MSTRG.12371.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12371.1.p1
Unique NameMSTRG.12371.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000093_pilon:499571..508282-

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12371.1.p1 ID=MSTRG.12371.1.p1|Name=MSTRG.12371.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8712bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000093_pilon:499571..508282- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTTTTTTCGACCGCAATCTTCATGAAACTGGTGGCCCTGGTATTCAAGTA
AAAGTTAAAGAACTTAAGGTAATACCATTTTTACCGGTTGAAAGAGAGAT
CGCTACAATCGACACAAAATCCTTTTTGCTTATTACCTAACCCTAACAAG
AAACTATTTAAAAACAAAAGGTTGTTGAATCAAAACTAACCAGATGACCC
GGCTGGTATCCTACTTAAAATTTGGGTATTTCTTAAAAAAGAGAATAGAT
AACATCGGGTGCCTAGGATTTGTTAGTCTTAATCTAGACTCAAATTAGTT
TTATACTTTTTTTTTCAATAGAAATGCACCAACACGTGTAATATTCTTAT
CGCGTTAGATGGCAGTTGCGGACGAGGATACCTTTTCCACAATACCAATG
GAAGGTTCCAGGAAGAAGATTATATGTTTGTGTCTCCAATCAAGTCTGGA
ACCATGGTCTTCACCGACATTCGTGATTTAAACGTAAGGCCAAATGTTGC
CATGTCCAATACTCTGGAGTTGTTTCAAGGCAATGACGATCAGGCGACAC
AAGCAATTAGATGGCTCAGGCACTTCAGAGGGGTACAATGTCAAAAGGCT
GGTGCCCTATTATCTGAATATAATTTGCGCTTTTGGGTTGATGATGGACT
GGAATTCCATGAAAGATTTTTTCAAGCTTTCGTAAGAAACTATGAAAATG
AATTTGTATAAACTAAAAATCTATTGATCGCTAATTGTTGATTACACGAT
AGTTTTTATGGATCTATGAAAATCTTATATTTTTTATTGTTCTTTTTTTG
AGAAAAAAAATATAAACTTAATTTCTATGCTTTCATCGCCTATGCTTTCA
TCAATTTGACTGGGTCAAATTGTTTAACAGTGAACCGGACATGGCTCTAG
GTTGGATTGTTAAACAGTGGAAGGTTGGATTGTTAAACAGTGGACTAGGT
CAAATTGTTTAACAGTGGACCGGACATGACTGTAGGTTAAATTGTTAAAC
AGTGGACTGTAAGTTGGATTGTTTAACAGTGGACTAGATTAAATTGTTAA
ACAGTGGACTGTAGGTTGGATTGTTTAACAGTGGACTAGGTTGGATTAAA
CAGTGGACTGGTTGTAGGTTGGATTGTTAAACAGTGGACTAGGTTGGATT
GTTACAGTGGACTGGTGTTAAACGTGGCCTTGGTGTTAAACAGTGGACTA
GGTTAAATTGTTAAACAGTGGACTGGGTTGGATTGTTAAACAGTGGACTA
GGTTGGATTGTTAAACAGTGAACTAGGTTGGATTGTTAAACAGTTGACTA
GGTTGGATTGTTAAACAGTGGACTAGGTTGGATTGTTAAACAGTCGACTA
GGTTTAGGTTAAATTGTTAAACAGTGGACTGGGTTGGATTGTTAAACAGT
TGACTAGGTTGGATTGTTAAACAGTGGACTAGGTTGGATTGTTAAACAGT
GGACTAGGTTGGATTGTTAAACAGTGGACTGGGTTGGATTGTTAAACAGT
GGACTAGGTTGGATTGTTTAACAGTGAACCGGACATGGCTAGGTTGAATT
GTTTAATAGTGAAATACTTTCTGGTCTGTATTTTATAACATTATTAGGTT
AAACGACATTAGGTTATATTCTTTAACAGTGCTCTCCACTACTAAAGAAT
