MSTRG.12299.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12299.2.p1
Unique NameMSTRG.12299.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000092_pilon:767742..788505+

Legend: exonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12299.2.p1 ID=MSTRG.12299.2.p1|Name=MSTRG.12299.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=20764bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000092_pilon:767742..788505+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AGCTGGCACACGAAgttattttaacgttcatctaacgttacatggacgtt gtgaacattagatgaacgttgaaacaacgttacaATTTAATTCTATTTGG ATGAAGTGTTGCTGTCCTTTTTGATACAGTTCTAATGTTTTACCAATTCA TTTGTTTCGtctattgttgttgtttttctgtACACATCTCGTTCAATTAt ttgttaaatttattttttttgtttcatttgctttttttttatttcttcga tttttcttttcctaCACTATACAGGGAATCTGGAAAGTTCTCTAATGGCT CCCGTTATTAGGGAAGTCATCGCCCGACTTTGTTTTACAAAAGGAAAACA CAACATTTCTTTCATCCTCTAAAATTTGGGTAACGTCGATTAccttctat tcatgatatgcacaattgcaatgtcttcaatgTCTTCTCAGCAGCtaatt ggttgcaagtgacgtattgactgaccAATCGGTCAATTGGGTCCGTGATT TAATGTCAGaggacattgcaatggtgcatatcatgaatatagaTCACACC TTACTTACAACCTTTCAGCTGTCAAGCTGTGAGCTTCATCTTCTAACTGT GTTAAAAACcctatattcatgatatgcaccattgcaatgtctttcacGAA CCCAACAGCTAATTGGTTGAAAACGTATTGACTGGTTTTACGTcaattac aaccaatcagctattgggtccatgatgtaatgtcagaagatatcgcaatg gtgcatatcatgaatatgtcATTTTCGTAACTTTCCAGAAACGCTGTTTC TAGTTTCGTCGTCCATTCTTCGTCatttttctcaattcttctgagatata atttttttaatattttatctttccatttttttccacattttcatttattt caaaaagagaggaagaaatttttgcaggGAATGTTTTAAACGGGTctcaa 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000092_pilon:767742..788505+

>MSTRG.12299.2.p1 ID=MSTRG.12299.2.p1|Name=MSTRG.12299.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3900bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000092_pilon:767742..788505+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTAGTGTTAggatatcttttttttaaagagaaattacTCCGATGCAATTC
ATCAACTATCAATCAGTTAATTTTGGTTTGGAAACGCAAATGGTTTATAC
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TAGTGAGAAATTTTCAGATGAACTTtcaaatgaaagtgaaagcgaAAGTG
ACGTCACGTTACGCGATCAACCTTTAAAAGCTTCTTTATTGGCCCACTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12299MSTRG.12299Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12299.2.p1MSTRG.12299.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12299.2.p1.exon1MSTRG.12299.2.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12299.2.p1.exon2MSTRG.12299.2.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12299.2.p1.exon3MSTRG.12299.2.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12299.2.p1.exon4MSTRG.12299.2.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000092_pilongenomesc0000092_pilon:767742..788505 +