MSTRG.12310.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12310.1.p1
Unique NameMSTRG.12310.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000092_pilon:824466..850246-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12310.1.p1 ID=MSTRG.12310.1.p1|Name=MSTRG.12310.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=25781bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000092_pilon:824466..850246- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTTCAATACACGTCAGTTCTGAATCGGACGGTATTTCCGCAAACATTAT ACGTATTATAGAGTTATAGGATTGTAACATGGTGTAGTATACTACTATGT ATTACAAAACAAATTACATCGAACATAGGGCTAGGAGGATGAGCAATTTT TCTCAAGAAAAGGTTGAGCATTAAGAGGAGAAGAAGTTTTACTTCTAATT TAGCGTTTCAGATGGGAAATAAGTGGCTTTATTTCCCATCCAGGAGTTAT TGATATAGCCCTTTCGGGGCTTTAAAATTAATGGGTGAAAGTGAAATATT TTAGGCTTAATACTTTTTTAATTAATTTGACCCTTAGTGTGAACTAGAAA AAAGCATTCACCTCAAAAACACCCCCTTCTCACAGACCCGGTAAGATTTT TTCAGCCAGTGGGGATAAAATTAACGGACTAAAACTCGACGGGGATTGAT ATTCCCCATATTTTTTATGACTGGGGATTTCAATTCTTTTGTTTTCAAGT CAGAAAATTCAGTGGGGATGGAAAAAATAGCATAATATTTTGCAATGAGG ATTGGTTTATTTGATTATTTTTAGTGGGGACGATATTTTGGCCATAATTT TTCCGGTGGGAAGGGGTCCCAGTGGGTCTGTGAGAAGGGGGTGTTCAAAA TGCTGCAATGTTTTTGTATAATCTTGATGACTCTCATTTCTGACATTTCA TGAAACAGAATCACAAATTTGAAGGCTAGTTATTATTATACATACAGTAG TTCACAAAAAGGCGGAGTTGGAATTTGTCATTATTTTTGTACTAAAATAT CACTCACACTTCATCATTTAGTTATAAAAATGTTATTGTTATCATTTTCA TCATGTGATCATACTCTATGACGTCATCTTTGAGAGTTTGTCGTTTTTAT AAAGATTTGTTTCCATCTTGTTCATATCAATGTTGGTTATTGGTCGTCAC 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000092_pilon:824466..850246-

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GAAGCTACGTTTTGTTCATTTCGGACTCGAAGCACATAAAGAGTGTCAGT
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TGGAGGGCGGTCTTATTTTAAAGTGAAATTTCACTCAGATGAAACTATGA
GTGGGAAAGGTTTTAAAGCCATTTTTAAAGAAATTGGATGAAGCTACCAG
GATGCCTTGCTTCTTATAAAACACCCGTCGGTAGGATCAGTACCCCGAAC
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TCCCGTTCATTTCAAAGTGGCCTTAAAATTGAAGGTTCCTTGGTCAAACG
AGGGTGGAGATTGTAGAGATAGTGTGACCATACATAATGACAAATATGAG
CGTAAACATCGTTTGAACACGCAACAGATTTGCTCGCAAAATGATGGCGT
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AGATATCAACGAATGCCAGTTCAAGAAGCAACCATGTGACCATTTCTGTA
CCAATCAGATTGGTTCTTTCAAATGCTCTTGTAAAGATGGATACCTTCTT
CAAAATGACAACAAGACGTGTAACGACAAGGATGAATGTGCGATAAAGAA
CGGAGGCTGTTCACACGCATGCGTGAATACAGCTGGAAGCTTCTTGTGCG
CATGTCCTAAAGGATACACACTGGCTGCTAACAAAACAACCTGTATAGAT
ATCGATGAATGTGCCCTTGGACTTCATTCATGCACGCAAGCATGTATCAA
CTATCCTGGTGGTTTCTTCTGTGGCTGTTATTCAGGATACCATACAGTCT
ATCAGAAAGATTCAAGAATCGCTGAATGCGTTGTTTGTTCACATCACATT
AAACAATTTCCAACACGCATTCAGTCTCCTGATTTTCCATTCGCTTACAA
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TTGAACTCGATTTCCCATTCTTCTCACTCAGAGAATTGGACAAAGAACGT
GGTTGCCTTGATTATATTGAAATTCATGAGGGCGATGGTAACAGTGAGAA
