MSTRG.12526.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12526.1.p1
Unique NameMSTRG.12526.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000095_pilon:209692..235684-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12526.1.p1 ID=MSTRG.12526.1.p1|Name=MSTRG.12526.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=25993bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000095_pilon:209692..235684- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGCGGCCCTTGGTCACCTTTCAGGTCCACTGACCTTTATTGTATACAGGT CAGTGTTCAGGTCCAGCAAAAAGTTCCTGGTTCATAATGGTAGCAAAAGA AGCGCCAAATGTTCATGCATTTCTTTCGAAGCAATATTTGAATCACAATT TTTTTATTTTATGTAGTTCCTGAGCTGTTCTGTATCGCTAATGATTAACA AGAAGGTAAGGGTCATCTCTTAATTTTATTTATTTACTGTCAGCTAGGGT TCCTTTTATACAGTGTAGACCTAAAGCTCTAAAACAGCATCTAATAACAT GAAAACCAGAATATGATTCTTCAATGGGAATCAAAACTATAAAGTGCACT TACAAACATCAATTTGTCAGATCTAACAAAATTAATAACCGCACTGTCAT CATTGACAATAAAACAAACGATTTTCTGTCAAGAGCCTTGTAAACATTCC AACAACTTCCATCGAAATGATCTATCACAGCTCAGTCTACCATTTTTAGC GCGGTCCGAGGATTGAGCCGAGAACGCTCCGCGAACTCCTGCGCGGGTGA AAAACTTCAATCTGTCAATCATTTTCTCAAGCGAAGAGTACGCGAAGCGA TTCTAGCTTTACGATAGTGCCGCGGGTCATCAATGGATAGTATTCAATTA TCATTATCCCTCTATTTTCATTCCTAGAACTTTTGCAAAAAAAAGGAAAA ATAGAAAAGTTGTATTTTTTACTGCTCTATTCACATACTGAATTTGAAAG ATCTTCTATGTGGCGTTTTTTTGCAAACTTCAAAAAACTGATTTTTGTCC CGCCTTTGCAGGACTTTGGCTTAAGTGCTTGAGTGCAGCATAGGGTACAA AGTCCAAACATGCGTTTCCCGTAATTTTTGTGTGAAGAGTTAGGTCTATA CTGTTATAGACCTTTTTTCAAAGAGGCAACCCAGAAACTTTCATGAAAAA 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AAAAAGGGGTACTTTTACCCATATTATAATAACATTACCCCCGTCTTTTG CCAGTTCGGTATAATATGTTATGAATTGTGTGAATTTGATGTGCGGCGAT GGCTCAATGGATAGAGCGCTGGCTTCCGAATCTGAAGGTCTTTCTTTAGT GGTGGATCGAATCCCGCTCGGGTCGAAAATTAGGTTGGTCGAAAATGATG GACAAATGATTGACAGGTATGAAAACTCAGTCAGAAATGAGAAACTAAGT CTCAGAAACTCAGAAACTCAGACAGTCAGAAAAGAGAAAGACAGGATCAG AGATAAGAAAATAAAAAAAAAACATGAAGGTACTTTGGGTGATCCGATGT AACTCTTTCCCATCTCGGAAGAGAGTAAAGTATTACCTGCGAGCGGAGCT CTAATTTTTGGACCTACCCCGGTGGGGTGGAGGTCCTATAAATTAACCCG TGTTCGTTAGTTCGTTCGTTCGTTAGTTACCAACTTTTCTCGAGATTAGC TCATTCAATTTTTCTGATTTTTTGCACAAAGGTGCATTACTATAAACCCT