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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000091_pilon:1282322..1295584+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12260.1.p1 ID=MSTRG.12260.1.p1|Name=MSTRG.12260.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13263bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000091_pilon:1282322..1295584+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATAGTTTTAGAAACACTAGAATTTTTCACAGAACATTATATGCAGGGGAC
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TCGATGTCAAATCTAGTCTTAGTTTTAGAAATCGGTGCATAAAATCAATA
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CAGGGACGTTatacttcattttccttgggaaatacagtgAACATACGTCA
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GCTCACAAGTCGGCTATTACAAGAATACTAACCTCAGTAACTTAAGTAGA
TTCTTTTATGGAGCCATGTTTtcgttttaaagcaaaaaataaagcaTTTT
TGAACGTTTGTTCAGCCAAATCAGGTCAGATCGTCATTTAGAGCAAAACG
TAATGAGTGTGGAATAAATTACCAGTTATAGATTTTGTCAGATTATCAGG
TTCTAGGTCCCTAGAATGTGGAGATTATCGGTACGAGgactctgattttc
aaaattccgaAGAAGTTTGCCGTGATTTTTCAGGGTATGgtaaaaatgta
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cctcaaaatcccgCCATATCCTGCGTAAGATCCCTCAAAATCGGAATCGG
GATAATTCCTGTTAGGGAAGGAGTAGAgctttttggcttttaggatgaaa
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acccccccccccctatgcGTAcgagaattttttatcaaaccgacaatgcg
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TTAGTTGCTGCCTTAGGATGCCTTATCGTCGTTGCATGTAAGTTCGAATT
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TGTTCACTCATCTACATCTCATGAATATTTCGCTAgagaataaataaaat
ttccatttggaGTATTGCATACCTTCATCAATtaaaaacaagaagcccag
agggcatgaaggcccagcgaataaaagtATGAGCTGAACAAGACTTGAGT
AGCAGAGGGGATTTGAACCTGGAGTCGCTTATACAAGCCAtagacgcctt
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tcttcctaaagagaagaaggtttgttacggtttgttacattgtttttctt
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GTTCCACGAAACTTAAAGAGAGGAAGATACGTTAATGTTGCATTTAAGTT
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GTTAAGAATCCTTTGACACTTTGACAGTCAAATTCATTACTGTTGTAGCT
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TtgtgcaaaataaacaaacttaaTAAAACCTTAGCAAGTACTGGGGGTGC
TAAAAAGATCCCTATCTTTGTGAAGGTCTTTGTCAAGCTCTAATACATTG
AAAGGTAAAACAGATGGTTGTTTCGGCCAATGACAATTAACGAAGAATAA
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TGCTTGGGCAAGCTACTGTCAAACAAACAGATACGTCAAGGATAATTGTA
AGAAAACTTGTGGTACTTGTCCTGGCGGAAACGGTGGCTCAAATGGACAA
TGTGGAATCTCAAAAGTCTCACAAAGTCGTGTTGTCAATGGTGTTGAAGC
CAAACCTGGAGCTTGGCCATGGATCGTATCTCTTCAAAGCTCAAGTGGAT
TCCATTTCTGCGGTGCCACTATTTTGACACCAAACTGGGTAAATTTTATA
GTCTTACTTTTATACCATTGTTGAAAACAAATGTTGAAACAGTGCTTGAT
ACACTGGATAGAGCTTTGATACATATATTTTCATTtgctaaaatttaaaa
tccatatATTACTGTCAGTTTCACGCCTTGTGCGATCATCAGATatataa
cctgataacagctgttcataatttttttacgtgcacggtaaacctctaaa
ggtacttgaaaattatacatctgaggaaaatagtcctcccgcggaaaatt
ttaaaacaagaatcttgctgtgcgccagaaagtcaaaaactgatacggcg
ccctattcataaacacaatcacacaattttgttgttattcccagtccttt
tagacgaacgcggcccttacgatttcgagattgcatattcgtcagattgt
atgttttcacccatccctttagagcttcagcgtggtgggcagaaaacaac
