MSTRG.12320.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12320.2.p1
Unique NameMSTRG.12320.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000092_pilon:978578..1000140+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12320.2.p1 ID=MSTRG.12320.2.p1|Name=MSTRG.12320.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=21563bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000092_pilon:978578..1000140+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTactgttttttaataaaacaggCATGCAAAAGGGACAATAAAAAATGTG CtactttttatttatatattatgGTGTTgctttttgtgttttggttggCG GTATTGTTTGTGGCGGATGGTTTGGATATGAGCAACACCCCGGTGAAGCA GTTTTTGCCACTGGAGTCTATATTATCTTTCATTTGTATGATGGAGTTTT CGCATCTTTTTGTCGCCACGAAACTGATTTAAAATGCAAACGATTGAAGG TCCTGCAATGGCGTAAGTCTACATAAAATTTCCTGGTTAATCATTTTATT ATTATAACGCTACTAAGAGTAAAGGTACCAGATGCAGCTTTAGATTCACT GCATTGTTtgggcccgggggggggcactcgatctgaaaacgaccatacgt tcggcccaaaatttggcttctaaaatcggacccttacagggggggtttca tggttggcggaggagcggaatcggcccttttttcggacggagtggcggaa tttggcgaaaatttagacggaattacggaaattgggttctctgacggaga cggaaaattagacaattttagtgcggaataacggaatttagcaaaaaaat tggcggaatttcggaattggtaaaagattttcaaaatttgcggaattttc gacaaaaatattgaatttcaaaggaattttcggtgacggaattttggttc aatttaagacggtgtgacgaaaattggagaaaaaattggcggaattacgg aatcgggtaccccctgaaacccccccccccttacagtgcagtgaatttcc atgaaaaatcatacccttacagtgcatttttcaaaatttctctgccgtaa gggcgaaaatttttgcaattttccaagaaaatgtggaatttttcctccaa aattgaccaattttgtgccaattttaccaaaaaaattggccttttatcac 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AATTATATCGAATTGGCTAGAGCTACCATACTTTAAATTAGTAACTATGG TCATGcccaaaaaagaaataaattccTGATTAAACACATTTTATGACCGC CATTTTCGATTTTCCACTACGCATTTATTTCGGGGAAGTAACTGCCaaat cagtgaaaaaaaaatagacaaaGAAGGTATTAAGAAGAGTCTGCTctttt tacttatttatttaaccAGGGCGAACAGTTATTTGCCTTTTCTCCAGGAC CATTTCCGGAGTGTTTAAAGCCAATTTTCTCAAACAGGAAACTTGCTTCT TATCCAATTTGGAAACAAAAGATGTTTCGGGATTTTttccaccttcccgt tcgggaagtaTTTCCCGTTAAGCTAATACTTACCATTTCTGTATAGTGTT GCTGACTGGTTGTCGATATAGAGCATATTCATATAGGTAAATAAAACTTC TTTTTCTCCGTTTTAGAgttttgttttgctttgctTGGAACCCTTTGTAT TGAGTCGTCGATTATGAAATCTATTTTCGGAGCATGGGCAGTGTTGTCAT TTAGTCACACAGTTATTGCAGCCATTAGGCTATATTGCGGTGACGGTTTA AACAGTTTAGGATTAACTTTTGGAGGAATCAATGAAACAAGGATTGATtg ggaaaacaaaatcaaacaaaacataCGAAAAGCGCCTGAATTTGTAACAT ATTGTGAAGTAAGTGAACCAAAACTGatctggaaattttggaaaacaaGA AAAGTCATTTGGAGAGAATATAAGACTTTCAAATATAAACATTGGATTGA TTTGAGCCAGATTGATGAAGTTTCGATTGAGAATATTGAAAAGGAGCAGT ATATTCAGAAGATTGAATTTGATATTCAGTTTGATGATGAGGAAACAGAA AAATCATATCAACAACATGTTCAAAATCTTTTGGACAAGTTACCTGAAAT GTGTCGGAATGGTGAGATCAAAACAAAACGCATGATCGAACTGGACGGAA TCAATATTGAAAGAGGGATTGTTATCAAGCTAAGTTCCACCGGTCTTGAA AAGTTTCTAGAAGAGTATCCTTGGttagttgttttgtttttgcctgtCGG CATCTTAAGCATATGTCGGAAGATCATCGATTGGTTGATCGTTAGAATGG ATATTGAGCcctttttaaagaaagtaaCAATCAGAAAAGTCGTTTCAAAC AAAGATATTGAGGTCATATAAACCTCACTTAACTTCACGTCAAGTATTTT GTGGACAGATCTGCATTTTTAACGTGATGATCCCAAACCAAGCATATATA CCCATTTTTCTGTTCAAATGTAAATACATTTAGCCTTTAAACACCAGAGC TCGTTTCATTATAGGACTTTTAAGAAATTAACAAACGAAACCTGGTAGAC AATAAAGACTCAGTAGgttcaagttttatttaattttttttctttgtaat ttttttatattaatgGTAAATATCCCCCTGGGGGTACCACCTTTGCTCAC CGACGGGGATTTCGCCGACGTTCGACAAAGGACCCTACGTGTAActtgtt ttttctcaaaatcttgccaaaatttgtataaaagtaAAACGATACCCTGA ATGGATTTGAAAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000092_pilon:978578..1000140+

