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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000093_pilon:82300..86462+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12345.8.p1 ID=MSTRG.12345.8.p1|Name=MSTRG.12345.8.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4163bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000093_pilon:82300..86462+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ACAActtttcataattataaattGGTGAACTTTTCGATTTCACTTGATTT
TCGGCTTTTCCGCGAAAATCTCCGCagaaaaaagtcttttgatacGAGTA
CTATACACAAGAAACGTTATGCTCTAGCAGAGTATGTGGATACAATAGTC
TCAAAATTGCTGAAAATTCGTCATCTTCTTTCACATTATAAAAAAGCCTG
CAAAATTCAGATACAGTATGCCTGCTATGACATGGAAGTATACAAGTCGC
AAGAAGAAACGACGGACAATTCGGATTAatagtttgattaaaaaatatgT
AGTTCCTGATCATATACGATTGAAAGTTCAAGTAATTAGTGATTTTCTTC
TATATTTACTTACATGCCAACTTTCCAAGCCGACATCAGGCATCGTTTTA
AAGTATCCTTTATGAACTTTAGATGAACAAAAGTTATGGTGCTTTATACC
TAACGGGATAGGCTGGTAATAGACTTCACTTTGTTGACATAATGCCAGCC
TTTCGGTAAAATACTGTATAGCGATTGAATCTCAGGTTTGATATAatata
tttatattttccaCCAAAGTCTAAGGTATTATTAATGACTACaaaaaaaT
CCCTAAGATTCGAACTAATATCTTAAGAAACTAAGAATAGAGTAAAGTGA
tcaattacaaaatcaaaagttttgaaaaaagtaggattagggTATCCGTc
ccacactttttacaaaagagTGGAGTCTTTTGTAAAGAAGGCGGGGATGT
AAACAGCCTTAATCCTCTAACGTAAACAAAGCAAGGAATAGAGGCTATGA
GCTCCTTTATCATGTGGGGAAGGATAGATGGATCATATGGTAAAAGGGGG
AGGCGCAAAATATCATGAGAATCAATAGGTGCTTGAAAAACCTATagtgg
aaaaaaaatcaaattaaaaacaacaagAGCTTTATCGTTAAATACGGTAT
AGCTGGAAGAAAGGTTTTAGCTATCGAACAAACCGGGAGCATACCTAGAT
AGCATCTTTTACGTTAGGGTGAAAGCTTTGAGGAAGTTCATAGCGAATCA
AGAAAACGCAGCTCGACTTAAAAGAACATGTTGTATAAATTAAGAAACCT
TTGCACGATAAAAgagaaatcaagaaaattaagTAGTGATTATCGAACCG
CGATGGCAGCTTTGGGATTAGAAGATCGTCATTACTTGCAGACCCTTGTA
GAGGACACTTTGGCCGATAATTTTTTACCACGAGCACCGGAGAAAAGGCG
CCAGTCGATATGGGAAAAAGGCTCTAAAATGATTCAAGAGTCTTTTACAT
CGATGAAACAAACTTATGATGAATTAAAGTTTAGATCACCAAGAAATTTG
CCTGAAAATAGTTTGGTACTAATATAATCATATTTGTATAATTTATACAA
AATTGTTTCCATGTTTTCATTAAGTGAGAATTAACTGTGTTCTTCATGTT
CGCACTGAGCTTGTTAGAATCAAATAAACTTTtgttaaatgatcaattag
gtccataaaatcacaaaatcgagtttttcaagaaatatatttGGCCATTC
GGCTGTCCCTTTACTTTTGCTaatgcttgaaaatgaaagagaaaaaaaat
aaggggCTCAATTATGGCTTAAGTAAAAGATTGTTCTTATGCAAACAAAT
CTTTGCTCCTGTTTTGAAACTTGGTCACGCTCTGGTTACGGTAAGTTGAG
