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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000091_pilon:1153823..1159956- Legend: polypeptideCDSexonthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12248.1.p1 ID=MSTRG.12248.1.p1|Name=MSTRG.12248.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6134bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000091_pilon:1153823..1159956- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) GTCCAAACGAGACCGATTCGCATTTTTAGGATGTATCTGGTCCAGTTTAT
TGTTTTGTTATGGTCACATTTAAGCACCTCTAGCGTACAGTAAGTATTCT
TTTTTGTCATTTGTCCTTTATTTTGAAGTTTTAAGTGTATAGACATCGGA
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AATCATTTCTGTGAAAGAATTAAAAAAAGACTTTAGTTACGGTATGATAC
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AAAAAAGTAATAAAACTGAAAGCCCGGGGGGCACCAGGTAAGTGACCTAC
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CTGATTTTTGGCCGAACGTGCGGTCGTTTTCAAAATCGAGTGCCCCCCCC
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GCTTGAAATGATTATCCGCTCAAGATTTTGAAGCTCAATAGAAATTCTTC
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CCCTCTTCCCTTGTCCTTAAACTCACCACTATGAGCTTTGAGATTGAGTA
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AAAAATTTATTCTAGGAAAACCATTTTGTCGTTTTTAAGGTGTAACACAC
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TACATTTTTAAAACTGTCAATAACTTCATTTTTACTGTTAACTTCATTTT
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ACCTCTGAAATTTCATAAGTTTAAAAAAATCTTCCCCTGAGTTTTCGGTC
ATTTTTTTTGGAGGCTTTTTGAAGAATGTTCTCTTGGTCTCTTGGAATAT
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TTTAAACAGTGGTTTAAAAGGAGGGGAATTCAAACCCAGACTCCCTACTG
TGTTTACAGTTCGTAAAACAATATATTGAATATAGAATGGGTTTTGATTT
TTATCTTAGATGGAAAACCTCTTGATGTTACCATGAAGTTGAAATTCTTT
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ATAATTCAATAATTTAACCACAACTGTCTTTTTAAATGAATACTTATTCC
CTGCCGTTGCAAAACTAAATAACGAACATCAATTCTTTAATTTTTATCCT
TTCGACCCTATTATGACTCTCTTTTTGTAGAAAATTCTAGATTCTAAAAT
AAAAATCCCTTGTCCTATTGGGCTATTTTAGAAATAGTCTGTACCCCCTA
TCTTGAGGACGTGTGAAGTCCAGGGTGGTCTGCAAAATAAAAAATCCAGG
GGGGTCTGTTTTTTTCGAGTGTAAAAATCCAGGGTGGTTAGTAAAAAGAA
ATAAAAAATCCAGGGTAGCATAGCAGAGAATTGCGCTTACGTTTTGGGGC
ACGCCATGGTCATTATTAATCATTATTAAACGAGGTCAAAGTCTAGGGTG
