MSTRG.12346.5.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12346.5.p1
Unique NameMSTRG.12346.5.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000093_pilon:107709..122723-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12346.5.p1 ID=MSTRG.12346.5.p1|Name=MSTRG.12346.5.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=15015bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000093_pilon:107709..122723- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GCCGTTTCTACCACCAATCAACCCTCAAAACCCATTGGAGGAAAACAAAA TCAAATTCATGCAACCTGACAAAAGGCTTTCGTTGCCCGACAATTTATTC GTCTCCACTCACCAAGGTGATAAAAAGAACCGACGACATTCCGACGACAT TCGATCAGTTGTCGAACTATTTTCCATACGTCGAAACACCATGTGTAGCC TGAATTCCGTCATCTCGAACGAGGTCAGTCTAAAGCCAGTTCATTCTATA CAATCTTTTGGGCATCTGTCGATCGCTCATAATATACCCTCAAACAGAGG CGCTCCCACAAATCTAACAGTCATTCAAGTCTATCAAAACCCGACAAATA CCGACGAACTACAACGTCAGTTTCTAAATAAACCACAAACGACGAATTTG ACGAGTGACGAAATTCGGCATATACGAGACAGGCTTTATACACCACTGAC AACTGCACACAAAGATAGCATAATAGCGGACTGTTTACCGTACAACCGGA CGGACTTAGAGCCGGACTTAATCTCAAGTGCAGTTGAATTGAGACAAAGT GTTAGAAATCATGAACTTTATAACTCGATTGAATTGATTGAGTCATTAAG TATCCATAGTACGAAAATTTGAGATAGTGCACCCCTGTATAGAATTGTAA TATGAAGATATCTAATCCACAGATCCAGAACTATACTCCGAACTTACTCA ATAGATTAACAATTTCGCTACAGAGGACCTGGTCAATGCAGTAGCTTCAG GCGGGGGAGGGGGTATTTAACTCCCTTTTTAGAAAGTGATCTGTTTCTAA AACTGACTATTTTCGTTTCTCTTTATCTGAACAAATTCTTTGAGTTTTTA GTTCTAAGGGAAGAAATATTTGCGCAAATTAATTTTGCGGCTCACAGCTT TAAATTTGGAAGTCTCGGTCAGTTTCATTTTGCGGTTGAGAGAGCTTTTT GTTTATAAAATGGCCTATCTTGCCATTAATAGACCATTTTAGAGGTGTTT TTTTAAATCCTGTGAATATTTGTGTTTCGCTGAATTTAATTTCGTGGATT TGTCAAAAAAGTGCGAAATTAAATTCTGCGAAAATTTATTCCCGCGAAAA TGCTTCACGCGGTACAATACCGAATCTCGGGAAGTTAGATCTCAATGAGT TGGTTGGCAATGGTCAATTCGCTTACCCTGAGTATCAGAGGTTAAGTTTT CAAAGAATATATTAACCTCGGAAGACCAATAATAGGAATTTTATCGCGCA TGTGTCAATCTAATCACTGTAGAAAGAATCAAAGATGAAGAGCAAATATT ACCTTATTAATGTCTAGCAGACTGTATCAGTATGCAGTTTACTATTTATA TGAATTCCCCAGAAACCTCCAGGTGTAATCGAAGTGAGTTTCTTTCAAAA TAAATCTTTTACATGATCCCCAAATGTATAACAGTAATTACTAAGCTATT GATTATGGAAATGTCACTTTTAATTGAATCGAAATAATAGACAGACTTTA TGTTATGATTCTCTATCACTGACTCTTTTTAAAAAGCATTGATGATATTT TTTGTTGTATTTTCAACGACAGGAATAAAAATATCAACTTTGAACTTCAT CCAAGATCTTAAATGGTCGTCATGGTTACTTTTGTCTTCGTTGATTGCGC GATGAATCTCTATTCGTCGGCACAGCGTCAATATATGATTTTGACCTGTG CTTTTCATGGTACAATTCGCTACTTGTTAAAATGAATCGGCATAATATTT TTTGAATCAATATTATTTCTATGTTTTTTTTTTCCTTTTCCGTGGAGACA TCCTGTATCTTTTTCATTGGGCCACCCCCACAGTCAAAAATTGAACCTCC TTGACAATTCATTCAGTGTTACTATGTCACTTTCAACACAAAATCAAAAT AGTTCAATATTGAAAGGTTGAATCAAAATTATACAATAAAGTTTCACAAT CATATGTTTTAAGTTGAATCGATGAAACTACATTTCACATGAAATTATTT TCAGTCATCTTCATCAATATTATTCTTATTTAAAACAAAATCAACTTATT TTTTCGATCACTGACAGGTTCAATTGGGAATGAATGTAAACTAACCTCGT TTCGTTAACGTACGTTTTTAGCGTGTTTTTAATTCGTGAATTAAATAATG GTTTTCTGCTCGTCAAATATATTCATGAATGAAATATTATTTAAATGTTT TGTTTTTACATAAGTGTTCCCGTTTCATATCAGACACATATTTCATATCG GGACAGCGTCTTCCTTCCTTTTGTTATGTTATGCTGGTATAAGCAAAAAA TATTTTTTTCCTCTTTCAGACCAATCTTGCTCCTCATTTGTGTCAATCCA