CCAACCAGTGACCACGCTAACTGCACCTGATCCGTAAGTTCTTATGAAGA
AGTTGTAATCGTACCTTTAGTTTTGAGTTATTGAAATCCAACTTGATCCC
TTTGGGTTCTGGGTTAAGTTAAAGGCTCCTCCTTGCAAAAAGGCTAAAAA
TACATCTTAAAATAATTTATTACTTAGAATAAACACCCCTTCTTTTAAAC
GCCTCCTCGCATAAAAGCCCCCTTTTTTAGGAAAATAATTAATAAACGTC
TCCTCCTCAAATAAACGCTCTTCCCTGGAAGGGTTTTTTTTTATTTAAAA
CATAGGCTCTTAGTCGAAACTTTCATTTTGAGAGAGAAATGGATACTTCG
ACACACAAGAACAAGAACATCGATAATTTTTAAAAATGTTGTTATGGTAT
AAAAATATATGTATCATCGCATTATCAAAAACAATTCTTCGTGTTTAATT
TTTCAAAATTCTCGAATAAAAGCGCACACCCCCTTAAAATCCAAAAAAAC
GAATTTTTCACGAATATGGCCCTAATTCGCAAAAGTTTCTTCAGAAAAAT
TAATCTCAGACAGGCAATTCGCAAAATATTTCTTTCGCGAAAATTACCGT
TCCAATCAAATTTTTAGTCAGAGATAAAAAAATATTAAAATGATCTAAGA
GACAAACATTAATTAATACAGATACATTTTCTAGTCCATAACAACTAATG
TTTCCTTTTTTTCATTAAAACGTGATTAAAACAGTGCGCATTTTTATATA
ATTTGCGAAAACTTCTTCCGTAAAAGTAATTTCGGTGAGCTCAATACACG
AAATATTTTCCGCGAAAATTACTTCCCTTAGGGTAGGAGCGATAATGGAA
TGTAGTTAGAAGGTCGGTTATGACAACATAAATTTTATCCAGACAATTTC
TAACACAGATATTTTTGTTTAGGAGGTGTAACCGACCATGTCGCAGATGT
TTGAGGCTCCGAAATGGGACAATATTTGAATCGTGGACACATATTTCCCT
TAGTGATTTATTTTTGATAATCTTCCTGTGGTCAAACAACGTTTCTATGA
CCAAAATAACGAATATTGTTGGAATACCAAAAAAAACAGTGATCAAAATG
TTGCAGCTTCTGCGCCAAGTCTGTACGAATGATCTAGCCAGAAACCCAGT
TGCTATTGGTGGTGGGGGTGCTAATTTTGTTGTCCAGATTGACGAGAGCC
AATTCCATCACAGGCAAAGAGTATGTTTTCATACGAGTGAGAGAGATTTT
TAACTACATTTTGCTCAAAAGTTTGTCATTCTTTTAAATTTTTGATAGAA
TCGGATGCATATTTTGCAGTTTAGTCTTAACAAAAAAATTGAATATTTTC
CAAAGTGCGTTCGACTTCGTTACATAATGTTGTTTTGACCCTATTCTTTT
AATTCTCGTTTCTTTATATAGGGAGGAAGAGGAAGAAGAGCGCAGGCACC
TGTTTGGGTATTTGGCTTGGCCGATACTCAATACACACCCGCCAAAGGTT
ATATGGAAATTGTGAACAGGCGAAATAGGCCCACTCTCACTGCTGTAATT
AATCGGGTTTTGAACCCTAACTCTGTCATACATAGCGATGAATGGCGTGC
TTACAATAGGCTTCGAAACTTTGTACCGAACTGCATACAACACGATACCG
TAAACCATACATACAACTTTGTCGATCCTCTAACAGGAGCCCACACACAG
GTAACCAGACAATAATTTTTTGTAAAATTAGCCATTGGGCTCGGTACATT
TTTTTAGTTCTCTGTAAAATTCTTGTAAAGTTTGCAGGTCCCTAAAAATC
CCCACCCCACCCAAAGTAAAAGCTTTGAAAAGTGATATTTTTAACGTTTT
TATATTTTAGAAAAGTTTACACTTTTTTCAAACCGTTTCTTTTTTTTTCA
TTAGAACATTGAATCGTACTGGAACCGTTTTAAGCTGAAACTGAAAGCTA
TGAAAGGTGTCGAACGAGCCAATTTACAAAGTTACATGAACGAGTTCATG
TGGAGGTAATTATTTTTCAATCGGAAAGAAATGCATTTGAAGCTACGTGA
CACTGGCAGGCCTCTCACAACAGATGAGATGAAGTTTTTATAAGATACTT
TAATAATTGGTCATTTGAAGTAATAACAATGACGTGTTCTTTAGAAAAAG
