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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000094_pilon:1135386..1147887+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12494.2.p1 ID=MSTRG.12494.2.p1|Name=MSTRG.12494.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12502bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000094_pilon:1135386..1147887+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
cagtgcatctctagtttttccgacccttacagtgcatttgaggtgccttg
aaaaagacacccttagtgcccgcacatacccgtcggtccttttgcccagc
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GTGTTTTTAATATATTAGAAAGAAACACCCACACTTATCAGTTtaatttt
aaagggataatcagatgttTTGAGATAGTTGGCCTGCAGAAAGATTATGT
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GAAAAATATTCAATGGCTATCGCCAAAAGAATTGCGAGTAGGGAATTTCG
AAGAGACCAATTGGATCGACTGATCTTTTCAATTAAGGTGtttttttCCC
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GAGTTTTCTTTTCAGTGATCTAACTtagaggttttatttttacacaagtg
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GCCCAGACCACCCTGGTGTCGCAATCAGCCAATCAGAGTTGAGTAAAGAC
GATACAGAGAAATCGAAGTATGCTTTTGTCGGAATGGCTTTTGAAGGGAA
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CGAAAAAGTAAGTTTATGGTTTCCAAATACTTTTTATTCTAAACTAGAAA
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TCTACGTCGTCCCTTACATATAATAGAATAATACAGGGTAATCTTGTTTT
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AATAAAGCCTGGCCTTTTATGcttttaagattttattttgacttgAAATC
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GCATATCAGATGACtttttttGCTGACAAATATGATTTTCGACCTTTTTT
GTTTATACTTGGAGCGACTTGGAGTTAGCTTTAAATTCATAGTCCAGCCA
GTACAAGCGTATTTAGacttatttcactttttgacaTGGAGAGAAGAAGC
TTTTAGTAGAAATTACTTGCATCCGTCCATATGttttaatgaaataattt
ttgctaaaacagaacttttgattgcTTTCTCGATATCAAAAATCGAAAGA
ATACacgttctttataagaactatcAAATTATTTATTCGTGATTTtacag
gcttaaatgttctggatatttttttaatatgcttactttaaaataaatta
aagttATGATCtaagatttttccaaatttgtcaTGTCACGAGATGCGAGG
TTGATTTCTCCGAAAATGTTCCAAGCGCTGTACCTCATCGGAAAATTTCT
GCGAAACATCGATTTTTGGTCTTGAAAAGGTCATTTCTTGGCATCGGAAG
GTGGAAACTTGACAGATAACCTCATTTCCTTGATCTACTTTTCGCACTGA
ATGCATTGGTAGCATCGAATCTTTAATTTCAGTCTTTGAAAAGAATCGCT
TGCAAAGGGTCCCTGATAAATTCTGACGGTCTATCGATTTACTTGAAAAA
TGCAAAGGAAAACCGAGAGGCAAATTGTAGGTGTAGCACCTTGTTAGTTG
CAAAAACTTGTCCAGATCTAAGGAATGGCCCtacaaaaacctgttttaag
gtcTCTTTGCCTAGTAGGGTTCTTTTGTGACATTTTCTGactttaaaatt
atataaattatacTTCTCCCATTTCTTTGCAAGCCTGATAGCCTTTTTGT
GGATATTCATTCTAGATAAtgtgtgatttgtccttttgttttgtgggttt
tgttttgtgggtttccatttgAATAGTTGAAGGCTTCATATTTCTAGACT