ATTCGAAAAAGCTTAGTTAAAATTGATCAGTAAGCAAACGGTATCACTCT AAACAAGACCTTTAAAGTAAAAAAATAAGAAAGAGTTGAAAGCGAAGATT CAAAATGAAGAAGACAATTACAATTAGTGAAGTTCAAATCATAGTTTATT TTTTTGTTTCTTCTTCATCATTCATCTTTGTTTTTCAGGTCTTTGATATT AACACTCCACTCACAAATTTCCTTTCAACCAATTCATTCTCATTTGAATT CTTTTTGATATCATTTAAAAAAAAACAATAAATGAACGTCAAACGTCATC ACTTTGAAAAAAATTCTCAAAAATAATGACGTCTAAAAACGCTGTTTTCT GCTGTTTTTTGGGGTCAATCACTTGTTAGCTTTGTATCATAACTTTATAT TGAGTAAATATTTTAGTGAAATTTCTTCACAGTGACGACCTCTTAAATCA AAGAATCTCTCCAGTGAAAATGAAAGTTATGGCGCTTCTCTAAAAGATCT TCATTTTTTTCTTCTTCATTTTCATCTTCGTTTTCAGAATTTTTTTAAAA ACTTTTTTATTTCAAATTGTTCCACTCACAAATATCTCTCCAACGATACC AAATTTATAAAGATTGAAGAATTCCTTCAAAAGTTATAGGTAAAAGAAAA AAGAGTGCACACTTATCGTGAATAGACTTTAATTACTTCCAAACTATTCA ATTCTTTTGAAATTTGAATATTGCATCTAAGTGCACCTAGCTCCTTTTTC CATATCTTTCATTCAAATCACTTTGTAGTGAGTACATAGATGGCGTTTAA GTGCGCTAAACGCACTTAGGCGCAATTTTTTACATAAGTGAGTACCAAGC TTAAGGGAGCTCTTGATGTTTCTTTTTGTTATGTACCCTTTTTATTTGTT TTTGAAATTTTATTATTCTAAACTTAACTTCTAAACTTAGCGGGCTAATC TTTTTTCGTTTTCTTTACTTTACTTTACTTTACTTTAAAAGCTACGAAGT GATGTAAAGGCTCTAGACGAACATTCATAATACATGAAGTGTAGACATCT GGTACATGCTAAATATTATTTGACAATGATGCTGTATCTAACATTCAACC TACACGCTATCACGGTTTTACAGTTAATACTAACATTTACTCACACGTTT GCATCAAACCAAACATATATGTGGCAATCGACAAACATCACCAGACAACA AACACATGTACAGTATATGCGATTCAAGAAATTAACTCGTGGATATAAGG TATGGGCTACACTCGGTAGACATATCGATTGTAATTTCAGTGGCTCCTCT AAAATGGAATGTGCTGATACTTGTATGAGAAAACCAATGTGTGTTACCTG GACATGGCGAGAACATTATGGGTTATGTCGCTGTTCTGCCGAAGTATACC GTGTCTCTCCTACTTACATTTTACAGGATAACCAATTTGATGCTTATGAA ATTTGGGTAAGTTTATATTTATAATCTTTAAAGCAAATAATATATGCATT TAGAGGGTTTTATGACTTCGGGCTAACTCCAGTAATGTCTCCCACCACAC TACTCCTCCTCGCTGATTTTTGTTTTCGATTTCTGACCATGGAGACTTTC ATTGATGTTTCTGAGTGACTTTAGTGATTTTGAACGAATTTTGAAATTTT CAACAATTTGGACCCAGAAGGGGTTTGAACCTGCAAACAGAAAGTTTCCT TGTGCAGTAGTCCGATGCTCTACCGTTCGACTACAAGACCACTGTAGATA ACGATAGTATAGTTTACTGATCCAATATATGGCAATAGTTCAAACCCTAC CAGAGAACTTAAAATGCCTCAAAAGTGTACTCTCGGGAGCTCTAACCCTG ATCCTAACTCATCAATAACCAACCCTAAACTTAACTAAAAGAAATGAAAT AATTTTGGGAGACATAATAGGATTTAGTCATGAATAAATTACTTTGGGAT TGTAAAATTTGGCACATGATACCCTAGATAAGGTCGTTTGTGAAATTCTG TCAATCAAGCGACCAAGTTTGCCCAGAACAAAGATGTAAATATAAGGTAG ACCAGGTCGATCTGGGGGGTCTGCGTCCCCCAAGAGGTGAAAAATATTTG ATGGTGGTTTTGGGTTGCTAAGATGCTATATTTTCAGGAATGAGACGGTA AATAGGCTGTTAAGGGGGGCTAACTAAAATGGTAAGCTAGGTAAGTGGGG GTGTTTTTAGCCAAAATACCAATTTGTAAGGGATTTTGCTTGAGACTTGA AACACCATGGTAACTTAGAAGTGCGATTCTGCACTATCTAAAAATCTTTA TTGCTTGAAACTTTCCAAATATGTTACAAATAGGTAAAATAAAATTTTGA AAAAAGAAAAATTCAAAAATATTTACCAGGGGGTTCTGTACCAAAGAAAA CAGGGGGTAAAAAACGAAAAAAACCCCCAAAATCGTATTTTTTCAGTAGA AAAGTGGTCATAGGCAAACGAAAAACTGTTTATGATACTTCAAAGGTTAT GTGGTGATAGATCGTGATTGCTCTCATCATAATATCAGGATTAACTATCC ACTGGGGGCTTAATTCTTTATTTTCAGGGGGTAAAACTTGCAAAAATACT CATTTTTTGACCAAAATTCAAATTTTTGAGCTAATGTCTCGCGATTAACC CCTCAAACAGTCTACAACTATGAAAATTCCCAATAAAAAGCCTTTAAACT AATAAATTTATCTGTTTCTAGGTTAGAAAGTTTCAAAATATCTCAAAATC GGGGGTAAAATGTCTTAAAATATTAAATTTTTACAAAATATCACAATTTT TTAAAAATTAAAATCAATTTTTGGACAAAAAAACAAAATCATAAGTCATA