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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000006_pilon:518718..526679- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.1231.1.p1 ID=MSTRG.1231.1.p1|Name=MSTRG.1231.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7962bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:518718..526679- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTGTTCATTGTCACAGTATAAATAGAAGCGCAAGAATTGAACAGTATTAA
GAAGCTCACCATCAGACAGAGAAGATATAAACCACAAGAAGCAGACAACA
AAGTTAACTCTTGGTATCATGATGAAAATCGTTTTTCTTTTTCTGGTTTG
TTTTGTTCTTCAACAAACAAGTTCAAATGAGTTGAAGGAAGGAGGTAAAT
ATGTAACATGTTCGAACCCAGTAACTCTAATGAAACATAAGGTTTCCTGT
TTGAAAACTAGATTTTGCCTTTTTAACAACCAGGTTACAAACAACAAATC
CATCTTCCCTTGTTCTTATATCATCTCATCCTTTCTATCTATGAGAAGGA
ATAGTAAAATTAAAACAGGAAACCTGACATTTAAAGATCCACATTCAAAC
ATTCAACAACATGCTCTGTTTCCCTTTCAGAATCTCACAGCCGTGAACGC
AGAGCAGTGTGTGGTTATCAAAGATATAACACTCGATTTAGGATGTGCTG
CAGTGGCAAATTGGGCCTAAAAGGATCTAACAATGCCTGCTGCGGTCAAA
CAGGTTATAACACTCGATTCAGGATGTGCTGCGGTGGCAAATTGGGCCTA
AAAGGATCTAGCAATACCTGTTGCGGACAAACAGGTTATAACACTCGATT
CAGGATATGCTGCGGTGGTAGATTGGGCTTAAAAGGATCTAACAATGCCT
GCTGCGGTCAAACAGGCTATAACACTCGATTCAGGATATGCTGCGGTGGC
AAATTGGGCTTAAAAGGATCTAACAATGCCTGCTGCGGTCAAACAGGTTA
TAACACTCGATTCAGGATATGCTGCGGTGGCAAATTGGGCTTAAAAGGAT
CTAACAATGCCTGTTGCGGTCAAACAGGTTATAACACTCGATTCAGGATA
TGCTGCGGTGGTAGATTGGGCTTAAAAGGATCTAACAATGCCTGCTGCGG
ACAAACAGGTTATAACACTCGATTTAGGATGTGCTGCAATGGTCGACTAT
GTTAAAAGAATATCTGTATAACTACAGCACCGAGTTTTAGTTTAAACATA
TGGGGATAGAGAAGGTATCTCCAGCAACCTCAAGCAAGAAAAAGTGCTTC
CGGAACGACTGATTTAATTTATCGCTTTCTTTATTTTCACGCGGCATATT
TTTCAAAATCTGGCGATTAATTTTACTTTCAATCTGCCGTTTGTGCGAAA
ATCACGCTTTAATTCCATCAAAGAGTTTCAATAATAGCCCCTTCAGGACT
TTAAACTCAATGGTATTAACTCTTATCAAGGATTTGTAGAAATAAAAGGA
GCGAAATGATATTGAAAATGTTATTTCTTACTTTGTATTTCTATAGAGCA
ATCTTTTTATGTATTGTTATAGTATTGTATTGTGTATGTATTGTTATATT
CATGTAAAAATAAAATTTTCATTCTTGATCCCTTAAAATATGGAATGTTT
ATGTTTCACTCTTGATAAGGAACACCCCTGTCTCAGTGCCCCAGTAGAAC
TGTTTCCCTCAGTGGGGATGAAAATTTCTATCAAAATGCCAATGCGGATG
