MSTRG.12313.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12313.1.p1
Unique NameMSTRG.12313.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000092_pilon:885036..898643-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12313.1.p1 ID=MSTRG.12313.1.p1|Name=MSTRG.12313.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13608bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000092_pilon:885036..898643- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TATTTCCAGGATGATATTGGAGATTGTGACGGTTCGCTTGGAGATAAAAT TTACTTTGTCGCGCGGTCGAACCACGGCAAATTCATAACAATAGACACTA TAATGTCCATCTCGCGAGGAAAGTTTCAACGAATGTCCAATTTGTTCGCT TCTGCATCCTTAGAGGACTTAACCAGACCTGGTAAAAATCCTCTACGGAA ACGTACCAAATCACAAACGCACTTATTAGCTTTAGCCGGAACTGAAAGTT CGGAATCAACGGAAAATAGTCCGGTCGTGTCAAAGAAAGAACCAATTGTT GATTTAATTAAAATGACTTCAAGCCCCCTTTTATCAAAAGTCGGGTTCAG CTCTCTGAGTGAAACACGGAAAACAGATAATGTGAAAATGAGATTGAACT ACGAAAGTGCGAGGACGGCAGGACATAAAAATCGGAACTCGAATTCAAGT TCAGGCTTACGTGGAATGAACCTAAAACATTTAGAAGCGGTTGCTTCACA GTCTAACAGAAGAGAAACTAGCCCGGATAGTCTAAATAGCTCAAACCCAG ACTCTTCAAACCTCATGAGAAACTCGAAAACTACTCTTAAAACGGATAAT GATAAAATTGAACTTCAACATCGCGAATCTGGCGCTAGATCGCTAGAAGA CGAAAGACCTAGCGCAAACGCTGCTTCAAATTCTTCCTCGCAAAGCAACA ACGCTTCTTCTTACCCAGGATGCAACAATGAAGACGCCGAATCGCTTTCA AGTGATCTACACGTGGATTCGCGGGTTGTCTTTTTTGACGATTCTGGGAT ACCTTTGCATGGTACTATCAAATATATCGGAACTTTTGATGACGTCATTC AAGTAGGCGTCGAGTTGGTGAGTGTATTTCTGTTGCTAGTTATGTTGATA AATGTATGGTTTATTTTTCAAGCTTTTGCTAACGGTACAAGATGAATGGA AATTTGGTAGCTTAATTCTCAGTTTGTGAAAGAAAAATTGAAACAAGTCG GTGTATGGACGAGGCATTGTAAGACTTTTCCAGAAATTTTCTGTATCCCC CCCCTGTAGAGGATATCCATTTTTCGATTTCCACAGCCCTTTGGATGTCT GGCTAAAGATAAAGACCCCCTAGATATCCTGGATGTCCAAGTTGATAAAA GGATCGAGGATGTCCAGACATTTTGTCCTGTACACCCTAGATATCCTCTA TCTCTTATAAGGTCCTACCCCCTGAATATCAAGATAGCATTGAACCCCCT GGATGTCTGATATACTCAATATGAGGGAGCACTGACTATTTCTGGAAAAG CTCATTGGCATAGTTCAGAAATTAAAATTCTGTCTATTTTTTGTCAACAG TCAAAAGCTGCTTACATTATCTCTGAACTTCTCTCTTATAGGATGCTCGC ATCACAGAATCGGATGGCAATTTCAGGGATGGGAAAAAGGTTTTTGATTG TCCTTCGAACAAAGGGCTACTTTGCAGACCAGAAGAATTGATCAAAGAGG ACTTGATGGAAATGCAGATGAATCAAGGCATGGGGAAAATCATTGTTGAT ACGCCTTGTAAGTTTTTTTTCAATGGAACAAAGTGAAACTTACTAAAATT GCAATCCTCACCCGACCTTATTAAACGTTAAAATACCCAAAATTGCCAAT ATATTTCGGCGCTGACTGTAGAAGCTATTTCAAAAGAACATTTTGCATCA TATTTGACATCCTCTATTTTATTATGATTTCAGTTTACAGTGCACCAGAG GTTGATCAAAATCAAAATGTCGTGATGGTTGAAAAATCAGGTAAGCATTA TCATCTGATCTCTAACTTCTCAACTGGATCGGGTTTGTTATAACAATGAA AGTGTGAAATCATGATGTGTCTGAGCTGTTTTCATTTCTGATCGTCAACA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000092_pilon:885036..898643-

>MSTRG.12313.1.p1 ID=MSTRG.12313.1.p1|Name=MSTRG.12313.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=13950bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000092_pilon:885036..898643- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AACGCTGCTTCAAATTCTTCCTCGCAAAGCAACAACGCTTCTTCTTACCC
