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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000093_pilon:927094..941698+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12399.2.p1 ID=MSTRG.12399.2.p1|Name=MSTRG.12399.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14605bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000093_pilon:927094..941698+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTTTTGGGAATAACGTGACTCTTACAAGAGAAAGAGATAACTATTTATAC
TGTGATTTGTCTGGATTCCTCAAACCAGGGTTTGCACAAACTCACTTTTC
AAGAAAGTTGAATCTGATGCATTAGACGGAAAGTTGTATAAGGGAGGTCA
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TCTCTATTGAGGATAGTAACCCTAAAACAACCTTTGTAGCTTGTTACAGT
CCAACTAATGTCTCTGAACAGGTTGATGTCGATAGTTTCTATTCCATTCT
TTCTCAAACTATCCTTTCTATTCCTGCGCATAACTTTCTTATATTAGCTG
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TATTAGATGAAGCTTATTTAACAGCTGAAGCATCTTTTATTCAAGGTAAG
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AAGTCACTGCTTGGAAATCCCCCACTTCTCGGACCTGACCAACTTCCTCT
GAACCAAGTCTTTGATCTCTTACACATTTCAACAGAGTCTTTTACTAAAG
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TCTCcctctattttctttgaaaggtgTTGACATTAAAAAAGTAATCGATT
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AGCCCATTCTTCTTTATGGTTCTGAAACCTGGACCATGACAAAATCTATG
GAGAAAAGTCTTGATGGGTGTTATaccaatctcctaaaaagggttcaaaa
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TACTGGTCCTAGACACTCAAGGAAGTGAACTTTCCTCGACAATTTGAGGC
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GAGCTGTGGAGAGAGAGATACTCGGTATTTCCGACCTGacggtcgaagga
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TCTTTTGTCTTTATGGGAttcaaccattgagtttcaagctcgAAGGTCTA
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AGGCAATGCCGGCAAAGTATCAACCAAAGTAACAACGCATTTTGCGAAAT
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GTGAGCGGCGCTTTGGGATTTCTTGGCAGCTCACCAACACCACAGCAAGC
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GAGAGCGTATGGGTTAAGAAACAGTATGAAGTGTTATTCGAAGGTTGGGC
TAACTGCATGATTTATTATTACAAAGATGAGAGTGCAGTTAATGAATGCC
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TTCAAAGGTAAAAATCCGAGCCGTCAAGAATTGAAACGTTTAGAGTTTCA
GTTCGAAGCTATTAGAGAATACTCTTTCTTAACACTTCTGGTGCTACGTT
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tttttcatGAAACAAGGTATGATCATTCCAGAAGAACTTGCTGATTATGC
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GTATTTGTAGGAGAACACTCACATGTAGCAAGATGAAATCAATgcaaaaa
