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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000094_pilon:475651..484798+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12455.1.p1 ID=MSTRG.12455.1.p1|Name=MSTRG.12455.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9148bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000094_pilon:475651..484798+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGAACAACTATAAATATTTTTGCTGTTGAACCCGACAATATCTCAAAATG
GCGCGTGAATTTCTCTGACTGAAGGACTGAAGCTGAAGGTATccaattaa
aattcaaaagttttcagCTGCACAACACTACGTCAAATTTCAGTTTACCT
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tgttgtggggggggggggggggggttaccattgcattgacttccaagcca
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GACTttagcagttacatcaatatgccaaaaattgagatattttactaact
aagcccagagaaaaattttaaacctttattatttgaatgcatgccttttt
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TtaggaaagtgctcaaaaaagTTACCTTTTCTCCAAATCACTCCATAATC
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gcccgtaccgttgaaacaggtctccgacccgactcgaaccaccaaatgca
agcaaccttggtttacaaacccaacaCCTAACCGCTTGCATCAACGAGAC
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cttaattaagaaagctcccaaccctaccggtgccctaTCCCTACGGGATC
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tattgtgactctcgagctccaaccctaaccctaactgataataaccgaac
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ACGCAGCTccccgctcgcagctctactctattatttttgttttgatttaa
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GACAacacatttgttttgattactcctccaagtttatcaatcatacttct
tcgttcctcttaaAGTGCACAGACACTCGTGTGTGTTCCTCTacaaattt
tttcatatttcaatttaaaagcctactttttgcaaaagagaaatctagta
ttttttaatacgtcaTTTTGTCCCattgttttgtcagatagtccaaagtt
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aaaattgtaaaatactttCCTATTTAGGCAAAAACTTCTGACTGGACAAA
CACACCGAACTGTCCAGTGCGTCAACAGGGTCGTCCCGAACGCCAAAGAG
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tggagcagctaaaaaaacactatttttctctccggaAAGTACCAGAGCTT
TTTTGGTGCTTCAtgagcaagtgatttttaacactTTCTAGAAAACCATT
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ACTATCGTTATTATATTGCGGATATCTTGCTCTAGAACACCAGGGAAGTG
CACCGGAACGTTCTGTGCGGAGTGCggttatgtttttttattttgaccac
ATACAGGAATTCGCCAAATATTGCTTGTAGACAcaagactcctggatggg
gAATCCACTTATTTCCCTTCAGGAAGGGAACTAAACGGGAAATTTAACAT
TCTCTCATTTCAAGCAATTATTTTACACTTCTTTTCAGTtgtcacactag
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taatatttaaaacaCTTTACAATAGGGGGTCATTTAGTACATAACACCAA
TGACACTTAGTACAGTGgtggtcaatttttttcaaagtggtAAAATGCAG
TTAGTACACCAGGTTCTGTGTTTTTTAATCCATTGATTTAGTTACAGTAC
ACAGTTGTTATGGATGGTTATGgaagtgtttttaaaacagGAATTTAAGA
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GGCAGAGCTTTTCAAATAAATGCACAGAAGATTTTCATAAAGACTAACAA
