MSTRG.12477.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12477.1.p1
Unique NameMSTRG.12477.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000094_pilon:704597..713909+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12477.1.p1 ID=MSTRG.12477.1.p1|Name=MSTRG.12477.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9313bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000094_pilon:704597..713909+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGAATACAATTTTATCTTGTTAATATAGGTTAAATTATCGTTCCGTAAAG TAAATATTTTCCGACGTGGAGATGTTTTTGATACAGGTCAGAGATGCGGA ttgcaaaaatcaaaacaaacaaaatggcgtaCCAAACTTTCCAGCAAGAA TATATGCAAATTCCAGTTGTAACTCGATTGTATACAACTGCATGTGTTTT TACAACTGCTGCCGTGGTAAGCTTACTTTATCCTTGAATTTCCTTGCTAT ATATGAGCTGCTTATTGCTGAAAGTGGCATTTCTCATGCAAAATAAGGGc tttgaaacttctttttttctctctaaattttagaaatatttttgaaaaag ctgtggattatttattattattataaccGTGTAAAGACTCACGTTGGgcc atattcaaattttctactttgcAGAACCATTCTCAATGATGCTGACTTTC CTGAAACCTTGGTTTCCTATAAGTGTGACTACAGTACCTTATTCCAGACG TTTACTATAAGATAAGGCGTAGatcacaaataagttgtgttcgcgtcgtc cgaccgactcactttctatcttaaaaatccgacacTTTTCAGTCGGAAAG TCAGAAATCTATTggattttttaccaatatttttcaaagcattttataCA TTCATCGTTAGTCGCCGATTGGATCATCCAGTGTTAGCTCTAGTTCAAAG AAGCTTTCCGtccgtaatttttcaaagattgtttgcgTTGCGACTGTTTT TTGAAACCGTGATATGTAACAAAGATTTTAATGCAGCTAGTGCGCTTGAA AATTCTTGCCGTGCGAACAAACCTATGTTCAGGTAGGGCGCATTTTTCCG ATGATTCTAGTGCTGACCGACTGCCTAGGTTCAGAGCGCACTTTTCTGAC GATTTTAGTGCCGATGGACTCACTttttggggctggaaatgacgcAAACA CAACATATGTGATTGACGCCTAAATCGATGATTAATTGATTAAATATTGA TTAAAAATtataatcgatagctaatcgatacTCACAAGTTTTTAGCACTC AATcacccaagacaattaattaaaacttacaaacttaaaatgagacaaaa tgtcCGATTGCAAACGTGCAGTATAaaccagaatatcaaccaaccaaatt ttgtcattcaattccccaaacagcgcttcgatttttaaggccttgtttat acgcttaAGTAAAAGTAAGGCGTAGatcacaaataagttgtgttcgcgtc gtccgaccgactcattttctatcttaaaaatccgacacTTTTCAGTCGGA AAGTCGGAAATCTATCGGATTTTTTACCAAtaattttcaaagcattttgt acacaacttatatgtgattgacgcctaattccgcacatgtaaatgggtca ttgtttgagggccggcaaaatttccgggaagtagtctatccggcggtgcg cggatctaggtgggttccgtctcccccgttGATCTTTTTcctgggaagtt gatcttcaaattagttttcaaggttggcttggctcaaattttaggcaatt tctcgtttttgaaaatgttaatttcattataaTAATAGGTCGTGGCCAGT