MSTRG.12284.2.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12284.2.p2
Unique NameMSTRG.12284.2.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000092_pilon:316727..337555-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12284.2.p2 ID=MSTRG.12284.2.p2|Name=MSTRG.12284.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=20829bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000092_pilon:316727..337555- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TCAACTGTAGTCTGAAAAATCCCTCTATGATTCTTCTATAAATGGAAAAT TGCATTTTGTTCGTTTCCAGGCGTATCCTTCTTTGAAACCTCTTGCATCA TGGGTATTAGATTTAATCGAACGTGTTAAATTCATCAATGGATGGATAGA TAATGGTATACCACCGGTAAGTTTATGGTCTAATACAGAATACTCTGTAC CAGAGAGTAGCTCAAGTAAAATGTAGCGTAGTACGGCAATGAATTCTTGA AATTTCCGTAGATCTCTGGTTTGTTTACAGATAGCATACATATAAAAATG TAGAACATTTTTTTCTTTATCTCCTTTTTAAGGTGTTTTGGATCAGTGGT TTCTTCTTCCCACAAGGTTTTTTGACTGGCACATTGCAAAATTACGCACG TGCTAATGCTATGGCTATCGATACAATCTCTTTTGATTACGAGGTAAGAT ATTCGGAAGATTTATTACCCAGCTGGCACAGAACGTTATAACAACGTCCA TCTGGCGCCCCTAATGTTACTTACTTACTATAACGTTTGTTGAATGTTAA AACAACGTTGTGTGCCAGCTGGGTACAACTTCTCAATCTACTCAATGTCA ATGTCAGCCAGCGTATGAAATCGTTCGATCATTTATTCCGATTCATATGA TAGCATTTGGTCTAGGCTCTACTAGCTGCTACTAGAATTATAAAATTCGA TGGCTTGAAATTGCCAGTGAGCTTTTTATTGGTTATTCAATATTTTCTTA AAGATTTTGTGTTTGTCCTCGTGTTAAATATTCTGGTTCTTTTTAATATT TCCGTTCACATTTCTTTTATATTGCCCAAATCGACCAATCAAAGTGTGTC AATAATCTTTTTTTCAGGTAATGAAAGAACCTGCGAAAAAACTCACATCA AGACCAACATCGGGATGTTACATCAGTGGTTTATACTTAGAAGGTGCTCG ATGGGGGTACAGTATTCACGAGTTAGCTGAAAGTAAACCTAAAGAACTGT ATACAGAGATGCCAGTGATTTGGTTGAAACCAGCTCAGAATCGTGTCAAA CCAAATGACGGGATATACGAGTGTCCAGTATACAAGACTTTGACACGAGC AGGTGAATAATTTTTTTTGAATTACCTTTATCTCATGCTTTAATGGGATA AACTTTCGCGGGGATTAAATTTCACGGATTTCGTGGATTTGAGTGTCATC CGTGAAAATCTGCGAAATTAAGTCCCAATGGAAATTTGGAAGGGCTTCGT CCGCGAAATTTAATCCCCGTGAAAGTTTATCCCATGAAAGTAACAGATCA TCCATTCTATGCATACCACGCTCTGCTCTAAAGGGTATGGGGAACTTAAC GCTCTGACCAAGTTGTACAGCCAAAACATTCAAAAATGCAAGGATGGGTA ATTTTTAGGGAGTAAGTGGGGGTAATAATAGTCTAGAAATTGGATAGAAC AATGAGCTATCGAAATTTTATTGTGATCTTCAGCGGGTTATTCTTACATT ATGATGAAATGGCCTCAAACATATCCTATAATAATAGTGAGTTGGTTGGG CCGTCATGAATATTTTGGGTTTGTTTCTTCCCATTTTTTGAAACAGATAT AGGCGCCTGCAACCTCAAGTTGTTCCAAGATAAGAACAAGAGGGAGAGAT AATGTAAATGACGATAAGAAATGTTAGATCATGTTTATGATACGTTTTTT CAAGATGGCGTTCTTAGATAGATAGAGTCGATATTTTACGTGGATAGCCC AGTAATCTAAGACTTTTAGACAGTCTTTTGATTATTTTCACGGGGTCCAC GGGCAGCCGGTTCAGCTATCTATGAATTGAGCGGAACATTGGAAGGAGCG GGTGTTCGAACCGCGAATCCCTGGTTTGAGACGCTGTCGCCTTTGACCAC TTGGCCATCGCTCCTAAAACGCTCTTCTTTCTCTGGTTTACTTTCATGTT TTATATTCCTTTCTTTCTCAACAAGTTCTCGACAGTTTTACTTTTTACCA TCTCTGGTGCTTATTGTGTCTCTTTTTTTCCAGCTGTGAAAAGCCCGATA ATCTGTGCCTGACAGAGCAAGTTATTAAAAAAGTAACATTGTATAATCTA TAGTCCCAAACTAAAACCCTCTTTAAATGATTTATGAGAATTTTAGTGAA