GTTTTGGAGTGCAATTTTTTACATTCAGTTTTCAATGGGGATAAAATCAT
AGAGCAATTTCCTAGTGGGGTTGAAATTGTAGGATATTTTTTCCACCGGG
TACGATTTTTTGGCCTATTTTCCACCGGGGTGGGGGGTCCACCGGGTCTG
TGACACAGGGGTGTTAAGGAATAACGATATTGCATAAAAGTACTGTCGCT
CGACGTTTGTATGTATAGGGTACTCTGTAAGAATCGACCAAAGAGAAGTA
CACTGTAAAAGAAAATTGATTGCTTTTCAGCTATCTGTTACTACTTCAAA
ATAGTAGGGCTTGGTACAGACTATGGTTCTAGGAAGAAGAAACACATGAA
AAACAAAGTACTTGAAAAATAACTAATAGAAAGCAAAACGCTGAATAAAC
GAAATTTAAAAGTGTTTATCCTTCGTCAAGTAGCTACCTCTCTTTCTTGG
ATCATAGAAAACATAAAGGAAACAAAACTTTATATTCTCTAGACTCTCTT
ATATTCTTTAGACACTTTGTAGTCTGATTTGCGCTCCTGCTGTTTTTTTT
TTTGAATACGTTTTTGAAGTCAGCTGCGAAAGGTTTTATGAATTTAGATA
TTCATTTTTTGGGATCTTCAGAAATCTTAGATGAAAATTGAAAAGATCTC
CTTCGCCTAGGACAAAGTTGGTCACGTTTTATAAATTGTAACAATGGGTT
TCTGGAGGAGTATAAATAGGGCAGGCTGGCAGTTCGGAGCCTGGAAGAAA
TCACAACAGTTATAACAAGGGAAAACTATAACAATAAACCTATTGAAAAG
GTAAAACTTTTTTTTTCAAAATCGCACTCTAGCACCGAAAATTTTCGGTG
ATTACATGAAGTTTGGGGCCATTACATGAAGTTTGTTTCATAGTTATTTA
TGCTATCTTTACTGTAAATGTCCAAAACTTTAGCACTTCTATAAACTTAA
CTATAGTTACAAATTCCACATTAGTAAAAATAGTAAAAACCTCAATCATC
TTCAAGTAAAGCAAAGTTTCGGATATGTGTAAACTATAAAGGTCCCTTTT
TTACACCCTCGAAAGTCTCTCAAAGGGGTACAAAAACCATTTGGCTCCAA
CATAACCGCCCCCACACAAACCTAGTAATCTTGCCCACACAACCGTGAAT
AAACAGTTTGGTTAGTTTTCATGGAAATTTGTAGCACTTTTTGCACAGAA
CATCTGCAGAAATTATAGTAAGTGAAACCAATGTTTTATGTAACTCATTA
TTTTCATAGATGGCGTTAACATCGTAGAGTTTTGTCCTTTTGGTTTGTTT
AATTGCTATCCAGGCTACCTTCTGTCCTACAAAAATCATTTATAATCAAT
CCAATCGAAGTCTTTTCCAAAAGTTTGGCAATTGCACATTTACACAAAAT
GCTTTTGAAGGGTAAAACGATAAGATTGAAGTTATACCTTATTGGAAAGA
CAATTCTGAGTGGCTGAATTTGATTTTTTTTATTGGAAATTTTTATCCAA
TGGAAGAAAATCTTCAATCTGTGTTTTGTTGAAACTTTGAACGTTAAAAT
GTATTTAGATTTTGCATATCCTTCTTGGATTAAAAGTTAGAGCCCTAATA
GAGCCGTAATATGAGTCCATTTAGCCCCTTTTAATCGATTGTAACTTTAG
GTAAAAAAAATACAGCTTCAGAAAAGAGTAATTTAAATAATTTTGGGCCC
GTCCGAAAAATCTTCCTTATTTATCTTCATTTTCGAAACTGTCAATTATA
TTTTTGGAGACTTTAATACAATAATATAACCTGTTGGCAAAAGAAAAAAA
TCAAAAATCATGATGACCAAAAAAAATACAAGAGTACAAGATATATTAAA
TTGTAGTACAATGCGTGCATCGAAAGTATAATTCAATTTTCTTTTTGAAA