ATTATATATATCCTTTCATAGGATGTCTCTGTATCTCAATCTTGGTGACA
TTGATTCTACTACTGGTCAGTATCTTCATGTGGCAATACTTCTTCCCTGG
ATCGAAATTCCGCTACTGGAAATGCAGCCTTGGTCGTGCGGAACCGGCCG
GTGATGTATCCTTCCGCTTTGTGTCATTCAAAGACCTAAGTAAGGTAAAA
TCAAAGCTCGAATCAGtagaacacccctgtgtcacagacccactgggacc
ccagcccactggaaaatttagcaaaaattccGTCCCCGGTGGGATTAATT
TCATCCTCACTTTAagttcaatgtttaaaaattgcactccaaaaccatcc
caactggattttttctccattgggatttcaaaaggaatttttattcccat
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cacattttttttataaaatgggTCAGCCCTTGGGTTGCTTAGCATTTTAG
CTCGTTGTCTaaaaaaaTTGCTTCAACCACTCCtgatattatactatatt
tatGCTCATTAGGTCACGGGCTATCGTTTGTCATGGTTAGATAATCTAAA
AAGCTTGTACCTCACGagaggtaaaaaaaaaatgtctaattTCAAGACTC
GAGCCTTTTCAACTTAGTCgcttaaaaaaaagtgtacaccCTTTAAAATA
CAGTGGATGCAACCCGCAACCCTTCCCTCCAGAAAACCCTTTAATAGCTG
TTCTATATAAGATCTACATAGTTGATTGGCTAATTTTCTAACTGCTCTTA
CTCGAATTTCTTAATGGAGCACGGCGAATTTTTGGGAGAATTTCTGAtct
gaaaacttaacctctctAATTCTTTAAGTATGGAGTTTATTTAATGATGC
TTTAAACGAAATTATGGCTTGCGGTTAAACCACAATTTTGAAGGTACTAT
TCCTGTATGAACAATTTTCTCATGAAGTGAACTTGACAGAATTACTTGAA
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ATAGTTACCCTTTTGGAAAACAATTAATTATGTGGTTATTAAATATGaca
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TTAGTGGTACCTTGATAATTATATTTTGTTTAATTGCAGTGGAAACATTG
TACATTTCTAGCATACAGGGGTATCAACCCAGCTCTACCAGGGTGTTATT
TAGCTATTTTTCCAGGGTGTCGTCACTAATAATTAACAAGAAAAGCATTT
ACGGCCTAACCAATTGAGCCAAATCTACGCGgccaaaaagaaatttcttt
gttcttaatCGTATATTGTATATATTCCCTCTAAAATGCTAGTGGCCCCT
AAATAGAAGCTTTGTTCTAAACTAATTATTCTGttctatattttcatttt
aaatgaaagttTTCTGATGGGTTTTAAAGATAAAACGATGTTAAAATCAC
TTATCACATTCTATATTTCAGTACGTATCCGTGCATGGCATAAGATTCGA
ATATTTCGAACTGTTAGATAAAATGGATCTGCAACATTACGAGCCACTTA
ATCTAAATGATACATGTAAGTGTAAATTTATATATTTGTACATCCCATGG
CTGGGTAGCTAAGtgggtagagcattcgccttacaatccgagggttgtgg
gttcgatccccggtcaccacAAACTCAGTGAAAGAGTAAAGCTTAAATTG
GGTGATATGATCTAGGTGATAATGAGAGTAGGTTTGgcactccacctcag
cattcgatttCACTTTACAACGGAAAATCATCAACACTCTGGGTAGATAC
AAAAGCAGCTTCAACTTATTAGGCGGTCAGTGTCAGGGCCGTTTTGACta
caaaaatgttatttttgttggTGAGCACGTGGAAAGCAGTGAGAAGATCC
CGGGAATGCGCCAAGAATACTTCCCCGGGAACGAGAAGGTTTAGCCTTGA
TCATCATGTGGCAATCTcataaaaattccttttgaaattCGATTTCGGTT
TCTTAAACTGCTAAGTCACGCATAGAATAGAATGGGTTCATGCTTTTAAG
CATATCTGACTGGAGACTGactattttcttaaatttttttttgacatttt
catcaaaacaacCCACGGTTCTGGCCGGAAAATTCGAGGTCGGTGAATAT
GCTGAAATACCGTCTTCCACAGTCAGTCAGGATATAGGAAAGTCAAAAGT
CAGCTATCTCTGTCGCAGCAATACATGAACCCGCTTTTGTCTGCACAGTG
gaatctccataacttgaacacgcTATGTgaacaaaattttcttcgagttt
CAGAGAACTTTTTGATCAGATTTTTCCCAAAGAAATTGTGTTTGAGTTTG
GAGAATTTACATAATAATACACAATTATATTTACAAACGCTTTCTTCCAG