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tatggTAGAAGTTTCCACTTTCTCAAAGGTTGAAACAGACCTTccaatag
actttttcataaattacgttacaaaCGTCACTTGCCTCATTTttaaatta
ttgccatggtgatttaCTCCCAGCAGGTttcattaaaactacttcctatt
cataaaaaaatcatttaatgtctcaagagacataatcaccatggtaattg
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ttgtatgGACTTCATTTGAatgatttgcaatatttttttctgatctgCAA
ATAATAAACCACCTATTCTATGCAGAATTTTTTGGATGTCCTGTTTGGAT
ATTTATTTTCGCTTCCTTGTAGGCAGATGTCATGTTTGAAGGAGAAAAAG
AAGGCCTGAATGAAATCCTCAAAACCAACACTGTCAAAGTTCCCACTCCA
ATAAaggtaataatttttttggggATCAACTTGATTAAAGGTATAAATGT
TAAAAGGACTAGAGTTGAATATTTGGTATGCACTAACCAAGCGGTATAGG
AATGACATACATTTTGGCATGCAAtacctttttattcaaattttttgggg
ATTGGGGACGAGTTTTGTGCAATTACACTATGTCAAACTTAAAAACTGAA
GtccaattttcaacttttctgaTGTCTATACATCACTTTAGGTTTTCAAG
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TATATTAAATCATCTTGAGGCCTTCCCTTACAATATCTGTGCTGTGACAT
TGAAATTTTTACCAGGAGATAATTTGTAGAATTTTAGTTTGACCACTTGT
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ATTCCAATCAATGCCCTAATTTTGCTTAAGTATTTTAGATTGCTTCATTG
cttatttacatttttagatTGCATATGCACAACATCAACAAGTTGAATAA
CATTGAATCAAATGCAAACAGAATCAACGGCAATGAAAATATTGTAAACA
ATGATGGGATTTATCAATTTGGTTTCCACGCAACAACTTGTTGTGGTTAT
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ACCTTATTGCTAcacctgtgtcacagacctgttGTGACCCATCCTTACTA
GATTTTTGGCCTgctgggaacaatagaatttctatccccgttgggatttt
gaaagaaactttcaTCTCCACTGTTAATTATTTAGACCTTTTATGTTCGC
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ATTTCCACTTTTACATATTAAATTTATGAAGCTATTTAGACTGAGAATGC
AGCTgagttgaaatgttttttatttgtctCTTAAAACAATctaattttac
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GTATCATCTGGTATTATTATGCTTTACTTTGATATCTCTAGTATGGTGAC
AGACAGCTGATGGAATTATGGTCAGAACTTCAGTTGAAGATCGATCAGCT
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GTGGAAATGCAGGACAGCTTGTAAACGAGCCAGGTATCTTTATTATATAG
CCTCTAAatatcaagttttttttttcaccataAAGCTTTTCAAAGTATAA
GAAGCTTGGTTTAACCTCTGATTGCtaggctgggcttaaaaaattattgg
tttgccgtcacccgaccctagattttggaggtgggtcggtcagtcagaat
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agtttgtttacatttatgtaattttgaataaaaaacagaagtgctagcag
ggaatatacgattcttatgctcgagacaaacaagatacgaacgttttgat
ttattgtttgaagttttttaaggaaaaaaaaatcttttttaaaatggcaa
taaaatttttttggtcGGCAGGTTTTGAGGTAGGGTTGGCGGttgggtga
cggcaaaccaacaatctTTGTTGAGAAAATCCAAACGTTGATTTGTATGC
CCATCATtgattcaatttcaaatttcaaatttttgtaattgTTTTATCAT
AGTTGTCTTTGATCCTGCAGCATTTTATGCACATCATGAATTTGAACTTT
CAATAACTGATATGTTTGGTCGATATGACCCTGGATTCTACAAATCATAT
CACGCGTTAATTCCAAAGGCTAAAGGGTTTGAAGAACGCCATCAACTTTA
TATTCTGTTTCATTATCTCAACCATTGGTAATTATTGATAATTactttat
tatattttattagaGCTCCACCACTTAATAAAATGCTCAGGAAGCGATGA
AGTCCattgatttattatttttatatccTTCCATGTACTTTTTCAACCTT
