MSTRG.12318.3.p1 (mRNA) -

Overview


Name	MSTRG.12318.3.p1
Unique Name	MSTRG.12318.3.p1
Type	mRNA
Organism	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000092_pilon:953675..1031942+
coding sequence from alignment at sc0000092_pilon:953675..1031942+

mRNA from alignment at sc0000092_pilon:953675..1031942+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR

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>MSTRG.12318.3.p1 ID=MSTRG.12318.3.p1|Name=MSTRG.12318.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=78268bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000092_pilon:953675..1031942+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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attcgaactaaaatattggtcctgTCAGCTGAAAAgtagtaccgtcaact
gctccaactagggactatcttacgcaacatgggaaggccattccaccacc
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tcatcaattttcactgaattATTGGCATGGCATTTCACAGCACACACTCA
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AATTTGACCGGAAGGAAAGTTCCACATCAACAGGATCAATCATCCTCACC
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GATGAGAAATTTGTTGCACTATTAACGATCACCCTAAACTCAATTAAAGC
CTATTTCAAGGAAGCGaaagagtggaatttcaaaCTCGAACAACTTCGTA
TCAAACGTGCTAACCAAGATGATGACGCCAAAATAACCGCCATGAAATTC
ACCGTGGCCGATCTCAAACGCAAAATCGAGGAGATCAATTGCAAGCTTAC
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ATTCCTCTAATATGAACACTGAGATAAAAGAGGTTTCTAACAAATACGAA
CAATTATTACAAACTCATGTTACTGACAAAACTTTAGTCACTGATATTAC
TAAAGTTGGAAAAAGCTATACAGAACTGACCAAGAGTTTCTCTGATTAcc
tgaaacttttgaaaactgaaGTCGATGAGAGAGACATCTACAAACAACGC
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ATCTGCAGACAACACCAACAAAGCTGCTACCAGACCTTCTCAAAAACAAT
TTCCTTCGAGGACCAGCTCTGTCATTAGTCAAAAACATCCCAGACATAGA
CGAGATATGGACAGCCCTCAAAGCAGCCTATGGAGATACCAGATGTCTTC
TCACAAAGAAACTCCAAATGCTGAGTGATAAGGGAGCGtctccaaatatt
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cgacttcgtttcgacttcgtttcgacttcgtttcgaATATATTCAGATAA
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tggatttcatgtcatccaaaaatttttagaatttttagcaATAGTCTCAT
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ATATGGGAATACCGTAATTAATTACAACTGAGTTGGTAATTAATTACAAA
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TCCCTGTTAGCTGATAGCCCCGAACagtaagaaaaacatatttctgAAAA
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ACCAAAACATTCTGTTGAAAATAAAGTTCAGTCATTAAGATATATTCCTA
AAAAAGCGTGCATATGTGAAATTAAACATGAACTCCCTATCGTATCcgtt
tcaaatttttaagtgAGAAGTTTCTCTAAacgaaatgaaacaaaatagaa
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caatttgaaacgaaaaaattgaaacaacatTTGGAGACGCTCCCTAAAGA
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TCCTTTCACCCAAAACCACCTGGCTTCGCTTCATCAAATTCTTGGAGAAA
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GGGGATATTCAGCAGACTCAAAAGAATTGTTGTGTTCAATCTGCAACACC
CCTGATGGATCAGATGATCACGTCTCCACAAATGGACCAGGACATTCTCG
ATTACTTCAGTACTTCACATGCAAAGCATTCGCCGAGCTGACACCAGCAA
ACAGACTTGCACTACTCAAGAAGAAAGGATATGAGAGAGGAATCTACCTA
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GAATCAACAACCTTATCAACACTTGGTACCTACAGTTTACAACTACCATT
GTGTGACGGAGATCAAGCCTTGGTTTCCGGCATCTGTATCAAGTCGATCA
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CAATCATTCAGCTCAAGTGGCATATCACATGTCACACTTCCTAAACCAGC
TCACGTCGTTGGAGGAGACACTCACCTGGTGTTGGGTGTCAAGTATTTAC
GTTATCATCCCAAGCTCATTTACCAGCTACCATCCGGACTTGGTATCTAT
CAATCCGCATTCAAAAACGCCGATGGAGGACGTGGAGTGATCGGAGGCCC