CGAATGTGACGGAGCCCGATTTTCGAAAAAAAAATTTTTCCGGCCGGTAG AACCGGGAATGTCCCGAAAAAAGCGGTTTTTTGAGATTTTCTCGAGATTT TATCATTAGTTTTTTGCGATTTTTTGCACATAGATGCACATTAGTACTGC CGAAAAGGTGTTTCTTAATTGCTTTCTCCGTTCCAATAGATATATAAATC GAAATTTAAAATTATACATTACTTCCATTAAATTCTAATTATTCGTTTTA TAAATAGGTAGGTCCATTAAAGTATTACTTGTTTCTTTCAAAAGATCGTT CGCGCACTGGTTCCTCGTTCGCGGACTGGGTCCGAATTGCGCGCGCTTTT AACGACTTATTATTCCAAGAAGAAGCCTTCAAATAAAGTGAAAACAAACT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000095_pilon:209692..235684-

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ATTTGCTAATGAAAGATGTCAAATCAAACCCAAAAAATCCGCGCTACATG
GAAGAGTTTCTGTACAATGAAAACGAATGCAAAACACCAATTCATGTCTT
TCTTTGGAATCCTATAGAAACATTTGGAGTAAAGATTAGTTGCTTGAAGC
ACAATAGTGTATTGAAAGGAGCTGACTGGACATCAAATACTTTGGATAAT
AAAGGACGTAGCCCCAGATTGATTTACTGTGTATTTTACAACGTTCTTCT
CATCCAGCGATATTATAGATGTGGACACTTAGGGAAGGATCAATGTATAC
TTGGATCAAGTACACTTAGTTTTATGGAGCTTTTGAATGAAGAATTGTTC
AAAAAATTTCCTTACAAAATGTATCATCAATCTGCCTACTCATTCAAGTT
TATTAATTTCGTGTTTGAGATGCTTGCTGGTGGAAACAATTTTAAAGCAA
TCAGTCAGACTGTCGCTAACCTGAAAGCAACACACTTTGGTCCATTAAAT
GGTTTGAATGATTTAATGATGAGCTTTCCAGCTTCTGGTCGTATAGAGAC
TTTGTTTTTAGATATCTTTCAAACAAGAAAGCATCATTATAAACTTGCGT
TGGAGAGAATAATACCAGAGAAAGTTATTTCGTTTGACCAGAGCTTCAAA
CTCCCTCAAAACATTGGTGGGAAAAGAAAAGCTGATGGGAAAATATTTAT
TGAACAAAAGAGACTCTTCCTTGCTCTTGATGAGAATCAAAAGATTGTTA
CATGGAAAATGGTCAAGTCTGACTCACTTGATGAAGCACACGATATTTTA
ACAGACCTGAAAGAAAGGTGCAAGAATATCTTCACAGTGGTTACTGGCAA
TTGTTGCAGAGATAGGAGTACCTATCAACATTATTTTGGTTATGTTTCGG
TAAAATTAGATCCTCGACAAGCTGCTCATCGTTTAAAGGAAATAGCTTCT
ATTACCAAAGTCACTCCAAACAGTTCGAAATTCATCAGTGGTTTGAAATA
TTTGTTTCGTGAGGATGGAGACGTTGATGCTGTTCGAAAGAAACCAATCC
CAGATAGAGAAACCATTCACGGGAATATTGATCAATTCTTAGAAATAAAT
TCTAATTTCATATCAAGTCTGTCAAAGGGTGAGGAATTTGAAGCAGAAAT
TGTAATACTCAAGACACATGTTGAGCAGGACTGTTTATCAGGTTTAGATG
TTGGTCAAAGCACAGAAGGAATTGAAGTTCTGCATAAGATGCTGGAAAAA
AGCTGTCTCAGAGCGAAATGTCATTGTAAACAACGGTGCAATAAAGAGAA
CCTAGGCAAGGGTAAACGACAATGTCCATGTGTATTAAAAGGCTTAGATT
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CGGAATCCTGATGGATGTCGTTGTCGTACGGGTTGTCACAGTGGTGATAG
TGGCGATGAGAGAAAACGCAAGTCTAAATGTCCTTGCTTGAAGTTGGCAA
