MSTRG.12526.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12526.2.p1
Unique NameMSTRG.12526.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000095_pilon:209692..235684-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12526.2.p1 ID=MSTRG.12526.2.p1|Name=MSTRG.12526.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=25993bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000095_pilon:209692..235684- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGCGGCCCTTGGTCACCTTTCAGGTCCACTGACCTTTATTGTATACAGGT CAGTGTTCAGGTCCAGCAAAAAGTTCCTGGTTCATAATGGTAGCAAAAGA AGCGCCAAATGTTCATGCATTTCTTTCGAAGCAATATTTGAATCACAATT TTTTTATTTTATGTAGTTCCTGAGCTGTTCTGTATCGCTAATGATTAACA AGAAGGTAAGGGTCATCTCTTAATTTTATTTATTTACTGTCAGCTAGGGT TCCTTTTATACAGTGTAGACCTAAAGCTCTAAAACAGCATCTAATAACAT GAAAACCAGAATATGATTCTTCAATGGGAATCAAAACTATAAAGTGCACT TACAAACATCAATTTGTCAGATCTAACAAAATTAATAACCGCACTGTCAT CATTGACAATAAAACAAACGATTTTCTGTCAAGAGCCTTGTAAACATTCC AACAACTTCCATCGAAATGATCTATCACAGCTCAGTCTACCATTTTTAGC GCGGTCCGAGGATTGAGCCGAGAACGCTCCGCGAACTCCTGCGCGGGTGA AAAACTTCAATCTGTCAATCATTTTCTCAAGCGAAGAGTACGCGAAGCGA TTCTAGCTTTACGATAGTGCCGCGGGTCATCAATGGATAGTATTCAATTA TCATTATCCCTCTATTTTCATTCCTAGAACTTTTGCAAAAAAAAGGAAAA ATAGAAAAGTTGTATTTTTTACTGCTCTATTCACATACTGAATTTGAAAG ATCTTCTATGTGGCGTTTTTTTGCAAACTTCAAAAAACTGATTTTTGTCC CGCCTTTGCAGGACTTTGGCTTAAGTGCTTGAGTGCAGCATAGGGTACAA AGTCCAAACATGCGTTTCCCGTAATTTTTGTGTGAAGAGTTAGGTCTATA CTGTTATAGACCTTTTTTCAAAGAGGCAACCCAGAAACTTTCATGAAAAA 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CTAAAGTTGCAGAATGGGTCAAAGAGCTCACTCTTTTGGCGACGATAGCA TGTTCACAACCACAAGCTGCGTATGTTTCATTCGTAGTTGGATATCGCCA AAAATTCAACTACATATTCCGTACGGTCAAAGACCTCGACGAATACCTGA TACCACTCGAAAACGTCATCAGATTCCACTTGATTCCCGCCTTCTGCGAT GGAAGACAATGCAATGATACTGAACGTCGCTTGATGGCTTTGCCGACGAA ATTCGGGGGACTTGGTATCATAAATGTAATAGAAGAAGCGAAATTCCAAT ACGAAACGAGCCTAAGTGCGACGGCCGAATTACGAGATCGTGTCGTAAAA CAATGTGAAGAGCCCGTTGATTATACAAGCTCGATTTCGATAATCAAATC GAGAAAAAACCAACGACTAAAGGAATATGAGGAAACCCTTCGGGAAATTG AGCCTTCTTTACCATCCATTGAGCGCAAAGCACTGGAAATTGCTCAATGT CCGGGTGCTTCATCGTGGTTGACGACTCTTCCTTTGAGGGAAGAAAATTT CATATTGAACAAGCAAGAATTCTTTGATGCGATTTTCATGCGGTACGGTT GGCAGATGAGGAGACTACCGGTCAAATGTGCATGTCAAGCATCCTTCTCC ATCGAACATGCACTTTCTTGTCACCTCGGTGGTTACGTCATTCATCGTCA CAACAACATCCGTGATGCGTTAGCGATGATGTTGAAAGAAGTTGCACATG ATGTGAAAATTGAACCCGTATTATTGGAACTCACAAGAACTGATAGTGCT GATTTTAAAAAATCAGCTATTTGTGGTAACGAGGCAAGGGCCGATGTTAG TGGTAACGGTTTTTGGACACGGTTTCAGAGAGCATTCTTTGATGTTAAGG