|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000094_pilon:321299..324033+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12450.1.p2 ID=MSTRG.12450.1.p2|Name=MSTRG.12450.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2735bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000094_pilon:321299..324033+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
cttctatatagtttttgacgcgttgttactaaaagaggtaacgagtggta
acgagtggtaacgagtggtaacgatgtggtaacgagtggtaacgatgtgg
taacgaggtggtaacgagtggtaacgatgtggtaacgaggtaacgagtgg
taaccagttgaaaacggtggccctaagtctccaaatttgaatttctcgat
tctggtgtttttgcaacagatGATGATGGAtcttgaggttctgcagcagg
acctggcagatctggtgaatgtgcagtaggaattggagatttgggggaat
gttatggtggagttgatggatctggtgaatgtgatggtaaagttggttgt
ttgggtgaatgaaatggtggaattgatggttctggtgaatgtaaatcaaa
gattgatggttctggaggttctgcatcaggagttggtgattctggtgaat
gtgcatcaggagttggtgattctggtgaatataatgctggtgttgatgga
tctgatgaatccaatggtggagttgttgattctggtaaatgtacagcagg
agttggtggttctggtgaatgtccagtaggagttgatgcttctggtgaaa
gtacagcaggagttggtggttctggtgaatgtccagcaggagttggtggt
tctggtgaatgggCAGCAGAAGTTGTTGATTCTGGCGAATGTGCAGCGGG
AGATTGGtaattctggtgaatgcaatggtggagttggtggttctagtgaa
tgtacagcaggagttggtggttctggtgaatgtgcagcaggagttggtgg
ttctggtgaatgtacagcaggagttggtggttctggtgaatgtaaagcag
gagttggtggttctggtgaatgtgcagcaggagttggtggttctggtgaa
tgtacagcaggagttggtggttctgctgaatgtacagcaggagttggtgg
ttctggtgaatgtacagcaagaattggtggttctggtgaatgtacagcag
gaatTGGTGGTTTTgatgaatgtacagcaggaataggtggttctggtgaa
tgtacagcaggagttgctgattctggtgaatgtgcagcaggagttggtgg
ttctggtgaatgtacagcaagaattggtggttctggtgaatgtacagcag
gaatTGGTGGTTTTgatgaatgtacagcaggaataggtggttctggtgaa
tgtccagcaggagttggtggttctggtgaatgggCAGCAGAAGTTGTTGA
TTCTGGCGAATGTGCAGCGGGAGATTGGtaattctggtgaatgcaatggt
ggagttggtggttctagtgaatgtacagcaggagttggtggttctggtga
atgtgcagcaggagttggtggttctggtgaatgtacagcaggagttggtg
gttctggtgaatgtaaagcaggagttggtggttctggtgaatgtgcagca
ggagttggtggttctggtgaatgtacagcaggagttggtggttctggtga
atgtacagcaggagttggtgattctgctgaatgtacagcaggagttggtg
gttctggtgaatgtacagcaagaattggtggttctggtgaatgtacagca
ggaattggtggttctgatgaatgtacagcaggaataggtggttctggtga
atgtacagcaggagttgctgattctggtgaatgtgcagcaggagttggcg
gttctggtgaatgcaatggtgaagttggtggttctggtgaatgtgcagca
ggagttggtggttctggtgaaagtacagcaggagttggtggttctggtga
atgtgcagcaggagttgttgattctggtgaatgtgcagcaggagttggtg
gttctggtgaatgtacagcaggagttggtggttctgctgaatgtacagca
ggggttggtggttctggtgaatgtacagcaagaattggtggttctggtga
atgtacagcaggaattggtggttctgatgaatgtacagcaggaataggtg
gttctggtgaatgtacatcaGGAGTTgctgattctggtgaatgtgcagca
ggagttggtggttctggtgaatgcaatggtgaagttggtggttctggtga
atgtgcagcaggagttggtggttctggtgaatgtacagcaggagttggtg
gttctggtgaatgtacagcaggagttggtggttctgctgaatgtacagca
ggagttggtggttctggtgaatgtacagcaagaattggtggttctggtga
atgtacagcaggaatTGGTGGTTTTgatgaatgtacagcaggaataggtg
gttctggtgaatgtacagcaggagttgctgattctggtgaatgtgcagca
ggagttggtggttctggtgaatgtacagcaagaattggtggttctggtga
atgtacagcaggaatTGGTGGTTTTgatgaatgtacagcaggaataggtg
gttctggtgaatgtacagcaggagttgctgattctggtgaatgtgcagca
ggagttggtggttctggtgaatgcaatggtgaagttggtggttctggtga
atgtgcagcaggagttggtggttctggtgaatgtgcagcaggagttgatg
gttctggtgaatttgcaacaggagttgatggttcttgtaaatgtgatggt
aaagttggttattttggtgaatgcaatggtggagttgatggttttggtga
atttgcATCAGAAGTTGATGGctctggtgaatgtg Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000094_pilon:321299..324033+ >MSTRG.12450.1.p2 ID=MSTRG.12450.1.p2|Name=MSTRG.12450.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=696bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000094_pilon:321299..324033+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgcttctggtgaaagtacagcaggagttggtggttctggtgaatgtcca
gcaggagttggtggttctggtgaatgggCAGCAGAAGTTGTTGATTCTGG
CGAATGTGCAGCGGGAGATTGGtaattctggtgaatgcaatggtggagtt
ggtggttctagtgaatgtacagcaggagttggtggttctggtgaatgtgc
agcaggagttggtggttctggtgaatgtacagcaggagttggtggttctg
gtgaatgtaaagcaggagttggtggttctggtgaatgtgcagcaggagtt
ggtggttctggtgaatgtacagcaggagttggtggttctgctgaatgtac
agcaggagttggtggttctggtgaatgtacagcaagaattggtggttctg
gtgaatgtacagcaggaatTGGTGGTTTTgatgaatgtacagcaggaata
ggtggttctggtgaatgtacagcaggagttgctgattctggtgaatgtgc
agcaggagttggtggttctggtgaatgtacagcaagaattggtggttctg
gtgaatgtacagcaggaatTGGTGGTTTTgatgaatgtacagcaggaata
ggtggttctggtgaatgtccagcaggagttggtggttctggtgaatgggC
AGCAGAAGTTGTTGATTCTGGCGAATGTGCAGCGGGAGATTGGtaa
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000094_pilon | genome | sc0000094_pilon:321299..324033 + |
|