GGTAAGTTATGAGGTTGATTTATAATTTTCCAAGAATTCAGTACAGTTAC
TTAATGATTTTTTCCTTTGCATTTTTAGGCTATGAAATTCACTGATGAAC
AGATTGAAGGTAAGCTTCGAGCACTTTTTCGTTTTGCTGTTCTACTTATG
TCTGTTACAAGGACTTTCGTCGCGCATTTTTCAATCTAGACGGATGAATT
CTTAGCAAATTCAGTGGaagacaaataaaatttttagatcGGTGGAACAA
ATCCTATTTTTAAAAACGCTCGGTTTATGGTAGGGAGATTGCTGACAAAA
TCGTTAATCGTTAATATTCCTTTCGGGTGGGCGAAATATTTCGTTCTCTG
GGCCAAAACATGGCCCTTGAATTTTACACTCTAGGAAAATGCGTAGATCT
TTTTCTCACAAAGAATGATTTCTTCTTTATAGAGGTCAAAGAAGCATTTG
CAATTTTCGATAAAAATGGTGACGGTACAATCACGACGAAAGATTTGATT
ACGGTCATGAGGTCGTTAGGGAAAAACCCAACAGAAGATGAAATTGACGA
CATGATTAATGAAGTGGATACTGATGGTGAGACAagaatttgcatttttt
tgattgcTCTAGTTCCACCCACAAATGCATACTTTTCCAAATTGGCTATT
CTAATAATCCTACCAAGTCGCTACGGTAATCCGCTTTGGAAGGTCAATCC
AACATTCATAATTGCGCTGCTTTAGCCTAAAAGCCATAGACCTATAGTtg
caatttaattttttgttttcactatAGGTAATGGAGTGATTGACTTCATT
GAGTTTCTGGAGATGATGGCCAAGATGTCAACAGATGTTGATGAGACAAT
CAAAGAAGCTTTCTACATCTTTGACAGTGATGGTTCAGGTGAGAAATCAA
TTTTTAGGGGTTATCTCCTCCATTGGGTTTTCCCAGAACTATACTGTAAA
CttctgttgaggaggtccatttccgttccaatgGGGTATGGTTTGATATG
TGGTGGTGTTCAataaaaataactggaattatATCGACTTTGTTTCAACC
ATTAAATTAATCCTAGAAAAATTCAGAATCTTAGAGGATGTTAAAcctaa
attttccatttttctggaaaagccaatTGTCGCTAAGTTTAACTGAACAG
AGATATATACAGCACCTTGTAAATTTAAATGCAACTCACTTAGTTCTTAT
TGTCTGGTTATTTGAGTTCTCGTGTAAAATCTTCCCGTTCTTAAGTCCTA
TTTTGAACCCCTTTTGAAAACAAATAAgaactaaattttcaaaatttcct
ctaATAATTTTTAGAGCAATTAAAACTTCAAGTCAACGTTCACATGAGTT
TTTTATGGGTATTTCGGTGGGGTATAGgatggaaatatttttcaagcgGG
ATAGCAGTATAACACGGTCTAATCGTCTTATTATTTATCAGGTGCCATTA
GTTCAGAGGAGTTTCGTAAAGTGATGATGACGTTAGGTGCTCAAATGACT
GACGAAGAAGTGACAGAAATTATTGAAGAGGTTGATGTGGATGGTGATGG
TCAAATTAATTTAGAAGGTGCGTTTAGTACACTTTCTCTTTTCTTAAGCA
GCCATGTgcaaaggtagagcatccagctacggtgcacaaggtCGTGGGTT
TAATCCCTTATTGGGTATACCTTCACACTTAGTTCTAGAATGGTGCTTGA
TATGTCTCTCAGCTTGCTGCTCAGCacttaagagaaggatcaaggataAG
TGAAGCAATCCAAGAGAAaaagagtggtgccctcccctaccttcaggtag
atagctatcgaaagagtcGGGTCGTCTGCAACTGCGGTCACAGATTTGAT
TATTTACTACTTAGCACTTCTTACTTTTTAGAATTCGTTAACATGTTGAA
AGGTGGAATCTAAAGaaaacaatataacacaacaactacaacaaattata
aatgaatttgcaacaatcaacaaaaacgaaattaatAATTCTGACCCCGA
CATTGTGCAGTGAAGAAAGGCGGCGAAAAAATGTGAGCAGAAAAACATAA
CTTGAAACAGCTTTCGAGTCTTTGAATACGATTGTTTTCCGACATGATCC