TAACAAAATTGTTTTATTACTGGTTAACGACCAACCGAATCAAATGAGAG
CTTGTAAAAATTCAATCTCGTCCCTCTCACAAGGAATAAAACAGCTAGTC
CTAAATTTTTATTGGGTTTAAACGTCATTTGATAATCAATAGGATACGCA
ATTTAATGATTTTGTAATTCTTTTTTAGGGACTGGTGGACTAGACCAAAC
ATTTGACAACATAATCAACCGGATAAATATTGATTATCCCCAAGCTTAAG
TTTGCTTTCATTGAAGTATGATTTTTATGTTTTCTTTTGTTATTGATTCA
CAAATCATAGTTTGACTTCTAGAGACTGTATGAAGCTATTTTTTTAGGTA
TTTTGTATGTATATGGTATAACATTTCATTATGCAAAACAAAGACTCTTA
CCATTAAAAATATACTTTAACTCTTTCTTTTTTGCCCTTTCCGCCAAAAT
TTGTCTCGCGATATCGCGTGGGATCGTCGATTCGCGAAATCAAATCGTCA
AATCCACGCGAAATTTTTGAAACTACCATTTTATCAAAACCATGCAATTT
TGGTAAAATATATCCATTTTTAGGGTCATTCGCGAAATTATACTCACGCG
AAAGTCTTGACTCGCAAAATTAAATCCTATTAAAGTAGCCTTAATCTGTC
TTATCTTGAAGTTGTTCACAATGGTTAGTGCTCCTTCTTTTCCAGGCAAC
GTAGAAAAAAAGGTAAACAAACAGGGTAAAAAGGCACGTATAGTAGTGAC
AGGAACAATGTGAAAAGTATACTTGGGTGCGATGTATACTTGTCTTGGGT
GAGAAGAATACTTATGAAATGTACAGTGGTCAGTAAAATTGTTTTGTGTA
AGTTCCTGTGAAAAGTGCTGAACATCCTAGTTCGAAAGATAGGCATAAAA
AGTGTTGTTTTTCGCAAAGGTTGATTTTAGTTAAATCGGAGTCAAATGGG
TCAATCACGAAAATTAATTCTTGTGAAATATATAGTCAAATATTCTTGAT
TTGCTTAAGATTTGCTCAAAAATTAAGAACATCTTAAAAACATGCCAAGG
TTGAAATGAAGAAAAGTCTACTAAGGGATTTTTAACGCTTAAATAACAGA
CACAAAACATCATTTCAACATTGTTTCAATGTCCAACTAACGTTCTGATG
TTGAAATAACATTTTTTGGACATCAAATAGTTTGTGGGCTGATGCAAGTA
TTCTAATCCTTTCTTCTTCACTCTCGAGAGTAACTTTTTTAACTCCATCG
TTCATTTGTATACATTTCATCTTTACGAGCGAGCACCTATGCCTTCTACC
TTGATTATCGTCACATCGAAACCCATTTGTTGTTTCAGTATTCTTTACAT
AAAATCTTTGTCACCAACTCGTTGCTCTTCTTTGTTTTCGTGCTTGTTTT
CACCTAAATCATGCACATGGTTGATTTGAGCCAACGCTCCTCTTCATTCA
CTGATTTGATGAAACTTTTTATGGTCACCTCTTGTTTTTGTAGATCTTCT
TTGGTGACTTCTGCATATGATTGTTTTTTTGTTTCTGTGTTGTTGAGCTG
TGTTTCAGATCGTTTGTTGTTCCGTTCTTTGTTGACGTCTTTTTTATTCA
TTAGCTTCTCGATTTTCCTTTTTAGAGAGGGTATTCTCTCGTTGAAACCT
AATTTCAATCCATGATGTTCATCTTTGTCTGCTTCTTTCGTTGTGATGTC
AATGCGAACTTTTTGTCTGCTTGTTTTAATCCTCTCAAATAAGAGTGGCG
TTATTGTAAGGGGGGGTTTCAGGGGGTACCCGATTCCGCAATTCCGTCAA
TTTTTTCTCTAATTTCCGTCAAACCGTCTTAAATTGAACCAAAATTCCGT
CACCGAAAATTCCTTTGAAATTCAATATTTTTGTCGAAAATTCCGCAAAT
TTTGAATATCTTTTACCAATTCCGAAATTCCGCATTTTTTTGGCTATATT
CCGTTTTTCCGCACTAAAATTGTCTAATTTTCCGTCTCCGTCAGAGAACC
CAATTTCCGTAATTCCGTCTAAATTTTCGCCAAATTCCGCCACTCCGTCC
GAGAAAAGGGCCGATTCCGCTCCTCCGCCAACCATGAAACCCCCCCTTTG
AAACACAATTTCCACATTCGAAGCGCCGGCTTTTATATTGCAGACAAAGC