CTACTAGATATTACCTGAACATTGATCGTTGTGCGCATGGTGGTATCCGA
CGGACTCCTGACACATCGCGCGGTCTGAAAGTGGTAGCGGGTCCAAATAT
CTTTGCGGTAGACGGGGGTTGCAGATATGTTTATTTCTTCAACGACAATT
TgggaaaatggagaaaatatttGACGGCAGACGTTTTGAAATGCAACCAC
GGTGACTGAaacaactttggaaatataagTATTTTCATTATCATTAACTT
TTGACTATCGAGAGCCGCTAAAATGCCTCAACTTTCGTTTGATTTGAAGA
CCCTGTAAATATAATACTATAACAGGGTTTGCATTGTTCACGCTGCGAAC
CTCAACTTCCATATACGGTATTAACAAACCTTTAGAAAACTGTGGAAAGT
ACTGGgctatatatgtgaagaaacaAGAATTTCTGttcaactatattcac
tcagaaGATTtcggtggcagagcagcatatgcattttgTCCTTATATATA
ATACACTTTCGTGATATAATGGTCAGTACGGAGTGATTCTGATGTATTAG
TACATCCCTAGAATCACTCTTCTTACCGTTACGGCTTTCCTACTAATATT
AGCCAACTGGATCGCAAAAGTCTGTTCTAGTGAATAAAAATAGGATATCT
GTGATCGacattagcctatttcatagaatTCGTGTTTTGAGTAAATTATA
TTTCTCTACGTTACTGCATTAGTgatcaactttttattttcagtacTGTT
ACTCCTTTATGAAttgaaattaaaggttttgcAAAGACAGCAACAATAGA
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tagactaaatatgttgaataatgtacaaaatgtgaaacatttgataactt
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ccccccccgcacgagaagctcaaagtatacttctctttagcattgtccat
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gtacgcagagaacaatagaaatgactttgtttaaacaatagatgtacgct
ttgctgaaccccctctccccccttcactgtgtacgtactaatggatggcc
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gggcagcggtgtagcaattaatttcaactgggaatcctctcttctgtgcc
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tttccactgtcgacctctgcacactctgtgtttaaaagttttcaaatcga
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tttttgcgattcgcctttatcacaaacacgtccaagtccaaaaaagcacg
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taaactttatcaaatcccaataacattataacaccatcaattcccctaga
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agaatgtagaaaaagaatccccttgatgaaaatcatgtgtttgatttgcc
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gtaccaaaaaagttaacccgatcggaagaaagtttagaaatcaaagtgag
at Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000094_pilon:1135386..1147887+ >MSTRG.12494.2.p1 ID=MSTRG.12494.2.p1|Name=MSTRG.12494.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5058bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000094_pilon:1135386..1147887+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAACCGCGAAATGCAGATACCTCAACAGAAACAATATGTTTGATGGG
TGTGGTTCCAGTCAAAGTGATTGGTAAAGTTCAACCACGTGATGCTCTTT
ACTCGTGCCCAGACCACCCTGGTGTCGCAATCAGCCAATCAGAGTTGAGT
AAAGACGATACAGAGAAATCGAAGTATGCTTTTGTCGGAATGGCTTTTGA
AGGGAAACCTTTAAATGATTCTAAAACTATTTGTTTTGTGATGACAATTA
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TCGATGAATGCACAATATCATCAACGAATCGAACACGTTAAGAAAAGTGG