GTTTTAAAAAAATCAGAAAAAAAATCGAAGGAGGTCCTGAAAATTTTAAA
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GGGTACAATTTTTTTCTGTAATAGCCCATTCTAAACGGCATGAATATATC
TGGCAAGGATGTCCAAAGATGTACAAAAACAAAAAAAATTCAATACTTTA
TTACAGCACTATCGCATCGAACTTGAGCTATTGCTGACTTGGGAAGACAC
ATTATTCCAATTCAACTTAACAAGCACGAACAGTTCATTGACATTAGGGA
AATTTCTCAACGATCTCATTTGGTTACCTGATGTATATGTTATGGATGAG
AAGTCAGGAAAAGAGGGTTATAAGCCGGTACAAAAAGCTATCGTTTCAAA
CGAAGGAAAAGTGATATTCGTTCGCAGGTAAGATTCCTTCGACCAAATAC
AACTCCAACCTCTAAAAACAAAGAGATACTTCAAATTGCACTAATAAGAC
GTTTTATATTTTCGAAAACAATGGAATTTATTGAAAAAAATTCCAGGTTA
ATCACCTTCAAGACTATAAGTGTATGCTAAATTTCAGATAATTTTATACA
ACAAAGTATACAATTTTCTACACTACTGGACTACCTCAAAGACCAAAAGA
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CTAAGCTTCTTGTAGAAGGATAAAAAAGCAGACCTTAATTCAAAACAAAT
TCTTACCTTACACACTCCTTAGGTTGAGTTTGGAGATGTTTTGTCCTATG
GATTATTGGTCATTTCCATTCGATAAACAAACATGTGAAATCACATTTCA
ACCTTGTAAGTGCCCATCTTTGCCCATCTTTTCTCGGGCCGGGTTCTCAG
GATGAAATAAAAATGAAATCAATAAAAAGAAAACTTTAAAGTTCCAATTA
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ATTGCTTTAAGACCCATCTTGGTGCGAGTACAATACCTTTAACGCCCATG
GAATAAAAAACATGTCTGGCAAATACTAGGGTTGAAGAATTTCGAGAATG
TGCAAACTCCGAAAACCGACCCTAGAGACTAAATATTAACGATTAAGCTA
CTCTCAGAGAAACAAAATCGGCGAAGAAGTGACCTTTAAAATTTTCGAAA
ATTTACTAGAGCCTTAAAGAGATTTTTTTTGACTTTTAATGGCTTAAAAA
CGTTTAACTTTTGGTTGTTTTGAGACCCGTAGAGAAGCTAGGAAGGTCAA
AAATCTACACTTACCACCGCACCTACCCAATACCTATTACCACCCTCCCT
TCCGAAGTTCTTTCCATATGGCAGCAAATCAAGAGTGCAAACGTTTCATG
AACAGACATTACTTATAATTTATCTTTTTATATCCAGATGCACATCCTAT
AACTGACATGAGGTTACACTGGCCAATAGGAAAACATCGTGAAGAAGTGG
TTGATTTTTCAAAGTTTACAACTTCAGAATATATTCTTATGGATTATCAT
ATTGGCCAGAGACAGATGCCAATTGGCTTATCAGGTAGGTTGACAATACC
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GTTGTTGTCATAACTTAAAGTGAAACTGAATCTATCAATGACAATAACTT
CATTTTTATTCTTTTTATAAGAACAATTTATAAGAACAAGTTTTTGAACC
TGGAACGGCTAGATTTTAATCAAATCAATTACCACCATTTTACACTTGAT
CAAAATAACAGGAATTTTAAAGTGAAAAGAGAAAAGGCATGCCTTGGAAA
AATATTTCTTTGACATTAAAACGAAATAATGCTATAAAAGAAATTCTTCT
TACTACATCTTCCTTTATTCGTTTTTTCAGGCATTTTTGACGTCATGGTA
GTGACACTAAACATCAAGCGAAATGCAAATTATTACATGTTACAACACAT
CCTACCATTAAACTTAAACATTATTCTCAGTATGACCACGTTTTGGATCG
ATCACAAGTGCGTTAAAGCAAGGATCACTATCCCACTAGTAGTCGTGCTC
ACACTTACTAAACAAACTGCTGCATTGAAAGCTACATTTCCATTCCAACG