ATTTATCGGACGTTTCTGTGGTACAAATAGCCCGAAGAAAATTATTTCCT
CGTTAAACCAAATCAAGATACATTTTCATGCCAGCAAAAAGAAAAGATTG
GGATGGTATTTAGGATTCCAGGCTAACATCAAACAAAAAGATTGTGGTGG
AACTCTTTTCGCCGTCAAAGGCTCATTCACGTCAACCAATTTCCCGTCAC
GTTACCCGATGGACGTCAAACGTGATTGCATATGGATTATCTCAACGACA
CAAACCAAAGAACGGAACGGCAAGAAGACGTCATTGACGTTAATTTTCGA
TCAGTTTCACGTCGGCAACGAGAAAAATCGTAAAACGGGCCAATGTGAGG
ATGATTACGTAGAAATACGTGAAGGCAAAGGCTTCTTATCGCCGTATATT
GTACGTTATTGCGGCAATACGTTACCGTCACCCGTCACAACGACGAGCGG
CAGTTTATACGTCAGACTCCACACTTCGGGAAAAAATAATAATAAGAAAT
CATTGACACAACAAATGTTCACTGGATTTCAAGCTGACTTTAAAACTGAC
AATTTACGATTACGAATCGATAATGCATTACGGCACGAGATTTTTCTCGA
AGAATGATGGTAAAACAATTCGCGCAAAGGAGGTTGGGAAAAACGTTAAT
GAAAACACGATCGGGAAATCTTATTACAAATTTGACGGACCGGTTTTAAG
CACACAAGATATTTTGGAAACAAATCTTCTATATAAATGCACCAAAATCA
CAGATGTTGCAGTTACGTTGGTCGTCGTGGTGGTCGCCAATATTTATCGC
TCGGCCGCGGCTGTCTACGATTTGGTATCGTTACGCACGAGTTAGGACAC
GCTGTCGGTTTTTGGCACGAACAGAATCGACCTGATCGCTCGATTTATAT
CGATGTTTTATACGATAATGTCGATTCATCGAAATTCTTAAATTTCGATC
CGAGAGGAATGAATGAAGTCAATACTTTTGATCAGGAGAAGGCAAGCTTT
TGATTTTGAAGGCGATGCGTCATTGGGAGAGCGAGACATGTATCAAATTT
GTCAAGAAGACCAAACAAGTTGATTTTCTACACATTTATCCTGGCAATGG
GTTATGTGCTTGATGCTCCTATCCCAGAATCTCAACTCATGACTGAACAT
CAACAGCACAGAAAACGACGTGCGGCCACGAACCATGAATTTAAGGTGTG
GCCGAACGGTGTTATACCATACTCGTTTGACAAAGCTATGTCCAATGCAT
CTTTTGGCCATCGTCATCATCTTATTGGCCTTGATGTCCCAACAACAACA
AGGTGTACTTTGTCTCGATCATGTAAACCTCGACGATGACATGTTGGATG
CAGGTGGACAAGGCTGTGGAGCTGCCGTACCCTTTCCCGAAAGCCATTGA
AATCAATTACCATAGCGTCTCGTCAAAAGAGCAGCATTGTGGTCGTACAT
TTAACATAACGCACGGCCGTTTCCGTACGCCCGGTTATCCGTTCCGTTAT
CCGGATTCACAGAGCTGCGTATGGACGTTACATTCACCTAAGCGTCAACG
TATGAAGCTACGTTTTGTTCATTTCGGACTCGAAGCACATAAAGAGTGTC
AGTATGATTACGTCATCGTTGAAGAACATTTTTATAATATGCCAGCCGTG
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TGATGGAGGGCGGTCTTATTTTAAAGTGAAATTTCACTCAGATGAAACTA
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CAGGATGCCTTGCTTCTTATAAAACACCCGTCGGTAGGATCAGTACCCCG
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GTACCAATCAGATTGGTTCTTTCAAATGCTCTTGTAAAGATGGATACCTT
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AATGTGAGGATGATTACGTAGAAATACGTGAAGGCAAAGGCTTCTTATCG
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ACAACAACAAGGTGTACTTTGTCTCGATCATGTAAACCTCGACGATGACA
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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12310MSTRG.12310Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12310.1.p1MSTRG.12310.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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MSTRG.12310.1.p1.exon3MSTRG.12310.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.12310.1.p1.exon1MSTRG.12310.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000092_pilongenomesc0000092_pilon:824466..850246 -