GGATTGTTAATCttaatgtttcaaaaataaagaaaaaattcaaaatgtct gggaccaactttttgatatgtttcttactcaatttgaaggtgctgattcg gaatttgaatgttaccaagcttgaaaacccgcagtttttgcgtaatttgc aaTTATTTGCGATTtaaggcaaaattgtaagccctgaaaattcgtgattt ttgggggccttaaaaatcaaaaaagacctattAACCATGTGATAGAACTC TTccaactgagcaaaaaaatgtattatatcaaagtctcaactttcctaga tcaaaagttatgggcgtttttgtggtaaaaaagtgctataattttgcata aattatgcagattgaggggaaattccctgttttcaatcaatttttgacca taaaattGTCTTCAAGCTTGGTATCATTtaaattccgaatcagcaccctc aaattgaccaaaattaaTTCTAAAAGCTTGGTCacggatattttgaaaaa aagtgaaacgttttggtGGCACTGGCCATGGCCTataaatccctttagaa gttttgcggtgcatttatttgcttgcgagtcaagtaaacgatatagcgct ttcgcagcattaatctttgatacgcattttggcgggacgctagtgtgact aactgataggatgaaccatattcatgtggctttcagccttgcactccatc gcagaggctaatcaattcAGTGTTTTTTCCAAGCACCCAAATGCCCCCGT TAGACGATGGcattaaactcaattcaaattgatttcattgataaattcta taaattcattcaattttaaCCGTTTTAAAGTGCCAGTTAAGACAAAAATA TGCTCAGCTTTCTGAACCCCCCACCAGGGCTAGCCCTGGACCCACAGGGG GGCTCAAGGCGCCCCCAGCCTCTGATATCGCGGCTTACGCCTTTgttaaa aactcaatttgaaagtaCAAACGGCGGCATTGCTTGGTGCTTGGAATAAT CCCtgcaattttaatgacttttttgactaatgaccaagttaaaaattttt aattatttttatatttgagtattaaaaaggcatgcattcaaataataaag gtttaaaatttttctctgggctagttagtaaaatatctcaaataggatcg tttttaatcgatatttaatcaatacacctttcctgtaattcaaacttctc agaaacgGCCCgtgaaaatgtgcgctccaccgttgtgtataaaattgttt gggaggtaaacgcacgcgtttttgcctgcgaggggttatggaaagtgggt tttcagcttctaacttttgatagcgatcttcttttggcaaaagattttca gggtggCATAATATCATGAaaagattgaacatactaaaatttgaggagat tttgttcgacagagcttaagaaaaactcaaaaaccaactttccctaagga aacgcatgcaaaaacaggtttgtttacctccagagcccaaacggtggaga gcatcaaaataatgcgcgcgcatttgTTTTATAAATTACGGGAAATGTGT ATCGATTAattatcgattagctatcgattttaatcgataatcgattttat caattaGTAACGTCTggcttattggaactaattttcgtgggaaCTAATTA TTTTTTGCggtcaaaaaaatatatctgaaagattgcatttcgcgggtttt aattttcctttctttcattttccttgagatttttcaaatttttcaataaa attgtaaaaaattgtattttgcgggaattaattttcgtggttttgaactc tcaaatttttttgcgggctcaaattttcgtgattttgatgaaaaaccggg aaaaacgctaaaattaattcccgcaaaaattaattccaatAAGGTAAATG CCATCAGGCTGATTTTCTAAACcaaatacattttttaataaatacttact tacttaacaAATTGATAGCCAATAATATCGCTGGATTGGATTTGGATTGG TGCATAAAATTGATACGCAATTGTTAATTAGGATTTTAAGGCTTAATTAC