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TGTTGAGTTTTCTTCAATCACCAATACCTCATCGCAAGAGGAGGAGTCCA
AGTCGACCCAGATGTGAAGATGCTATCCTTACTCAGCAAAGACAAGCGTT
TCGAGCTCTCAGAATCAACAGGATCAGAGATTACATATAGATGCATCAAG
TGCAGATCCTGCTCGACCTGCAAAGTTCCGACCATCAACAAGATTCAGCA
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CTCAATACCAACACTGTGACAGCAACCTTACCCTTGCTTCAGGATCCAAG
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ATTGCGTCAGAGAAGAAACTTCAAGATCTTGGTTTAGTTGATTATGTTCA
TAATCTACCAGCTGACCAACAACAGATGCTCAAATCCAGTACCGTCCAAA
ACTACATACCCTGGCGAGCAGTGTGGAAGTTATCATCACTCAGCACTCCA
TGTCGCATTGTTTTTGATGCGTCACAACCAACCCAATCAGGATTCAGTCT
CAACGATTTGCTAGCCAAGGGAACAAACAATTTGAACAAAACTTCAGGAG
ATGATGATCAGATGGTCCATCCATGAAATTGGTTTACACAGTGACGTCAG
TAAAATGTACAACACTGTTAAGCTCGACCCAACGCATTGGACGTTGCAAC
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GACATCAACTCAGAGGAAGCATGCAAACGAGCAGACGAGCTAGAAGTTAT
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ATGAAATGGTACTCAAAGTCTGAAGTTTCGATCTCAATCTCAGAACTGAA
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GGTCAGAAGTCGTGTCATTGAGATCAATCGATTCACAAGCAAAGATGACT
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CGATTGGATGAAACAAGAAAGAGTCAATTCCCAGCAAAGCGTGTTGAAGA
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CTGCAAGAACATTGAAGTGCACGTCAGTCTCAACAGTGACGAAATAAAGA
AGAGATACGAGTTCTCTTCCTACATCTTGGATCCAAATCACCATTCATTC
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TCGCAAAGCAAAACCAAAGCTTAATGGGGAATTATCTGAAGAGGAGTTAT
CATCAGCAGAACAGTACTATTTTCAGAAAGGAACATCTGAAATCaagaag
ttcaccaacaaatCGAAGTACGAAAACATCGCAAGAGAACAAAATGGAAC
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GAAGATTCACCAAAGTCAAGAAAGACTTGAGCTCGTCAACCTTCTGTGTG
CCTGTTTTAGATAGGTACTCTCCCTTATCATACAGCATTGTCATGGACAT
TCACTGGAACCACCCTACTGCACGTCATTCTGGTGTTGAAACAACTCATC
GATTTGTTCTACAGAAAGTGTACATCATTGATGGCAGAAGTCTCGTCAAG
CAAGTTCGTGATTCATGTCAACGGTGCAGATACCTGATGAAACGTACAGT
CGAAATTGCAATGGGACCAGTTCCACCATATAATCTCACCATAGCACCAG
CTTTCTTTACTCACAATCGACCTATCAGGACCTTACCTGGCTTATCAacc
acaaaacaaaagaagactATCAAAATCTGGCTTGTAGTTTTGTGTTGTTG
TTCAACTTCGGCAgtcagcatcaaaacaatggatGACTATTCAGCAACAT
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GCTCCTTTGTGATGAAGGGAGTCAGTTGGTTAAAGCATGCAAAGAGATGA
ACCTCAACCTTCGAGATGTCCAATCAACCTGATGAAGCTTCACAAAGTCG
AATTTCAAGTCCTTCCTGTGCAGGGACACTATATGCATGGGAAAGTGGAA
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CGATCAATAACCTACCACTCGCCCTTGGTAACATCGTTGGTGATTTCGAA
TGCATGGACTTGATAACTCCAAATAGATTGTTACTAGGAAGAAACAATGA
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CATGTTCCAAATTGATGAAGCAACAAAAATGGTACCAACAGATAGCATCA
AATTGGAGATATTGTCATCTTTACGAAAACTGATTCGCATATCAAAGGAT
TATACGTATGGTCAAGTTACTAATCTTGAATACAGTACCGAGGTGTTGCA
CGTAAAGCCCCACCATAGATACAAAAACGTGACAGAGAACGTATTTCGTG
aaaaaaaCGAGCAGTTCGTGGTTTGGTTATTATTCATCATGTTGACGAGT
CTGACGTAATGACTCAACTTGGTCAAATGGCATTGTATGTTGATTTGGCT
TGTTCAAAATGATTTTCCCATTGGGGGGAGTGTAATGTTTGTGAttataa
aatggacaaaatcattttaacttCGTGTTAATGACTTTGATCTTATAAAA
GATCGCATATTCTTAGAGAAAAcatattttcttataattagCAGAAAGCA
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TGTATGTTGAGGGAAGTCAGAGAAAAAGTcactatttttaatttacaaat
ttggaatttaagtcaatgaatttcaagttataattcatcaattttcactg
aattATTGGCATGGCATTTCACAGCACACACTCATAGGCCAGCCGGTGAG
TtttggttcttttgtttttctgtggTTTTGTCTAGGACTTTGGTTCTCAG
TGTCTCTCTTTAAGTTAGGATAACCataggatttttttcagtacaattTT
CAATTATAGAATTTACCTAAAATTTCATTTGGAATTAGCTCATTTCAGTC
ATGTTTTCATGTCATTTTGTCTCTATGATTTGTTCacatttttgagatat