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ggacgaaaatgtaacaggctagtgaaaatacgaaattttattggttgaaa
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AAGACATTAAAAATTAGTCCGGTGGGACGACTTTTGTAATTGTTCAAGAT
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GTCGAGTACTCCCACACAGTGCTGTAATCTCGGACCGGAAGAAAAATCCT
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tatttgaatttttttcttgatagCATAACAAGACTTTCTCATTATCTTAA
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TCGAACCCTTTTTGCTGATGTTGCTTTGATTGAATTATCAACTCCATTCA
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CCACCAGCTGGAGGAAGAAGCAAATGTTTCATTGCTGGTAAGCACATCTT
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tagtgtTTATAAAAGCTCCATTCTTACACAGAAACTGTATAATCCTGGTC
TGGAAGATCATTGATTAAACCTTTTGTTAGCTTTCCTtggttaatatcaa
aagataaaaatcgatttgctaggtttttgatcacgttaccaagctctcct
cttgggattggtttaaagTTTAATCACATGATCGAAAAGTGAGCATAACA
ATCTAAtctctcaacgcaagttcaagtaagaaacaatgaaaagaaacaaa
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ATATCTTACACTATGACAGAAAATCAGGATTCAGAGCGCATTCAGTGATC
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ACACACTTGGAATTTCTATTGAAGAAAACCTATTTCATTAATATAGTCCC
AGAGAAGTTGTAAGAACTAGACGTATAGTATGACATACATggtatcgagt
tcgaacatgattccgagtagaaggttgttgtgTGTGTTTaagaaaatgta
agaaaataataccatcacaataattgtttttacaacagtaattatgataa
aaaagaattataactttctttacaattttgttaatgacgttaaagttatt
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gatatgacacagagagaaactttgataaacatgttgcaaatttagtgaaa
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TTAGGACACCTTTTAGTCTGTTTTAGTTTAACATGAAGATGCGTCCTCTC
AATCTTCGATTATTTAAAAAGTGTAATTTAATTGTTTACAATTCTTATAG
TACGTCGTTACAGGTTGAACTTAGAGAAGGCTAAATAAACTAAGATGTTT
TATTCATTTATAGTAGATTGTAATAAAATACCAGTAAACACGCAAACTAA
TAACTTATCGATTATACTCTCTTTCAAGGATGGGGAACCACAAGTCACCC
AGGAAGCTCGCCGAGTCGTCTCCAACAAGCTGAACTTCCAGTTGTCCAGT
CTCCACACAGAGGTTGTCATAACAACAGAGAAGTTGTTTGCGTGGGTAAA
GGATTTACTAGTCGACCCGATGGCTCTCAACAACCTAATGCATGCCGTGG
TGATTCTGGTGGCCCATTGATGTGCAGGAAATCTGATGGTTCATGGCAAG
TTGATGGCGTTGCTAGTTATGTTTACACTTATTGTAAATACTACACAGCT
TACGCTCCAGTCAACAAATACTTGCCTTGGATCAAACAATACGTTCGTGA
TTTGtaaattgtcaaaaataaagAGATGTATCATATCAGTCTTtaagtaa
aatatattttaaagatGTCTCAACTAATGAATATATAAGACCTTGTTATT
GGTTATTCTGGTT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000091_pilon:1282322..1295584+ >MSTRG.12260.1.p1 ID=MSTRG.12260.1.p1|Name=MSTRG.12260.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3324bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000091_pilon:1282322..1295584+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTTTTATTAAAGGTGTTCCTCGTTATTTTTATATcTGGCATCATATC
AGGAGATACTGGAATTAATGGAAAATGTGGAATCACCAAAGTTTCTCAAA
GTCGTGTTGTCAATGGTGTTGAAGCAAAAGAAGGAGCTTGGCCATGGATT
GCTTCTATTCAAACTGCACGAGGTTTTCATACCTGTGGTGGTACCATCTT
GAATCCAAACTGGGTGCTGACAGCCAGTCACTGTGTAGCTGCAAATCGTA
ATAGTCCCGGGTATTTTAGATTGGTAGCAGGCGTGCACAACAAAACGAAT
CATAACGAAACCACACAGCAAAAAGTTCTAGTTAAAAGAATTATCGTTCA
TCCAGACTACAGCTCACGTATTCTTAGAAACGATATTGCTTTGATTGAAT
TATCATCTCCATTCAGATTGAATGACCGTGTTGTCAAAGCTTGTATGCCA
CAACATGGAGTTTATCCACCAGCTGGAAGTGGAAGCAAATGTTTCATTGC
