MSTRG.12382.5.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12382.5.p2
Unique NameMSTRG.12382.5.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000093_pilon:696639..732074-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12382.5.p2 ID=MSTRG.12382.5.p2|Name=MSTRG.12382.5.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=35436bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000093_pilon:696639..732074- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTTTTTAATAGAGGAAATAAATTAAATAAAACTACATACAAGATGAAAGC AACAAATTTATCAAACTCCATCAACATGTCATCGCCTTTGCATCATTTTC GAGAGAAAAATGACGAGAAAGCTGTCAACATGTTGAGTATGATGAAAGAT AAAAGTTTTGATCAACCATTGTTTGAAGCAGAGAAAGTCCAAGAAATGGA AGAACGCGCAAGATCAAGATTGAGTGAATACGATCCAGCAGATTCCTCTT TGAAACAAGGTAAGCGCGGCTGACTTTCTTTTTATGCAGTGTTAGAAGTT TTCTCCGCTCAGACAGATCTCTATCTCAGGGAAGTAAATAAAGAGGCTTG TATGTCTCAAAGTTTAATTCACTAAAGTTTCCAGAATATTTACTAACCTT GCTTTCACCAGTGCTCTTATTCATTATTCTTGTTTCTTCCTGTTAGCTTA CCTCAAGAAGGTTGAGATAATGTGTTCTCTTTAAAATTCTTAAAAAAATA AAAGTTAACTGTTGTCTTCTATAGTCCGTTCAGTGTCATGCATTGTTTTT GATAGTTAATAAAATGAAAAGAATCACATCTGAAAGCCGTTAACAAATAT CTAACTGAAAATGAACAAACTATAATTTTAATCTTCATCTGTTATGAAAA TGACATCTTAAAATAAAAATTTGAATTTAATTTTACTATCTAGACAAGTA ATATGGTGGTCTCCTGCAGTGTTTGTTTGAATCCAGCTATACTAGAAAAA GAGACTAACAACTGTGATAATAATAACAATAACAATTACAGTACAGTTTT TTATACAATCTTAACCCCGCAAGGATTGGATCAGCCATGTCATTTTTCAA TAATATTTAAACAAGGTCTTTTTACTTTAAAGATTTTTTAAAATAATTAT TGTAATAGCTTGATGTAATGTAATTTAACTAAACTTTATTTTTCAGCTAC 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000093_pilon:696639..732074-

>MSTRG.12382.5.p2 ID=MSTRG.12382.5.p2|Name=MSTRG.12382.5.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3375bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000093_pilon:696639..732074- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAACTCAAGCTATAGTCACCATCAATGCAAGGACATCTCGTATTTTGATT
ACCAACGAGACAGCATGTGACCTGTTTGGTTACACAGATGAAGAATTATG
TGGCAAGCACATGAAAGTATCTCAACTGTTCACAATGGAGGATGGTGTGA
AACAGAATGTTTTGATTGAACAGAATATTGATAAAGAAGGAAATATTGTT
ATGGTTTCAGGGAAAGTGGTATATGATTTGTCTAAGTCATACCACAGTAT
CAGCTACTGCGCAAGTCCATGTCCTGGTAATATATCAACAAACAGTCCTG
CACAACATTCCTTGAATGCTTCATGGCAATTTTTTAATTTTATGGGTGGA
TCAGCTGAAATTGAGAACAACACCAATTCGCAGTATAAAAAACCTCTACC
ACTGATTCAATGTCTTCTAAATCTAACCTCTCTACAATATCAAAGAGCAG
TCATAAATATGAAAGCAACAAATTTATCAAACTCCATCAACATGTCATCG
CCTTTGCATCATTTTCGAGAGAAAAATGACGAGAAAGCTGTCAACATGTT
GAGTATGATGAAAGATAAAAGTTTTGATCAACCATTGTTTGAAGCAGAGA
AAGTCCAAGAAATGGAAGAACGCGCAAGATCAAGATTGAGTGAATACGAT
CCAGCAGATTCCTCTTTGAAACAAGAAACTCAAGCTATAGTCACCATCAA
TGCAAGGACATCTCGTATTTTGATTACCAACGAGACAGCATGTGACCTGT
TTGGTTACACAGATGAAGAATTATGTGGCAAGCACATGAAAGTATCTCAA
CTGTTCACAATGGAGGATGGTGTGAAACAGAATGTTTTGATTGAACAGAA
TATTGATAAAGAAGGAAATATTGTTATGGTTTCAGGGAAAGTGGTATATG
ATTTGTCTAAGTCATACCACAGTATCAGCTACTGCGCAAGTCCATGTCCT
GGTAATATATCAACAAACAGTCCTGCACAACATTCCTTGAATGCTTCATG
GCAATTTTTTAATTTTATGGGTGGATCAGCTGAAATTGAGAACAACACCA
ATTCGCAGTATAAAAAACCTCTACCACTGATTCAATGTCTTCTAAATCTA
ACCTCTCTACAATATCAAAGAGCAGTCATAAATATGAAAGCAACAAATTT
ATCAAACTCCATCAACATGTCATCGCCTTTGCATCATTTTCGAGAGAAAA
ATGACGAGAAAGCTGTCAACATGTTGAGTATGATGAAAGATAAAAGTTTT
GATCAACCATTGTTTGAAGCAGAGAAAGTCCAAGAAATGGAAGAACGCGC
AAGATCAAGATTGAGTGAATACGATCCAGCAGATTCCTCTTTGAAACAAG
AAACTCAAGCTATAGTCACCATCAATGCAAGGACATCTCGTATTTTGATT
ACCAACGAGACAGCATGTGACCTGTTTGGTTACACAGATGAAGAATTATG
TGGCAAGCACATGAAAGTATCTCAACTGTTCACAATGGAGGATGGTGTGA