TTAAAGAGGTAACTAGATTGTTTGTATCTTTGACCTGTAAAATCCTTCTG
TGTTCTTCTTTATGCTTGTAAAACTCAGTCTTTTTATGTTACTCTTTTCC
AAAACAAAGATAttcaagttacaagtttttgacttttagcttgaaaacaa
tagaaatcgAAGTGGTTTGAAAGCTGTTGTGAACATTTTTGCCTTGTTTT
TTAGGAACCATTTTGGACAAGGTTACCGGTCCTCATCTGTATCAACTatg
agaaaaatattgaaattcctCAAATGAAATATTATTATGTATAGAAACCT
AAAACAGAGACTTGAACCATGAGAGATGTGATCGATGATGTAGATATAGC
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atatattttgtaaaCTAGGAAGGTTGTTACTATCCATTTTGATACTGACT
GCATTGTTTTTATGTTGCTTTGCAATCTGTTCCTTTTAAAAAGCTTCTTC
TTGTGCTTCTTGGTTTATCaatcaaacatattttttcttcttatagATCA
CAAAAAACAAGCAGATCATCTAATCGAACAAAAAATGGATATCCAGTTTG
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GAGTTTTATCAATGTGGATCTTGCTCTGAAGTGTTGTACTCCTTCAACAA
ATTGACCTTGAATTTGTCGTTTCAACTTGATCAATGGAATACTTTTCTTA
AGCAACTGAAAGTCAACTTTAACGTTGTTGGTACAGACAACAGTGTTCAG
TGTAGCAAATGTTTAAACAATTTTACGCCCTTACAAAGTGCAGAAACATC
TACAAGACAAAACAATAAAGATTCTTTAGTTTGTGAGATATGCTATCAAA
TATTCTCTTGCTCCTCGAAATTTAAAGAACATTGTGAGACACATAAGAAA
TTGAAACCCTACGAATGTAGCGTCTGTAAGAGATCTTTTTCTCAGAAGCA
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GCCAAGATGTTCCTTTCAAATCTGTGGAGTGTATGAAAACCAGACCTACA
AAAGCTGCAAAACAAGATATTGTTAGGAAATTCCAATGCGATTACTGTGG
GAAATTCTTTCGCTTTAACAACCAACTTCAAACACATATTCGTATTCATA
CTGGTGAAAAACCATTCAAATGTATCTTATGTGATAAAGCTTTTAGTGAT
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TCATAAATGTGATATATGCGGCAAGGCGTTCGCTGTTCTTGGCAACTTGA
GACGACATTATGTCACTCATACAGGAGAAAAACCATATCCTTGTAAAATT
TGTGATGAACGTTTTAGAGATCCTTACCACTTGAAGAAACATTCACGTAT
ACACACTGGTGAATCTCACAAATGCAGCAATTGCGAAATGTCCTTTATTG
ATAAGAAAAGTTTAGACAAACATAAAAAGACTCACCTCTCAGGTACCAAA
CCTCCAGAACCAGTTGCACGGTTAGATTGCACTTATTGTGATAAGAAGTT
TACTTATCCATCACAACTGAAGAAACACATTGTAAAACACACTGGAGAAA
AGCCCTATGAATGTGACATCTGTGGGAAGAAATATTCACAATCAAACTTA
CTTTTCACACATAAGAAAATGCATGCTGGAGAAGAAAAACCACATGAGTG
TGATATTTGTGGGAAGAGGTTTTGGCGAAAGCGTGATAGAGATAGGCATC
GTAGATCAAAAGTGCATGAGGTTAAAACTGGCCCAAAAAAGAAGTCATTT
CATTGCGATGTTTGTGGTGAGGCTTTTAAAAGTGCTAAAAATTTGAGGAC
CCATTCAAAAACGCATGAAGGGGATAAGCAAAACAAGTGTGCTGTTTGTG
ATAAAACGTTTTCAGAGGCGAATGAGTTGGTGAAGCATTATCAGTTACAC
AGGAAACTAGAGAAAAGTGTTGTTTCTGCGAATCAAGCTGATTTGCAGAA
ATATCTTCAACTCCATGAGAAGGGAAcccttgaaaatgaaaacgatAAAG
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ACAAGTGAGGAAAAGTCTGCTCCTAATACAACATCTGATAATAATGAAAA
CAGTGAAAAGTCGACATTCATTGACAATGATGGTGATGGTTCTCAGATAA
AACCAAGAGATGATATTAAATGATAAAATCTGTTTCCAAAAACTGCTAGT
CTGTactttttacagattttttaaaCTCTCTTGAGTTGAGAGAAAAGAGA
TATTAATACCTCATTGTAATGATAATTTTGAGAAGCTTCGTATTAGATTT
GCACAAAGAAAGGTCCAAATGGGAAATAAATTACTTAAAGATGCTAAAAA
TGGAGCTATTACAAGGGGTTATAACtttgagaaatgaaaaatttgaatgc
aTTATTGAAATCAGCCggttcaaagtttaaaaaaagtatatttaataaaa
