MSTRG.12382.2.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12382.2.p2
Unique NameMSTRG.12382.2.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000093_pilon:696573..737817-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12382.2.p2 ID=MSTRG.12382.2.p2|Name=MSTRG.12382.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=41245bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000093_pilon:696573..737817- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TCTTAGGAATTCCTCGAGGGTATTCTATTGTACCTTATCTGCCAAAACTT AATCGGCCTTAATTTTAGTCGGCCTTAATTATTAGTCGGCCCTAATTTTA GTCACCAAGCCAAAATTTAGTCACTTAGGGCCGACTAAGTTTTTTTCGAC AAGGTAATACTCCTGAAACAATCCCACAATGCATGTTCATGTGCATACGA TTAAATGCTTTTAGAGTATTCATGTTTTTATAAGAACAAACTATATAAGA ACACAAGGCTTCGATGGCCAAAATATCAAGAACAAGTTGAGATTATTTTT AAGGCTTTGCGGACTCGAAAAAGGCCAATTTCTTAAGAAAATTGACAAAA ATGCCCACTAAATGGTGAACATAAGAACATGATAAAAACATTTTTAGGCT TTGAACTCAAAAAGTGAAGAACATCTAAAGGCTTCAAAAATCTTTCGATG TTCTTATAAAAAAACGTGTATAAGGAACTTGAGGCTCAAAATGGCCCTAT AGGAACGGTAAGAGTTAAACCTGAACAAAAAGTTGATCAAATATTGATGA TCAAATCAAAACCAACTATACCAATCTTAAACAGCTAAGTAAACGAGGAA CTCGATAAGGAACTTTGATGCTGAAATTTTTTGGATAAATAGGTTGGTTC CTTATTAAAAAAAACGTACATTGTTGAGTATGTCTAAATTTCTTCAATTT TGGCATTCAATAAACGGGGTAATTCAATAGCAATTAAATTTGTACCAATT TGTCTTTCTAATGACTCATTATTTTAAGCTCGACATTCTGATATCTGCGG TCAAGGTGTGGCTTTTTATTATAATTTCCTACAATTAGTGTAGCATTTTT TCGGCTATTTCCGGCTAATTATCGTGAACTTTACTTTATATATTTGAAGA GGTCATAGAATAAATTAATTCATAGTTCGAACCCCCCCCCCCCTTTCTTA AGGGGGGGTGACACCTTCCAAAAAAGTGAAGAAGGGGGGGATCAGAAATT TTCACTAAAAAGGGGGGGGGATAGCAAGGAGGGGGGGATAGCAAGGAGGG GGGGATCGTTTAAGAAGGGGGGCTTACATATATTGTAGATTATTTTCCAG CACTGTTATGAAATTTGGTCTGCATGAAATATTTTCACTAAAAAGTGGTA TATATTTGCCAGACTTAATTTTTCTTTACTGTTTCCCTTCCCTTTTTACC ATAAAAATTTAGCCCGAAATCCTTGGGGGATAGGTATTTTTAAAGGTTGG GGGGGATGCCAAGAAGGGGGGATCATTTAAGAAGGGGGGGATCAGACCCC TTTCTGCACTATGTAATTTAGTTTGACTTTGTTTATCCTGCTGTTGTCCC GCGTATATTTATACCCATTGCCGTATGGGTCTATTGTCATTGTCTTTTCT CATTTGAGATTTTTTAAACCGACCGCTGCGATGGAGTGTTGGTGAGAGAG GGGGGACGATGAGATAAGTGTTGCTATTTATAAATCATACTTCATCGCAG AGGTCTCCGTACGGGAATTTTCTTATCAAACAGACAATGCGCACAGAGTG TACTACGAAGCGATAAACGTACAGAGTACGTACATAGTGTCCCCCCCCCC TGGATTCAGGGGGGAACGGGTTTTGAGGTCAAAAGGACGTATAGGGGGGA AAGAATTTTTTTTGAAGCCAGGCATAATGCTTAGTTTTATTAATATTATG GTTTAAAAACAACCATCCTTTCCATATATTCTTGAATTAGAACTACCTTA