AAAAATTTTTTTAGCAAGGTCAAATACTTCAAATCAGATCTTCTTAAATT CTCTTTATCTCATTCTATCAACTTTTATAGACAGGCACACTGATTTGGCG GGTTTTGGTTATTCTGTCTGGATTCGTGGCAAAAGGTAGAATTGAACTGT ATATTGAAGAAATGAACAGTGGGGTAGCAAAGAGGCAGTGTACCCCCCCC CCCCCGCGACAGTTTTATTTTTTGGAGCCTAAAGGGGGACGGCGCCAAAA TGGCCCTTAAAACTTACCTCACTTAGACCAATGCCTTTTTAAACCTCGAA TAGCTTAGTTTAAACGGGAAAATTCCCATAAGACAATCTTAAGAAAGATT TTCCGTAAGGTCTAAAGTAAGATTTTACGTACGTGTGAAAAAAAGCTTAA TAGCCAAAAAAGAAAGTAATCATCAAAAAGATTTTGTGCTTAATCAACTT GCGTAGCTTTTAACTATTCCCAGCAAGGGGGAGCAAAATTCTTAGTTCTT TAATTTGCTTCCCCAGTCTTGCTTTAGACACCATGCTTTTTAACGGTTCC TTCCAGCTAGCCGTCAGTGTCAAAATGCCCCCTAAAAAGCTATTAAACTT GCATTCATTTAGCTGTTGGCTTGATTCGTCTATATTATATTTTCTCAAAT TTCGTACGATAAAAGCCGCCAATGCTGTTTCGTCAAGCATAATACTAGCT TCCAATCAATTATCAGTAACTCTCGTAGAAATCGAAGCACGTTCTCACCG CTATCTACAAATGAATAAAAACAAAACTTGCTTTTCATCAAGCAGTTTTA GCATCTCACAGTTAAAAAAAACCTATATTTTTCCGGAAATGTATATTGGT CAGAGATCTTAAGCTAAACAATGAAGAGAGCAATTTCGACGGACTTGTAG TTTATATCCGCTATCAATCAACAGAACAAAGACTTGTTTTCCGCGTGACA AATGCAAGTTTTATTTTAACAGCCAACTGTCAATCATAACTGAAATCGTT TTGACATTTCTTTGAAGCTATTCGTCTCTTTTATTTGAAAGCTGATAGAA ACTGTCCTTACCATTTATCTTTCTGTGACGTTTTCATATTCCGACAAACT TTGAATTGTTGGATTACATATTAGAGATGATTGAAGATCTCGTCCGATCG TCGGCTGATCGAAAGTTAAGATATGCATTGCTATAAAGACAAAAAATCGG ACGTGAAAAGATAACTATTGGTAGCTACGGGTTGAGGAGTACCTTATGGA CACAAATGCCCATATATGTTAGCGGGCATCTACAAATAGTTACGTTATGC TCTTTTTGCCCTCTTCTATTTTTTGTAACCGCTAGATTTTCTTTCAATCC AATAAAAGAATCTTCACAGAAACTCGGCGGTCTTCTATGCGTGACAATAT AATACTCTTCTTTTGTTAATTGCTCACCAATTATCTAATACCCAGCAAAA GTTAATTATCTGACCTTCATTCACTCTTAGCGCCTACGCTTGTAAGAAAG ATCGACCAGGATATCAGATTTAACATTCTACACTATAATTATACACAGCT AAAACGTCATAATCGATAGGACAATTTCTAAGCCTGGGAAATTCCATAGA TTAGAAAAAGAGGAACCTTGTCATTACTATGGGAATAATTTGGCTGACCA GGAATTTTTGAAGACGGCGTCTTTTAAAACTGGAATACAGAATATGAAAC TGCAAAGGACTTCATCGGGGTCCAAAGATGTCAAATGTTAGAATGCGTAA ATGCAATGACATTTAAATCGTCACCTTAGTCAGTCAGGATCTAGCAAAAT AAAAACCTAACCATCCGTCTTTGTCACAGAAAAACTCGCTAATGTTTTGA AATGATAAAAGTTACAGGAATGGTAAAACATCACTAGCCTGGTTAACCAA GCCAGTTTTTACAAGGCTATGATACGGCTGACGGCAATACGGCGCTTTGA TGATTTTTATGATGTACAGAATTTTATAAGTTTGCCTTGAAAAACTGATA TTCAGTCACAACTTAGTTACCATTAGATTTCCCCAAGTGACTGAATCAAT CTGGCTTACATTTCTAGACTAAAACATCACCAGGTAGGTCGGTAGGTGAT AGAAAAAGGGATTAAATTTACGTGATTAATAATTTTGGGTTAATTTACTG TTTCATTGTTATTCTTTTCTATAGGTACTTTGTCGACGACTGGACATTCA ACCAATTTCGTATTATCCGTTGAACTACCCACATCCAAAAACCAGCCGTA TTGGATCAAACAGGGTGTCGCACTCATGTGTGCACTTGATTTCTAATTTT TTTCCTTTCATTTTAATGTAAATTGTGTAAAATATGAATTCTTTATAATG TTTCCAAAGGGATATGAAATGCTCGGAGAAAATCTAAGGAGGTTGGGAAG GCTGGTGGTTTTTTTTGACGAAATGATATCTTAACTATGTATTATTGAAT ACTTACTTAATGTTATTTCAAAAATTAAAATTTTCATTCTTGATTCTAGA CATCTTGAATCAGGAGAAATCATTTCTTT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000092_pilon:316727..337555-