CTTTTGATGGATTGATTGATTATTCATCAATAGCGCACACTGTGCTGAAT ctaaatagattttatttttgacataatcattactcttgatgcgtttgtac gagttccaatccccgTCAACCTTTGCGCTAATCTCTTTTGCAAGTTAACT GCATCAGTTGACAAAGGATATAACAATTTGCACgcatctttaattgagcc gcattggatagttgttttggaggacCTGACGacctattgaataactaatt actccacatcagttacctagagacaagatataATTACTCCACatcagtta cctagagacaagataatttattaTTCAATAGGCTGTCACGTTCTTCAAAA CAActattgtgggattgcaactcgtacaaatccaaacgtaaaaaaaagtg aaaagtaataattatgacgtagcgttgcggagcgctattaaATCGTGAAT ATTGATTAGCtagttttgtttgatttatttctcattttttattccAGCAA TTAGACGTAGTGAACCCTTTTCAATTGTATTTCAATCCAGACCTCATTTT CAAACATGGTCAAGTAAGTATAcaacattttattaaaaatataatGTGTA TCATTTATTGAGAAATATTCTAATTTACAATTAGATGAGTGtttcccttt cattctttatgcccccctcttttttatcccccctcttttttatcccccaa tgtattcaaatttttcttgttccgtcccccccTCCTCATTTTTGCTTTCC TCCAGTTATTTTACGGTTTTGCGGCtcccccatatggttaacataaaaat gccttaaatcaagttaaaagttttggaaagcttgaaaatatagccttgaa actgcttgaaaaattaagtaaagtttgctgattttattgcttaaacaggt cCTCTACGAGATCGCCTttagatcagtgaagttcccccaatcaaaatttc caaaatttatggtTCCCCCTCTGTGACACTGTAATGTCATTCCTTCAatt tatctggtaccagatgtggaaatatgctacgacacgctttgctctgaagg tcgggcatattttaacatctggaagttttgcattacgggatttgacttgA CCGCGTTTAAACATTTTGTGAGGAGCTTGGAAACGATCAACAGCAAGTCA GCATCTCATTCAAAATCGGATGCGGGTGCTAGTCAGAAAATATAACACAT CGGATTCGCATCAGATTTGTAATATTTTCTAGACTAGcaccatattcaaa atggtTCGGAATCATATTCATGTACTAGTAAACAAACATAAACAGTCCCT AATTTAGCTTCATTTACAtgaaaatacaacttaaaacatgaatttattgc tttttccAACTTACCTAGACATACTCGATAAATATTACACTAACCTTCAT AGTTTTCAGGAcctcaaaagtgaattttcaatgtgctctgtaaaattaca aaattgggcTGTTCTGTTGGTACACAAAAAGTGAGGTTAATCGTTAGTAA GTTACAAACTACCTATACAGAAGTCTGTAGATCTTTCTGAAGACAAAATT ATCTGTTTTGTACACATATTTGTACTGCTGCTAGAGACTTTGACTGACTT TGACTGTTGTCGGTCAGTCGGTTGTGTTCAGTTGTCTGGCGGTCAACAGT CGTTTTGATAGGACCGCACAAGATTATACCAACATGAAACTTACTGAAAA AGCATAAGGAACATACCTGTTACTGTTTCTTTATAATCTTTGAGTTtgga tttgagaaaaatcagtaaaaatcagtccaccaaaacaaacaaaaaataat caacatttgtgtgcaaaaaacaatctttaaaaggttggtgcatttacaga aattacactgaatacTAAAAGTAATACTAAGAAAGTATAAAGACatttat attgtaaaaaaaatccaccaaaacaaaccaaaaacaaccaaaatctaaca aaagtTCTTCACTACTTGCCCCTCTTGAATCCGAAATTTGCTTTGTCATT GAAGCGCCAAAACtgtaaataaaattagtttttgacgGTCGGCGCAGCAg acattttcatgctaaattttgTTCAGTCGGGACGAACAAAATTCTTGAGC