TACACCCGTTTCAATGGAATATTACTTAAACTTTTCAATTTGCTTCGTCT
TTATGGTGCTATTGGAATATTGTTTAATTGGATTGTACAAAGTAAAGAAA
ATTAAGGTGAGGAGATTTAGCTTGTAATTTTTGCTAGTGAAGTTTCTTTG
CTTCGTTATTGACACCCCTGGCGTGTCGCAGTCAAAGTTACGAAGACTTA
TATTGAAATATCCTGAATATTTCTCCTTATTTGTCCAACCAAGTCGCACA
GTACTAAGCTGTGTGTGCAGAATGAATACAGCAGCTTTCGTAAAAAATCG
AAGGGCACTATATTAACATTTAGGATGTAGGGTAACTTTTCGATATATCT
TCAAGTCAAATATACTAAACAACTTTTTCAATTTTTTTTAGAAATCGGAA
GCAAAAGATAAAGAGCGCACAACCACTGTGATTGGTCCAAATCAAATAGA
CCCACATCCAGATTTACGTTGGAGAAAACATTCCTCAATATCGGTGTATT
TGGTCAATGACCCAGATGACGAGGAAATCGAAAAAATAGTTCATCCTTTG
GATAAGAAATCACGTTACATTTACCCTATAACTTTCATCTTTTACAATGC
CTTATATTTCTCATTATTGATAACTAACCAAGGGTTGGCTGCATTTTAAT
GGACAATTTTGATTGACTAATATCGAAAGTGAAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000091_pilon:1153823..1159956- >MSTRG.12248.1.p1 ID=MSTRG.12248.1.p1|Name=MSTRG.12248.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=10224bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000091_pilon:1153823..1159956- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) AAATCGGAAGCAAAAGATAAAGAGCGCACAACCACTGTGATTGGTCCAAA TCAAATAGACCCACATCCAGATTTACGTTGGAGAAAACATTCCTCAATAT CGGTGTATTTGGTCAATGACCCAGATGACGAGGAAATCGAAAAAATAGTT CATCCTTTGGATAAGAAATCACGTTACATTTACCCTATAACTTTCATCTT TTACAATGCCTTATATTTCTCATTATTGATAACTAACCAAGGGTTGGCTG CATTTTAAGCATTTTTGACGTCATGGTAGTGACACTAAACATCAAGCGAA ATGCAAATTATTACATGTTACAACACATCCTACCATTAAACTTAAACATT ATTCTCAGTATGACCACGTTTTGGATCGATCACAAGTGCGTTAAAGCAAG GATCACTATCCCACTAGTAGTCGTGCTCACACTTACTAAACAAACTGCTG CATTGAAAGCTACATTTCCATTCCAACGTACACCCGTTTCAATGGAATAT TACTTAAACTTTTCAATTTGCTTCGTCTTTATGGTGCTATTGGAATATTG TTTAATTGGATTGTACAAAGTAAAGAAAATTAAGATGCACATCCTATAAC TGACATGAGGTTACACTGGCCAATAGGAAAACATCGTGAAGAAGTGGTTG ATTTTTCAAAGTTTACAACTTCAGAATATATTCTTATGGATTATCATATT GGCCAGAGACAGATGCCAATTGGCTTATCAGGTTGAGTTTGGAGATGTTT TGTCCTATGGATTATTGGTCATTTCCATTCGATAAACAAACATGTGAAAT CACATTTCAACCTTCACTATCGCATCGAACTTGAGCTATTGCTGACTTGG GAAGACACATTATTCCAATTCAACTTAACAAGCACGAACAGTTCATTGAC ATTAGGGAAATTTCTCAACGATCTCATTTGGTTACCTGATGTATATGTTA TGGATGAGAAGTCAGGAAAAGAGGGTTATAAGCCGGTACAAAAAGCTATC GTTTCAAACGAAGGAAAAGTGATATTCGTTCGCAGATGGAAAACCTCTTG ATGTTACCATGAAGTTGAAATTCTTTAACATGTTACCACTCTCCCCACGG