TAAGTTGTGAAAACTGTTCGTGTACGAATTGTAAGAATCCTCACGGCGCA
CGCGTCGTAGTATTAGACTCAGGTAATAAAAAACGACAAATACGAAATCG
AAATTCACATACAACTTATAAGAAAGTAAGAACCGAAGATTATCTTGCTA
CTTTGTCAAACATAACACCTTGTGCATCGTTAGGTCAAGGTTCGTGGGAT
TTGGAAGAGATTGCTTGTTTGTATGTAAGCACGATGTGGATACTTCAAAT
ACACTCCTTGTATGACACTGAAAAGATACACGAACTTTATCATTTCTTCT
TGAATGAAGAATCGATAGGAAAGGTGATCAGTTTGAAAACGAAAACATTG
AAGCAAGTGACCGAAAAATTATTCACGATGAGATTTGTCAATGATGAATT
TTTTATCCCTAATCATGACTCTCAATAATACCTTGCCATTGCAAGAAAGG
ATGCACCAGAGATGGCAAGTGGAAAAAGTGTCCATGTGCCTCGGCCGAAA
GAAGTTGCACCAAAAAATGTTTTTGCCGCAACTGTAGCAACAACAAACCT
GTGTGTGAGCCTCATGGAAATGGTTGTCGTTGCGAAAAGGGGTGCATCAA
TATCGATGGTCATCCTAGATCTCGATGTCCATGCTTGCTGTCCGGGGTGA
GTTGCAGTAATTGCAAATGCAAAACTTGTAAAAACCCATTCGGGCAAAGA
GAAGAACGCGAACGACGTCAAGACAAAAGCCTCGATATTGGGCAAGAAAG
TGATGATGAGAGTACCCTTGGACACTGTGTAGTGAGAGCTCAGATGACGA
TGGCACCAGAATAGACGAAACATCTCTTAATGATAGTCTCATCATCAACG
CGTGTAGTAACATCCTCCGAATCCCTATTCTAATTATTCAACCTTTCCAA
CGATTGTCCTTTCACACTTTACTACCGAAAGATCAGTTGACAGAGACGCC
CATCGTTTTAACATACCATTCCGCTTCCAAACGTATGTTGGGAACTAAAC
CTATGGACACACTGGTGGTTGAAACGAAAAAGACGAGCAAAGACAAAAGC
CTCGATATTGGGCAAGAAAGTGATGATGAGAGTACCCCTGATGCATCGGT
GGTCAGTCCTGAACTCATGGAAGCTATTATTACACTTTTGATTTATCATT
ACAACTGCAAAATTGACGGCAAGAATCACAAATGTAACGTTTCCATTGTT
CCGGTGTTTCTACCTGAGGATATGAATAAGGAAGACATGTCTCTGCTCAT
TTCTCATCCTTCAATTGCCATTACTGACGATGAAGAGGAGAGAAAAAGTA
TTCTCGAAAAAGCACTCACTCAAATTCAAATCGTTATCAAAACAGTAAAA
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CAATAGTTCACCAGGAGAACTGCCAGATCACGAGGATAGCCATGATGCTC
AAGTGCTTTTCAACTTGAGTGCTTTTGGCTTACAATCAGATTCCTTGGAA
GAGCATTGTGCTTTCAAAGTTGTACTTTTGCAGTTGTATCAGTTCGTCAA
TTTTGGAACAGAAGGCGTTTTGGTGGAACATTTCAAAAATATTGGTTTGG
CTGGTGAGGTGGAGCAGGATTCAACTTATTTAAGATGGTTGTTCTTGGGA
AAGAATATCAAGAATCAATAGATTTGCTAATGAAAGATGTCAAATCAAAC
CCAAAAAATCCGCGCTACATGGAAGAGTTTCTGTACAATGAAAACGAATG
CAAAACACCAATTCATGTCTTTCTTTGGAATCCTATAGAAACATTTGGAG
TAAAGATTAGTTGCTTGAAGCACAATAGTGTATTGAAAGGAGCTGACTGG
ACATCAAATACTTTGGATAATAAAGGACGTAGCCCCAGATTGATTTACTG
TGTATTTTACAACGTTCTTCTCATCCAGCGATATTATAGATGTGGACACT
TAGGGAAGGATCAATGTATACTTGGATCAAGTACACTTAGTTTTATGGAG
CTTTTGAATGAAGAATTGTTCAAAAAATTTCCTTACAAAATGTATCATCA