TGAATCTAGGCCGGGAGCTCAGAGCAAGCATAATGGACAAGTCTATCTCA
TCTCCTACATTGTAAGGTGTCGTTATCTTCTATGATGGTGTTTATCAAAC
AGTTATTGGGTGTGCAATACAATATCCATAATTTTTTTAAATTTCCTTGT
TGAAATTTTCGTTGATTTCCGTCATATTGTTGCATTTTCAGGATCGTGGC
AGCACAGAAAAAATTTGACGTCAATATATAAGGGGGGGGGTAAACCGGAG
AACCATTTTCAACTAGTAATATCTCCTAAACCAAGCATTTTATGAGGCTT
TTGTAGCTACCAATCGAAAGAGGACACAATTCTGAACAAAAAAACTAGCC
ACCTAGCCGTTAACGATTATCACCATGCATTAACTCCTTTGATACCGTTC
CAGCCAAAATCGTTCCTATTGGAACGACGTTTTCTCCAGCCTCTGATAGA
AAGAAATTTTTAATCGCTTTGAAACTGCATTTTCTTGAAAGTTAATAGAA
CTTACTTTTAATTAAAACGAAAACGACGTTTTCAAGTCTTTTCATTAGTA
AGAAAACGCCCCGCAAACTTTCTCATTTCTCAATTGCTAGAATCCGGAAA
TGTTCTCTTTCTGGCGGTATTGAAAGAGTTAAAACAACGCTCCGTGCCTG
CTATTACGGTTCTCTAGAGAATTGGACTCGTATGTATAGAAGAACATTAA
GAAGAACATCTAAGGCTGAAAATTGAGAAAATAAAGTCCAAATAATACGT
AAATACGATTTTAGAACAAAATTAAAAAAAATAATTTTCTCTTGCCTTGC
GCATGATTTTATTTCGTCACCCGGTAATGCGAAAATGAAGAGTTTTTAGA
TTTGGCCGCGGGTTGAATTTTTTTTATTCATTCATTCATTCATTCATTCA
TTCATTTAATGAATGAAAATGAAATGGGATGTCTTTTCCCCCAAAAGAGC
CAGAAAAAAATTTAATCACGTGATTTTTTTTCTTTCGCGTTTTCTTCTTT
TGTATCAGACATGTCTCCCCTTTTCATTTTTCTTTCTTTATTTGTTGGCT
TGAACGTTAGAGAGACGTTCACATTAGTAAACTTTGAGGGAGATTTCATT
TCGGTCATTTGTAAATTGAAATCGTAATCATGACCTTTGAAGACATCTTA
GCGATTTGTGAAGATGAGCAAGTTTTGATAAGGGAGCTGATGGATGCTGG
CTTATTAGCAAGTACAAGAAAATGTATGAACCGGAGAAAACACGAAGAAG
ATATTCAGATGATATTATTGCCAGATATGAAGACTTGGTAAGACGTTTTA
ATTTGCTTTTGTTTACCCTGAAAAATCATTTACGTTTCTATGAAGCTCTT
TCTCCTTTCATGAATCTGATAAATATCAATCTCAAAGATGTTTGATACTT
TCATTTGAAGTCTTAAAAGCCTTTAAATATAAAATATATCAAGAAACAAA
GTTTAATAAAATATCAACACAATATATCAGCAGTAAACAAATAACTGACG
CTTAAAAGCGGCCATTTTTTAATCCCCAGTAAGTTAAGTATTTTTAATTT
ATTTTTTGCCTACATGTTTTTAAGGCGATGCCCAAGATGTACAAGCAAAG
CTTCATTCAAGACGGGGTCGTTTTTTTCGCAAACAAATATACCACTTTCA
AAATGGATTCAAGGCATTGATAGATGGGCACGCCAGATGAGCCTTAGGGT
AATGATATATTTAAAATAGAGGACACAATGAAATAAACAGACCTTTATGT
CTTTTATCGTAAATACTAACCTGATATTCATATGCTGAATTTTCTATCGG
TACGTTTTTAAAGCTCTAAAGACACAATGAAAATAAACCATCTACGTAGG
CTAGGTCATCTTTTCAAAGCCCTACCTTAAGCTTAAGTAGCTAAATGCAT
ACCCAGCAGGCATGGGACGTTGTTTTAACGTCCAAAAAACGTTTTAAGAA
ATTTTAAGCCCTGAACAAGTTCGGTCCAGCTTAAAAATAACCAGTAAACA
GTTTAAAATGTCTGCGAAATTTTCATGTAATAAAATATACTTTGATTCTT
TAGGAGATTGCTGAGGATTTGGACTTGTCGATTCCTACAACAAGCCAAAT