ACCAGTTTTCTTGATTTTAGGGCGAAAATTGCAAAAACACCTTCTTTTCG ACAAAAACTGGTAGTCCATAAGACTTTCAAATCGGCTAAAAGTAACAGCT TTCTATGAAAAATATACTGAGACAACGTAATAAAAAAGTCTATCATAATA TCAATAGCTTTAGAATTATCCATAATAAACCAATCATAGCGATGTCAAAT TAAACAACAACAAATCTTACACCTTCATATTATTTAGTTCTCGTCGTCAT CCTCAGCTGATCTCTTCATCTTCGTCTTCATCCGATTCGTCGTCGGAAAT TTCATCTTCTCCAACTTCAGCTTCTTCGCTGTTGTAGGTCGCATCACAAA GTATCTCCTCAACTTTAAGGGGAAAGATTACCTCGTCAACCCAAATTGTA GATCCGTCGTTCGACCAACCACTTTCTGTAATATCTCCTTGTTAACCAAC TTATTAATGATGATTTCCAAAGTTTGCTAACGTAGTTTGCCTTCTTCGAG TGGAGAATCAAAATTGACTGAGACGGAGGAAGCATGGCCATATCGATAAT TTTTCTGCTTTTGGTGTACTTCTTTTCAAACATTTTTGCTCTCGCTACGT TGACTGATGTTTCTTTAGGATAACCATAAAGGGCGCAGACGAATCGTTCC AAATAATTTTGAGTTTCTTCTTCCAAATTCCATGATTCTCCCAAGCGGCG AAAAGCTTCCACGAAATTTCTATTCTTCTTCATTTTATTGAAGCAGGTTG ATTTTCCTTCTTTGAAGAATAATGATTATATGTAATCGTTTCCTGTAAAG GCGTGGAAACCACTCAAAGATGTTTTGTACTTGACAGCATCTTTGCCAAG GTTGCCTGTCCAAAACCCTTTCCGTGTCTTCCCTTTGCCGTAGTCAAGAT AGATTTTGGTTGGACTTAGAAGACATGCTGCAAGAACAAAGATGTCAGTG TCTGCAGATGGAGATCTTAAGATTACTTTCGCTTCGGGATTTTCTTTCAG GACATGACTGCAGTGAGGGGTGACCTTTGAGTCAGCTTCCTCTTGATCAG ATGACAAATTCTCTGAAATAGTGACACCCGTTCGACTAAGACAATACGTA ACACCTTCTTGAGAAAAATAGACCTTCGAACAATTTGTGGTCTGCAATAC TCTCTGATAATTACTTCTCATTACTTCTGACATCAGCTCAACCAATTTTG TTTTGTTTTCAACATTCCTCATGAAGTCTCCGAAGTCATAGGGAAATATC GATTCCTTGGATGCGATCATAACTTTTTGATCTTTACCACGCTCATTACG TTCATCACCTTTGATCGAATTGGATCTGTATGTGTCAGCAACAATATCAA TACGGTTGTACCATTTTGGCAGGTCTCCAATGAATTTCGTCATAGTCCAA ATAGCAGCAATCAGGTCAATGACAAAGGACTTATCTTTCTTCTTGATAGA CTTCAGTGAAACATCTGATCTAGGATCTTTCTAGTTGTCGTATCTGCAAC CAGTAGTTTCATTAGCCTGCTTTTTGGTGTTTCACGTTTTTGGTGTTTTC CATTTCCATGTGCAAGACTGAGAGGTGCAGGAGCCAATGGGTAGACAAGA GCTGATGGAATATCAATTGCGCGTTCATTTCTAATTGAAAACGAAAGAAG GGTACCAATGATATCCCGATTTACTTCTATTATTGTATTTGCAAAATATT GACATTTAATGACTGATGTTGAATATGTCTTGAATATGTAGATAGGAACT CGGCTCAATCTGTCTTTCTTTGGATTTCCTTTGACACTTGACTGCTCAAA TTCGTCTCGCATTCTCTTCCCGTCTTCTTCTATTTTCAAAATCTTGCTTG CAAACGATTCCTCAACCATTTCCCCAGAGAAGAAAAGTTGTATAGCCCCT CCAGACCTAAATCAAAAGGATTGATGTATTTCCCTTTCACCACCTGAAAA ATTTTTGTCACATGCTTTTCACTGGCAAGAATCTTGGACGGTCTCATAGG CTTGTATTTATCACATAATCTTAAAGTGCCAGCCATCTTTTTTAATTCAG AGGTTGTTTTAGCTATGTCAGCTCGATTCAAACACCATTTTAGAACTGCG TCCTTTTTGTTCGCAAAAAACTTGATTCCACCTGAAAATGACGAATTTTT CTGTAGTAACCCTTCTATTTGATTTATCTCCAGTGATCAAACGCGAGGTA AATACATATTGATTTTGATTGGGAAAGATTTCATATTGAACCTAATTCCC TATTAATGTAATTATTTATCTGAGGTTTTAGCATCGCGGTTGATCGACTG TTCTCCACGCTGATCTGTGGAAGGATAAGCTGATTGAGCTTGGACAGAAA TTCCAGACATTTTGAAGGTCTCTGTCAAGCCAGGGTATCGCAGATCAATC TCCTTCATTACACGTTTTTTTTTTTATGAACGTCAAAAATTTTCGAAGCC TTCAGATGTTCTTAGTTTTTTGAATTTGAAGCCTAAAAATGTTCTTAAAA TGTTCTTATTTTCAGCATTTTTTGAGCATTTTGATGTAATTTCTTAAGAA AATGCATGTTTTTAAGTCTCCAAAGCCTTAGAATGTTCTTAGAATGTTCT TAAATTTTTGGGCCTCGAAGCCTTATGTTCTTATATAGTTTGTTCTTATA AAAAAAAACGTGTATTTGGACATACCACAAGACATATCTTGCATAGTTGG TTTTGTTAAATGCAAAATAGAAAGGCAACATCTCATCCCACGCAAGGCAG CATCTCATCCCACGCTTGCAATCTCATCTCGAAGTTGTTTGTTTGGACGG CTGTGTGAATCTTGTGCTGAATTCTCACGATGTTCAGGTGTACCATCCAA