tttagaGGTTTATCACGAGCATTTTGAGGATATCTAGGATATTTTGTCAT
TTAGTCAAGGATTTGTCATtttagttcaaaatatttatcattttcatttt
gtactttttagttTGAACTCTGTCAACACAATACATCAATCAACTTCAAT
TGTGTGCGTGTTCCAAACCGACCCTTAATCTGTGTCCAGCCTGCCTGCCT
CTAcaaaccccactgggaaattgcccTATGATTTTATCACCAAttgaaaa
ttgcacttcaaaaacAATCCCCACTTGCGTTTTTGAACTGAAAACAATAG
ATTTCCCATTCCCATTGATATTTCATTAGTTTCAATAGTCAGGTATGATG
ATTGTAGCCTGTTACTCCCCCCGGGGATACCTAGGCAAGTGAAAGGTATG
TGTATGTGCCGCCATTAACTCCCCACTGAGAGAAAAAGTTCCACTGAGCT
TGCGAGACAGTGGTGTTTAATACATTGAGTACTGGAAGAAATGTTCTGCG
AAATTCTTTGACtcgaatttctaaatttactaACCCTCAgaaatattctt
ctttttcaacaatAGGTAAAATAACACCTGAGGAATTTGAGACGTTAAAC
ACACTCGGTATCGAAGATTACTTAAACATTGTGATGCGAGAACATCCCAA
ACATCGTCAACGAACTTCCGATCAAGTCTGGTTACCAATGTCTGAAGAAT
ACGATGTAGTCCTTAGCAACTTAAGAAACAGGTATGACGATTGTAGCATG
TTACTCTTCCGGGGGTATCTAGACAAGTGAAAGGTATGTGTATTAGCGCG
TTTAGCgtgcagtggtcctgattacccattacgctttgcgactgtgaaat
ggcctattgcCAGACGAAGATGGCTTTATTTCTAAGCAATGCAGTCAAAT
AACAAGTGGTTGACTATAAAAGAGTTTGAAATGTTGGATTAGAAGCTTAA
ATCATTGTTGAGGGGAAATAATGATCGCGCTGGTTTGGAGAGTTCCGTTT
CAGTTAGAAATATATTATCTTTCTGTAAGGAACTACCTAGATTCAGAGAT
TCAGTTTTAAGTGTTTTGACATTATTATAGGGCCCGAGTCAGGATAAAAT
CAAACGGAATTTAAACAGCGATGACGAGTTTTAGGTCCAAATTAAAGAGA
AATTCATTATGTTGTTATATAAAGTGGTAAATTGTCTAAGAATAAAATTA
TAAATCCTTTAGAGTATGTATTTCTATCAATATAAACGTTAAGGTTATTC
CCATGACACATTTTGATTTGCGCATACCATACCATAGTTCTTGATCGTCC
TCGTCTAAGATAGTTTACGATAACCGCCGCCCTAATGCACATTTTGAATG
AGAGACATTTTAACTCTCGTGTTATATCCATAAGTTCAGCTAACATGACA
CTTAGTATTATCCTTAAATCTATAGTCTAGCGTATGTATCAGTAAATTGC
GAAGTAATGTGTTTTCCTCTGGGTGTTCCTATTTTAGGAGTGTATAATTT
CTCATTAAAACGTCGTGGCTGTGTGTTGCATAAATGTTATTTGATAAGCG
TATTGTCCTACAAAGATCATATTTTGATCATGTTCATCGTTACGACCTTG
AATCGCAAATTGCGACCTTAAATCACAAATTACGACCTTGAATCAACACC
AATAAATTTTGTAGAAGTGAAACCAATTCTTACAAACTAAGAGCCAGTAC
GCATGCTCCAAATCAAGATCAATATAGAAGCGTTGATAGATTCCATTGAT
GTAAACCATCCTAAAATGAAAGCCCAATCATAATCCATCGCTACTTTGGT
TACCATTATGTTTTTCTGATTATCCTTGTCCGAAAAAATCGCCATGGCAA
TGATCCCAAACACTGCTGTTCCAAATAAAGCAactgaaattaattttgct
ttAATCTTAACTCCGAAAATCAAGCCGGATAACACCAGTGCCAAAACACT
ACATATTAATGCTAGAATGATGCATGCTTGCACTGCCCGTAGACTCTTGG
TGATTTTCAACTCCTGGCAGACTATACAGCGACGTTCGCCTATATCTGTC
TTACGATTATACTGTGTACATTCACGCCAGAGACCGATTGATATGGTCTG
CTTAACACCTCCGTTATCGATGCTTCCGTCAACCCATTTCATCCAGCCCG
TCATTTCGTCATGACCAATGCAAATAGATGCAAAAAATGCTGTTATTTGT
ATGCAGATTAAGAAAATGATCGTCTTTGCTATCTCCATTGTCTCTTTTGT
ATTTTCTGAAAGAAAGAAGATATAAGTTAATAAAAAAGGTATCTAATAAG
CAACGGTGTCTGAAAAAGATAAAGTGTCAGAGACTCTGGGACTCTCGGGC
GATCTCTAGACTAACCCTTTTGCTAAGAATCTTacaacaattttgaaaaa
agaaattcacaAGCACTTATGTACAGCTTGAAAAAGCTATCCTCAGAAAG
TTTAGCTATTCAATAATGTGATTGAAAGACTGAAAGgtattttactttca
aaaacCGTTGAAAACTActgaaaataagttaaaaaagaTACGCTTTAGAT
ATACCCAACGTAAACTTTggttttcaaaggtttttcatGATATAATCTTC
TTTCGAGACTCCCCTTGTCCTTTTTATTTGCATAATACCTCTCATTTACC
CTCCGGTACATAACCCCTGCTTCTTCCCTGAAACTACCTTGTCTCATAAT
TCATTTTACTAACTTTTAAAACTCTGTTCATCTTGAAAGGAGCAGACTTC
TTCCACTCCGTTTCAAACCTAACTCTAACTCGTGTCATTCAAaagttttc
ccaaaaaaaaaccACAAGACTCTCGACAAAcgaaaagtagaaaaatattt
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GAGCCTAAAATCTTTTCCACATTATACATGTTTCCCTTATTTTCTCCAAA
CGTTcataacatttttgtttttacttcatATTTTATTCATGTCTAATGTA
TTATAGATACCCCGCCGTTCTCAACTTTTTCCGAACTAAAAGCTTTCACA
TCTAAAACGTTTTCCTTCATTTACAAGAAGGGTATAAAACtaacaagttt
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GAAACGTTTGCCTTGAATTCTGAACTAAatcactacacgttttttttata
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000092_pilon:953675..1031942+