AGGATGCAACAATGAAGACGCCGAATCGCTTTCAAGTGATCTACACGTGG
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TTCAAAAGTTTACGTCGTAACGCTGTGACGGGAGCAATATGGATTCTTGA
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CATCGTGATTGTATCGTGCATTATATTGGACCCTTGGAACGAAACAAAGG
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ATAAGGGATGCCTGTTGAGAGTGACGCGGCAAGATTTGGTTGAACATAAC
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ACATGATTGCATCATGTCCCGTACCTGGTTGTAGGTATAAATCCACTGGG
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ATTCTTCATCCGCGCGGAAGAAGAAAGAGAGAAGCAAATCATCAGTTTAC
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CGGGTTCAGCTCTCTGAGTGAAACACGGAAAACAGATAATGTGAAAATGA
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TCGCTTTCAAGTGATCTACACGTGGATTCGCGGGTTGTCTTTTTTGACGA
TTCTGGGATACCTTTGCATGGTACTATCAAATATATCGGAACTTTTGATG
ACGTCATTCAAGTAGGCGTCGAGTTGATGGCGGAAGCGAGTACCTCATCA
AAGCGTTATTGCATCATATTAAAATGTAACCCTGATACGGATATAACAGA
TGAGAAACAACGTTCCGATAAACCGTTCAAAAGTTTACGTCGTAACGCTG
TGACGGGAGCAATATGGATTCTTGATGACGCACGACAACGAGCAGATAAC
GACGGGACGGTGATCTTGACGTCCGTCGTGTCGCGAAGTTTTTGTATCGA
AACACCTCGATCAAACATTAAGGAGATAACAGACCAAGAGTATGGGTTTT
TGGAAGCTGTACCACACGAACGTCGTATTGGTGTTCTGGAGAATAAACTT
TTACCAGAGCTGCTGAAAATCAAGATTTATGATAAGATCACGGTGGCCCT
GGACGTGGCGAGTGACCAAGAAAGCCATCGTGATTGTATCGTGCATTATA
TTGGACCCTTGGAACGAAACAAAGGAACGTATTTTGGAGTTGTTTTCGAG
TGGGTGAAGAACATTTCTCATGTCCAATATGTCTTGATACCGTTGAAGAA
GCTGTTGAAACGACGTGTTGTCATCAAATTTTCTGTGAAAAGTGCATACG
TAAGCATCGAGAAATATCATGCCCCAAATGTCGAAAACAACCTTTCACCA
TTATTGTGAGTCACTTTGTTCGGAAACTGGTCGGTAATTTCTACATGGAA
TGTACGAATGACGGATGCTATCATATATTAACTCGATCAGATATGAAATA
TCATAAAGAGAAATGTGCTTTCGAGAAAATTCGATGTCCAAATGATGGAT
GTAAAGCGAAAGTTATTCGTTCTTCTTTGGACGAACATTTGAAGATGTGT
AGTTATTCTTTAGTGAAATGTCGGAATAAGGGATGCCTGTTGAGAGTGAC
GCGGCAAGATTTGGTTGAACATAACCGGCGTTGTGATTACATGGAAGTCA
CGTGTTCAAACGAAGGCTGTCACGTGACGATGATTCGATTAAAGTTATCG
AGACATTTACGAGAGTCGTGTCGCTACATGATTGCATCATGTCCCGTACC
TGGTTGTAGGTATAAATCCACTGGGAGCACGTTAGGCGAACACTTAAGTT
CGGAGCATTATGAAATGTTTATGAGACATTTGGATGAGCTGAAAGCTTTG
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AGAGAGAAGCAAATCATCAGTTTACAGTGCACCAGAGGTTGATCAAAATC
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TGGCAATTTCAGGGATGGGAAAAAGGTTTTTGATTGTCCTTCGAACAAAG
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ACGCACTTATTAGCTTTAGCCGGAACTGAAAGTTCGGAATCAACGGAAAA
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GGCAGGACATAAAAATCGGAACTCGAATTCAAGTTCAGGCTTACGTGGAA
TGAACCTAAAACATTTAGAAGCGGTTGCTTCACAGTCTAACAGAAGAGAA
ACTAGCCCGGATAGTCTAAATAGCTCAAACCCAGACTCTTCAAACCTCAT
GAGAAACTCGAAAACTACTCTTAAAACGGATAATGATAAAATTGAACTTC
AACATCGCGAATCTGGCGCTAGATCGCTAGAAGACGAAAGACCTAGCGCA
AACGCTGCTTCAAATTCTTCCTCGCAAAGCAACAACGCTTCTTCTTACCC
AGGATGCAACAATGAAGACGCCGAATCGCTTTCAAGTGATCTACACGTGG
ATTCGCGGGTTGTCTTTTTTGACGATTCTGGGATACCTTTGCATGGTACT