AACTAGGCTGTTTTGCCGACTTTCCAATCTCGAACATCTTGACCGTAGCG CTCGTATCTTTGTAAGAATTCGTTCCAATTCGGAGGTATCATGCTGTCAA AGCTCTCAGGGTCAGAACTGATGTCGTACAAACAATCGGGCACTTTCGGA GCTTTTTGAAATAAAACTCACGCAACCCACGCACTTAAACATGATAACTT AAACACGGCACTTTTCAGAGATTCTTTTAACAAAAATGTTACAAAATTTA CATTACAAACGTTTTGAATAACTGAAAACACTCTCTAGATTAGATTGAAA ATCCAACGTAACACATTGTGTAATGAGATAAGGCTGATTATTGCTGATAA TTAGATATAAATTGGTCACAAAAGGTTTCTAGATCTATAAAGGTGTCATA TTTTTCTTTCGATTAAACTGACTACAACCAAATTTGAGCCTAATTGGTGT AATTCTGATTTGTGTGAACCGCACTGTCATTAAAGTCTCTTTGGTAGTCT TTAATTTTGAAAAAAAGTGATTTTTTTGTAAAGATCTAACATTTTTGGAC ATTTTACCCCGGATTTGAGGTATTTTGAAATTTTCTAACTTAAAAACTGA TAAATTTATTAGTTTAAAGGCTTTTTATTGGGAATTTTAATAGTTTTAGA CTGTTTGAGGGGTTAATCGCGAGACATTAGCTCAAAAATTTGAATTTTGG TCAAAAAATGAGTATTTTTTGCAATTTTTACCCCCTGAAAATAAAGAATT AAGCCCCCAGTGGATAGTTAATCCTGATATTATGATGAGAGCAATCACGA TCTATCACCACATAACCTTTGAAGTATCATAAACAGTTTTTCGTTTGCGT AGGACCACTTTTCTGCTGAAAAAATACGATTTTGGGGGTTTTTTTCGTGT TTTACCCCCTGTTTTCTTTGGTACAGAACCCCCTGGTAAATATTTTTGAA TTTTCTTTTTTCAAAATGTTATTTTACCTATTTGTAACATATTTGGAAAG TTTCAAGCAATAACGATTTTTAGATAGTGCAGAATCGCACTTCTAAGTTA CCATGGTGTTTCAAGTCTCAAGCAAAATCCCTTACAAATTGGTATTTTGG CTAAAAAACCCCCCACTTACCTAGCTTACCATTTTAGTTAGCCCCCTTAA CAGCCTATTTACCGTCTCATTCCTGAAAATATAGCATCTTAGCAACCCAA AACCACCATCAAACATTTTTCACCTCTTGGGGGACGCAGACCCCCCAGAT CGACCTGGTCTAAGGATAGAAAGTTAGATAGACATTTTACAAATTACGGC ACGTTTTGAAATTATTGCCATGATGATTAACTCCCAGCGGATTTTATTAC AACTACTTATTCTTTTCATAAAAAACCATTTAATGTCTCCAGGGATGTGA TCACCATGGTAATTGTTTGAATACGAGGCAAGTGATGTTCGTGACGTAAT TTATGAAAAGGTCTATTATGGAATTTTTTCGTTTCAGAATCCCTGTATGC AGAATGCATTGTTATGTGAACATGGAAGTATTTGCTCACCGAACCGCTTG ACTAAAACATATCAATGTCTCCATTGTTTCCCTCCATACACTGGCAAACA TTGCAATGAAACTGGTAATTATTATTATTGATATGCGTAAGCCAAGATTA CGTCGTTTTTCATATCGAAAACACTGGAATTTTACCCCTGAGTGTTACAC GTTTTTTTTTTAAGAAAAACGAGGTTCAGAATGCCTAAAAACTAAGAAAC ATGCTGAGGCTGAGAATGAGAAAATAAAATTTTTTAATTCGTTTTTTAAG AGCTTTGCAAACAAAACAAATGTTTTTTATTTCTTTCCATGAAAAATAGG CTGTCAATCTAATCACTGTAGAAAGAATTCAACAAAGATGAAGGGCAAAT ATTACCATATTAATGTCTAGCAGACTGTATTAATATACATATTTACTATT GACGAATTCCTCAGAAATCTCCAAGTGTAATTGAAATTGGTTTCTTTCAA AAAAATCTTCTACATGATTCCCAAATGTATAACAGTAATTACTAAGTTAT TTATTATGGTAATGTTACTTTAATGGAATCGAAATAATTGACCAAATCTT TTTGTTACGATTCTTGACTCTTTTTAAAAGGCGTTGATGACATTTTTAAG TTGTGTTTTCAATGACGCGAAAAAAATAATATCAACTTTGAACTTAATCC AAGATCTTAAATGGTCGTCATGGTTACTTTTCTCTGCCTTGATTGCGCGC TGAATAGAATCCGGATGGTCGGCACCGGGCGATGTATGATTTCAGCCTGT GCTTTCACAGTAAAGATTGGCTCCACTCATTTACCTTGAGTGCCACCCCC CCCTCCCCACGGTTTTATCCCGTGGAATCGAAAACTTCGGTTTCTCTGTG TAAATTAATTACAATTTAAGATTTAACCAATGCTGGGCTACATATTACCA TCTAGTAGGGGGAAATTTGTTCGTTTTTTTGAGGTCGCTCGATTTTTTTA GTCAAAGCACTTGTTATACATTTTTGGAAAGCTAAGGGGTAGGGGAATCA AAATAACTTGGGTGCCAATTTTGTTTCGGACACTTTGGTATGATTTTCGG ACAAATACGACGGTCTCGGGCAAAAATCATAGGGTGAAAAAATAATGAAA ATTTCAGCTTGAGAAAACGGAGACCTGTTATATATTTTTGGAAAGCTCTC AAAAAATTAAGATTAGTGATATATTGCGAGTATAGGTGATTTCAGTACCT AACTCGAGATATTGAGCTACCAAAAGCGCTAAAACTGGACAAAACAGCTG