TTGAATAGAAAATTGAAATTTTTTCTAATTTCTTTTTTTAATATGTGAAA
CAAAATTGAAGAATAAGTCAAATTTGTATTTTCTATTTGAAATAGGAAAT
TGAACTAAAATGATATATTTTGGGAAAAATACGACCAAAAAAAAAATTTC
CCGCTTAAATTCTTGCATCAACCGTTTTATATCTCCCTAATACTAAGCCA
CGCAATTTAATCAGACAGCATTTACTTTATGTACACTCTTATTAGCTCCG
TAGTAATTGGCGCACTTGCTTTATGACATTTCTAAATAACGGAGATAATT
GGAACCTTTGAAAGTTACTGACAGTGCAAGCAGCAGTATTGTTAAGCTTC
AATGGTCGAAACGAAAATTTATATTTCGAGTTGTTGGTCTTTTTCAAAAA
TTTTCTCATTAATGCATTAAGGTATCATATGAGAACTTCCCATTTTCACG
GTCCTATAGAAGTAAAGCTTGAGCTATGTCGACCTGCTTTTTCGGCCCAC
GCGAAAAAAGTCACTATATATTCTTATTTGCGGTGGCACACATTGGAAAT
AAAAATGTCGGCATATGTCCCATTTCCATTTATTTGCCGGAATTCTTTTT
GCAGCATAAAAACTCGAGTTTTTTTTTTAAACGAAGCTTAAAAGTGTACT
GGTAGTTAACATTTCGAACATCTTTGTATTTTAGGGAGATGGGGAGCATC
TGAGAGGAGGAGTCGAGCCCCCCCCCCCCCCAGGGGGGTTCAAGCAGTTA
ATCCAAAACACTTCTCACTATGCCTGTTTTGACCGTGGTGGTCCATTTTC
AAATTTTGAAAAATATAGTTAATCCAAGAGTGGATTAACTGCCAAAGGGG
TGGTCTCTGAAAGAATTCTGGGAAAAAAAAGTGGACTAACTGCATTTTCT
GTCATTCTGTAAAATTCATTTATTCTGATTCATGCTCGTTTTTGCCTAGA
CTAGTAAACTAGTCGGTTATTACTTTTAACCTTATAATAAAACTGTCAAT
CAAATAATGTAAACACTAATTAAATATTCAGCGCGCGTGAGAGAAAAGGA
AAATAACCGACTAGAAGCTACTTCCAACGCCTTTTTTTCTTCACCTAAAA
TCGTAAGGAGAGACATACAGATTTCTGTATGTCTGACCCGTGCGGGATTG
CATTTATTTTTCTTTCTGTTTATTGCGTTTTTAGAAATGCTCATTTATTT
ATATGTTCTCATGTTCAATGTTACTATGAAATATCATTTAGTCAAAAAAG
TTGGATGGATTCTCAAAAACCTAAAAAAAGTTGTAAAATTAAACAACGTT
TTTTGAGGGAAGTAGCTTCTAGTCGTTGAAATTCAGAAAAGAGACGCAAC
TTCACCCCTTCGATTCTTTTTATTTGGAGCTTGATTTTTTGTATATGGGT
CTGTTTTCAACGACTAGTTTACTAGTCTAGTTTTTGCCTCTTCTTCTGTC
TTTAAAACGTCAAACTGTATCAAAGTCCTGCTTTAACTTTATCCTGCTTT
GTTTACAAATTCGGTTTTCACTAATTTTCAAGCTGATACAAAATCGGGTG
ATTCGCCCCTTTTTTGTAAACAAAAATCCGATTAAAACAGATTAAAAATG
GTAGACAATTTGCGAAATATATTTCAGGTGGAACAGCCTGCTTGCGAGCT
TGTATAACCTTTTTATCAAAATGGTTTGTTTTAAACCAGCTTTTACTTAA
TATATACTTAATAGAACATATGTTTTACTACCTGTCAATAGAAATATTTC
TCACAGAATTCTATACATCCTATTTATCTATTCTTTCTATGTACTATTGT
GCAAACACACACACACATTTTTTTACTGCTCCTCTTTCACTTTTTTCACT
TAAGTTTGAAAGCAGTTGAAAACGGTATTATGAGCATGAATCTGGTAATG
TCACCCAAATAGGTCAAAGTTTTTGGAAAAAATAAAGTTTTGAATTTCAC