>MSTRG.12320.2.p1 ID=MSTRG.12320.2.p1|Name=MSTRG.12320.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1944bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000092_pilon:978578..1000140+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTGCtactttttatttatatattatgGTGTTgctttttgtgttttggt
tggCGGTATTGTTTGTGGCGGATGGTTTGGATATGAGCAACACCCCGGTG
AAGCAGTTTTTGCCACTGGAGTCTATATTATCTTTCATTTGTATGATGGA
GTTTTCGCATCTTTTTGTCGCCACGAAACTGATTTAAAATGCAAACGATT
GAAGGTCCTGCAATGGCAgttttgttttgctttgctTGGAACCCTTTGTA
TTGAGTCGTCGATTATGAAATCTATTTTCGGAGCATGGGCAGTGTTGTCA
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AAACAGTTTAGGATTAACTTTTGGAGGAATCAATGAAACAAGGATTGATt
gggaaaacaaaatcaaacaaaacataCGAAAAGCGCCTGAATTTGTAACA
TATTGTGAAGTAAGTGAACCAAAACTGatctggaaattttggaaaacaaG
AAAAGTCATTTGGAGAGAATATAAGACTTTCAAATATAAACATTGGATTG
ATTTGAGCCAGATTGATGAAGTTTCGATTGAGAATATTGAAAAGGAGCAG
TATATTCAGAAGATTGAATTTGATATTCAGTTTGATGATGAGGAAACAGA
AAAATCATATCAACAACATGTTCAAAATCTTTTGGACAAGTTACCTGAAA
TGTGTCGGAATGGTGAGATCAAAACAAAACGCATGATCGAACTGGACGGA
ATCAATATTGAAAGAGGGATTGTTATCAAGCTAAGTTCCACCGGTCTTGA
AAAGTTTCTAGAAGAGTATCCTTGGttagttgttttgtttttgcctgtCG
GCATCTTAAGCATATGTCGGAAGATCATCGATTGGTTGATCGTTAGAATG
GATATTGAGCcctttttaaagaaagtaaCAATCAGAAAAGTCGTTTCAAA
CAAAGATATTGAGGTCATATAAATGTGCtactttttatttatatattatg
GTGTTgctttttgtgttttggttggCGGTATTGTTTGTGGCGGATGGTTT
GGATATGAGCAACACCCCGGTGAAGCAGTTTTTGCCACTGGAGTCTATAT
TATCTTTCATTTGTATGATGGAGTTTTCGCATCTTTTTGTCGCCACGAAA
CTGATTTAAAATGCAAACGATTGAAGGTCCTGCAATGGCAgttttgtttt
gctttgctTGGAACCCTTTGTATTGAGTCGTCGATTATGAAATCTATTTT
CGGAGCATGGGCAGTGTTGTCATTTAGTCACACAGTTATTGCAGCCATTA
GGCTATATTGCGGTGACGGTTTAAACAGTTTAGGATTAACTTTTGGAGGA
ATCAATGAAACAAGGATTGATtgggaaaacaaaatcaaacaaaacataCG
AAAAGCGCCTGAATTTGTAACATATTGTGAAGTAAGTGAACCAAAACTGa
tctggaaattttggaaaacaaGAAAAGTCATTTGGAGAGAATATAAGACT
TTCAAATATAAACATTGGATTGATTTGAGCCAGATTGATGAAGTTTCGAT
TGAGAATATTGAAAAGGAGCAGTATATTCAGAAGATTGAATTTGATATTC
AGTTTGATGATGAGGAAACAGAAAAATCATATCAACAACATGTTCAAAAT
CTTTTGGACAAGTTACCTGAAATGTGTCGGAATGGTGAGATCAAAACAAA
ACGCATGATCGAACTGGACGGAATCAATATTGAAAGAGGGATTGTTATCA
AGCTAAGTTCCACCGGTCTTGAAAAGTTTCTAGAAGAGTATCCTTGGtta
gttgttttgtttttgcctgtCGGCATCTTAAGCATATGTCGGAAGATCAT
CGATTGGTTGATCGTTAGAATGGATATTGAGCcctttttaaagaaagtaa
CAATCAGAAAAGTCGTTTCAAACAAAGATATTGAGGTCATATAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12320MSTRG.12320Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12320.2.p1.exon1MSTRG.12320.2.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12320.2.p1.exon2MSTRG.12320.2.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12320.2.p1MSTRG.12320.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000092_pilongenomesc0000092_pilon:978578..1000140 +