MSTRG.1234.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.1234.1.p1
Unique NameMSTRG.1234.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000006_pilon:545893..561184+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.1234.1.p1 ID=MSTRG.1234.1.p1|Name=MSTRG.1234.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=15292bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:545893..561184+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TTTATAAAAGGatatttttaactgtaaaaTCATTTAGGCCCTTTTTATTT ATACAGAAACAACAGAAACCCTGTCATTTAAATTCCTTTTTT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000006_pilon:545893..561184+

>MSTRG.1234.1.p1 ID=MSTRG.1234.1.p1|Name=MSTRG.1234.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3402bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:545893..561184+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCGGTGACCATCACAACGGACTATGGGGAtatgaaaatcgaattatt
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AGGATCAGGCAAAGGTGGAAAGAGCATTTGGGGAggaaaatttgaagatg
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GCAACCGCACCTTGATATGAAGTATACTATCTTTGGCAAAGTGATCGATG
GTTTTGACGTTTTGGACGATTTGGAGAAATTGCCGGTAAACGAAAAGAAC
TTTCGTCCTCATGATAAAGTTTACATCAATAATGTCAACATTCATGCAAA
TCCACTGGCTGATTGAATGGCGGTGACCATCACAACGGACTATGGGGAta
tgaaaatcgaattattTTGTGAGGATACTCCAAAAACATGTGAAAACTTT
TTGGCGTTATGTGCAAGTGGATATTATAATGGTTGCTCCTTTCACAGaaa
cATTAAAGGCTTCATGGTCCAGACAGGTGATCCTTCAGGATCAGGCAAAG
GTGGAAAGAGCATTTGGGGAggaaaatttgaagatgaaattGTGCCTCAT
TTAAAGCACAACGCACGTGGCATCCTTTCGATGGCAAACAGTGGTCCAAA
CACCAATGcaagtcagtttttttttacGTATGCCAAGCAACCGCACCTTG
ATATGAAGTATACTATCTTTGGCAAAGTGATCGATGGTTTTGACGTTTTG
GACGATTTGGAGAAATTGCCGGTAAACGAAAAGAACTTTCGTCCTCATGA
TAAAGTTTACATCAATAATGTCAACATTCATGCAAATCCACTGGCTGATT
GA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1234MSTRG.1234Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1234.1.p1MSTRG.1234.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1234.1.p1.exon1MSTRG.1234.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1234.1.p1.exon2MSTRG.1234.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1234.1.p1.exon3MSTRG.1234.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1234.1.p1.exon4MSTRG.1234.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1234.1.p1.exon5MSTRG.1234.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1234.1.p1.exon6MSTRG.1234.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1234.1.p1.exon7MSTRG.1234.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000006_pilongenomesc0000006_pilon:545893..561184 +