GGGAAAACAATAAGCGTTAAGTTCATCAAATTACAGCTTTTTAATTTTAT GCTTGAGGGGGGGGGGAAAGAAAAATTTTCGGAGGCAGGGTGGGGAAAAA TGAGGGGGGGGGGAATGGAAAATTTTCATTCTAGGCATGGGGGGGAAGAG ACCCTGAAGGACACTATGACGTACAGAGTACGGGTATATCGACCTTTACA AATTCAAGGATTATTTACTTTTCGTTTTCTAATCAACCCAAACAACAATT AAACACATTAGCAATTGATTATAAAGGTAGTGAGTGTTTGAGGGGTGATC TACGCTCTTTTTTTCACAAGACAACGTAGGCTGCATGCATCCCCAAATTA GTTTTGATATAGGGGATGCGAATTGGGCTCTGATATCGCTTCCGAGAAAA TTACCGAATAGCTATGTATTTTGCAGAATTTTGGCGACTTGTATTTTTAA AAAAACTCGATGTGTATTGTTTGAGTTATTTGATGACGTAAATAGAAATC AAATAAAGATTCCCATAAAAAGAACATATGGCTAGAAATCTCTCTTTCTC CTCCTCTTTCTTTTTGTTTATCAAAATTAATTGAATTAGCAAACAAAAAT CTCAAGATAACAAAAGACGACAAACTGTCAATCAAAGTTCTCTATCATTC AACTCTTTTTTTGGTTAGCAGATTTTTTGCTAAGTTCGGAACGGTTTTGT GAGCCTGATTCGCATCCCCTATATCAAAACTTATCAGAGGGGATGTGTGC AGCCTAAAGACAACGAGGCTCTGAAATATCGGTGCTGAGCTGTTAAACTA GGCCAAAAAAACTTCATCATTTGTTGAATTTCGATTCTAACCTAAGAATA ACATTTAAAATATTGTTGTATGATTTACCCAAAAAAATGTTAAGAATATC AATGATGAAATGGAAAAACACTATTCTTACAAAAAAGCATATAAAGCGGC GCTCTTTGTAGTGAGGTCTGGTAGCACATAAAAACGTAAGAATACTTCAG ATGGTGATAAAAGCATGAAATTTGGCACCGAAGATCTTTAGAGGGTCTAA AACTTAATTTCAAACAGTAACACTAAAATTTGCCACCTGGCCACCTGCCA GATGACGTCATCAGGTGGCTGATGAAAAGATTATTTTTTTGAAAATATTC AAAATCTGATGGTTCCAGCGGAAAGAACATGAAATGCTGATGAAAATCGA GGTACAAAACATGCCTTTAAAATCTTCCTATCAAAAGTTATGAAGGTTGA AAGTTTTGTGATGACGTCATCATAAGCCTTTCCAGGCAAAACCTAAAAAT GCCGTAATAACGAACTGGTTGACCAAATTTGGTGTTTTATACATGAATCA TGAATATATTATTGAATATTTATTTTTGTGCTAACAGACCTCACAAGAGT ACCAGAATATCTTAATTTTTAGGAATTTTTTTCTAAAATACCCTGTGATT TCTTATTGCGACGTAAGGTCATTTTTCCATGGGATTGGAAACATATTTTA AAAAGGGCTTAGGGAGAAGAAAGATCAGTCATTAGGGATTTTTGAAAGAT ACAGGTACCCACCCTATGTCGCCTCCTTCTTTTTACTGTAAAATTTTGAC TTCCTGGCTCATGCATTGTTTTTTTTAAGAACTTCCAAAAACATTTAAAG ACTTCAGATGTTCCAAACTTTTTAAGTTTCGAGCCTAAAAATGTTCCATG TTTAAATCATGCTCTTACACGCTTACACTTTTTAATTCATCATGAATATT CTTAACTTTTTGGGGAAAATCATCCTGAAATATTCTTACAGTATTCTTAG GTTTGGATCCAAACCCAGCCCAAATCTAGTGTGTAATACATACCTCAAGC AAAAATTTGGCATTTTTGTTGAACCTCTTAGCATTGTTGGGTAATAGTTG GCAATTTAATAGTAATATTCTCTAAAATGGCATTCTTATGTTCAGTTGCC AAATCCCAGAGAATCTCCTCTTTAGTAAGCTATATTTACGTAAGAAATCA ATTAAAGAGGAATTTCTTGAGCGCGTTTACAATTTGATGTGTTTGTGTGC GGTTCCCTATGAAAAAATAATCGCTAAAACCAAACGAATACATACCATTG TAATTATATTTTTAAAGGACATTACACAATACTCAATCGATTGCATTGCA AAATGCCTATAAAATATGTATACACAAACTATATAAGAACATCAGGCTTA