TTTCAAACCTTCTAGCTCCGAGTTATCGTGAAAAATCCGTTTCAACTACA TTAGCAAGCTTTGAGAAGCAGAAGAAACGAGCTTATAACCAACGAATCCA GGAAATTGAGAGAGGGACTTTCACACCATTGATTTTTGGTGCTACTGGCG GAACTTCCCGTGAATGTTCGATATTTTTAAATAGACTTTCTGAGAAAATC TCAGAGAAGCAAAATTGCATGAAGAGTGTCGTGATCGCCGGGATTCGACG CAAGATTTCCTTCATCTTGATCCGATCAGTTGTTGCTTGTCTGAGAGGTG AACGTGCGAGTCGCACATTTACCCCAGACCAAGTAGCACTGAAAGATCAA AAGCTGAACGAAGTCTTGTCGTCGTTCCGTGAGTGAGGTTGTGATATTTT CATTTTTATTTATTTATTTAAAGACAATTAACTTTTGTAACACAAAAGAC CCGTGCCGGGACTGGCTCCGGTAATAGTATATACCAGTTTAAGAAAAATT TGACATAATCTAAAAAAAAAGTCTGCGAACGATCCGAACACCATATTCAA AATGAAGACATTGCAACGTCAAAACATTCGAAAGCGCTGGCGATCTCAAT TAAAAAAGAAGACACTGCATTGCCGCGCTTTTCGATGAGCAAAACTTGAA AAAGAAAACAAAAAAATGGACGACAAAAAAATATTTTTTTATAAAAAAGA CGCTATTTTGGTGAAAAAGCGCGTGGTTTTGAAAAGTTCAAATACCCCTG TATCATCTCGGAGAGAGTTATATCGGATCACCCAAAGTTACCTTCATTTT TTTATTTTTCATTTTTTTATTTTTTTATCCACGGATCGCTGATAGTCACC TTTCCGGGGGTTTTGTTGTTTGGAATTGATTAACTAACAGTTAGGTAGGG TCAGGGTTGCTAGTAACGGCTTGTCACTGTGCCGGGTGCATACTCGGCGC CTTGGGCCCCGCAGGGTTGCTAGTAACGGCTCGAATTTCAGTCAGGTTTA AAAAAGGGGTACTTTTACCCATATTATAATAACATTACCCCCGTCTTTTG CCAGTTCGGTATAATATGTTATGAATTGTGTGAATTTGATGTGCGGCGAT GGCTCAATGGATAGAGCGCTGGCTTCCGAATCTGAAGGTCTTTCTTTAGT GGTGGATCGAATCCCGCTCGGGTCGAAAATTAGGTTGGTCGAAAATGATG GACAAATGATTGACAGGTATGAAAACTCAGTCAGAAATGAGAAACTAAGT CTCAGAAACTCAGAAACTCAGACAGTCAGAAAAGAGAAAGACAGGATCAG AGATAAGAAAATAAAAAAAAAACATGAAGGTACTTTGGGTGATCCGATGT AACTCTTTCCCATCTCGGAAGAGAGTAAAGTATTACCTGCGAGCGGAGCT CTAATTTTTGGACCTACCCCGGTGGGGTGGAGGTCCTATAAATTAACCCG TGTTCGTTAGTTCGTTCGTTCGTTAGTTACCAACTTTTCTCGAGATTAGC TCATTCAATTTTTCTGATTTTTTGCACAAAGGTGCATTACTATAAACCCT CGAATGTGACGGAGCCCGATTTTCGAAAAAAAAATTTTTCCGGCCGGTAG AACCGGGAATGTCCCGAAAAAAGCGGTTTTTTGAGATTTTCTCGAGATTT TATCATTAGTTTTTTGCGATTTTTTGCACATAGATGCACATTAGTACTGC CGAAAAGGTGTTTCTTAATTGCTTTCTCCGTTCCAATAGATATATAAATC GAAATTTAAAATTATACATTACTTCCATTAAATTCTAATTATTCGTTTTA TAAATAGGTAGGTCCATTAAAGTATTACTTGTTTCTTTCAAAAGATCGTT CGCGCACTGGTTCCTCGTTCGCGGACTGGGTCCGAATTGCGCGCGCTTTT AACGACTTATTATTCCAAGAAGAAGCCTTCAAATAAAGTGAAAACAAACT 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ATTATCATTTGACATGTAATTATCATTTGTGAACGTTTGCGCTTTTTTAT TTTTTTATTAAATTCTCTTTAACCACCAAAAACAAATTGGTATATATCAG TATATATAACTAAACAATATCCTCTACTTTAGGCTATATAACAAAATTTG CACTTTCGTTTTTGATTAAAAATAAAAGCAACAGTAATATGTGAAATGAT ATTGGGCACTGAAATTTAGGAAGAACGGGATATCCGCTATGCCCTATGAA GGAGAGACCGATCTTGCCAGCGGGGCCTATCCGATGTTCGAGAGCGGTCT TGCCTCCAAATGCCTAAGTGCGGACCCCACAATAGCGGAGTTGATATTTT