TTTCTGGCTGAAAAACACTGAAAAACACTGTTTTTAAGGATTAAAATCTC GAGTTAGGTAAAGAAATCACCTATACTCGCAATATATCACTAATCTTAAT TTTTTGAGAGCTTTCCAAAAATATACAACAGGTCTCCGTTTTCTCAAGTT AAAATTTTCACTAATTTTTCACCCTATGATTTTTGCCCGAGACTGTCGTA TTTGTCCGAAAATCACACCAAAGTGTCCGAAACAAAATTGGCACCTAAGT TATTTTGATTCCCCTACCCCTTAGCTTTCCAAAAATGTATAACAAGTGCT TTGACTAAAAAAATCGAGCGATTTTACAAATTTCCCCCTACTAATCCTTC ATTTTAAACATAAAACCTCAAAGGCCAGAAATTTGAAGTTATCTCTTGTG TAGACTGTAGCAATGCTGGTTTAATTTTCTTGATTATTTTGTCATTTCTT CTCCCTCTCTCTTTGAGGCGGCCGGTCGGGCAAGGGACGCCAAACCGGGT TCTAGACTTTTCAACCTTTCCTTTTCTGCTATACTTAACTATATGGTTAG ACTTTGTGCCTATGTTTTAATTTCTTTCTTCTTGTTAAGCTGACAGGTGA CTCTAGAGTGGCAGGAGATGCTTAATCAAGCTAGCGCACCTGATCTCAAA CTTCGGTCTTCAGCTTATCACTTCCTTTTGTGTCTTGTGCATTCCTTTTG TTTTTTACTTTTTGGACCTACCCCGGTGGGGTGGAGGTCCTATAAATTAA CCCATGTTCGTTAGTTAGTTAGTACGTTAGTTACCAACTTTTCTCGAGAT TGGCTCATTTAATTTTTCTGATTTTTTGCACAAAGGTGTTACTATAAACC CTCGAATGTGACGGAGCCCGATTTTCGAAAAAAAAAATTTTCCGGCCGGT AGAACCGGAAATGTCCCGAAAAAAGCGGTTTTTTGAGATTTTCTCGAGAT TTTATCATTAGTTTTTTGCGATTTTTTGCACATAGATGCACATTAGTACT GCCGAAAAGGTGTCGAAAACCGCTTGCCGAAAAAAAAAATTTTCCGGTCT GTAGAACCGGAAATGTGCCGGAAATCGTCGTTTTTTCACATTTCCGTCAC ATTTTTTCAACTTATTTTAATTGTTTCTTTACAGAAAATGTTCTTTAGAT GATGCCCAAAACTTAGCATCGTTTGATTTCCAAAAAAATCATCCTTTGAG TCCGGAACTCCTTAAAAATCGCCGGAACAGCCGAAAACCGGCGTAAAATG GTTTTCCTTCATTTTTTCAACTTATACTCGACAGATTTTCATGATTTTTT GCACAATGATGTAAAATGCCAATGCCCAAAATGTGACAGAGCCCAATTTT CCGAAAAGAAATTTTTCCGGCCGCTAGAACCGGAAATGTCCCGAAAAAAG CGGTTTTTTGAGATTTTCTCGAGATTTTCTCATTAGTTTTTTGCGATTTT TTGCACATAGATGCACATTAGTACTGCCGAAAAGGTGTTTCTTAATTGCT TTCTCCGTTCCAATAGATATATAAATCGAAATTTAAAATTATACATTACT TCCATTAAATTCTAATTATTCGTTTTATAAATAGGTAGGTCCATTAAAGT ATTACTTGTTTTATTTCTTTCTTCATTGGGTTTTTATTACAGATTGTCAT GGTTAGTCGCTAGTTTGTATCTTCTTCAGTGTATATAACTTCACTATATT TCTTTTTTTAAGGTCCATCGATACCCTCGACGATTTCGCAAGGTAAGATA AAAAAGGGTGCGACAATTTCGTTGCTCCGAGGAAAATAGAGATCTTTCAG GCTTTTGGTGGGTTGTTTAACGAAAGAAAATATTATTATTATTCTAGACG TCTATTGGTAAATTTTGAACTTTGAAATCTATTTTTTTTAAATGCAATGT AAAGATACATCCAGGTTTCCTTGTGAAAAGGGAAGGTCTTTGTGGGGTTT TTATGCATGATCGTTGATCTTGAAAATGTTATCTTAAATCGTTTTTGGTT GGTTTTATGTTCTATCCACAACAGGGTGTCCGGAAAAAAGTATCGAGCTG AAACACAACTATGAGTAAAAATAATTTATGTGTATGTTCACAAAGTTGTA TTTTAAGGCTTGGGGACACGAGAAGTTTTTTTTCACGTTTGTGCAATGCA ACATGCGGGAACATGCTCCATCCCACCAACACAAGAAAAAAGTGCTTGTC CTATGGTTTCTTTTTTTGTTCATGGGACAAAAAGTGAGGGAAATACCTAA AAGACACGCTGATTTTGTCCCAAAAAGAAGATTCGAATCAATTTTGCTCC ATTGTCCCAGGGACAAGAAAGAAAGAAAAATGGGGTTGAGACACGAAAAA GCGTTTCAGGTTGGTGGGATGGTGTCCCCAAGCCTTTAAGTTCCCCCTCC TTTTTTGAAGATGTATATTTTGTCCAACAAAGGATTTTTAAAAAAGGTTA TCGATTAATGCCTTTTAGAAAACAAACTTTTCTATATAATAAGGCTGTGA TTTCTCATATTTCGGCGTGGATCATCACAAACTTATCTCCACAATAATAT TTTCAAACTCGATGCTTTTTTCCAGACAGCATGTACAATCTGGATAACGT TTTTTTACAAACTCTTTATTTTCATTGTTTTTAAAAGTAGAAAAAAACTT TTTCAAAAGTCGTTTTTAAACTATTATCCAATTGACAGTGAGCTGATTTC ACAAAATTCGTTTACCAAATCAATCATCTATTTTTAAGACATTTTACTTG GTAAAAACGCTTCCTGTATTGCTTTGAAAGAACATTTCAATATACCAAAC GGTTTGCAACAATACACAATACATCCATGGAGAGACCAACGAAAAATTCA