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TAAATGTAAAATGATTCCAGATGCCGCAAGCCACGAATGGTGTAAATACC
GTCTGGATGTTTCTGTAAGCTCAAGTGAAAGATGGGGTCAACATTGGACT
GATAGTAGTAATATGGaaaaaaaaGGCGAACGAGAATTATTTGCATTATC
AGATCGTTTTTGGAGACAAACATCATCCGTGGTTCGAAAGTATTGGCAGG
AGACGGTGATGGTACAGGTTCCTAAATGGGAAGAATTTGCAATTCAAGCT
GAAAAGGAATATCAATTGCATAGAGGTATATCATTTTTATCGTTTGcaag
tttttcatattttagtaAGCTACGTAACTTCCACCATTATTGGACAAATC
AAGACTCCATTCTCTTGATTCCTGCCATGTCAGATAATTGTTCATATTGA
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GCCCTCCCCtgccttcgggtagacagctatacgaaaagggagcttttggg
tcgccctcgactgcggtcgcaaacgtacttacttacttacttaaatcTTT
TAGGTGGTAACCTTGCATTGAAGAGACCAACATACCACTCGAGTGCATAC
AATCAATGGAATCAACCAAAATCCTCTTTTGCAGTTGATGGTAACTACAA
CCAATGTCTTCCACGTGATCATTTGATCTCTCAGACTGGATATGGGTCAC
ATGAATCATGGAGGGTCATTTTAGATGGTATTTATGAAATTAAGAGTGTC
ATCTTGTATAATGTTGTTGATAACTGGACCAGTGACGACCTATCGAATGT
TAATATATATGTTGATGATATCGGTGACAAGAGAAGCTTTTGTGCTAAAA
CTGGTAACATGAAACACGTTTACATCAAAGAGTATAAATGTGCGGTCGGA
GCTATTGGCAATGTTGTCTTGCTTTTGAAGCCAAGCAGTGGGAGAGTGAG
CTTATGTGAAGTCGTTGTATATGGGGCCAAAggtaaatttgttttttttt
atttttctatgtacGATAATAAACTCTCGCTTatttgaacttctattatt
caaatctttctataatacGAGCTatctattatttgaatctctTTGTTATT
TAAACAAAGAAGATATCCCCATTCGAATATAAAGAACATGATTTATCTCT
TATCATTTGCTTATGCAGCACTCTTATGAACAATTTTCTCCCCCTTCTGC
GCAGCGCGGCTTAAGAATAACTTTtcgaaaattctattgttaaaTTTACC
TCGTCGGCATATGAGGCATCGccataaaaagaatatttttaagcttttgT
AGACGCTgctaattttaaaaaatcaactttttcaaacttaaaataaattt
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ggggggggtttaccACAGTGAAGACTTTGACGAATTGTTTAGATCTAACA
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TTTCGAATTTGACGGTAGTGAAAACCCGACGATTTCAGGTCTACATACAT
TGCGAACTTGCccatgttaaaggttttatttttacataagtgttcccgtt
tcatatcagacacatatttcatatcagaacagtgccttttgttatattgt
ggtgatataaacaaaaaaaaatttttcttgccCTCTTTCcgatcaatctt
gctccacatccgtgtcaattcaatgtaaaaaagcttgtaaattaaaattg
atgagtaagcaaacgatatcactcttatttaccCTTTGGATCCGGAcatt
attttggtattttagggTTCCTTGACACCTAGGCGAATGCGATGAAGAAT
GactttttgatggttttatAACCACCTGTAAaactatatattttctgaaa
gcatATGAAATGTAGAGTCTGAATACATATTCGAaagttaatgaaatttt
gctccTAGCAACCAGCCTAGGTTGcctagcaaccaaaatttctaaaaaat
atttttttttcgtcaattttcaactttggaGTCATCGTCATCTGAAGAGT
TGATTAGCTGAGTTTAGGCTACGAATATCCACAAAAATAAGACCAAGTTT
AGTACCGACCAAAtgcagaaaaaatatttgaagaagtttGTCTACTTTCC
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ttccttagaaaattaGTACGACTACTTTAATCTGTGATAGATAGAGACTG
AAAGATTCAATACTTTTGCTCTTACAAACCACTCAAAACACATGGTTTTC
AGATGGGTATATCTTCTTGAGACCatctggtgaaaatttcatagAAATCC