GATGAAGCATTTTCGAGAGCAGTGTCAAAGTTTTTTCGACCGCAATCTTC
ATGAAACTGGTGGCCCTGGTATTCAAGTAAAAGTTAAAGAACTTAAGGTA
ATACCATTTTTACCGGTTGAAAGAGAGATCGCTACAATCGACACAATATC
CTTTTTGCTTATTACCTAACCTTAACAAGAAACTATTTAAAACCAAAAGG
TTGTTGAATCAAAACTAACCAGATGGCCCGGCTGGTATCCTACTTAAAAT
TTGGGTATTTCTTAAAAAAAAGAATAGATAACATCGGGTGCCTAGGATTT
GTTACTCTTAATCTAGACTCAAATTAGTTTTATACTTTTTTCAATAGAAA
TGCACCAACACGTGTAATATTCTTATCGCGTTAGATGGCAGTTGCGGACG
AGGATACCTTTTCCACAATACCAATGGAAGGTTCCAGGAAGAAGATTATA
TGTTTGTGTCACCAATCAAGTCTGGAACCATGGTCTTCACCGACATTCGC
GATTTAAACGTAAGGCCAAATGTTGCCATGTCCAATACTCTGGAGTTGTT
TCAAGGCAATGACGATCAGGCGACACAAGCAATTAGATGGCTCAGGCACT
TCAGAGGGGTACAATGTCAAAAGGCTGGTGCCCTATTATCTGAATATAAT
TTGCGCTTTTGG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000093_pilon:499571..508282-

>MSTRG.12371.1.p1 ID=MSTRG.12371.1.p1|Name=MSTRG.12371.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=762bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000093_pilon:499571..508282- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAATGCACCAACACGTGTAATATTCTTATCGCGTTAGATGGCAGTTGCGG
ACGAGGATACCTTTTCCACAATACCAATGGAAGGTTCCAGGAAGAAGATT
ATATGTTTGTGTCACCAATCAAGTCTGGAACCATGGTCTTCACCGACATT
CGCGATTTAAACGTAAGGCCAAATGTTGCCATGTCCAATACTCTGGAGTT
GTTTCAAGGCAATGACGATCAGGCGACACAAGCAATTAGATGGCTCAGGC
ACTTCAGAGGGGTACAATGTCAAAAGGCTGGTGCCCTATTATCTGAATAT
AATTTGCGCTTTTGGTTTTTCGACCGCAATCTTCATGAAACTGGTGGCCC
TGGTATTCAAGTAAAAGTTAAAGAACTTAAGAAATGCACCAACACGTGTA
ATATTCTTATCGCGTTAGATGGCAGTTGCGGACGAGGATACCTTTTCCAC
AATACCAATGGAAGGTTCCAGGAAGAAGATTATATGTTTGTGTCACCAAT
CAAGTCTGGAACCATGGTCTTCACCGACATTCGCGATTTAAACGTAAGGC
CAAATGTTGCCATGTCCAATACTCTGGAGTTGTTTCAAGGCAATGACGAT
CAGGCGACACAAGCAATTAGATGGCTCAGGCACTTCAGAGGGGTACAATG
TCAAAAGGCTGGTGCCCTATTATCTGAATATAATTTGCGCTTTTGGTTTT
TCGACCGCAATCTTCATGAAACTGGTGGCCCTGGTATTCAAGTAAAAGTT
AAAGAACTTAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12371MSTRG.12371Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12371.1.p1.exon2MSTRG.12371.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12371.1.p1.exon1MSTRG.12371.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12371.1.p1MSTRG.12371.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000093_pilongenomesc0000093_pilon:499571..508282 -