TATAAAATGTTCAGGTTCGGAAGATAATTACATTTACTTTGAAGGAAGAA TATTGTTCCAATTTTTGTAAATTTTAGGTAGACTCGCTAATTTTTTTTCC AAAGCTATTTCGCGAGATTTTATTTTATTTCAAGTATCATTTCATCAGAT AGATATGCAGTTCTTTAAGGAACTAAAAATTTGATTCGAATTACAGAGAG TAATTTCAGGAAAACTCGAATGATAAGAATTTGAATTAGAACGAGTTGAC TGTATGTCTACACTTTTCTGAAACTTTTAAACTAGCTGATATATTTTCTT TTTCTTTTTAAAATCAGGAAAAGTTATGAGATTTACCCGACTAGACACAA GAGACCAAGCTCCAGTGAAGGAACTAAAAGCTGCGTCAATGGAAGATGGT CTTGTGCTTGAGAATAATTATCGTGCGCATGCGTCCTTTCTACGCATGGC TAAAATACTAATGAACTTTGAAACCATACGCATGAAATGTGTTCGAAACA CAACAGAATTAGTTTCACTGGGCAACAAAAGACAAGCTTCTGATGCCGAT TTCAATGTTATACGATATTTCTCAGGAGAAAGTGATAGCCGACCTGTGGA GACGACAAGTAGTTGGAGATCCAGGCTGAATGGGGTGTGGGATGATTACC CAATTGATGCAGTCGACGACCTGTTATCTGCTGACAATGTTGAAAAAGAA TATCGACCTTTCAAAGATATTTATATAGGTAATGATGGTTTAAAAATGAC ATTCACAAATGAATCACAACAATGCTTTGGTCCTGAAGGCGATTTTAACC ATTATTTACTCGAAGTTTATTGATGAGAAATGGAAACATATTTCCGACAG AATAATGACCTTTCAAAGATATTTATATAGGTAATGATGATTTAAAAATG ACATTCACCAATGAATCGCAACAATGTTTTGGTCCTGAAGGCGATTTTAA CCATTATTTACTCGAAGTTTATTGATGAGAAATGGAAACATATTTCTGAA AGAATATCGACCTTTCAAAGATATTTATATAGGTAATGATGGTTTAAAAA TGACAGTATGATACTGGTCCGAACTTCCTATATCTGTAACCGAAAAATGA ATCGATTTTAGACACCGAAGTTTTTGCTTTCGTTTAGGTACTCGGTATCG TACTTTTGTGAGGGAGATTAATACCAATGAAGTATAAGCCCGAAGGGCTA GAAGAGAATCTTTGACCTGTCTCAGGCAAGAAAAAGTGAAGCCTTAAAAT GGGCGCTGCATTTTTGACGACGGGTTGAATGTAGCAGTCCTTTTGTTTTC TAGTGATATTTTTTT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000093_pilon:107709..122723-

>MSTRG.12346.5.p1 ID=MSTRG.12346.5.p1|Name=MSTRG.12346.5.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=6060bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000093_pilon:107709..122723- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GAAAAGTTATGAGATTTACCCGACTAGACACAAGAGACCAAGCTCCAGTG
AAGGAACTAAAAGCTGCGTCAATGGAAGATGGTCTTGTGCTTGAGAATAA
TTATCGTGCGCATGCGTCCTTTCTACGCATGGCTAAAATACTAATGAACT
TTGAAACCATACGCATGAAATGTGTTCGAAACACAACAGAATTAGTTTCA
CTGGGCAACAAAAGACAAGCTTCTGATGCCGATTTCAATGTTATACGATA
TTTCTCAGGAGAAAGTGATAGCCGACCTGTGGAGACGACAAGTAGTTGGA
GATCCAGGCTGAATGGGGTGTGGGATGATTACCCAATTGATGCAGTCGAC
GACCTGTTATCTGCTGACAATGTTGAAAAAGAATATCGACCTTTCAAAGA
TATTTATATAGGTAATGATGGTTTAAAAATGACATTCACAAATGAATCAC
AACAATGCTTTGGTCCTGAAGGCGATTTTAACCATTATTTACTCGAAGTT
TATTGAACATTTTACTTGGTAAAAACGCTTCCTGTATTGCTTTGAAAGAA
CATTTCAATATACCAAACGGTTTGCAACAATACACAATACATCCATGGAG
AGACCAACGAAAAATTCATATAAAATGTTCAGGTCCATCGATACCCTCGA
CGATTTCGCAAGAATCCCTGTATGCAGAATGCATTGTTATGTGAACATGG
AAGTATTTGCTCACCGAACCGCTTGACTAAAACATATCAATGTCTCCATT
GTTTCCCTCCATACACTGGCAAACATTGCAATGAAACTGATGAAGTGTAG
ACATCTGGTACATGCTAAATATTATTTGACAATGATGCTGTATCTAACAT
TCAACCTACACGCTATCACGGTTTTACAGTTAATACTAACATTTACTCAC
ACGTTTGCATCAAACCAAACATATATGTGGCAATCGACAAACATCACCAG
ACAACAAACACATGTACAGTATATGCGATTCAAGAAATTAACTCGTGGAT
ATAAGGTATGGGCTACACTCGGTAGACATATCGATTGTAATTTCAGTGGC
TCCTCTAAAATGGAATGTGCTGATACTTGTATGAGAAAACCAATGTGTGT
TACCTGGACATGGCGAGAACATTATGGGTTATGTCGCTGTTCTGCCGAAG
TATACCGTGTCTCTCCTACTTACATTTTACAGGATAACCAATTTGATGCT