AACAACCTAATCAGATTTTAATGGTAGTTTGTTTTTGGCAGGTCAGATCT
GACCCGTCACGGATCCAAAGGGTtgaaacccagctggcacataacgttgt
ttcaacgtgtatctaacgttcacaacgtccatatgacgttatatgaacgt
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GAAGTGGTCTTGGATAGTCGATATCATATTGACAGTGTCATCATTTATGG
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CGTTCGCATCAAAAGGTTTCAGTGTGTAAATTTGTCACCAAAATCAATGA
AACTGCCAAAGTTCACAATTTCAAATGCGATCATCCGGCTTATGGTAATA
TTCTTCGAATTGCCAAAAATATCATGAGTGATCGTAACGAAGAAGTGTTG
CAATTATGTGAAGTCGAAGTTTACGGGCATCAATGTGAGTTTATTTGTCT
GCTAGAAGATTAGTAAAGGTGGAGCGACCGttgtcacaggaaaaaatttt
cgatttccaaggttggaaatttcaagttttcttagttggaaaaaagataa
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gttgaaaaagccaaaatccaaatttaacaaggttggaattttttaaaatt
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agtaagcaaacgatatcacctTTGAATTtaacagaaaattttgaatagaG
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GCAGCAGAGTCCAACGATCATTACAGTTATACAAAAGTACACACTGCTGG
ACGTGCAGTTAATGGAAATCATATGAATTGCCGACTTCCTCAAAACACTC
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TACCGAAGAGTTATCAAATGCTATTATCTATGTTACTGAGATTGAAAATG
AATATTATGATCGTAAAATGGATTTTCGTTTCAATGTCACTGGAAATATG
ACGGATGTCAATGCTCGAGAATTTACTTCACAATATTCAATGTTTGGTCA
TATTGTCaagattgaaaaagaaaaatctaatgAGCCTTTAACCTTATGTG
AAGTTGAAGTTTACGGAAAGAAAGGTACGCTTGATCTCTCGTTTTTGGTT
TATGTTATTGTGAACcgagctggcacacaacgttgttttaacgttcaaat
aacgttatttggacgttgtgaatgtcacatggacgttgttttgacgttgt
gtgccgtctgggaaATCACAAGGTTGGAATAAGTGTATATGTTGTTATTG
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AAGAAAGGGCGCAAAAGACACCTCTCGTTACTGACTTCGGCGCCtctttg
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CCCCccaaaatcttataaaaaaattgcctccccagtttgtcCGAATTTTa
atcgacccaccacgctactggtgTTGAATGGACTATAGGAGTagattttt
gagctttttatctacaattcatgatattgaAAGGGATCTGTATAGTTATA
cagtcccagctggcacacaacgttgttttaacgtttattcaacgttatat
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CTTAAACTCGAaactctacaactcgaatgtctccttaaaaCTCCTTCATT
TAACAATGTCTTATATAAAGCTTACTCACAAAATGTCcttaatttgaaca
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AGAGTTCATTTTGGGATATTCTAGGATTTTGCGAGGGTGTTTCACTATAT
AAtccaaaaaaaagcaaaaaagggcgGTGGCGTTTATTTGGCATCTGATG
GTTTATTTAATGaatccttttttttattttgcagtTACAAAGTCGGAAAT
AAGGACGATCAGAGCAAAAGAAGCGTGCGAAATCCCAAAGaaaaaaaTCG
AGCAATTAAAGAAAGAAGGCAAACCAATACCACAGCATCTAAAATTTCGA
ATGGAATTCTCTTGTGGTCGTGGAGGAATGTTTGGAGGTTTTGGTTTACC
ATTTGGTGGCTTCGGATTCTAAATAAGTTGAATATGTAACGTGTGCTAGT