TGGATGGGGAACCACAAGTCACCCAGGAAGCTCGCCGAGTCGTCTCCAAC
AAGCTGAACTTCCAGTTGTCCAGTCTCCACACAGAGGTTGTCATAACAAC
AGAGAAGTTGTTTGCGTGGGTAAAGGATTTACTAGTCGACCCGATGGCTC
TCAACAACCTAATGCATGCCGTGGTGATTCTGGTGGCCCATTGATGTGCA
GGAAATCTGATGGTTCATGGCAAGTTGATGGCGTTGCTAGTTATGTTTAC
ACTTATTGTAAATACTACACAGCTTACGCTCCAGTCAACAAATACTTGCC
TTGGATCAAACAATACGTTCGTGATTTGtaaATGTTTTTATTAAAGGTGT
TCCTCGTTATTTTTATATcTGGCATCATATCAGGAGATACTGGAATTAAT
GGAAAATGTGGAATCACCAAAGTTTCTCAAAGTCGTGTTGTCAATGGTGT
TGAAGCAAAAGAAGGAGCTTGGCCATGGATTGCTTCTATTCAAACTGCAC
GAGGTTTTCATACCTGTGGTGGTACCATCTTGAATCCAAACTGGGTGCTG
ACAGCCAGTCACTGTGTAGCTGCAAATCGTAATAGTCCCGGGTATTTTAG
ATTGGTAGCAGGCGTGCACAACAAAACGAATCATAACGAAACCACACAGC
AAAAAGTTCTAGTTAAAAGAATTATCGTTCATCCAGACTACAGCTCACGT
ATTCTTAGAAACGATATTGCTTTGATTGAATTATCATCTCCATTCAGATT
GAATGACCGTGTTGTCAAAGCTTGTATGCCACAACATGGAGTTTATCCAC
CAGCTGGAAGTGGAAGCAAATGTTTCATTGCTGGATGGGGAACCACAAGT
CACCCAGGAAGCTCGCCGAGTCGTCTCCAACAAGCTGAACTTCCAGTTGT
CCAGTCTCCACACAGAGGTTGTCATAACAACAGAGAAGTTGTTTGCGTGG
GTAAAGGATTTACTAGTCGACCCGATGGCTCTCAACAACCTAATGCATGC
CGTGGTGATTCTGGTGGCCCATTGATGTGCAGGAAATCTGATGGTTCATG
GCAAGTTGATGGCGTTGCTAGTTATGTTTACACTTATTGTAAATACTACA
CAGCTTACGCTCCAGTCAACAAATACTTGCCTTGGATCAAACAATACGTT
CGTGATTTGtaaATGTTTTTATTAAAGGTGTTCCTCGTTATTTTTATATc
TGGCATCATATCAGGAGATACTGGAATTAATGGAAAATGTGGAATCACCA
AAGTTTCTCAAAGTCGTGTTGTCAATGGTGTTGAAGCAAAAGAAGGAGCT
TGGCCATGGATTGCTTCTATTCAAACTGCACGAGGTTTTCATACCTGTGG
TGGTACCATCTTGAATCCAAACTGGGTGCTGACAGCCAGTCACTGTGTAG
CTGCAAATCGTAATAGTCCCGGGTATTTTAGATTGGTAGCAGGCGTGCAC
AACAAAACGAATCATAACGAAACCACACAGCAAAAAGTTCTAGTTAAAAG
AATTATCGTTCATCCAGACTACAGCTCACGTATTCTTAGAAACGATATTG
CTTTGATTGAATTATCATCTCCATTCAGATTGAATGACCGTGTTGTCAAA
GCTTGTATGCCACAACATGGAGTTTATCCACCAGCTGGAAGTGGAAGCAA
ATGTTTCATTGCTGGATGGGGAACCACAAGTCACCCAGGAAGCTCGCCGA
GTCGTCTCCAACAAGCTGAACTTCCAGTTGTCCAGTCTCCACACAGAGGT
TGTCATAACAACAGAGAAGTTGTTTGCGTGGGTAAAGGATTTACTAGTCG
ACCCGATGGCTCTCAACAACCTAATGCATGCCGTGGTGATTCTGGTGGCC
CATTGATGTGCAGGAAATCTGATGGTTCATGGCAAGTTGATGGCGTTGCT
AGTTATGTTTACACTTATTGTAAATACTACACAGCTTACGCTCCAGTCAA
CAAATACTTGCCTTGGATCAAACAATACGTTCGTGATTTGtaaATGTTTT
TATTAAAGGTGTTCCTCGTTATTTTTATATcTGGCATCATATCAGGAGAT
ACTGGAATTAATGGAAAATGTGGAATCACCAAAGTTTCTCAAAGTCGTGT
TGTCAATGGTGTTGAAGCAAAAGAAGGAGCTTGGCCATGGATTGCTTCTA
TTCAAACTGCACGAGGTTTTCATACCTGTGGTGGTACCATCTTGAATCCA
AACTGGGTGCTGACAGCCAGTCACTGTGTAGCTGCAAATCGTAATAGTCC
CGGGTATTTTAGATTGGTAGCAGGCGTGCACAACAAAACGAATCATAACG
AAACCACACAGCAAAAAGTTCTAGTTAAAAGAATTATCGTTCATCCAGAC
TACAGCTCACGTATTCTTAGAAACGATATTGCTTTGATTGAATTATCATC
TCCATTCAGATTGAATGACCGTGTTGTCAAAGCTTGTATGCCACAACATG
GAGTTTATCCACCAGCTGGAAGTGGAAGCAAATGTTTCATTGCTGGATGG
GGAACCACAAGTCACCCAGGAAGCTCGCCGAGTCGTCTCCAACAAGCTGA
ACTTCCAGTTGTCCAGTCTCCACACAGAGGTTGTCATAACAACAGAGAAG
TTGTTTGCGTGGGTAAAGGATTTACTAGTCGACCCGATGGCTCTCAACAA
CCTAATGCATGCCGTGGTGATTCTGGTGGCCCATTGATGTGCAGGAAATC
TGATGGTTCATGGCAAGTTGATGGCGTTGCTAGTTATGTTTACACTTATT
GTAAATACTACACAGCTTACGCTCCAGTCAACAAATACTTGCCTTGGATC
AAACAATACGTTCGTGATTTGtaa
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000091_pilon | genome | sc0000091_pilon:1282322..1295584 + |
|