AAGCGAAGATATAGCCATTGAACCCGACTGttgtcggcacatcaaagggc CAcTACTAAacctctccgatggtatattggtccgctcctttagagcttta gcgtgggcggccgccaatacgccatcggaatatcagataatccTTCAATG AGTCTCAATCAGCCAACTAACGAAATTCCATGCAATATTTTTTGTTACAA TccaaatgttttcttttgtttttcaggtCTGGAGGCTTGTCACAAATTTC CTGTTCTTTGGGACGTTTGGGTTCAATTTTCTATTTAACATGATATTCAC GTatccttttttcaataaaatgtttCTTCATAGAATTGTTAATGATTTTT CCCAGGGtatttaagaaattttgaaaatatttcgtcTTTTAAGAATGATA ATAATAAGATATGTTTTAAGTTGCCTGCTCCGAAGAATTCCAAAGGATAA ATTAGACTTTTCAATCGTCTTACGTTTACTCATCAAACCATCAATTATGG CCACCGTCATGGGGGGAGGGAGCAATGGTCTCCAGTAatttgcaaagtat tttttttttacttagaaatatatttttcatagtGCCCAGTTTTGCGATTG AGAAGCTTGTCATCTTATGTAAATTCCAAATATACCGTTTAAGGGGATAA AATAAGGGCGAAAAGTTGAAGACTTCCTACGTCGCCAAACTTTGGTGAGC AACACAgatttttggccccctcaatctGACTCGCACGCCGGGCGCACTGT CAATTGATAACAGATTAACAAATGATTCGACCTTAACCACAAATTCGACT TACAGGTATCGGTATTGCCGGATGTTAGAAGAAGGTTCATTTCGAGCACG ATCAGCTGATTTTGtgctgatgtttttatttggtgGATTTCTCATGACTG TATCCTTTTCtcttgaaatgattttttcaccagaaatagtttaagagtca acattttttagtctgtttttattttggtttatcTTACCGATTTATATTAC CGTTATCCTGCGTTCTGAATATttactttctctttttcttgcttgcAGAA ATAAGGGATTAATAACAGATTATTTTCAGGCTTGTGCATGTGGTCCTATC GAACTTTAAAAACATCTATATAGTTTGTGTTGAGATTCTGGAATGTCCCA TATTATACTACAAGACTTGAAAATCAGCTTTATTTTCTGcttaaaatttt tctattttaactTACTATTTGACTCACAATCAAACCTTTTTCTACtctca aaaatgaaataaaatctcACTCAAGAAAGCGTAATgggctttcccagaaa aaaattgaatatgggaggtggaggatataacattttttggaaatttaccc cctcagacattgtgacttttgaatCCCCGAACAACAGGTCTAACCacccg gacaagcattagttgaccccctggacactcagaattaccctcaaacagag aaAGTTTACACCCTGGATAAGGctaattttgtagatttttcacactaccg gacactatatcctccaccccccgtAGAAAGAGCCCAATCTTTCACTTATA ATCAAATTCCAATTTTACGATTTGCTGTtcattcatgtaaaaaagttgtT TCTTTAACTTTTATACCACATTGTACACCAGATAATAGCGTTATTTGTCA ATTTGGTTTTCTTGGGTCAAGCATTCACAATTATGTTAGTATACGTATGG AGTCGGAGGAACTTGTATGTGCGAATGAACTTCTTTGGATTGATGAATTT TCAAGCTCCTTTTCTACCTTGGGTTTTATTAGGATTCTCATTGCTGCTGG GAAATTCTGTTGTGGTCGATTTGATGGGTAAGAAAAATCTATTCTTATTC AAAACTTATCATATAATGTTTGCCGAGAACAACTGTTGACGTTTTAAATC TAAACTCATACCTGTATTGTATCAATCGAAGTGGCTTTCGTCACTGTATT TCTACGCGCCGTCCTctttaatacactcttctcgagatgcataaatttat tgttgtcctcgttttcaaacagatttcattgctataaaattacatattca