TATGGCCTAAATATTAAGAACGAGTTAAGAACATTTTAAAGAACCTACAA CTCTCTTTTTCTTAGGAAATTGGCCCAAAATACTTACAAAATGGTAAAAA AGAGAACATGTTAAGAGCATGTTTAGGCTTGAAACTGAAAATGTGGGGAT CAAATTGCGCGGCTGAGCTCATCCGCGAAATTCTAAGATTTCGCAGGGAC TTAATTTCGCGGATGACATAACCGGAAACAATGTTTTCACGCTTTTGTGT CTTTTTACTGCCAAATTATACATACATGCTGATGTATGTTCAAAAATCAT CTTGAAATACTCTATACACTTATTTTTTATACGAACCAGTAAAATTTTTC TGAAACTTGGCTGTTCTATTTTTTTTGGCACTTTGAGCCTCAAATTGCTC TTATTCTGTTCTTATTTATAGGGTGTGATTGATCATTGTTTTTATAAAAT TGTTCTAATAAAAAAAGTTTAGAGCTTCTTTTATAAGCCAGTTAACATTT TAAAAGTAGTTATTTGACATTTTAAGAGCTTTGTTCAAAAAAATCTCGTG GGACTTAATTTTGCGGATAACACAAAATTCACGAAATTTATTCACGGGGA AAATTTATCCCATTAAAGTAGCTCCAACTTCTTGAATTAAATCTCAAATT GAGAGTAGACTCGCGGTGTCATTTGAAACAAATTTCAACGATTTGTCTGA CCACGTTCAGTTGCATTTTAGGGTGTCTACGGGAATGAATATTTTTCAAA ACTTTTTTCACATTTATGACTTCCTAAGATAGAAGAGTTTCTGATGCAAA AATGAAGATCGTAGCATTATACTACAAGAAGTTGATTTTTCTTCCTCTTC ATTTTTCATTTTTTGAATTATTTTCTTTTTTGATAATATTCCACTCCGAA TTTTCTTTTAAACGAGCACAAAACCGCAAATTAATTCAAATTTTATCAAA AGTTATTGAGGTTTGAAAAAGACTGCTAGCTAATTTTTAATCGACATTAA ATTCATATTTTTTATTTTTCATAGGTGTCACAGACGAACCAGACAACAAT ACCGAAAATCTAACGTGCCAAAGTCCTCGTAAAAGTCCGCATTCCAACGC GACCGGCAACCAATCTCATAAGAAAACAATGACGTCATCAAGTCACTCCT CCACATCGTCATCAATGACGTCATCTTCATCGTTCTCCTCCTTAGATGAT TTAGCGAGTTCGCATGACAGCGAGTTGGAGAGGAATAAAGAGTTGATGAA AGAAGAGTATAAGAGATATTTGGAGGATCCGAATAGCACTGAAATAAGCA ATGCAGTACTGTCAAAATCATTCTAATTGTATGGTCAAATAAACTAAGGC TTCGCACGATTGGAATATTTCGAGGACCCGAATAGCATTGAAATAAGCAA TGCAGTACTGTCAAAATCATTCTAATGGTATGATCAGATAAACTAAGGCT TCGCATATATAGAATATTTTGATGACCCAAATAGCACTGGAATAAGCAAT GCAGTACTGGCTAAATCATTCTAATGGTATGATCAGATAAACTAAGGCTT CGCATATATAGAATATTTTGATGACCCAAATAGCACTGGAATAAGCAATG CAGTACTGGCTAAATCATTCTAATGGTATGGTCAAATAAACTAAAACTTC GCACGTATGGAATATTTAGAGGACCCGAATAACACAGAAATAAGAAAAAT CATTTTAATGGTCTAATAATGGTATGGTCAGATAAACTATATATGGAATA TTCAGAGGATCCGAATGGCACAAAAATGAGAAATACAGCATTGTCAAAAT CCTTTTGATTGGAATCTTAAAGAGCTGTCATTCGGAGAGGAACAATTGCA CCTGAAGACGCAGATAATCCAGACCTGTAGAAAGTAGGTTCGACCACTAA AGAAAGAAACAAACAGCGCAGAATTATTAAAATCGCCAGTTGATGGCGAA CTATTCTTAGTATTGTATCAAGCTCGACTAATTTTGGAACATCTGACACT TTCAATAAATCAGGCTTCCTTTTTTCAATAGTTCACGAAAATTTCTTTTA ATGAAGTGCGTTTCTTTCACCGTGAATTTGTGTGTCGCCGAAAGAAAAAT CTTATCCAAAATCATTTTACCAATCACCTATAAAGAACCGGTTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000093_pilon:696573..737817-

