MSTRG.12346.4.p3 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12346.4.p3
Unique NameMSTRG.12346.4.p3
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000093_pilon:107414..155869-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12346.4.p3 ID=MSTRG.12346.4.p3|Name=MSTRG.12346.4.p3|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=48456bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000093_pilon:107414..155869- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AGAAAAAACCTAAGGTTAAAAAAAAGATACAATTTCCACATGATGCATTC ATTATGGATCATTATCGCAGCATCAATATCTATGTGTTCTGCATCTGAAT GTAGCTTGACAGATTTTGAACTGTACCAACAGACTTGTATGAACAACACT TTATATAGCACCTTCAATGAGACAAAGATGTTGGAAGTTATCGAAAATTG TTTTCCTTGGATTTCACACAATTTTCCACAATGTTGGCAAGCTGTTCACA GCAATATTACAACGAGTAAATGTCAACAAACTTGCCAGTATTTTCAAAAC CATTGTCCAATGTTAGCGTTGTTTGATTCAACAAAATGTTTCAGTAGATG TGTTGTTGGAGCAGAAAATAGGCAGCAGAAATATGAAAATCTTTTATCCC TAAACTGCTCACAGGTATAAGTTTTTTAAATTAAATGTGGAACATATTTT GTATTTTTCCAAATATTTTCAATCTTCAATCATCTAAGAATTAAACGAAG AAGGTACAGACAACTCTCTCTAATTCGAACCTCTAACATTCGAACCTTTC TGTAATTCGAACTATAATATTGATCCCCTCCAGCTGGAAAGTGGTTTAAA TTTATTCTTTATAATTCAAATGCTTTTGCAACTCGAAGAAGATTTCTGGC CCCTTCAAGATCCAATTAGAGAAGTCAACTGTATCACCAAAATTACGCAA AATTTCATTAGGAACAATAAAAGCACTACTTGTGTGCTGCGCTTTCTTTG CACACGTTTTCTTTAACATTAAAAGTGTTTTAAAAGCAATTCTTTCTGAC CCACTTTTTAAAGAAATGCCAGGCATCCTGGATTCAAAACTACTATAAAG ATTTCACACTACTATAAACAAAATACTCGATCAAGCAAGCTTTTCCTAGT ACCCATCCTGTCCTACTTAATTGAAAATCTTAGGATTTTTAATGTTGTCA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000093_pilon:107414..155869-

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ATTTTGAACTGTACCAACAGACTTGTATGAACAACACTTTATATAGCACC
TTCAATGAGACAAAGATGTTGGAAGTTATCGAAAATTGTTTTCCTTGGAT
TTCACACAATTTTCCACAATGTTGGCAAGCTGTTCACAGCAATATTACAA
CGAGTAAATGTCAACAAACTTGCCAGTATTTTCAAAACCATTGTCCAATG
TTAGCGTTGTTTGATTCAACAAAATGTTTCAGTAGATGTGTTGTTGGAGC
AGAAAATAGGCAGCAGAAATATGAAAATCTTTTATCCCTAAACTGCTCAC
AGGCATGGAGATTCATTTTGGTGTATCCTATCTTTCATATTGATTTAACA
ATTTACTCATGGAAACTGATCTACCCTACTAATATCTCATCTGATGTAAT
GATTTATGTTAAGCTTTCTGATTGACTGGAAAAGTCAAAACCGATATCCA
GCCCTTATTCTGTTCATAACGAGCATCTGTTTCATGATGTGTTTTCTTGG
TTGGATTATTCAATTCTTTGGTGTTGGCAGAAAGATATCTTGTGATCCAA
CCAATCTTCGTAGAAACAAAGAACCAAGAATACTGTCGCCAAAACTTGTG
CTGGAAATTTTGTTTCAAGCTCACATTCATCGGAATGGGCGATCCAGTGG
AATTATCAAAATCAAAAACAAGATAACGAAATAGTGAATACTACATCTGG
TTGTGCTCTTTCTTGTGATAATCAGATTCAAGTATTTCGATCAGGCCAAT
TGCAAGTTGATGGACCAATCATATGTTTTTCATTGTTGGGAATAATTGCT
TCATCCTTCACCGTGATGATGCATTCATTATGGATCATTATCGCAGCATC
AATATCTATGTGTTCTGCATCTGAATGTAGCTTGACAGATTTTGAACTGT
ACCAACAGACTTGTATGAACAACACTTTATATAGCACCTTCAATGAGACA
AAGATGTTGGAAGTTATCGAAAATTGTTTTCCTTGGATTTCACACAATTT
TCCACAATGTTGGCAAGCTGTTCACAGCAATATTACAACGAGTAAATGTC
AACAAACTTGCCAGTATTTTCAAAACCATTGTCCAATGTTAGCGTTGTTT
GATTCAACAAAATGTTTCAGTAGATGTGTTGTTGGAGCAGAAAATAGGCA
GCAGAAATATGAAAATCTTTTATCCCTAAACTGCTCACAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12346MSTRG.12346Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12346.4.p3.exon16MSTRG.12346.4.p3.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12346.4.p3.exon15MSTRG.12346.4.p3.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12346.4.p3.exon14MSTRG.12346.4.p3.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12346.4.p3.exon13MSTRG.12346.4.p3.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12346.4.p3.exon12MSTRG.12346.4.p3.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12346.4.p3.exon11MSTRG.12346.4.p3.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12346.4.p3.exon10MSTRG.12346.4.p3.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12346.4.p3.exon9MSTRG.12346.4.p3.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12346.4.p3.exon8MSTRG.12346.4.p3.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12346.4.p3.exon7MSTRG.12346.4.p3.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12346.4.p3.exon6MSTRG.12346.4.p3.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12346.4.p3.exon5MSTRG.12346.4.p3.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12346.4.p3.exon4MSTRG.12346.4.p3.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12346.4.p3.exon3MSTRG.12346.4.p3.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12346.4.p3.exon2MSTRG.12346.4.p3.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12346.4.p3.exon1MSTRG.12346.4.p3.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12346.4.p3MSTRG.12346.4.p3-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000093_pilongenomesc0000093_pilon:107414..155869 -