cgatgatgattgtgttgtttacacttcatgagacattttgaatttcaagc acttttgttttaaagttaatgtttgccttttgggaatttaaattggttta aatgtataatttcatagcaatgaaatctgtttgataacgaggacaacaat aaatttatgcatctcgagaagagtgtattaacTAGACATCGTACCCTaaa atcacgaaatttaatAAAGAATCCCGCAGCGCTTGTATAAAGGTATATGA TAGCTGTTGAATTTACAAATAAAAGACATGAGTGGTTGTTTAAATTCTCC TTGTAAGTTTCTTTGTCTTTGTTATTTCAGGTATAGCAGTGGGTCACATA TATTATTTTCTTGAAGACGTTTTCCCACAGCAACCAGGAGGCTTCAGAAT CCTCAAGACTCCACAATTCATGTAAgaaatgtttacatttctttgTGCTA GAACCTCAAGTTTGATTTAAACGAAATAACAATGATTTTAtcagaaaaca ttttataatttgatttttatgtaGTATATCTTAGcatttttattgaatag taaaaataaaaataattttatgctGATACTTTGCTTTCTTCAGTTTGTGA TATCGAATTTGTGATATCAGCTCTATTCATCACTCGAATTTTGTTCGATT ATATTAAATTTTGGGTTTTTGCTTCTTCGCAAAGATAAAACATTTGAAAT CGTGTGAGAttgctgactcgcgaaattacatcctagtgaaatatttttaa gatcCGATTTACGGCTCAAAATACCCTGTAAAGGCTatctgtgaaaaaaa ttgtgttttaggGCCATTTCAATAGCACaccgctatgcaaacgtcaaaat tattacttttaacatttgaccgaaattcgatcccacaatccttttcatct cgattcgtaatgcgtgcaagttattatttttgtattgtcaataagtgtaa ttgacttgcaaaagcaattaatgcaaaggatgatgggataaaaactcgga caaacagtaattttgatgtttttttttagaatcactgcggtatgctattg atttatcttttttttcagtcaaacgATTTTCGATCGACGTGAAGAACCGG AGTACGAACCGATGCCGGAAGCGGAAAGACCGGGTGGCTTCGACTTCGGA CAGCCCCGAGACAATCCCGGGCAACAAGCAGATGCGGAACCAGCGGAGCC TGAGAGAAATGAACACGAACACAATGATTGATAATTGGAACGttcgtttg ttttgttttttgttggtgtttgtttgATCGAGAATGGCATGTTCTTGATG AATGTCGAGAGGGAAAGCGAGGAGGCAACATTCTTACGATTTAGGGGTAT TTATCTATAATGAAAGTTATACATTTTATTGACAATAAAGAACCGTAGCT CGTTTTCCGTTGCATTCCTTATCTTTTTCTGGtgagtaatttttctttga atttcaaaattgttaaaatttgtcaaaacttcTTGAGACCGAAACTCTTC TTAGTTGAAATTG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000094_pilon:704597..713909+

>MSTRG.12477.1.p1 ID=MSTRG.12477.1.p1|Name=MSTRG.12477.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5649bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000094_pilon:704597..713909+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCGGAttgcaaaaatcaaaacaaacaaaatggcgtaCCAAACTTTCCA
GCAAGAATATATGCAAATTCCAGTTGTAACTCGATTGTATACAACTGCAT
GTGTTTTTACAACTGCTGCCGTGCAATTAGACGTAGTGAACCCTTTTCAA
TTGTATTTCAATCCAGACCTCATTTTCAAACATGGTCAAgtCTGGAGGCT
TGTCACAAATTTCCTGTTCTTTGGGACGTTTGGGTTCAATTTTCTATTTA