TTTTATTCCTGGATAATCTTTTTATTAATGACTTCAATTTTCAGAAAACA
TAAATATCAGGGCTTAATCAAACTGGCTTGGTCCAGAAATTTGACCTAGA
GTAGTTATAATCAGACAAATTTGGCAAAAAACTCTTTTTAGTTTACACTT
CATTTGAGATAAAATATGCATAATCTAATACTTGTCTTAGATTTCAGTCC
AAGCCTAATATAATAAGCTGCATTGAAAAGCAATTTTTACCGTCCAGTAT
GACATATTTTTCAAATTCTGACACTTTTTCCAGAAGAAAATCTAAAATAC
TAAAAAATATTCCTATAAAGTTTGACTTCATGAAAAGAAAACTGGCTATG
ATCAGGTAACTTCATTCTAGATTTAAAGGACCCATTAAAACCAAAAGTTT
GTTATATTTCAGTTGATCAATAAAAAATTAGAAAATGAAACCTTGTTGGT
TGCGGACGACATAACTTTTTGTCAAATTTACTTTAAAATCAGCAATAAAC
ATTAAACTGAGTAATTATTTGGCTTTTAATACTTTGCTGTACTTGAACCA
AAATTTAATCATTGAAATTTGTTGTCTTGAGTTGAAAGGTCTTTGTAACT
ATGATTTCCTGAAAATTGAAGATTTATCTGTAAAAGAGAATCCAATCATA
TATCATTTTTTGTCATAATCTAATTTTAAAAGTGAAATTTTGAGCTTGAC
ATTAACTGTTGTACATCTTCATAATCAGTAAATATGATTTTTCCTTGAAA
AGCCACTCAACCTGCATGCCAAAATGCCCCGGTGGAATGTTTTAGGAGGT
GGTTCCTAAATATCATCCAAAATCAGTTACTACGGATGATGTTCTGGATT
AACTGCTTCCCCCCCCCCCCTGGCCCCCTTAAATTTCCAAGATTGAAAAG
TTTGAAAAAGTGATCTGGAAAGTAAATATGAGGTAAATATGAAAATTTTA
GTTCGGCCAGTATTCTGCTTAGTAATTCAAGTTTATATTTGGTGCTTACT
TGCAAAGTTTCATGTCAAAGATTTTCACTCTAAGAAACACAGAAGCTTTA
AGAGTTGTTGAGTAATATTATTTTTTTCACCATCTAATAACAGTTCTTAA
TGTTTTGATATCAACTGTCATTTACGTCATCAAAACATATCACAGAAAAA
ATGCTGAAACGCTGACACTCCTGAAAAAAAAACGCTGAAATTCCAAGAAA
TCTAAATTTGACTAGCTTATACGTTTTTAGAAGACCAAATATGACGATGA
ATTCATTTCCATTGTTCATTGTCACAGTATAAATAGAAACGCAAGAAGTG
AACAGTATTAAGAAGCTCACCATCAGACAGAGAAGATATACCACAAAAAA
CAGACAACAAAGTTAACTCTTGGTATCATGATGAAAATCGTTTTTCTTTT
TCTGGTTTGTTTTGTTCTTCAACAAACAAGTTCAAATGAGTTGAAGGAAG
GAGGTAAATATGTAACATGTTCGAACCCAGTAACTCTAATGAAACATAAG
GTTTCCTTTTCGAAAACTAGATTTTGCCTTTTTAGCAACCAGTGGAAAAC
TGGTTACAAAAAACAACTTCTTCTTCCCTTGTTCTTTTATCTTATCCTTT
CGATCTATGAAAAGGGATGGTAAAATTGGAACAGGAAACCTGACATTAAA
AGATTCGCATTCAACGTATCAAAAACTTCAACAACATTCTCCGTTTACCT
TTCAGAATCTCACAGCCGTGAACGCAGAGCAGTGTGTGGTTTTCAAAGAT
ATAACCCGACATTTAGAATGTGCTGCGGTGGCAGATTGGTTTTCAAAGGA
TCTAACAATGCGTGCTGTGGACAGGCAGGTTATAACATTCGATTCAGGAT
GTGCTGCGGTGGCAGATTGGTTTTCAAAGGATCTAACAATGCGTGCTGTG