CTCTATTTTGACAACAGATGAAACATCTGAAGTTTTAGAGCATGTCAAAA GAAATCAACTCAGTCATTTTGTGCGACCTAAACAGAAAGGTCCAAACGAG ACCGATTCGCATTTTTAGGATGTATCTGGTCCAGTTTATTGTTTTGTTAT GGTCACATTTAAGCACCTCTAGCGTACAAAATCGGAAGCAAAAGATAAAG AGCGCACAACCACTGTGATTGGTCCAAATCAAATAGACCCACATCCAGAT TTACGTTGGAGAAAACATTCCTCAATATCGGTGTATTTGGTCAATGACCC AGATGACGAGGAAATCGAAAAAATAGTTCATCCTTTGGATAAGAAATCAC GTTACATTTACCCTATAACTTTCATCTTTTACAATGCCTTATATTTCTCA TTATTGATAACTAACCAAGGGTTGGCTGCATTTTAAGCATTTTTGACGTC ATGGTAGTGACACTAAACATCAAGCGAAATGCAAATTATTACATGTTACA ACACATCCTACCATTAAACTTAAACATTATTCTCAGTATGACCACGTTTT GGATCGATCACAAGTGCGTTAAAGCAAGGATCACTATCCCACTAGTAGTC GTGCTCACACTTACTAAACAAACTGCTGCATTGAAAGCTACATTTCCATT CCAACGTACACCCGTTTCAATGGAATATTACTTAAACTTTTCAATTTGCT TCGTCTTTATGGTGCTATTGGAATATTGTTTAATTGGATTGTACAAAGTA AAGAAAATTAAGATGCACATCCTATAACTGACATGAGGTTACACTGGCCA ATAGGAAAACATCGTGAAGAAGTGGTTGATTTTTCAAAGTTTACAACTTC AGAATATATTCTTATGGATTATCATATTGGCCAGAGACAGATGCCAATTG GCTTATCAGGTTGAGTTTGGAGATGTTTTGTCCTATGGATTATTGGTCAT TTCCATTCGATAAACAAACATGTGAAATCACATTTCAACCTTCACTATCG CATCGAACTTGAGCTATTGCTGACTTGGGAAGACACATTATTCCAATTCA ACTTAACAAGCACGAACAGTTCATTGACATTAGGGAAATTTCTCAACGAT CTCATTTGGTTACCTGATGTATATGTTATGGATGAGAAGTCAGGAAAAGA GGGTTATAAGCCGGTACAAAAAGCTATCGTTTCAAACGAAGGAAAAGTGA TATTCGTTCGCAGATGGAAAACCTCTTGATGTTACCATGAAGTTGAAATT CTTTAACATGTTACCACTCTCCCCACGGCTCTATTTTGACAACAGATGAA ACATCTGAAGTTTTAGAGCATGTCAAAAGAAATCAACTCAGTCATTTTGT GCGACCTAAACAGAAAGGTCCAAACGAGACCGATTCGCATTTTTAGGATG TATCTGGTCCAGTTTATTGTTTTGTTATGGTCACATTTAAGCACCTCTAG CGTACAAAATCGGAAGCAAAAGATAAAGAGCGCACAACCACTGTGATTGG TCCAAATCAAATAGACCCACATCCAGATTTACGTTGGAGAAAACATTCCT CAATATCGGTGTATTTGGTCAATGACCCAGATGACGAGGAAATCGAAAAA ATAGTTCATCCTTTGGATAAGAAATCACGTTACATTTACCCTATAACTTT CATCTTTTACAATGCCTTATATTTCTCATTATTGATAACTAACCAAGGGT TGGCTGCATTTTAAGCATTTTTGACGTCATGGTAGTGACACTAAACATCA AGCGAAATGCAAATTATTACATGTTACAACACATCCTACCATTAAACTTA AACATTATTCTCAGTATGACCACGTTTTGGATCGATCACAAGTGCGTTAA AGCAAGGATCACTATCCCACTAGTAGTCGTGCTCACACTTACTAAACAAA CTGCTGCATTGAAAGCTACATTTCCATTCCAACGTACACCCGTTTCAATG GAATATTACTTAAACTTTTCAATTTGCTTCGTCTTTATGGTGCTATTGGA ATATTGTTTAATTGGATTGTACAAAGTAAAGAAAATTAAGATGCACATCC TATAACTGACATGAGGTTACACTGGCCAATAGGAAAACATCGTGAAGAAG TGGTTGATTTTTCAAAGTTTACAACTTCAGAATATATTCTTATGGATTAT