gtttttggttCTCACTCAAGCTACTTCATTTTCAGGATATTCTAAATATA
TTATTTGTATTGCCTCAAATTTGTCTTTCCAGCAAGGTATtactttttat
tgtattttttttcctCAAGGGCAACGTTCAAAAAAGTGCGaacagtcaat
tttttttggaatagacaAATTTTTAATCATTCTGGGTATAATTTAGATAA
TAATACATTTTGGTTCAAACAATGTTTGTCTCTCTTTGTAAAACTTACGT
TGTTAATTTTGTcaccaaattttgaaatatatatgCTCAAAATTGGAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000094_pilon:475651..484798+ >MSTRG.12455.1.p1 ID=MSTRG.12455.1.p1|Name=MSTRG.12455.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1812bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000094_pilon:475651..484798+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTGCTTTGCAATCTGTTCCTTTTAAAAAGCTTCTTCTTGTGCTTCTT
GGTTTATCaatcaaacatattttttcttcttatagATCACAAAAAACAAG
CAGATCATCTAATCGAACAAAAAATGGATATCCAGTTTGAAAGGGAAGCA
GTTTGCACTCATACAAACCTTGGGAAAGTTGCAGTTATTGAGTTTTATCA
ATGTGGATCTTGCTCTGAAGTGTTGTACTCCTTCAACAAATTGACCTTGA
ATTTGTCGTTTCAACTTGATCAATGGAATACTTTTCTTAAGCAACTGAAA
GTCAACTTTAACGTTGTTGGTACAGACAACAGTGTTCAGTGTAGCAAATG
TTTAAACAATTTTACGCCCTTACAAAGTGCAGAAACATCTACAAGACAAA
ACAATAAAGATTCTTTAGTTTGTGAGATATGCTATCAAATATTCTCTTGC
TCCTCGAAATTTAAAGAACATTGTGAGACACATAAGAAATTGAAACCCTA
CGAATGTAGCGTCTGTAAGAGATCTTTTTCTCAGAAGCATACCTTCGAAA
AGCATGCAGAACTTCACAAGAGAAAAGTATTTACAAGTAGCCAAGATGTT
CCTTTCAAATCTGTGGAGTGTATGAAAACCAGACCTACAAAAGCTGCAAA
ACAAGATATTGTTAGGAAATTCCAATGCGATTACTGTGGGAAATTCTTTC
GCTTTAACAACCAACTTCAAACACATATTCGTATTCATACTGGTGAAAAA
CCATTCAAATGTATCTTATGTGATAAAGCTTTTAGTGATCCAAGTGCTCT
CAAGAGACATAAAATAGCCTTACATACCAACATTAAAGATCATAAATGTG
ATATATGCGGCAAGGCGTTCGCTGTTCTTGGCAACTTGAGACGACATTAT
GTCACTCATACAGGAGAAAAACCATATCCTTGTAAAATTTGTGATGAACG
TTTTAGAGATCCTTACCACTTGAAGAAACATTCACGTATACACACTGGTG
AATCTCACAAATGCAGCAATTGCGAAATGTCCTTTATTGATAAGAAAAGT
TTAGACAAACATAAAAAGACTCACCTCTCAGGTACCAAACCTCCAGAACC
AGTTGCACGGTTAGATTGCACTTATTGTGATAAGAAGTTTACTTATCCAT
CACAACTGAAGAAACACATTGTAAAACACACTGGAGAAAAGCCCTATGAA
TGTGACATCTGTGGGAAGAAATATTCACAATCAAACTTACTTTTCACACA
TAAGAAAATGCATGCTGGAGAAGAAAAACCACATGAGTGTGATATTTGTG
GGAAGAGGTTTTGGCGAAAGCGTGATAGAGATAGGCATCGTAGATCAAAA
GTGCATGAGGTTAAAACTGGCCCAAAAAAGAAGTCATTTCATTGCGATGT
TTGTGGTGAGGCTTTTAAAAGTGCTAAAAATTTGAGGACCCATTCAAAAA
CGCATGAAGGGGATAAGCAAAACAAGTGTGCTGTTTGTGATAAAACGTTT
TCAGAGGCGAATGAGTTGGTGAAGCATTATCAGTTACACAGGAAACTAGA
GAAAAGTGTTGTTTCTGCGAATCAAGCTGATTTGCAGAAATATCTTCAAC
TCCATGAGAAGGGAAcccttgaaaatgaaaacgatAAAGAATCTATGCAT
GATACTGCAAAGGCTGGTAACGAGAGTGAGAAAACTGATACAAGTGAGGA
AAAGTCTGCTCCTAATACAACATCTGATAATAATGAAAACAGTGAAAAGT
CGACATTCATTGACAATGATGGTGATGGTTCTCAGATAAAACCAAGAGAT
GATATTAAATGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000094_pilon | genome | sc0000094_pilon:475651..484798 + |
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