTTTACATATTCTGTACTTAAAAATAA
AGAAACAGTCATAAAATGTCATCTGTTGATGGAAATGACCTGAAATATTT
TTCAGTTGTTCCCCTAATGCCAATGATTAGTTGGCTCGAGAAAATAAACC
AATATTTTGACAAAAATTATCCTGTTAGAGCCCTTAAGTGGGCCTGATTT
AGCATTTTACGAGGGAGAAAACAACAAAGTTAAGCAAATTTTCAATCGAT
CATATCTTTAAGAGACTTCAAAAGCCCATTGAGATTTTTTTGAGGCTATA
AACTAGACCTACTAAGGAAGCCTTGCTGAAAATTTCAAAAAAATTTGGTG
TTGCCTTAAAAAGATACGCCATCTTGAATTTTGCTCCAGGTCTGCCAAAA
TAGCAATTTTTTCGGCCATTTTTGACGGTTACGCAAAGATGGAAATCCTG
AAAATGTTATTTTTGTGGCCAAAACCCACCAGTAAACCACTCCAGGTCAA
AAGTTTACTTCAAAAAAGTCCCAAGGACCATCAGCAGCCAGCTAAAAGTG
CTTCCAAACCAGATTACGCAAAGTTTTAAGCCCTCTACAGGAGGTGCTAG
AGATTTTCGGGGAAAATTTTGGAGACTGAATTTGATTTTTTCTGATTCCC
TACAAAAAGTTCTTGAAATCCACTGTAAATCAGCTTTCTAATGTACTTGA
ATAAAAATTCATTGGCTTTCAAAATCTGCTCCCCAACAGAGTTCATGATT
TTTAGGGGTCAATTTTCGCTTAGTAGCCCATCTTTGAGACGTTGTATCTT
CAAAACTACTTGAGATATCAAGGTGAAATTTTCAGAGTCTTATTTTCTTG
TGTGATAGATCATTTGGTCAAAATTTCATCAAAATCTGAGACATCAAGAA
ATCACATCTTGAAGGCTCTTAGAAAAAATGGCTCTTAACCTTTTAAAAGT
AATAATCAACTTTAACTTTAAGATACCTTAAAATATTATATAACACAATA
GTCTTCTTAAAAAAGTTGTTTGCACGATTTCTGTGCTATCTAGGGCTAAC
TAATTAATTTGTTAGAACGAATATGTTTTGCTGGCTAATCTTCTGTATCT
GTTGTTTAAAAGTATACATTGCACTGATCCCAACTTTGTTCGTCTTCCTT
ACAGATGACGAGAAGATGGAAATGTTTTCAAACGAAGTCTAAATTAAAAA
CGAATTTAATCAGTTAAATTGTAATTAAACCTAAGGCGATCATATTATCC
GCTTCTAAATATTTTTAAAATAATGTACAGAAATAAGAGATAACCTTTGT
AAATTTTAATAAAAATGATATTATACGTTCGTTTTCTTCCTTCGCCACTC
ACTATAAAGCATTCAGCAATCGTGCAAACACTTTTTTGGGGAAAAATACA
TTTTACGTACTTTGGAAATCATAATGTGCACGTTGCATTCTTTACAGGAG
TGCGAGGAAGAAAGTCGAAGAAAAAAGCCGCTAAAACTTTAAACAATACT
GACAGTAATAATAGTAACAGTAAAACTATGGACATATACAGCACAGTGTG
GTTAAGCGATTATGAATCGATTAAATCTGTCGGTAGTAAATCGTTAAACA
CGAGTGCTTCTTCATTCACTGAGAGTATTAACATGTCCCACTCCACCCCT
CGTCGTCCCATTGCTAACCAAACAATTAATATCCCTGTTGCTGGACAATC
AACTAAACAATCAAAATGGCGGACATTGAGTTTACCGGAGCTCGAAATGT
CGACGTTGACGGGTGATGATTTAACCGAACGTTTTGTACGTTTACAACTT
GAGCAGGACAATCGCGAATTACGTTCCACCGTTGATACGTTACAACAGAC
ATTGGAACAAGTCAAAACGTCCGTCTTCCCTTACGAAGCGGAATGCTGTG
ACGAATGTGCGGATAGCAGAAACACACTGGATAGCATCTTTTACGAACTT
TCTCATAAAATGCAACGTAAAAAGCAACTGGAATATCGTGATTACACTCC
GTCTTTCGAGCGAACAGAGAGTGGTTACGACACATTACAACCACAAGATT
CCTCTCTTCATCGGCTTTCATCTACTTTTGACAAACAATCCAACCATTCT
TTACTTTTATCCTCAACAGAGGAACACCAAAGTACCCCGGAAGATTATTT
CCAATCTCGATTAGTCAAACGCCGTACTGCTCTTGCTGGCCATGACACTT
CGTGCTGTATGGTCCAATAAAACACCTAAAATTTAAACCATAGGTTAAAA
TATATTTATAAATCTTAATTTATTATTTTAAACATTTGAATTATTTTCTT
ATAATGAATATAACTTGCTAAATGAAATTAACCAATACAAGTTAAATCCA
ATCAATCAATCAATTAATCAATAATGATCATATAAACAAACAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000095_pilon:543860..553802- >MSTRG.12546.3.p2 ID=MSTRG.12546.3.p2|Name=MSTRG.12546.3.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=906bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000095_pilon:543860..553802- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGATATTATACGTTCGTTTTCTTCCTTCGCCACTCACTATAAAGCATTC AGCAATCGTGCAAACACTTTTTTGGGGAAAAATACATTTTACGTACTTTG GAAATCATAATGTGCACGTTGCATTCTTTACAGGAGTGCGAGGAAGAAAG TCGAAGAAAAAAGCCGCTAAAACTTTAAACAATACTGACAGTAATAATAG TAACAGTAAAACTATGGACATATACAGCACAGTGTGGTTAAGCGATTATG AATCGATTAAATCTGTCGGTAGTAAATCGTTAAACACGAGTGCTTCTTCA TTCACTGAGAGTATTAACATGTCCCACTCCACCCCTCGTCGTCCCATTGC TAACCAAACAATTAATATCCCTGTTGCTGGACAATCAACTAAACAATCAA AATGGCGGACATTGAGTTTACCGGAGCTCGAAATGTCGACGTTGACGGGT GATGATTTAACCGAACGTTTTGTACGTTTACAACTTGAGCAGGACAATCG CGAATTACGTTCCACCGTTGATACGTTACAACAGACATTGGAACAAGTCA AAACGTCCGTCTTCCCTTACGAAGCGGAATGCTGTGACGAATGTGCGGAT AGCAGAAACACACTGGATAGCATCTTTTACGAACTTTCTCATAAAATGCA ACGTAAAAAGCAACTGGAATATCGTGATTACACTCCGTCTTTCGAGCGAA CAGAGAGTGGTTACGACACATTACAACCACAAGATTCCTCTCTTCATCGG CTTTCATCTACTTTTGACAAACAATCCAACCATTCTTTACTTTTATCCTC AACAGAGGAACACCAAAGTACCCCGGAAGATTATTTCCAATCTCGATTAG TCAAACGCCGTACTGCTCTTGCTGGCCATGACACTTCGTGCTGTATGGTC CAATAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000095_pilon | genome | sc0000095_pilon:543860..553802 - |
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