>MSTRG.12382.2.p2 ID=MSTRG.12382.2.p2|Name=MSTRG.12382.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2448bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000093_pilon:696573..737817- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAACTCAAGCTATAGTCACCATCAATGCAAGGACATCTCGTATTTTGATT
ACCAACGAGACAGCATGTGACCTGTTTGGTTACACAGATGAAGAATTATG
TGGCAAGCACATGAAAGTATCTCAACTGTTCACAATGGAGGATGGTGTGA
AACAGAATGTTTTGATTGAACAGAATATTGATAAAGAAGGAAATATTGTT
ATGGTTTCAGGGAAAGTGGTATATGATTTGTCTAAGTCATACCACAGTAT
CAGCTACTGCGCAAGTCCATGTCCTGGTAATATATCAACAAACAGTCCTG
CACAACATTCCTTGAATGCTTCATGGCAATTTTTTAATTTTATGGGTGGA
TCAGCTGAAATTGAGAACAACACCAATTCGCAGTATAAAAAACCTATGAA
AGCAACAAATTTATCAAACTCCATCAACATGTCATCGCCTTTGCATCATT
TTCGAGAGAAAAATGACGAGAAAGCTGTCAACATGTTGAGTATGATGAAA
GATAAAAGTTTTGATCAACCATTGTTTGAAGCAGAGAAAGTCCAAGAAAT
GGAAGAACGCGCAAGATCAAGATTGAGTGAATACGATCCAGCAGATTCCT
CTTTGAAACAAGAAACTCAAGCTATAGTCACCATCAATGCAAGGACATCT
CGTATTTTGATTACCAACGAGACAGCATGTGACCTGTTTGGTTACACAGA
TGAAGAATTATGTGGCAAGCACATGAAAGTATCTCAACTGTTCACAATGG
AGGATGGTGTGAAACAGAATGTTTTGATTGAACAGAATATTGATAAAGAA
GGAAATATTGTTATGGTTTCAGGGAAAGTGGTATATGATTTGTCTAAGTC
ATACCACAGTATCAGCTACTGCGCAAGTCCATGTCCTGGTAATATATCAA
CAAACAGTCCTGCACAACATTCCTTGAATGCTTCATGGCAATTTTTTAAT
TTTATGGGTGGATCAGCTGAAATTGAGAACAACACCAATTCGCAGTATAA
AAAACCTATGAAAGCAACAAATTTATCAAACTCCATCAACATGTCATCGC
CTTTGCATCATTTTCGAGAGAAAAATGACGAGAAAGCTGTCAACATGTTG
AGTATGATGAAAGATAAAAGTTTTGATCAACCATTGTTTGAAGCAGAGAA
AGTCCAAGAAATGGAAGAACGCGCAAGATCAAGATTGAGTGAATACGATC
CAGCAGATTCCTCTTTGAAACAAGAAACTCAAGCTATAGTCACCATCAAT
GCAAGGACATCTCGTATTTTGATTACCAACGAGACAGCATGTGACCTGTT
TGGTTACACAGATGAAGAATTATGTGGCAAGCACATGAAAGTATCTCAAC
TGTTCACAATGGAGGATGGTGTGAAACAGAATGTTTTGATTGAACAGAAT
ATTGATAAAGAAGGAAATATTGTTATGGTTTCAGGGAAAGTGGTATATGA
TTTGTCTAAGTCATACCACAGTATCAGCTACTGCGCAAGTCCATGTCCTG
GTAATATATCAACAAACAGTCCTGCACAACATTCCTTGAATGCTTCATGG
CAATTTTTTAATTTTATGGGTGGATCAGCTGAAATTGAGAACAACACCAA
TTCGCAGTATAAAAAACCTATGAAAGCAACAAATTTATCAAACTCCATCA
ACATGTCATCGCCTTTGCATCATTTTCGAGAGAAAAATGACGAGAAAGCT
GTCAACATGTTGAGTATGATGAAAGATAAAAGTTTTGATCAACCATTGTT
TGAAGCAGAGAAAGTCCAAGAAATGGAAGAACGCGCAAGATCAAGATTGA
GTGAATACGATCCAGCAGATTCCTCTTTGAAACAAGAAACTCAAGCTATA
GTCACCATCAATGCAAGGACATCTCGTATTTTGATTACCAACGAGACAGC
ATGTGACCTGTTTGGTTACACAGATGAAGAATTATGTGGCAAGCACATGA