GAAAAACTTCCGAAAAAGATGTCTCTGTATCTCAATCTTGGTGACATTGA
TTCTACTACTGGTCAGTATCTTCATGTGGCAATACTTCTTCCCTGGATCG
AAATTCCGCTACTGGAAATGCAGCCTTGGTCGTGCGGAACCGGCCGGTGA
TGTATCCTTCCGCTTTGTGTCATTCAAAGACCTAAGTAAGTACGTATCCG
TGCATGGCATAAGATTCGAATATTTCGAACTGTTAGATAAAATGGATCTG
CAACATTACGAGCCACTTAATCTAAATGATACATCTACTAGATATTACCT
GAACATTGATCGTTGTGCGCATGGTGGTATCCGACGGACTCCTGACACAT
CGCGCGGTCTGAAAGTGGTAGCGGGTCCAAATATCTTTGCGGTAGACGGG
GGTTGCAGATATGTTTATTTCTTCAACGACAATTTgggaaaatggagaaa
atatttGACGGCAGACGTTTTGAAATGCAACCACGGTGACTGAATGAAAC
CGCGAAATGCAGATACCTCAACAGAAACAATATGTTTGATGGGTGTGGTT
CCAGTCAAAGTGATTGGTAAAGTTCAACCACGTGATGCTCTTTACTCGTG
CCCAGACCACCCTGGTGTCGCAATCAGCCAATCAGAGTTGAGTAAAGACG
ATACAGAGAAATCGAAGTATGCTTTTGTCGGAATGGCTTTTGAAGGGAAA
CCTTTAAATGATTCTAAAACTATTTGTTTTGTGATGACAATTATATCGAT
GAACCAATCGATAACTCAGCGAATGTTCAACGAACGATTGGAATCGATGA
ATGCACAATATCATCAACGAATCGAACACGTTAAGAAAAGTGGGAAAAAC
TTCCGAAAAAGATGTCTCTGTATCTCAATCTTGGTGACATTGATTCTACT
ACTGGTCAGTATCTTCATGTGGCAATACTTCTTCCCTGGATCGAAATTCC
GCTACTGGAAATGCAGCCTTGGTCGTGCGGAACCGGCCGGTGATGTATCC
TTCCGCTTTGTGTCATTCAAAGACCTAAGTAAGTACGTATCCGTGCATGG
CATAAGATTCGAATATTTCGAACTGTTAGATAAAATGGATCTGCAACATT
ACGAGCCACTTAATCTAAATGATACATCTACTAGATATTACCTGAACATT
GATCGTTGTGCGCATGGTGGTATCCGACGGACTCCTGACACATCGCGCGG
TCTGAAAGTGGTAGCGGGTCCAAATATCTTTGCGGTAGACGGGGGTTGCA
GATATGTTTATTTCTTCAACGACAATTTgggaaaatggagaaaatatttG
ACGGCAGACGTTTTGAAATGCAACCACGGTGACTGAATGAAACCGCGAAA
TGCAGATACCTCAACAGAAACAATATGTTTGATGGGTGTGGTTCCAGTCA
AAGTGATTGGTAAAGTTCAACCACGTGATGCTCTTTACTCGTGCCCAGAC
CACCCTGGTGTCGCAATCAGCCAATCAGAGTTGAGTAAAGACGATACAGA
GAAATCGAAGTATGCTTTTGTCGGAATGGCTTTTGAAGGGAAACCTTTAA
ATGATTCTAAAACTATTTGTTTTGTGATGACAATTATATCGATGAACCAA
TCGATAACTCAGCGAATGTTCAACGAACGATTGGAATCGATGAATGCACA
ATATCATCAACGAATCGAACACGTTAAGAAAAGTGGGAAAAACTTCCGAA
AAAGATGTCTCTGTATCTCAATCTTGGTGACATTGATTCTACTACTGGTC
AGTATCTTCATGTGGCAATACTTCTTCCCTGGATCGAAATTCCGCTACTG
GAAATGCAGCCTTGGTCGTGCGGAACCGGCCGGTGATGTATCCTTCCGCT
TTGTGTCATTCAAAGACCTAAGTAAGTACGTATCCGTGCATGGCATAAGA
TTCGAATATTTCGAACTGTTAGATAAAATGGATCTGCAACATTACGAGCC
ACTTAATCTAAATGATACATCTACTAGATATTACCTGAACATTGATCGTT
GTGCGCATGGTGGTATCCGACGGACTCCTGACACATCGCGCGGTCTGAAA
GTGGTAGCGGGTCCAAATATCTTTGCGGTAGACGGGGGTTGCAGATATGT
TTATTTCTTCAACGACAATTTgggaaaatggagaaaatatttGACGGCAG
ACGTTTTGAAATGCAACCACGGTGACTGAATGAAACCGCGAAATGCAGAT
ACCTCAACAGAAACAATATGTTTGATGGGTGTGGTTCCAGTCAAAGTGAT
TGGTAAAGTTCAACCACGTGATGCTCTTTACTCGTGCCCAGACCACCCTG
GTGTCGCAATCAGCCAATCAGAGTTGAGTAAAGACGATACAGAGAAATCG