ATCTGCCTACTCATTCAAGTTTATTAATTTCGTGTTTGAGATGCTTGCTG
GTGGAAACAATTTTAAAGCAATCAGTCAGACTGTCGCTAACCTGAAAGCA
ACACACTTTGGTCCATTAAATGGTTTGAATGATTTAATGATGAGCTTTCC
AGCTTCTGGTCGTATAGAGACTTTGTTTTTAGATATCTTTCAAACAAGAA
AGCATCATTATAAACTTGCGTTGGAGAGAATAATACCAGAGAAAGTTATT
TCGTTTGACCAGAGCTTCAAACTCCCTCAAAACATTGGTGGGAAAAGAAA
AGCTGATGGGAAAATATTTATTGAACAAAAGAGACTCTTCCTTGCTCTTG
ATGAGAATCAAAAGATTGTTACATGGAAAATGGTCAAGTCTGACTCACTT
GATGAAGCACACGATATTTTAACAGACCTGAAAGAAAGGTGCAAGAATAT
CTTCACAGTGGTTACTGGCAATTGTTGCAGAGATAGGAGTACCTATCAAC
ATTATTTTGGTTATGTTTCGGTAAAATTAGATCCTCGACAAGCTGCTCAT
CGTTTAAAGGAAATAGCTTCTATTACCAAAGTCACTCCAAACAGTTCGAA
ATTCATCAGTGGTTTGAAATATTTGTTTCGTGAGGATGGAGACGTTGATG
CTGTTCGAAAGAAACCAATCCCAGATAGAGAAACCATTCACGGGAATATT
GATCAATTCTTAGAAATAAATTCTAATTTCATATCAAGTCTGTCAAAGGG
TGAGGAATTTGAAGCAGAAATTGTAATACTCAAGACACATGTTGAGCAGG
ACTGTTTATCAGGTTTAGATGTTGGTCAAAGCACAGAAGGAATTGAAGTT
CTGCATAAGATGCTGGAAAAAAGCTGTCTCAGAGCGAAATGTCATTGTAA
ACAACGGTGCAATAAAGAGAACCTAGGCAAGGGTAAACGACAATGTCCAT
GTGTATTAAAAGGCTTAGATTGCAGTGATAAATGTCTTTGTAGAGAATGC
CAAAACAACAAGAAAATCAAACGGAATCCTGATGGATGTCGTTGTCGTAC
GGGTTGTCACAGTGGTGATAGTGGCGATGAGAGAAAACGCAAGTCTAAAT
GTCCTTGCTTGAAGTTGGCAATAAGTTGTGAAAACTGTTCGTGTACGAAT
TGTAAGAATCCTCACGGCGCACGCGTCGTAGTATTAGACTCAGGTAATAA
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GAACCGAAGATTATCTTGCTACTTTGTCAAACATAACACCTTGTGCATCG
TTAGGTCAAGGTTCGTGGGATTTGGAAGAGATTGCTTGTTTGTATGTAAG
CACGATGTGGATACTTCAAATACACTCCTTGTATGACACTGAAAAGATAC
ACGAACTTTATCATTTCTTCTTGAATGAAGAATCGATAGGAAAGGTGATC
AGTTTGAAAACGAAAACATTGAAGCAAGTGACCGAAAAATTATTCACGAT
GAGATTTGTCAATGATGAATTTTTTATCCCTAATCATGACTCTCAATAAT
ACCTTGCCATTGCAAGAAAGGATGCACCAGAGATGGCAAGTGGAAAAAGT
GTCCATGTGCCTCGGCCGAAAGAAGTTGCACCAAAAAATGTTTTTGCCGC
AACTGTAGCAACAACAAACCTGTGTGTGAGCCTCATGGAAATGGTTGTCG
TTGCGAAAAGGGGTGCATCAATATCGATGGTCATCCTAGATCTCGATGTC
CATGCTTGCTGTCCGGGGTGAGTTGCAGTAATTGCAAATGCAAAACTTGT
AAAAACCCATTCGGGCAAAGAGAAGAACGCGAACGACGTCAAGACAAAAG
CCTCGATATTGGGCAAGAAAGTGATGATGAGAGTACCCTTGGACACTGTG
TAGTGAGAGCTCAGATGACGATGGCACCAGAATAGACGAAACATCTCTTA
ATGATAGTCTCATCATCAACGCGTGTAGTAACATCCTCCGAATCCCTATT