>MSTRG.12318.3.p1 ID=MSTRG.12318.3.p1|Name=MSTRG.12318.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=15378bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000092_pilon:953675..1031942+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GTGAAGCCCCAAAAAAGATCAGCTGTAGCCTGGTATAACCATCATGTTGA
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Gene-mRNA-Prot

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.12318	MSTRG.12318	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	gene

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.12318.3.p1.exon1	MSTRG.12318.3.p1.exon1	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.12318.3.p1.exon2	MSTRG.12318.3.p1.exon2	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.12318.3.p1.exon3	MSTRG.12318.3.p1.exon3	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.12318.3.p1.exon4	MSTRG.12318.3.p1.exon4	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.12318.3.p1.exon5	MSTRG.12318.3.p1.exon5	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.12318.3.p1.exon6	MSTRG.12318.3.p1.exon6	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.12318.3.p1.exon7	MSTRG.12318.3.p1.exon7	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.12318.3.p1.exon8	MSTRG.12318.3.p1.exon8	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.12318.3.p1.exon9	MSTRG.12318.3.p1.exon9	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.12318.3.p1.exon10	MSTRG.12318.3.p1.exon10	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.12318.3.p1.exon11	MSTRG.12318.3.p1.exon11	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.12318.3.p1	MSTRG.12318.3.p1-protein	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000092_pilon	genome	sc0000092_pilon:953675..1031942 +

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MSTRG.12318.3.p1 (mRNA) -