AAGTATCTCAACTGTTCACAATGGAGGATGGTGTGAAACAGAATGTTTTG
ATTGAACAGAATATTGATAAAGAAGGAAATATTGTTATGGTTTCAGGGAA
AGTGGTATATGATTTGTCTAAGTCATACCACAGTATCAGCTACTGCGCAA
GTCCATGTCCTGGTAATATATCAACAAACAGTCCTGCACAACATTCCTTG
AATGCTTCATGGCAATTTTTTAATTTTATGGGTGGATCAGCTGAAATTGA
GAACAACACCAATTCGCAGTATAAAAAACCTATGAAAGCAACAAATTTAT
CAAACTCCATCAACATGTCATCGCCTTTGCATCATTTTCGAGAGAAAAAT
GACGAGAAAGCTGTCAACATGTTGAGTATGATGAAAGATAAAAGTTTTGA
TCAACCATTGTTTGAAGCAGAGAAAGTCCAAGAAATGGAAGAACGCGCAA
GATCAAGATTGAGTGAATACGATCCAGCAGATTCCTCTTTGAAACAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12382MSTRG.12382Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12382.2.p2MSTRG.12382.2.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12382.2.p2.exon18MSTRG.12382.2.p2.exon18Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.2.p2.exon17MSTRG.12382.2.p2.exon17Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.2.p2.exon16MSTRG.12382.2.p2.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.2.p2.exon15MSTRG.12382.2.p2.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.2.p2.exon14MSTRG.12382.2.p2.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.2.p2.exon13MSTRG.12382.2.p2.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.2.p2.exon12MSTRG.12382.2.p2.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.2.p2.exon11MSTRG.12382.2.p2.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.2.p2.exon10MSTRG.12382.2.p2.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.2.p2.exon9MSTRG.12382.2.p2.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.2.p2.exon8MSTRG.12382.2.p2.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.2.p2.exon7MSTRG.12382.2.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.2.p2.exon6MSTRG.12382.2.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.2.p2.exon5MSTRG.12382.2.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.2.p2.exon4MSTRG.12382.2.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.2.p2.exon3MSTRG.12382.2.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.2.p2.exon2MSTRG.12382.2.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12382.2.p2.exon1MSTRG.12382.2.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000093_pilongenomesc0000093_pilon:696573..737817 -