GACAGGCAGGTTATAACATTCGATTCAGGATGTGCTGCGGTGGCAGATTG
GTTTTCAAAGGATCTAACAATGCGTGCTGCGGGCAGACAGGTTATAACAT
TCGATTCAGAAGTTGCTGCAATGGTCGACTATGTTAAAAGGATAACTTTA
TAGCTACCGTTTTGAAGTTGTCAAAGGCGATTCTCCTTCCTCAGCTCGAT
CGCATTAACCATCGAGTTTAAAGTCCGAAGGGCTGGAGAGGAATTTTTTA
CCTCTATCATGTAGAAATAAGTAAAGCCTTAAGCTTTGATTCGCTTTTAG
AATGAGAGATTACATCGAACATTGTTTACCTTCCTTCGGCATATTTTTCT
AAATCCTTTCAATCTGGTGTTTGTGTGAAAAGCACGCTGGTCACGCGTTT
CAGATGGGAAATAACTGGATTCTTTTCTTATCCAAGAGTCTCAACTCTAG
CCCCTCGGGGCCTTAAACTCAATGGTAATAGCCCTTATCAAGAATTCGTA
GAAACAAAAGGAGCAAAATGATATCAAAAATATAATTTTTTATTTTGTAT
TTTTGTAGAGCAATCTTTTGATGTTTTTTCATATATTTTTCATATATATA
AATAAAATTCTCAATATTAGTTCCTTAAAATACGGATTCCAATTGAGTTA
TAACCGTGTTAT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000006_pilon:518718..526679- >MSTRG.1231.1.p1 ID=MSTRG.1231.1.p1|Name=MSTRG.1231.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=816bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:518718..526679- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AATCTCACAGCCGTGAACGCAGAGCAGTGTGTGGTTTTCAAAGATATAAC
CCGACATTTAGAATGTGCTGCGGTGGCAGATTGGTTTTCAAAGGATCTAA
CAATGCGTGCTGTGGACAGGCAGGTTATAACATTCGATTCAGGATGTGCT
GCGGTGGCAGATTGGTTTTCAAAGGATCTAACAATGCGTGCTGTGGACAG
GCAGGTTATAACATTCGATTCAGGATGTGCTGCGGTGGCAGATTGGTTTT
CAAAGGATCTAACAATGCGTGCTGCGGGCAGACAGGTTATAACATTCGAT
TCAGAAGTTGCTGCAATGGTCGACTATGTTAAATGATGAAAATCGTTTTT
CTTTTTCTGGTTTGTTTTGTTCTTCAACAAACAAGTTCAAATGAGTTGAA
GGAAGGAGAATCTCACAGCCGTGAACGCAGAGCAGTGTGTGGTTTTCAAA
GATATAACCCGACATTTAGAATGTGCTGCGGTGGCAGATTGGTTTTCAAA
GGATCTAACAATGCGTGCTGTGGACAGGCAGGTTATAACATTCGATTCAG
GATGTGCTGCGGTGGCAGATTGGTTTTCAAAGGATCTAACAATGCGTGCT
GTGGACAGGCAGGTTATAACATTCGATTCAGGATGTGCTGCGGTGGCAGA
TTGGTTTTCAAAGGATCTAACAATGCGTGCTGCGGGCAGACAGGTTATAA
CATTCGATTCAGAAGTTGCTGCAATGGTCGACTATGTTAAATGATGAAAA
TCGTTTTTCTTTTTCTGGTTTGTTTTGTTCTTCAACAAACAAGTTCAAAT
GAGTTGAAGGAAGGAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000006_pilon | genome | sc0000006_pilon:518718..526679 - |
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