AACAGAATGTTTTGATTGAACAGAATATTGATAAAGAAGGAAATATTGTT
ATGGTTTCAGGGAAAGTGGTATATGATTTGTCTAAGTCATACCACAGTAT
CAGCTACTGCGCAAGTCCATGTCCTGGTAATATATCAACAAACAGTCCTG
CACAACATTCCTTGAATGCTTCATGGCAATTTTTTAATTTTATGGGTGGA
TCAGCTGAAATTGAGAACAACACCAATTCGCAGTATAAAAAACCTCTACC
ACTGATTCAATGTCTTCTAAATCTAACCTCTCTACAATATCAAAGAGCAG
TCATAAATATGAAAGCAACAAATTTATCAAACTCCATCAACATGTCATCG
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GAGTATGATGAAAGATAAAAGTTTTGATCAACCATTGTTTGAAGCAGAGA
AAGTCCAAGAAATGGAAGAACGCGCAAGATCAAGATTGAGTGAATACGAT
CCAGCAGATTCCTCTTTGAAACAAGAAACTCAAGCTATAGTCACCATCAA
TGCAAGGACATCTCGTATTTTGATTACCAACGAGACAGCATGTGACCTGT
TTGGTTACACAGATGAAGAATTATGTGGCAAGCACATGAAAGTATCTCAA
CTGTTCACAATGGAGGATGGTGTGAAACAGAATGTTTTGATTGAACAGAA
TATTGATAAAGAAGGAAATATTGTTATGGTTTCAGGGAAAGTGGTATATG
ATTTGTCTAAGTCATACCACAGTATCAGCTACTGCGCAAGTCCATGTCCT
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GCAATTTTTTAATTTTATGGGTGGATCAGCTGAAATTGAGAACAACACCA
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ACCTCTCTACAATATCAAAGAGCAGTCATAAATATGAAAGCAACAAATTT
ATCAAACTCCATCAACATGTCATCGCCTTTGCATCATTTTCGAGAGAAAA
ATGACGAGAAAGCTGTCAACATGTTGAGTATGATGAAAGATAAAAGTTTT
GATCAACCATTGTTTGAAGCAGAGAAAGTCCAAGAAATGGAAGAACGCGC
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AAACTCAAGCTATAGTCACCATCAATGCAAGGACATCTCGTATTTTGATT
ACCAACGAGACAGCATGTGACCTGTTTGGTTACACAGATGAAGAATTATG
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AACAGAATGTTTTGATTGAACAGAATATTGATAAAGAAGGAAATATTGTT
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AAGTCCAAGAAATGGAAGAACGCGCAAGATCAAGATTGAGTGAATACGAT
CCAGCAGATTCCTCTTTGAAACAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12382MSTRG.12382Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12382.5.p2.exon18MSTRG.12382.5.p2.exon18Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.5.p2.exon17MSTRG.12382.5.p2.exon17Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.5.p2.exon16MSTRG.12382.5.p2.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.5.p2.exon15MSTRG.12382.5.p2.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.5.p2.exon14MSTRG.12382.5.p2.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.5.p2.exon13MSTRG.12382.5.p2.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.5.p2.exon12MSTRG.12382.5.p2.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.5.p2.exon11MSTRG.12382.5.p2.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.5.p2.exon10MSTRG.12382.5.p2.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.5.p2.exon9MSTRG.12382.5.p2.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.5.p2.exon8MSTRG.12382.5.p2.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.5.p2.exon7MSTRG.12382.5.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.5.p2.exon6MSTRG.12382.5.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.5.p2.exon5MSTRG.12382.5.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.5.p2.exon4MSTRG.12382.5.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.5.p2.exon3MSTRG.12382.5.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.5.p2.exon2MSTRG.12382.5.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.5.p2.exon1MSTRG.12382.5.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12382.5.p2MSTRG.12382.5.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000093_pilongenomesc0000093_pilon:696639..732074 -