GTATACACCTTTTTGATCGTAGCCAccaattaccgcgcgggcattttttt
gtctgttttaccaccctaaaaccgtcccagtcgttttttcgcacctatag
acaattagtgtggtcgtgttacaaaaatacaggctgtttgtaggaaaata
ataagatctagctgaaactttctccagaccttctctataggatgcttata
cctcaggaaaaattcccctaaaatcccactggtggaacatcccttttttg
ggacatttctattttccccaggcaaaatcctaagggcgaaattttttgaa
aatttcaaacttatCTCCAGACAATATCATGTATACCATTCGAAAGCTCT
CGAAAAACTATATAGAAGACTTTTAAACGGTTATAGCTGATTTCCTTACC
TAACTCGAGATATTTCATGCGCAAGTTCCACTTTTCGCCACACTTTGGTC
AAAATTGACCATAAATAGCATCTTCTGTGTGAATTATCTCGAGTTAGCTA
ATGAAATCGgctataaccgtttaaaagtcttctatatagtttttcgagag
ctttcgaatggtatacatgatattgtctggaaataagtttgaaattttca
aaaaatttcgcccttaggattttgcctggggaaaatagaaatgtcccaaa
aaagggatgttccaccagtgggattttaggggaatttttcctgaggtata
accatcctatagagaaggtctggagaaaatttcagctagatcatattgtt
ttcccgtaaattatgctataCGACCCCACtaaatagaaaaaggtgtcaaa
aaaggattggatccaGTCCAGGGGGGataattgaataataaagtggcaca
cgcctgaccgcacgactacggtcgaaaaagtgtgTTCATATGATATTCAT
tgcgtaatgttttctacggaaatatcCTAGTTTCTACCAGTATCAATCat
aaatataataaattttgtaatttctttaaCCAGACTGAACCTTGATTAGC
CAAGATCCTAAGCTGTATTCAACCATGTATACTATTAGCTTAGTCGCAAA
GAAATTTGGTAAAAACAATTTGTCGCTTTAATTTTGACAGGAAAAGTACT
ACAATCTGATTAGATGCGATAAAACGAGCTGCAACGAAGATTTGTTTGCG
AATATAGGCGTTTGTATGTATAGTTGACCCTCTCCTGACGTTCTAcaatt
cgataggctcccttactcgatgaaatttaaagtccctgtcaacaagaaac
tcataaacgacgctcccttatttgatgaaaatcctattccccttgaagat
cgaattagagaacgtcaacTACAATGAAGACTTGTTGAACGGAGGTTATA
CATCATGTCTGAGACTCTGGCTAAACTTTGATTTACTCTAGGATTCTGTG
TATATAGTTGTAAATAAGGCACCCAGATACGGCAAATAACGTTGCTTcta
cgtttatctaatgttcacaacgtccgtATAACGTTGGATGAACGTTGACC
ACGTTATGTGACAGTTTGGCCAATAACGTGATttgatacacttttttata
atagcaaaataaaaattgaaacatgaagCTTTTAATGATTTACAGACTCT
AAAGCGTGTAGTTTTTACAGAAattacaggcccggcggaagcggggagac
ttgGGAGACTTCCCACTTTAACGGCTATTCCGCCGGTTTCTTAGGAAAAC
TgataaaaatattcacaaagtGATGAAAATGTAAATATGTTAAGAGCTCT
TAGGGTCCTTAGGATCCGTAGAACCTTTCGTAGGACTCAACCGCATATGA
TTGGTTTCGAAAGTAAATAGGGTTTCGAAATCTTTTCGAGAGGGGGCTCC
AAATTAGGCCTAACATACAAGCAAAATTCTTAACCctcaaaataagtaaa
aaatg Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000093_pilon:927094..941698+ >MSTRG.12399.2.p1 ID=MSTRG.12399.2.p1|Name=MSTRG.12399.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2628bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000093_pilon:927094..941698+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGCAACCGACGTCGAAGTATCTTTGAAGGACGTTCGCATCAAAAGGT
TTCAGTGTGTAAATTTGTCACCAAAATCAATGAAACTGCCAAAGTTCACA