CATATTGGCCAGAGACAGATGCCAATTGGCTTATCAGGTTGAGTTTGGAG ATGTTTTGTCCTATGGATTATTGGTCATTTCCATTCGATAAACAAACATG TGAAATCACATTTCAACCTTCACTATCGCATCGAACTTGAGCTATTGCTG ACTTGGGAAGACACATTATTCCAATTCAACTTAACAAGCACGAACAGTTC ATTGACATTAGGGAAATTTCTCAACGATCTCATTTGGTTACCTGATGTAT ATGTTATGGATGAGAAGTCAGGAAAAGAGGGTTATAAGCCGGTACAAAAA GCTATCGTTTCAAACGAAGGAAAAGTGATATTCGTTCGCAGATGGAAAAC CTCTTGATGTTACCATGAAGTTGAAATTCTTTAACATGTTACCACTCTCC CCACGGCTCTATTTTGACAACAGATGAAACATCTGAAGTTTTAGAGCATG TCAAAAGAAATCAACTCAGTCATTTTGTGCGACCTAAACAGAAAGGTCCA AACGAGACCGATTCGCATTTTTAGGATGTATCTGGTCCAGTTTATTGTTT TGTTATGGTCACATTTAAGCACCTCTAGCGTACAAAATCGGAAGCAAAAG ATAAAGAGCGCACAACCACTGTGATTGGTCCAAATCAAATAGACCCACAT CCAGATTTACGTTGGAGAAAACATTCCTCAATATCGGTGTATTTGGTCAA TGACCCAGATGACGAGGAAATCGAAAAAATAGTTCATCCTTTGGATAAGA AATCACGTTACATTTACCCTATAACTTTCATCTTTTACAATGCCTTATAT TTCTCATTATTGATAACTAACCAAGGGTTGGCTGCATTTTAAGCATTTTT GACGTCATGGTAGTGACACTAAACATCAAGCGAAATGCAAATTATTACAT GTTACAACACATCCTACCATTAAACTTAAACATTATTCTCAGTATGACCA CGTTTTGGATCGATCACAAGTGCGTTAAAGCAAGGATCACTATCCCACTA GTAGTCGTGCTCACACTTACTAAACAAACTGCTGCATTGAAAGCTACATT TCCATTCCAACGTACACCCGTTTCAATGGAATATTACTTAAACTTTTCAA TTTGCTTCGTCTTTATGGTGCTATTGGAATATTGTTTAATTGGATTGTAC AAAGTAAAGAAAATTAAGATGCACATCCTATAACTGACATGAGGTTACAC TGGCCAATAGGAAAACATCGTGAAGAAGTGGTTGATTTTTCAAAGTTTAC AACTTCAGAATATATTCTTATGGATTATCATATTGGCCAGAGACAGATGC CAATTGGCTTATCAGGTTGAGTTTGGAGATGTTTTGTCCTATGGATTATT GGTCATTTCCATTCGATAAACAAACATGTGAAATCACATTTCAACCTTCA CTATCGCATCGAACTTGAGCTATTGCTGACTTGGGAAGACACATTATTCC AATTCAACTTAACAAGCACGAACAGTTCATTGACATTAGGGAAATTTCTC AACGATCTCATTTGGTTACCTGATGTATATGTTATGGATGAGAAGTCAGG AAAAGAGGGTTATAAGCCGGTACAAAAAGCTATCGTTTCAAACGAAGGAA AAGTGATATTCGTTCGCAGATGGAAAACCTCTTGATGTTACCATGAAGTT GAAATTCTTTAACATGTTACCACTCTCCCCACGGCTCTATTTTGACAACA GATGAAACATCTGAAGTTTTAGAGCATGTCAAAAGAAATCAACTCAGTCA TTTTGTGCGACCTAAACAGAAAGGTCCAAACGAGACCGATTCGCATTTTT AGGATGTATCTGGTCCAGTTTATTGTTTTGTTATGGTCACATTTAAGCAC CTCTAGCGTACAAAATCGGAAGCAAAAGATAAAGAGCGCACAACCACTGT GATTGGTCCAAATCAAATAGACCCACATCCAGATTTACGTTGGAGAAAAC ATTCCTCAATATCGGTGTATTTGGTCAATGACCCAGATGACGAGGAAATC GAAAAAATAGTTCATCCTTTGGATAAGAAATCACGTTACATTTACCCTAT AACTTTCATCTTTTACAATGCCTTATATTTCTCATTATTGATAACTAACC AAGGGTTGGCTGCATTTTAAGCATTTTTGACGTCATGGTAGTGACACTAA