GTTATTGTTATTTGAGCTGGCGCATGACGTCTATTTGACGTTGTTTGGGA
TGTTATGGACGCAAGATGAATGTTACTTTGACTTTGTGTACCCGCTTGAA
TGCGAGTTGTTGGCGGAATTGGAGGAAAACAGAACAAAATGGAAATCTGA
TGATCGTATGCAAGATTGAGAAATGAATGAATCCATTCACAGaaaaaaaC
GTTGAATATTAtgaacaattttaaaatataagacaaaaatatttttaata
catAATATCTCTTACGTGCGTATTTCAGGAACTGAGCAGAATTTCTATGT
CTTTCAATGTGCCTTTGGCGAAAGAAGAAATACTTAATTAATTGAACTTT
AATTCAATTGGAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000093_pilon:82300..86462+ >MSTRG.12345.8.p1 ID=MSTRG.12345.8.p1|Name=MSTRG.12345.8.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3348bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000093_pilon:82300..86462+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCCTGCTATGACATGGAAGTATACAAGTCGCAAGAAGAAACGACGGAC
AATTCGGATTAatagtttgattaaaaaatatgTAGTTCCTGATCATATAC
GATTGAAAGTTCAAGCTATGAAATTCACTGATGAACAGATTGAAGAGGTC
AAAGAAGCATTTGCAATTTTCGATAAAAATGGTGACGGTACAATCACGAC
GAAAGATTTGATTACGGTCATGAGGTCGTTAGGGAAAAACCCAACAGAAG
ATGAAATTGACGACATGATTAATGAAGTGGATACTGATGGTAATGGAGTG
ATTGACTTCATTGAGTTTCTGGAGATGATGGCCAAGATGTCAACAGATGT
TGATGAGACAATCAAAGAAGCTTTCTACATCTTTGACAGTGATGGTTCAG
GTGCCATTAGTTCAGAGGAGTTTCGTAAAGTGATGATGACGTTAGGTGCT
CAAATGACTGACGAAGAAGTGACAGAAATTATTGAAGAGGTTGATGTGGA
TGGTGATGGTCAAATTAATTTAGAAGAATTCGTTAACATGTTGAAAGGTG
GAATCTAAATGCCTGCTATGACATGGAAGTATACAAGTCGCAAGAAGAAA
CGACGGACAATTCGGATTAatagtttgattaaaaaatatgTAGTTCCTGA
TCATATACGATTGAAAGTTCAAGCTATGAAATTCACTGATGAACAGATTG
AAGAGGTCAAAGAAGCATTTGCAATTTTCGATAAAAATGGTGACGGTACA
ATCACGACGAAAGATTTGATTACGGTCATGAGGTCGTTAGGGAAAAACCC
AACAGAAGATGAAATTGACGACATGATTAATGAAGTGGATACTGATGGTA
ATGGAGTGATTGACTTCATTGAGTTTCTGGAGATGATGGCCAAGATGTCA
ACAGATGTTGATGAGACAATCAAAGAAGCTTTCTACATCTTTGACAGTGA
TGGTTCAGGTGCCATTAGTTCAGAGGAGTTTCGTAAAGTGATGATGACGT
TAGGTGCTCAAATGACTGACGAAGAAGTGACAGAAATTATTGAAGAGGTT
GATGTGGATGGTGATGGTCAAATTAATTTAGAAGAATTCGTTAACATGTT
GAAAGGTGGAATCTAAATGCCTGCTATGACATGGAAGTATACAAGTCGCA
AGAAGAAACGACGGACAATTCGGATTAatagtttgattaaaaaatatgTA
GTTCCTGATCATATACGATTGAAAGTTCAAGCTATGAAATTCACTGATGA
ACAGATTGAAGAGGTCAAAGAAGCATTTGCAATTTTCGATAAAAATGGTG
ACGGTACAATCACGACGAAAGATTTGATTACGGTCATGAGGTCGTTAGGG
AAAAACCCAACAGAAGATGAAATTGACGACATGATTAATGAAGTGGATAC