CTAATTATTCAACCTTTCCAACGATTGTCCTTTCACACTTTACTACCGAA
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AAGACGAGCAAAGACAAAAGCCTCGATATTGGGCAAGAAAGTGATGATGA
GAGTACCCCTGATGCATCGGTGGTCAGTCCTGAACTCATGGAAGCTATTA
TTACACTTTTGATTTATCATTACAACTGCAAAATTGACGGCAAGAATCAC
AAATGTAACGTTTCCATTGTTCCGGTGTTTCTACCTGAGGATATGAATAA
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ATGAAGAGGAGAGAAAAAGTATTCTCGAAAAAGCACTCACTCAAATTCAA
ATCGTTATCAAAACAGTAAAATCGATTCAAAACGTTTGTAAGCTGCGCTT
ATCAGCTGAGGAGGTTTTGTCCAATAGTTCACCAGGAGAACTGCCAGATC
ACGAGGATAGCCATGATGCTCAAGTGCTTTTCAACTTGAGTGCTTTTGGC
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GCAGTTGTATCAGTTCGTCAATTTTGGAACAGAAGGCGTTTTGGTGGAAC
ATTTCAAAAATATTGGTTTGGCTGGTGAGGTGGAGCAGGATTCAACTTAT
TTAAGATGGTTGTTCTTGGGAAAGAATATCAAGAATCAATAGATTTGCTA
ATGAAAGATGTCAAATCAAACCCAAAAAATCCGCGCTACATGGAAGAGTT
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GTATTGAAAGGAGCTGACTGGACATCAAATACTTTGGATAATAAAGGACG
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GATCCTCGACAAGCTGCTCATCGTTTAAAGGAAATAGCTTCTATTACCAA
AGTCACTCCAAACAGTTCGAAATTCATCAGTGGTTTGAAATATTTGTTTC
GTGAGGATGGAGACGTTGATGCTGTTCGAAAGAAACCAATCCCAGATAGA
GAAACCATTCACGGGAATATTGATCAATTCTTAGAAATAAATTCTAATTT
CATATCAAGTCTGTCAAAGGGTGAGGAATTTGAAGCAGAAATTGTAATAC
TCAAGACACATGTTGAGCAGGACTGTTTATCAGGTTTAGATGTTGGTCAA
AGCACAGAAGGAATTGAAGTTCTGCATAAGATGCTGGAAAAAAGCTGTCT
CAGAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12526MSTRG.12526Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12526.1.p1MSTRG.12526.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12526.1.p1.exon6MSTRG.12526.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12526.1.p1.exon5MSTRG.12526.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12526.1.p1.exon4MSTRG.12526.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12526.1.p1.exon3MSTRG.12526.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12526.1.p1.exon2MSTRG.12526.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12526.1.p1.exon1MSTRG.12526.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000095_pilongenomesc0000095_pilon:209692..235684 -