ACATGATATTCACGTATCGGTATTGCCGGATGTTAGAAGAAGGTTCATTT
CGAGCACGATCAGCTGATTTTGtgctgatgtttttatttggtgGATTTCT
CATGACTATAATAGCGTTATTTGTCAATTTGGTTTTCTTGGGTCAAGCAT
TCACAATTATGTTAGTATACGTATGGAGTCGGAGGAACTTGTATGTGCGA
ATGAACTTCTTTGGATTGATGAATTTTCAAGCTCCTTTTCTACCTTGGGT
TTTATTAGGATTCTCATTGCTGCTGGGAAATTCTGTTGTGGTCGATTTGA
TGGGTATAGCAGTGGGTCACATATATTATTTTCTTGAAGACGTTTTCCCA
CAGCAACCAGGAGGCTTCAGAATCCTCAAGACTCCACAATTCATtcaaac
gATTTTCGATCGACGTGAAGAACCGGAGTACGAACCGATGCCGGAAGCGG
AAAGACCGGGTGGCTTCGACTTCGGACAGCCCCGAGACAATCCCGGGCAA
CAAGCAGATGCGGAACCAGCGGAGCCTGAGAGAAATGAACACGAACACAA
TGATTGAATGCGGAttgcaaaaatcaaaacaaacaaaatggcgtaCCAAA
CTTTCCAGCAAGAATATATGCAAATTCCAGTTGTAACTCGATTGTATACA
ACTGCATGTGTTTTTACAACTGCTGCCGTGCAATTAGACGTAGTGAACCC
TTTTCAATTGTATTTCAATCCAGACCTCATTTTCAAACATGGTCAAgtCT
GGAGGCTTGTCACAAATTTCCTGTTCTTTGGGACGTTTGGGTTCAATTTT
CTATTTAACATGATATTCACGTATCGGTATTGCCGGATGTTAGAAGAAGG
TTCATTTCGAGCACGATCAGCTGATTTTGtgctgatgtttttatttggtg
GATTTCTCATGACTATAATAGCGTTATTTGTCAATTTGGTTTTCTTGGGT
CAAGCATTCACAATTATGTTAGTATACGTATGGAGTCGGAGGAACTTGTA
TGTGCGAATGAACTTCTTTGGATTGATGAATTTTCAAGCTCCTTTTCTAC
CTTGGGTTTTATTAGGATTCTCATTGCTGCTGGGAAATTCTGTTGTGGTC
GATTTGATGGGTATAGCAGTGGGTCACATATATTATTTTCTTGAAGACGT
TTTCCCACAGCAACCAGGAGGCTTCAGAATCCTCAAGACTCCACAATTCA
TtcaaacgATTTTCGATCGACGTGAAGAACCGGAGTACGAACCGATGCCG
GAAGCGGAAAGACCGGGTGGCTTCGACTTCGGACAGCCCCGAGACAATCC
CGGGCAACAAGCAGATGCGGAACCAGCGGAGCCTGAGAGAAATGAACACG
AACACAATGATTGAATGCGGAttgcaaaaatcaaaacaaacaaaatggcg
taCCAAACTTTCCAGCAAGAATATATGCAAATTCCAGTTGTAACTCGATT
GTATACAACTGCATGTGTTTTTACAACTGCTGCCGTGCAATTAGACGTAG
TGAACCCTTTTCAATTGTATTTCAATCCAGACCTCATTTTCAAACATGGT
CAAgtCTGGAGGCTTGTCACAAATTTCCTGTTCTTTGGGACGTTTGGGTT
CAATTTTCTATTTAACATGATATTCACGTATCGGTATTGCCGGATGTTAG
AAGAAGGTTCATTTCGAGCACGATCAGCTGATTTTGtgctgatgttttta
tttggtgGATTTCTCATGACTATAATAGCGTTATTTGTCAATTTGGTTTT
CTTGGGTCAAGCATTCACAATTATGTTAGTATACGTATGGAGTCGGAGGA
ACTTGTATGTGCGAATGAACTTCTTTGGATTGATGAATTTTCAAGCTCCT
TTTCTACCTTGGGTTTTATTAGGATTCTCATTGCTGCTGGGAAATTCTGT
TGTGGTCGATTTGATGGGTATAGCAGTGGGTCACATATATTATTTTCTTG
AAGACGTTTTCCCACAGCAACCAGGAGGCTTCAGAATCCTCAAGACTCCA
CAATTCATtcaaacgATTTTCGATCGACGTGAAGAACCGGAGTACGAACC