ACATCAAGCGAAATGCAAATTATTACATGTTACAACACATCCTACCATTA AACTTAAACATTATTCTCAGTATGACCACGTTTTGGATCGATCACAAGTG CGTTAAAGCAAGGATCACTATCCCACTAGTAGTCGTGCTCACACTTACTA AACAAACTGCTGCATTGAAAGCTACATTTCCATTCCAACGTACACCCGTT TCAATGGAATATTACTTAAACTTTTCAATTTGCTTCGTCTTTATGGTGCT ATTGGAATATTGTTTAATTGGATTGTACAAAGTAAAGAAAATTAAGATGC ACATCCTATAACTGACATGAGGTTACACTGGCCAATAGGAAAACATCGTG AAGAAGTGGTTGATTTTTCAAAGTTTACAACTTCAGAATATATTCTTATG GATTATCATATTGGCCAGAGACAGATGCCAATTGGCTTATCAGGTTGAGT TTGGAGATGTTTTGTCCTATGGATTATTGGTCATTTCCATTCGATAAACA AACATGTGAAATCACATTTCAACCTTCACTATCGCATCGAACTTGAGCTA TTGCTGACTTGGGAAGACACATTATTCCAATTCAACTTAACAAGCACGAA CAGTTCATTGACATTAGGGAAATTTCTCAACGATCTCATTTGGTTACCTG ATGTATATGTTATGGATGAGAAGTCAGGAAAAGAGGGTTATAAGCCGGTA CAAAAAGCTATCGTTTCAAACGAAGGAAAAGTGATATTCGTTCGCAGATG GAAAACCTCTTGATGTTACCATGAAGTTGAAATTCTTTAACATGTTACCA CTCTCCCCACGGCTCTATTTTGACAACAGATGAAACATCTGAAGTTTTAG AGCATGTCAAAAGAAATCAACTCAGTCATTTTGTGCGACCTAAACAGAAA 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AATGCCTTATATTTCTCATTATTGATAACTAACCAAGGGTTGGCTGCATT TTAAGCATTTTTGACGTCATGGTAGTGACACTAAACATCAAGCGAAATGC AAATTATTACATGTTACAACACATCCTACCATTAAACTTAAACATTATTC TCAGTATGACCACGTTTTGGATCGATCACAAGTGCGTTAAAGCAAGGATC ACTATCCCACTAGTAGTCGTGCTCACACTTACTAAACAAACTGCTGCATT GAAAGCTACATTTCCATTCCAACGTACACCCGTTTCAATGGAATATTACT TAAACTTTTCAATTTGCTTCGTCTTTATGGTGCTATTGGAATATTGTTTA ATTGGATTGTACAAAGTAAAGAAAATTAAGATGCACATCCTATAACTGAC ATGAGGTTACACTGGCCAATAGGAAAACATCGTGAAGAAGTGGTTGATTT TTCAAAGTTTACAACTTCAGAATATATTCTTATGGATTATCATATTGGCC AGAGACAGATGCCAATTGGCTTATCAGGTTGAGTTTGGAGATGTTTTGTC CTATGGATTATTGGTCATTTCCATTCGATAAACAAACATGTGAAATCACA TTTCAACCTTCACTATCGCATCGAACTTGAGCTATTGCTGACTTGGGAAG ACACATTATTCCAATTCAACTTAACAAGCACGAACAGTTCATTGACATTA GGGAAATTTCTCAACGATCTCATTTGGTTACCTGATGTATATGTTATGGA TGAGAAGTCAGGAAAAGAGGGTTATAAGCCGGTACAAAAAGCTATCGTTT CAAACGAAGGAAAAGTGATATTCGTTCGCAGATGGAAAACCTCTTGATGT TACCATGAAGTTGAAATTCTTTAACATGTTACCACTCTCCCCACGGCTCT ATTTTGACAACAGATGAAACATCTGAAGTTTTAGAGCATGTCAAAAGAAA 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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000091_pilon | genome | sc0000091_pilon:1153823..1159956 - |
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