AAGTATGCTTTTGTCGGAATGGCTTTTGAAGGGAAACCTTTAAATGATTC
TAAAACTATTTGTTTTGTGATGACAATTATATCGATGAACCAATCGATAA
CTCAGCGAATGTTCAACGAACGATTGGAATCGATGAATGCACAATATCAT
CAACGAATCGAACACGTTAAGAAAAGTGGGAAAAACTTCCGAAAAAGATG
TCTCTGTATCTCAATCTTGGTGACATTGATTCTACTACTGGTCAGTATCT
TCATGTGGCAATACTTCTTCCCTGGATCGAAATTCCGCTACTGGAAATGC
AGCCTTGGTCGTGCGGAACCGGCCGGTGATGTATCCTTCCGCTTTGTGTC
ATTCAAAGACCTAAGTAAGTACGTATCCGTGCATGGCATAAGATTCGAAT
ATTTCGAACTGTTAGATAAAATGGATCTGCAACATTACGAGCCACTTAAT
CTAAATGATACATCTACTAGATATTACCTGAACATTGATCGTTGTGCGCA
TGGTGGTATCCGACGGACTCCTGACACATCGCGCGGTCTGAAAGTGGTAG
CGGGTCCAAATATCTTTGCGGTAGACGGGGGTTGCAGATATGTTTATTTC
TTCAACGACAATTTgggaaaatggagaaaatatttGACGGCAGACGTTTT
GAAATGCAACCACGGTGACTGAATGAAACCGCGAAATGCAGATACCTCAA
CAGAAACAATATGTTTGATGGGTGTGGTTCCAGTCAAAGTGATTGGTAAA
GTTCAACCACGTGATGCTCTTTACTCGTGCCCAGACCACCCTGGTGTCGC
AATCAGCCAATCAGAGTTGAGTAAAGACGATACAGAGAAATCGAAGTATG
CTTTTGTCGGAATGGCTTTTGAAGGGAAACCTTTAAATGATTCTAAAACT
ATTTGTTTTGTGATGACAATTATATCGATGAACCAATCGATAACTCAGCG
AATGTTCAACGAACGATTGGAATCGATGAATGCACAATATCATCAACGAA
TCGAACACGTTAAGAAAAGTGGGAAAAACTTCCGAAAAAGATGTCTCTGT
ATCTCAATCTTGGTGACATTGATTCTACTACTGGTCAGTATCTTCATGTG
GCAATACTTCTTCCCTGGATCGAAATTCCGCTACTGGAAATGCAGCCTTG
GTCGTGCGGAACCGGCCGGTGATGTATCCTTCCGCTTTGTGTCATTCAAA
GACCTAAGTAAGTACGTATCCGTGCATGGCATAAGATTCGAATATTTCGA
ACTGTTAGATAAAATGGATCTGCAACATTACGAGCCACTTAATCTAAATG
ATACATCTACTAGATATTACCTGAACATTGATCGTTGTGCGCATGGTGGT
ATCCGACGGACTCCTGACACATCGCGCGGTCTGAAAGTGGTAGCGGGTCC
AAATATCTTTGCGGTAGACGGGGGTTGCAGATATGTTTATTTCTTCAACG
ACAATTTgggaaaatggagaaaatatttGACGGCAGACGTTTTGAAATGC
AACCACGGTGACTGAATGAAACCGCGAAATGCAGATACCTCAACAGAAAC
AATATGTTTGATGGGTGTGGTTCCAGTCAAAGTGATTGGTAAAGTTCAAC
CACGTGATGCTCTTTACTCGTGCCCAGACCACCCTGGTGTCGCAATCAGC
CAATCAGAGTTGAGTAAAGACGATACAGAGAAATCGAAGTATGCTTTTGT
CGGAATGGCTTTTGAAGGGAAACCTTTAAATGATTCTAAAACTATTTGTT
TTGTGATGACAATTATATCGATGAACCAATCGATAACTCAGCGAATGTTC
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TCTTGGTGACATTGATTCTACTACTGGTCAGTATCTTCATGTGGCAATAC
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GGAACCGGCCGGTGATGTATCCTTCCGCTTTGTGTCATTCAAAGACCTAA
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GATAAAATGGATCTGCAACATTACGAGCCACTTAATCTAAATGATACATC
TACTAGATATTACCTGAACATTGATCGTTGTGCGCATGGTGGTATCCGAC
GGACTCCTGACACATCGCGCGGTCTGAAAGTGGTAGCGGGTCCAAATATC
TTTGCGGTAGACGGGGGTTGCAGATATGTTTATTTCTTCAACGACAATTT
gggaaaatggagaaaatatttGACGGCAGACGTTTTGAAATGCAACCACG
GTGACTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000094_pilon | genome | sc0000094_pilon:1135386..1147887 + |
|