TGATGGTAATGGAGTGATTGACTTCATTGAGTTTCTGGAGATGATGGCCA
AGATGTCAACAGATGTTGATGAGACAATCAAAGAAGCTTTCTACATCTTT
GACAGTGATGGTTCAGGTGCCATTAGTTCAGAGGAGTTTCGTAAAGTGAT
GATGACGTTAGGTGCTCAAATGACTGACGAAGAAGTGACAGAAATTATTG
AAGAGGTTGATGTGGATGGTGATGGTCAAATTAATTTAGAAGAATTCGTT
AACATGTTGAAAGGTGGAATCTAAATGCCTGCTATGACATGGAAGTATAC
AAGTCGCAAGAAGAAACGACGGACAATTCGGATTAatagtttgattaaaa
aatatgTAGTTCCTGATCATATACGATTGAAAGTTCAAGCTATGAAATTC
ACTGATGAACAGATTGAAGAGGTCAAAGAAGCATTTGCAATTTTCGATAA
AAATGGTGACGGTACAATCACGACGAAAGATTTGATTACGGTCATGAGGT
CGTTAGGGAAAAACCCAACAGAAGATGAAATTGACGACATGATTAATGAA
GTGGATACTGATGGTAATGGAGTGATTGACTTCATTGAGTTTCTGGAGAT
GATGGCCAAGATGTCAACAGATGTTGATGAGACAATCAAAGAAGCTTTCT
ACATCTTTGACAGTGATGGTTCAGGTGCCATTAGTTCAGAGGAGTTTCGT
AAAGTGATGATGACGTTAGGTGCTCAAATGACTGACGAAGAAGTGACAGA
AATTATTGAAGAGGTTGATGTGGATGGTGATGGTCAAATTAATTTAGAAG
AATTCGTTAACATGTTGAAAGGTGGAATCTAAATGCCTGCTATGACATGG
AAGTATACAAGTCGCAAGAAGAAACGACGGACAATTCGGATTAatagttt
gattaaaaaatatgTAGTTCCTGATCATATACGATTGAAAGTTCAAGCTA
TGAAATTCACTGATGAACAGATTGAAGAGGTCAAAGAAGCATTTGCAATT
TTCGATAAAAATGGTGACGGTACAATCACGACGAAAGATTTGATTACGGT
CATGAGGTCGTTAGGGAAAAACCCAACAGAAGATGAAATTGACGACATGA
TTAATGAAGTGGATACTGATGGTAATGGAGTGATTGACTTCATTGAGTTT
CTGGAGATGATGGCCAAGATGTCAACAGATGTTGATGAGACAATCAAAGA
AGCTTTCTACATCTTTGACAGTGATGGTTCAGGTGCCATTAGTTCAGAGG
AGTTTCGTAAAGTGATGATGACGTTAGGTGCTCAAATGACTGACGAAGAA
GTGACAGAAATTATTGAAGAGGTTGATGTGGATGGTGATGGTCAAATTAA
TTTAGAAGAATTCGTTAACATGTTGAAAGGTGGAATCTAAATGCCTGCTA
TGACATGGAAGTATACAAGTCGCAAGAAGAAACGACGGACAATTCGGATT
AatagtttgattaaaaaatatgTAGTTCCTGATCATATACGATTGAAAGT
TCAAGCTATGAAATTCACTGATGAACAGATTGAAGAGGTCAAAGAAGCAT
TTGCAATTTTCGATAAAAATGGTGACGGTACAATCACGACGAAAGATTTG
ATTACGGTCATGAGGTCGTTAGGGAAAAACCCAACAGAAGATGAAATTGA
CGACATGATTAATGAAGTGGATACTGATGGTAATGGAGTGATTGACTTCA
TTGAGTTTCTGGAGATGATGGCCAAGATGTCAACAGATGTTGATGAGACA
ATCAAAGAAGCTTTCTACATCTTTGACAGTGATGGTTCAGGTGCCATTAG
TTCAGAGGAGTTTCGTAAAGTGATGATGACGTTAGGTGCTCAAATGACTG
ACGAAGAAGTGACAGAAATTATTGAAGAGGTTGATGTGGATGGTGATGGT
CAAATTAATTTAGAAGAATTCGTTAACATGTTGAAAGGTGGAATCTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000093_pilon | genome | sc0000093_pilon:82300..86462 + |
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