GATGCCGGAAGCGGAAAGACCGGGTGGCTTCGACTTCGGACAGCCCCGAG
ACAATCCCGGGCAACAAGCAGATGCGGAACCAGCGGAGCCTGAGAGAAAT
GAACACGAACACAATGATTGAATGCGGAttgcaaaaatcaaaacaaacaa
aatggcgtaCCAAACTTTCCAGCAAGAATATATGCAAATTCCAGTTGTAA
CTCGATTGTATACAACTGCATGTGTTTTTACAACTGCTGCCGTGCAATTA
GACGTAGTGAACCCTTTTCAATTGTATTTCAATCCAGACCTCATTTTCAA
ACATGGTCAAgtCTGGAGGCTTGTCACAAATTTCCTGTTCTTTGGGACGT
TTGGGTTCAATTTTCTATTTAACATGATATTCACGTATCGGTATTGCCGG
ATGTTAGAAGAAGGTTCATTTCGAGCACGATCAGCTGATTTTGtgctgat
gtttttatttggtgGATTTCTCATGACTATAATAGCGTTATTTGTCAATT
TGGTTTTCTTGGGTCAAGCATTCACAATTATGTTAGTATACGTATGGAGT
CGGAGGAACTTGTATGTGCGAATGAACTTCTTTGGATTGATGAATTTTCA
AGCTCCTTTTCTACCTTGGGTTTTATTAGGATTCTCATTGCTGCTGGGAA
ATTCTGTTGTGGTCGATTTGATGGGTATAGCAGTGGGTCACATATATTAT
TTTCTTGAAGACGTTTTCCCACAGCAACCAGGAGGCTTCAGAATCCTCAA
GACTCCACAATTCATtcaaacgATTTTCGATCGACGTGAAGAACCGGAGT
ACGAACCGATGCCGGAAGCGGAAAGACCGGGTGGCTTCGACTTCGGACAG
CCCCGAGACAATCCCGGGCAACAAGCAGATGCGGAACCAGCGGAGCCTGA
GAGAAATGAACACGAACACAATGATTGAATGCGGAttgcaaaaatcaaaa
caaacaaaatggcgtaCCAAACTTTCCAGCAAGAATATATGCAAATTCCA
GTTGTAACTCGATTGTATACAACTGCATGTGTTTTTACAACTGCTGCCGT
GCAATTAGACGTAGTGAACCCTTTTCAATTGTATTTCAATCCAGACCTCA
TTTTCAAACATGGTCAAgtCTGGAGGCTTGTCACAAATTTCCTGTTCTTT
GGGACGTTTGGGTTCAATTTTCTATTTAACATGATATTCACGTATCGGTA
TTGCCGGATGTTAGAAGAAGGTTCATTTCGAGCACGATCAGCTGATTTTG
tgctgatgtttttatttggtgGATTTCTCATGACTATAATAGCGTTATTT
GTCAATTTGGTTTTCTTGGGTCAAGCATTCACAATTATGTTAGTATACGT
ATGGAGTCGGAGGAACTTGTATGTGCGAATGAACTTCTTTGGATTGATGA
ATTTTCAAGCTCCTTTTCTACCTTGGGTTTTATTAGGATTCTCATTGCTG
CTGGGAAATTCTGTTGTGGTCGATTTGATGGGTATAGCAGTGGGTCACAT
ATATTATTTTCTTGAAGACGTTTTCCCACAGCAACCAGGAGGCTTCAGAA
TCCTCAAGACTCCACAATTCATtcaaacgATTTTCGATCGACGTGAAGAA
CCGGAGTACGAACCGATGCCGGAAGCGGAAAGACCGGGTGGCTTCGACTT
CGGACAGCCCCGAGACAATCCCGGGCAACAAGCAGATGCGGAACCAGCGG
AGCCTGAGAGAAATGAACACGAACACAATGATTGAATGCGGAttgcaaaa
atcaaaacaaacaaaatggcgtaCCAAACTTTCCAGCAAGAATATATGCA
AATTCCAGTTGTAACTCGATTGTATACAACTGCATGTGTTTTTACAACTG
CTGCCGTGCAATTAGACGTAGTGAACCCTTTTCAATTGTATTTCAATCCA
GACCTCATTTTCAAACATGGTCAAgtCTGGAGGCTTGTCACAAATTTCCT
GTTCTTTGGGACGTTTGGGTTCAATTTTCTATTTAACATGATATTCACGT
ATCGGTATTGCCGGATGTTAGAAGAAGGTTCATTTCGAGCACGATCAGCT
GATTTTGtgctgatgtttttatttggtgGATTTCTCATGACTATAATAGC