TATGAAATTTGGGAAAAGTTATGAGATTTACCCGACTAGACACAAGAGAC
CAAGCTCCAGTGAAGGAACTAAAAGCTGCGTCAATGGAAGATGGTCTTGT
GCTTGAGAATAATTATCGTGCGCATGCGTCCTTTCTACGCATGGCTAAAA
TACTAATGAACTTTGAAACCATACGCATGAAATGTGTTCGAAACACAACA
GAATTAGTTTCACTGGGCAACAAAAGACAAGCTTCTGATGCCGATTTCAA
TGTTATACGATATTTCTCAGGAGAAAGTGATAGCCGACCTGTGGAGACGA
CAAGTAGTTGGAGATCCAGGCTGAATGGGGTGTGGGATGATTACCCAATT
GATGCAGTCGACGACCTGTTATCTGCTGACAATGTTGAAAAAGAATATCG
ACCTTTCAAAGATATTTATATAGGTAATGATGGTTTAAAAATGACATTCA
CAAATGAATCACAACAATGCTTTGGTCCTGAAGGCGATTTTAACCATTAT
TTACTCGAAGTTTATTGAACATTTTACTTGGTAAAAACGCTTCCTGTATT
GCTTTGAAAGAACATTTCAATATACCAAACGGTTTGCAACAATACACAAT
ACATCCATGGAGAGACCAACGAAAAATTCATATAAAATGTTCAGGTCCAT
CGATACCCTCGACGATTTCGCAAGAATCCCTGTATGCAGAATGCATTGTT
ATGTGAACATGGAAGTATTTGCTCACCGAACCGCTTGACTAAAACATATC
AATGTCTCCATTGTTTCCCTCCATACACTGGCAAACATTGCAATGAAACT
GATGAAGTGTAGACATCTGGTACATGCTAAATATTATTTGACAATGATGC
TGTATCTAACATTCAACCTACACGCTATCACGGTTTTACAGTTAATACTA
ACATTTACTCACACGTTTGCATCAAACCAAACATATATGTGGCAATCGAC
AAACATCACCAGACAACAAACACATGTACAGTATATGCGATTCAAGAAAT
TAACTCGTGGATATAAGGTATGGGCTACACTCGGTAGACATATCGATTGT
AATTTCAGTGGCTCCTCTAAAATGGAATGTGCTGATACTTGTATGAGAAA
ACCAATGTGTGTTACCTGGACATGGCGAGAACATTATGGGTTATGTCGCT
GTTCTGCCGAAGTATACCGTGTCTCTCCTACTTACATTTTACAGGATAAC
CAATTTGATGCTTATGAAATTTGGGAAAAGTTATGAGATTTACCCGACTA
GACACAAGAGACCAAGCTCCAGTGAAGGAACTAAAAGCTGCGTCAATGGA
AGATGGTCTTGTGCTTGAGAATAATTATCGTGCGCATGCGTCCTTTCTAC
GCATGGCTAAAATACTAATGAACTTTGAAACCATACGCATGAAATGTGTT
CGAAACACAACAGAATTAGTTTCACTGGGCAACAAAAGACAAGCTTCTGA
TGCCGATTTCAATGTTATACGATATTTCTCAGGAGAAAGTGATAGCCGAC
CTGTGGAGACGACAAGTAGTTGGAGATCCAGGCTGAATGGGGTGTGGGAT
GATTACCCAATTGATGCAGTCGACGACCTGTTATCTGCTGACAATGTTGA
AAAAGAATATCGACCTTTCAAAGATATTTATATAGGTAATGATGGTTTAA
AAATGACATTCACAAATGAATCACAACAATGCTTTGGTCCTGAAGGCGAT
TTTAACCATTATTTACTCGAAGTTTATTGAACATTTTACTTGGTAAAAAC
GCTTCCTGTATTGCTTTGAAAGAACATTTCAATATACCAAACGGTTTGCA
ACAATACACAATACATCCATGGAGAGACCAACGAAAAATTCATATAAAAT
GTTCAGGTCCATCGATACCCTCGACGATTTCGCAAGAATCCCTGTATGCA
GAATGCATTGTTATGTGAACATGGAAGTATTTGCTCACCGAACCGCTTGA
CTAAAACATATCAATGTCTCCATTGTTTCCCTCCATACACTGGCAAACAT
TGCAATGAAACTGATGAAGTGTAGACATCTGGTACATGCTAAATATTATT
TGACAATGATGCTGTATCTAACATTCAACCTACACGCTATCACGGTTTTA
CAGTTAATACTAACATTTACTCACACGTTTGCATCAAACCAAACATATAT
GTGGCAATCGACAAACATCACCAGACAACAAACACATGTACAGTATATGC
GATTCAAGAAATTAACTCGTGGATATAAGGTATGGGCTACACTCGGTAGA
CATATCGATTGTAATTTCAGTGGCTCCTCTAAAATGGAATGTGCTGATAC
TTGTATGAGAAAACCAATGTGTGTTACCTGGACATGGCGAGAACATTATG
GGTTATGTCGCTGTTCTGCCGAAGTATACCGTGTCTCTCCTACTTACATT
TTACAGGATAACCAATTTGATGCTTATGAAATTTGGGAAAAGTTATGAGA
TTTACCCGACTAGACACAAGAGACCAAGCTCCAGTGAAGGAACTAAAAGC
TGCGTCAATGGAAGATGGTCTTGTGCTTGAGAATAATTATCGTGCGCATG
CGTCCTTTCTACGCATGGCTAAAATACTAATGAACTTTGAAACCATACGC
ATGAAATGTGTTCGAAACACAACAGAATTAGTTTCACTGGGCAACAAAAG
ACAAGCTTCTGATGCCGATTTCAATGTTATACGATATTTCTCAGGAGAAA
GTGATAGCCGACCTGTGGAGACGACAAGTAGTTGGAGATCCAGGCTGAAT
GGGGTGTGGGATGATTACCCAATTGATGCAGTCGACGACCTGTTATCTGC
TGACAATGTTGAAAAAGAATATCGACCTTTCAAAGATATTTATATAGGTA