ATTTCAAATGCGATCATCCGGCTTATGGTAATATTCTTCGAATTGCCAAA
AATATCATGAGTGATCGTAACGAAGAAGTGTTGCAATTATGTGAAGTCGA
AGTTTACGGGCATCAATttAAGATTCAAAGAGGAGAAATGGAGAATATAG
CTTATCGTGGTCAAGCAGCAGAGTCCAACGATCATTACAGTTATACAAAA
GTACACACTGCTGGACGTGCAGTTAATGGAAATCATATGAATTGCCGACT
TCCTCAAAACACTCTCACCAGAATTGTTGATAGATATACAGCATGGTGGC
AAGTTCGTCTTCCCTCGCTGTCCAAGGTTGAAAGTGTCATTATCTATAAT
CGAATCGACTGTTGTACCGAAGAGTTATCAAATGCTATTATCTATGTTAC
TGAGATTGAAAATGAATATTATGATCGTAAAATGGATTTTCGTTTCAATG
TCACTGGAAATATGACGGATGTCAATGCTCGAGAATTTACTTCACAATAT
TCAATGTTTGGTCATATTGTCaagattgaaaaagaaaaatctaatgAGCC
TTTAACCTTATGTGAAGTTGAAGTTTACGGAAAGAAAGtTACAAAGTCGG
AAATAAGGACGATCAGAGCAAAAGAAGCGTGCGAAATCCCAAAGaaaaaa
aTCGAGCAATTAAAGAAAGAAGGCAAACCAATACCACAGCATCTAAAATT
TCGAATGGAATTCTCTTGTGGTCGTGGAGGAATGTTTGGAGGTTTTGGTT
TACCATTTGGTGGCTTCGGATTCTAAATGGGCAACCGACGTCGAAGTATC
TTTGAAGGACGTTCGCATCAAAAGGTTTCAGTGTGTAAATTTGTCACCAA
AATCAATGAAACTGCCAAAGTTCACAATTTCAAATGCGATCATCCGGCTT
ATGGTAATATTCTTCGAATTGCCAAAAATATCATGAGTGATCGTAACGAA
GAAGTGTTGCAATTATGTGAAGTCGAAGTTTACGGGCATCAATttAAGAT
TCAAAGAGGAGAAATGGAGAATATAGCTTATCGTGGTCAAGCAGCAGAGT
CCAACGATCATTACAGTTATACAAAAGTACACACTGCTGGACGTGCAGTT
AATGGAAATCATATGAATTGCCGACTTCCTCAAAACACTCTCACCAGAAT
TGTTGATAGATATACAGCATGGTGGCAAGTTCGTCTTCCCTCGCTGTCCA
AGGTTGAAAGTGTCATTATCTATAATCGAATCGACTGTTGTACCGAAGAG
TTATCAAATGCTATTATCTATGTTACTGAGATTGAAAATGAATATTATGA
TCGTAAAATGGATTTTCGTTTCAATGTCACTGGAAATATGACGGATGTCA
ATGCTCGAGAATTTACTTCACAATATTCAATGTTTGGTCATATTGTCaag
attgaaaaagaaaaatctaatgAGCCTTTAACCTTATGTGAAGTTGAAGT
TTACGGAAAGAAAGtTACAAAGTCGGAAATAAGGACGATCAGAGCAAAAG
AAGCGTGCGAAATCCCAAAGaaaaaaaTCGAGCAATTAAAGAAAGAAGGC
AAACCAATACCACAGCATCTAAAATTTCGAATGGAATTCTCTTGTGGTCG
TGGAGGAATGTTTGGAGGTTTTGGTTTACCATTTGGTGGCTTCGGATTCT
AAATGGGCAACCGACGTCGAAGTATCTTTGAAGGACGTTCGCATCAAAAG
GTTTCAGTGTGTAAATTTGTCACCAAAATCAATGAAACTGCCAAAGTTCA
CAATTTCAAATGCGATCATCCGGCTTATGGTAATATTCTTCGAATTGCCA
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GAAGTTTACGGGCATCAATttAAGATTCAAAGAGGAGAAATGGAGAATAT
AGCTTATCGTGGTCAAGCAGCAGAGTCCAACGATCATTACAGTTATACAA
AAGTACACACTGCTGGACGTGCAGTTAATGGAAATCATATGAATTGCCGA
CTTCCTCAAAACACTCTCACCAGAATTGTTGATAGATATACAGCATGGTG
GCAAGTTCGTCTTCCCTCGCTGTCCAAGGTTGAAAGTGTCATTATCTATA
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TTTCGAATGGAATTCTCTTGTGGTCGTGGAGGAATGTTTGGAGGTTTTGG
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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000093_pilon | genome | sc0000093_pilon:927094..941698 + |
|