GTTCGGACCTAGACGGACAGAAGACGAGGATTGAGGATTGAGGATTTTAA GATTGATAACTGCCTCTTGAGAATACATTTACGTCAATGTAGATTTAATG TCAATATTGATTTCGTTTGAAAACGAGGCCTACAAATGCTTTTTATACAT CTCGAGAAGAGTGTTTTGAAAATTTTTAAGAATAACGAGGCTTATTTCGT ACAAATTTTTCAGTCAATGAAAGATCTCAATTTGATCATTTTCTGTTTCA GTACCTTGCCATTGCAAGAAAGGATGCACCAGAGATGGCAAGTGGAAAAA GTGTCCATGTGCCTCGGCCGAAAGAAGTTGCACCAAAAAATGTTTTTGCC GCAACTGTAGCAACAACAAACCTGTGTGTGAGCCTCATGGAAATGGTTGT CGTTGCGAAAAGGGGTGCATCAATATCGATGGTCATCCTAGATCTCGATG TCCATGCTTGCTGTCCGGGGTGAGTTGCAGTAATTGCAAATGCAAAACTT GTAAAAACCCATTCGGGCAAAGAGAAGAACGCGAACGACGTCAAGACAAA AGCCTCGATATTGGGCAAGAAAGTGATGATGAGAGTACCCTTGGTGAGAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000095_pilon:209692..235684-

>MSTRG.12526.2.p1 ID=MSTRG.12526.2.p1|Name=MSTRG.12526.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=7380bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000095_pilon:209692..235684- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GATAGGAAAGGTGATCAGTTTGAAAACGAAAACATTGAAGCAAGTGACCG
AAAAATTATTCACGATGAGATTTGTCAATGATGAATTTTTTATCCCTAAT
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GACGTCAAGACAAAAGCCTCGATATTGGGCAAGAAAGTGATGATGAGAGT
ACCCTTGGACACTGTGTAGTGAGAGCTCAGATGACGATGGCACCAGAATA
GACGAAACATCTCTTAATGATAGTCTCATCATCAACGCGTGTAGTAACAT
CCTCCGAATCCCTATTCTAATTATTCAACCTTTCCAACGATTGTCCTTTC
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TTTCCATTGTTCCGGTGTTTCTACCTGAGGATATGAATAAGGAAGACATG
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TGTCATTGTAAACAACGGTGCAATAAAGAGAACCTAGGCAAGGGTAAACG
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CGTTGTCGTACGGGTTGTCACAGTGGTGATAGTGGCGATGAGAGAAAACG
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TGGACACTGTGTAGTGAGAGCTCAGATGACGATGGCACCAGAATAGACGA
AACATCTCTTAATGATAGTCTCATCATCAACGCGTGTAGTAACATCCTCC
GAATCCCTATTCTAATTATTCAACCTTTCCAACGATTGTCCTTTCACACT
TTACTACCGAAAGATCAGTTGACAGAGACGCCCATCGTTTTAACATACCA
TTCCGCTTCCAAACGTATGTTGGGAACTAAACCTATGGACACACTGGTGG
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ATCATTACAACTGCAAAATTGACGGCAAGAATCACAAATGTAACGTTTCC
ATTGTTCCGGTGTTTCTACCTGAGGATATGAATAAGGAAGACATGTCTCT
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ATGCTCAAGTGCTTTTCAACTTGAGTGCTTTTGGCTTACAATCAGATTCC
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GTCCATGTGTATTAAAAGGCTTAGATTGCAGTGATAAATGTCTTTGTAGA
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TCGTACGGGTTGTCACAGTGGTGATAGTGGCGATGAGAGAAAACGCAAGT