ATGATGGTTTAAAAATGACATTCACAAATGAATCACAACAATGCTTTGGT
CCTGAAGGCGATTTTAACCATTATTTACTCGAAGTTTATTGAACATTTTA
CTTGGTAAAAACGCTTCCTGTATTGCTTTGAAAGAACATTTCAATATACC
AAACGGTTTGCAACAATACACAATACATCCATGGAGAGACCAACGAAAAA
TTCATATAAAATGTTCAGGTCCATCGATACCCTCGACGATTTCGCAAGAA
TCCCTGTATGCAGAATGCATTGTTATGTGAACATGGAAGTATTTGCTCAC
CGAACCGCTTGACTAAAACATATCAATGTCTCCATTGTTTCCCTCCATAC
ACTGGCAAACATTGCAATGAAACTGATGAAGTGTAGACATCTGGTACATG
CTAAATATTATTTGACAATGATGCTGTATCTAACATTCAACCTACACGCT
ATCACGGTTTTACAGTTAATACTAACATTTACTCACACGTTTGCATCAAA
CCAAACATATATGTGGCAATCGACAAACATCACCAGACAACAAACACATG
TACAGTATATGCGATTCAAGAAATTAACTCGTGGATATAAGGTATGGGCT
ACACTCGGTAGACATATCGATTGTAATTTCAGTGGCTCCTCTAAAATGGA
ATGTGCTGATACTTGTATGAGAAAACCAATGTGTGTTACCTGGACATGGC
GAGAACATTATGGGTTATGTCGCTGTTCTGCCGAAGTATACCGTGTCTCT
CCTACTTACATTTTACAGGATAACCAATTTGATGCTTATGAAATTTGGGA
AAAGTTATGAGATTTACCCGACTAGACACAAGAGACCAAGCTCCAGTGAA
GGAACTAAAAGCTGCGTCAATGGAAGATGGTCTTGTGCTTGAGAATAATT
ATCGTGCGCATGCGTCCTTTCTACGCATGGCTAAAATACTAATGAACTTT
GAAACCATACGCATGAAATGTGTTCGAAACACAACAGAATTAGTTTCACT
GGGCAACAAAAGACAAGCTTCTGATGCCGATTTCAATGTTATACGATATT
TCTCAGGAGAAAGTGATAGCCGACCTGTGGAGACGACAAGTAGTTGGAGA
TCCAGGCTGAATGGGGTGTGGGATGATTACCCAATTGATGCAGTCGACGA
CCTGTTATCTGCTGACAATGTTGAAAAAGAATATCGACCTTTCAAAGATA
TTTATATAGGTAATGATGGTTTAAAAATGACATTCACAAATGAATCACAA
CAATGCTTTGGTCCTGAAGGCGATTTTAACCATTATTTACTCGAAGTTTA
TTGAACATTTTACTTGGTAAAAACGCTTCCTGTATTGCTTTGAAAGAACA
TTTCAATATACCAAACGGTTTGCAACAATACACAATACATCCATGGAGAG
ACCAACGAAAAATTCATATAAAATGTTCAGGTCCATCGATACCCTCGACG
ATTTCGCAAGAATCCCTGTATGCAGAATGCATTGTTATGTGAACATGGAA
GTATTTGCTCACCGAACCGCTTGACTAAAACATATCAATGTCTCCATTGT
TTCCCTCCATACACTGGCAAACATTGCAATGAAACTGATGAAGTGTAGAC
ATCTGGTACATGCTAAATATTATTTGACAATGATGCTGTATCTAACATTC
AACCTACACGCTATCACGGTTTTACAGTTAATACTAACATTTACTCACAC
GTTTGCATCAAACCAAACATATATGTGGCAATCGACAAACATCACCAGAC
AACAAACACATGTACAGTATATGCGATTCAAGAAATTAACTCGTGGATAT
AAGGTATGGGCTACACTCGGTAGACATATCGATTGTAATTTCAGTGGCTC
CTCTAAAATGGAATGTGCTGATACTTGTATGAGAAAACCAATGTGTGTTA
CCTGGACATGGCGAGAACATTATGGGTTATGTCGCTGTTCTGCCGAAGTA
TACCGTGTCTCTCCTACTTACATTTTACAGGATAACCAATTTGATGCTTA
TGAAATTTGG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12346MSTRG.12346Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12346.5.p1MSTRG.12346.5.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12346.5.p1.exon7MSTRG.12346.5.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12346.5.p1.exon6MSTRG.12346.5.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12346.5.p1.exon5MSTRG.12346.5.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12346.5.p1.exon4MSTRG.12346.5.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12346.5.p1.exon3MSTRG.12346.5.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12346.5.p1.exon2MSTRG.12346.5.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12346.5.p1.exon1MSTRG.12346.5.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000093_pilongenomesc0000093_pilon:107709..122723 -