>MSTRG.12284.2.p2 ID=MSTRG.12284.2.p2|Name=MSTRG.12284.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=822bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000092_pilon:316727..337555- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ACTTACAAACAATCTGGAAGCACAGTCATTAAATGAATTACACGAAATGG
CTTCAGCAAAGAGAAACCTTCAAATGGCTGGCTTATCTAATGATATTCCT
ATATGGGCTAGAAAACCAAACAACCAAATATTTTCTACTCTATTATTTCA
AAGATCGATTCCATATCCAAACAGCCCAAGCAGTGATTTATTACAGTGTA
ACTGAGGCTATATATTCGGTGGCACAAATTATTGGTGGCGCCGTTATTGG
GCGTTACACGGACCGCACGAGAAATTTGAGGCGTGTGGTGGTGGGCGTAA
TGTTGTTGTCTTTTGGCGGGAATTTCTATGTTTTACACGGGCAGTTATGG
TTGGTAATTCTCGGGCGGTTTTTGATGGGATTCCCCGAATCGTTGCAAAC
TGCAGTCATCGACTTACAAACAATCTGGAAGCACAGTCATTAAATGAATT
ACACGAAATGGCTTCAGCAAAGAGAAACCTTCAAATGGCTGGCTTATCTA
ATGATATTCCTATATGGGCTAGAAAACCAAACAACCAAATATTTTCTACT
CTATTATTTCAAAGATCGATTCCATATCCAAACAGCCCAAGCAGTGATTT
ATTACAGTGTAACTGAGGCTATATATTCGGTGGCACAAATTATTGGTGGC
GCCGTTATTGGGCGTTACACGGACCGCACGAGAAATTTGAGGCGTGTGGT
GGTGGGCGTAATGTTGTTGTCTTTTGGCGGGAATTTCTATGTTTTACACG
GGCAGTTATGGTTGGTAATTCTCGGGCGGTTTTTGATGGGATTCCCCGAA
TCGTTGCAAACTGCAGTCATCG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12284MSTRG.12284Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12284.2.p2.exon15MSTRG.12284.2.p2.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12284.2.p2.exon14MSTRG.12284.2.p2.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12284.2.p2.exon13MSTRG.12284.2.p2.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12284.2.p2.exon12MSTRG.12284.2.p2.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12284.2.p2.exon11MSTRG.12284.2.p2.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12284.2.p2.exon10MSTRG.12284.2.p2.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12284.2.p2.exon9MSTRG.12284.2.p2.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12284.2.p2.exon8MSTRG.12284.2.p2.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12284.2.p2.exon7MSTRG.12284.2.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12284.2.p2.exon6MSTRG.12284.2.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12284.2.p2.exon5MSTRG.12284.2.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12284.2.p2.exon4MSTRG.12284.2.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12284.2.p2.exon3MSTRG.12284.2.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12284.2.p2.exon2MSTRG.12284.2.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12284.2.p2.exon1MSTRG.12284.2.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12284.2.p2MSTRG.12284.2.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000092_pilongenomesc0000092_pilon:316727..337555 -