ATCAAATATATCGGAACTTTTGATGACGTCATTCAAGTAGGCGTCGAGTT
GATGGCGGAAGCGAGTACCTCATCAAAGCGTTATTGCATCATATTAAAAT
GTAACCCTGATACGGATATAACAGATGAGAAACAACGTTCCGATAAACCG
TTCAAAAGTTTACGTCGTAACGCTGTGACGGGAGCAATATGGATTCTTGA
TGACGCACGACAACGAGCAGATAACGACGGGACGGTGATCTTGACGTCCG
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ATAACAGACCAAGAGTATGGGTTTTTGGAAGCTGTACCACACGAACGTCG
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TTTATGATAAGATCACGGTGGCCCTGGACGTGGCGAGTGACCAAGAAAGC
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AAAATTCGATGTCCAAATGATGGATGTAAAGCGAAAGTTATTCGTTCTTC
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ATAAGGGATGCCTGTTGAGAGTGACGCGGCAAGATTTGGTTGAACATAAC
CGGCGTTGTGATTACATGGAAGTCACGTGTTCAAACGAAGGCTGTCACGT
GACGATGATTCGATTAAAGTTATCGAGACATTTACGAGAGTCGTGTCGCT
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AGTGCACCAGAGGTTGATCAAAATCAAAATGTCGTGATGGTTGAAAAATC
AGGATGCTCGCATCACAGAATCGGATGGCAATTTCAGGGATGGGAAAAAG
GTTTTTGATTGTCCTTCGAACAAAGGGCTACTTTGCAGACCAGAAGAATT
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TCGCTTTCAAGTGATCTACACGTGGATTCGCGGGTTGTCTTTTTTGACGA
TTCTGGGATACCTTTGCATGGTACTATCAAATATATCGGAACTTTTGATG
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GTAAAGCGAAAGTTATTCGTTCTTCTTTGGACGAACATTTGAAGATGTGT
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CGTGTTCAAACGAAGGCTGTCACGTGACGATGATTCGATTAAAGTTATCG
AGACATTTACGAGAGTCGTGTCGCTACATGATTGCATCATGTCCCGTACC
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GTTTTTGATTGTCCTTCGAACAAAGGGCTACTTTGCAGACCAGAAGAATT
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AGATAAAATTTACTTTGTCGCGCGGTCGAACCACGGCAAATTCATAACAA
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GATTGAACTACGAAAGTGCGAGGACGGCAGGACATAAAAATCGGAACTCG
AATTCAAGTTCAGGCTTACGTGGAATGAACCTAAAACATTTAGAAGCGGT
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CAAACCCAGACTCTTCAAACCTCATGAGAAACTCGAAAACTACTCTTAAA
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GCTAGAAGACGAAAGACCTAGCGCAAACGCTGCTTCAAATTCTTCCTCGC
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GACGGGACGGTGATCTTGACGTCCGTCGTGTCGCGAAGTTTTTGTATCGA
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GGACGTGGCGAGTGACCAAGAAAGCCATCGTGATTGTATCGTGCATTATA
TTGGACCCTTGGAACGAAACAAAGGAACGTATTTTGGAGTTGTTTTCGAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12313MSTRG.12313Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12313.1.p1MSTRG.12313.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12313.1.p1.exon6MSTRG.12313.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12313.1.p1.exon5MSTRG.12313.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.12313.1.p1.exon3MSTRG.12313.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.12313.1.p1.exon1MSTRG.12313.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000092_pilongenomesc0000092_pilon:885036..898643 -