GTTATTTGTCAATTTGGTTTTCTTGGGTCAAGCATTCACAATTATGTTAG
TATACGTATGGAGTCGGAGGAACTTGTATGTGCGAATGAACTTCTTTGGA
TTGATGAATTTTCAAGCTCCTTTTCTACCTTGGGTTTTATTAGGATTCTC
ATTGCTGCTGGGAAATTCTGTTGTGGTCGATTTGATGGGTATAGCAGTGG
GTCACATATATTATTTTCTTGAAGACGTTTTCCCACAGCAACCAGGAGGC
TTCAGAATCCTCAAGACTCCACAATTCATtcaaacgATTTTCGATCGACG
TGAAGAACCGGAGTACGAACCGATGCCGGAAGCGGAAAGACCGGGTGGCT
TCGACTTCGGACAGCCCCGAGACAATCCCGGGCAACAAGCAGATGCGGAA
CCAGCGGAGCCTGAGAGAAATGAACACGAACACAATGATTGAATGCGGAt
tgcaaaaatcaaaacaaacaaaatggcgtaCCAAACTTTCCAGCAAGAAT
ATATGCAAATTCCAGTTGTAACTCGATTGTATACAACTGCATGTGTTTTT
ACAACTGCTGCCGTGCAATTAGACGTAGTGAACCCTTTTCAATTGTATTT
CAATCCAGACCTCATTTTCAAACATGGTCAAgtCTGGAGGCTTGTCACAA
ATTTCCTGTTCTTTGGGACGTTTGGGTTCAATTTTCTATTTAACATGATA
TTCACGTATCGGTATTGCCGGATGTTAGAAGAAGGTTCATTTCGAGCACG
ATCAGCTGATTTTGtgctgatgtttttatttggtgGATTTCTCATGACTA
TAATAGCGTTATTTGTCAATTTGGTTTTCTTGGGTCAAGCATTCACAATT
ATGTTAGTATACGTATGGAGTCGGAGGAACTTGTATGTGCGAATGAACTT
CTTTGGATTGATGAATTTTCAAGCTCCTTTTCTACCTTGGGTTTTATTAG
GATTCTCATTGCTGCTGGGAAATTCTGTTGTGGTCGATTTGATGGGTATA
GCAGTGGGTCACATATATTATTTTCTTGAAGACGTTTTCCCACAGCAACC
AGGAGGCTTCAGAATCCTCAAGACTCCACAATTCATtcaaacgATTTTCG
ATCGACGTGAAGAACCGGAGTACGAACCGATGCCGGAAGCGGAAAGACCG
GGTGGCTTCGACTTCGGACAGCCCCGAGACAATCCCGGGCAACAAGCAGA
TGCGGAACCAGCGGAGCCTGAGAGAAATGAACACGAACACAATGATTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12477MSTRG.12477Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12477.1.p1MSTRG.12477.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12477.1.p1.exon1MSTRG.12477.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12477.1.p1.exon2MSTRG.12477.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12477.1.p1.exon3MSTRG.12477.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12477.1.p1.exon4MSTRG.12477.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12477.1.p1.exon5MSTRG.12477.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12477.1.p1.exon6MSTRG.12477.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12477.1.p1.exon7MSTRG.12477.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000094_pilongenomesc0000094_pilon:704597..713909 +