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AATAATACCTTGCCATTGCAAGAAAGGATGCACCAGAGATGGCAAGTGGA
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TGCCGCAACTGTAGCAACAACAAACCTGTGTGTGAGCCTCATGGAAATGG
TTGTCGTTGCGAAAAGGGGTGCATCAATATCGATGGTCATCCTAGATCTC
GATGTCCATGCTTGCTGTCCGGGGTGAGTTGCAGTAATTGCAAATGCAAA
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ATTCTCGAAAAAGCACTCACTCAAATTCAAATCGTTATCAAAACAGTAAA
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CGGGTTGTCACAGTGGTGATAGTGGCGATGAGAGAAAACGCAAGTCTAAA
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GCACGATGTGGATACTTCAAATACACTCCTTGTATGACACTGAAAAGATA
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CAGTTTGAAAACGAAAACATTGAAGCAAGTGACCGAAAAATTATTCACGA
TGAGATTTGTCAATGATGAATTTTTTATCCCTAATCATGACTCTCAATAA
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TGTCCATGTGCCTCGGCCGAAAGAAGTTGCACCAAAAAATGTTTTTGCCG
CAACTGTAGCAACAACAAACCTGTGTGTGAGCCTCATGGAAATGGTTGTC
GTTGCGAAAAGGGGTGCATCAATATCGATGGTCATCCTAGATCTCGATGT
CCATGCTTGCTGTCCGGGGTGAGTTGCAGTAATTGCAAATGCAAAACTTG
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GCCTCGATATTGGGCAAGAAAGTGATGATGAGAGTACCCTTGGACACTGT
GTAGTGAGAGCTCAGATGACGATGGCACCAGAATAGACGAAACATCTCTT
AATGATAGTCTCATCATCAACGCGTGTAGTAACATCCTCCGAATCCCTAT
TCTAATTATTCAACCTTTCCAACGATTGTCCTTTCACACTTTACTACCGA
AAGATCAGTTGACAGAGACGCCCATCGTTTTAACATACCATTCCGCTTCC
AAACGTATGTTGGGAACTAAACCTATGGACACACTGGTGGTTGAAACGAA
AAAGACGAGCAAAGACAAAAGCCTCGATATTGGGCAAGAAAGTGATGATG
AGAGTACCCCTGATGGAAGCTATTATTACACTTTTGATTTATCATTACAA
CTGCAAAATTGACGGCAAGAATCACAAATGTAACGTTTCCATTGTTCCGG
TGTTTCTACCTGAGGATATGAATAAGGAAGACATGTCTCTGCTCATTTCT
CATCCTTCAATTGCCATTACTGACGATGAAGAGGAGAGAAAAAGTATTCT
CGAAAAAGCACTCACTCAAATTCAAATCGTTATCAAAACAGTAAAATCGA
TTCAAAACGTTTGTAAGCTGCGCTTATCAGCTGAGGAGGTTTTGTCCAAT
AGTTCACCAGGAGAACTGCCAGATCACGAGGATAGCCATGATGCTCAAGT
GCTTTTCAACTTGAGTGCTTTTGGCTTACAATCAGATTCCTTGGAAGAGC
ATTGTGCTTTCAAAGTTGTACTTTTGCAGTTGTATCAGTTCGTCAATTTT
GGAACAGAAGGCGTTTTGGTGGAACATTTCAAAAATATTGGTTTGGCTGG
TGAGGTGGAGCAGGATTCAACTTATTTAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12526MSTRG.12526Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12526.2.p1MSTRG.12526.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12526.2.p1.exon5MSTRG.12526.2.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12526.2.p1.exon4MSTRG.12526.2.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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