MSTRG.12247.3.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12247.3.p1
Unique NameMSTRG.12247.3.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000091_pilon:1129975..1147423+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12247.3.p1 ID=MSTRG.12247.3.p1|Name=MSTRG.12247.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=17449bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000091_pilon:1129975..1147423+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AATTTAGATAATTCACTCTCCtagtttaaagaaacaaaagcattttaaaa gGTAAAAGTGTGACATAATACCGTAAAGTCCGGGtaatttgcatcagtgg agggaaacttgcatagccatcaaatgactgaccaatcaaagcagcaaaat ttcaaaacaaatgaactatacgcagctccgctcgcagctctactctacca tttttgttttgatttaactttgtattttaatgaccagacgggtcattcat ttgagggctatgcatgtttgcctccactgatgcatgttacccgatctcac ggtaacTCGCTCACTGTTGACTGTATGGCCAGAACTTTCTTGGGCCACTC TTGTGACTTGGCAATTTAGCTGgcaatattttgaacttgaaaaaagtcTC AGGTGTGACTCGAACTGGCTGGCACGCATGTGTCTAATTTGGAAATGCGT GTGTCAATGTTTGATCGGAGAAATAAGTTTTACCAATGTCTAGACTATAT CTAAAGAATTAGTAAACCGTTTTAAGATCTGTAAAAAGCTCTCTACTCCC AAATAGTTCTAGAATAAACCCTGAAAATCCCaagatgattgataaaatat taaatctttaaagaaagattgaaaatgaaaattcatgaagaaaaaacaaa ccttaagcaaagaaattgcctttatagctcatttttctatgaaaaataga aaaacttttggaTATTTGAGTTCCTTAAACATTGTAGAAAatcttttagt acacatggcaaaagaaaaagaaataattaaaaccttaaaatcaactgAAT TCTTTTAATAATCATAAGATAACCATaaaaaaaaCGCtctttcgccattt tgttttttaaaaatgtgaaGTCGGAACTTCTTGTGACGtaacaaataaat tttcaacatccAATGAAAATGTGCGATTTGTATCATGCGGTAGAAAAAAG TCATGTGACAGCAATTTCCGTAGAATGGCCGCTCCGTTATATTTATAGGA TAAGAATACGAAGATCAGGGGGttatattattagctggggcttcgtgagg ctattattattgttattattatcattaatttattTGTCAACACAGGTCAG GTTCTTtatacaaaactatatatacaagctatatacaattctatatatat TGGCAGTaaaaactgatgtggacctgcaggctaagaaacaaaaaagtaaa accgCTGCAAAGGCGAAATGTGTTTTATGCAAAATAAGACTAAGGCTAGG TTAATTAAAGTGTGTCTGAGAAATTAATGAAGAGGATTTAGAATATGTAA ATCttatgtgttccaaatgaataatttaaaatatgtatatgttatgtttt tataaatatataaaatataaaaataataaatatgttttcggttatgatat atgatataactttagtaataaatgAAGTCTTCGTGAAGAAGAGCTCTTCC TGTCAttttaaaattaactttttcaagGCAGTCTGATTTTTTCAGATCCT TCTTGAAGGATTTGAAATTGTCCATATTTTTAATTCTGTCTGGAATATTG TTCCATACAATAGCATTTCTGTAGCGAAATGAACGTTTGAAAGCAACATA TTTGAATGGAGACATATCGATTTTCAGTGTATTGCGAGACTTTCTTGATT TCGTTTTAACAATCAGGTCAGAGAGTAATGGAGAACCAAGGTTGTTATGT ATCTTGTAAACTTTACATGCAATACTTCGCTTGTAATAATAGATAATGGG TTTCCATTTGACACTGGCTAGGACAGCATTATCACGAACAGACTTTTTGA CTCGATTTATGAACTGTGCAGCCTTTATGTGGACATTCTCGACATACGAC ATAAGATTCTCAGAACAATTTCCCCAAATGAGTATACCGTAGATAACAGA GGGTAATATGCCTTGAAAATATATTGTTGATAAGGTAGGGTATGGCATGT TTCTCATTTGATAAAGTTTGTTCAGTTTAATACTAAAAGATTTGGTAATT TTTCGAACATGCTCCTCCCATTCCAACTTGTCATCAATAGTAACTTCAAT ACAAATCACTCATATTGTTTACgttgatggaaaaacttgctGGTCCAATT AGAGATCCTTGCGGAACACCATATTCGACTCTTTCAAGGTTGGATTCGAT TCCATTTAGTGATGTGAATTGCTTTCTGTTACTAAGGTAGCTCGTTAGGT ATGAGAGAAAATCTCCAGATATTCCAGAAGCACTCATTTTCTTTAATAGG ATTGGGTGTGACACGCTATCGAACGCCTTGCGAAAGTCGATAAACAGGAC TGCGACTACCTCATTTTTGTCGATAGATTTCCTCCACTTTTTTGTCATAT AAAGAAGTATATCTTCTGTGGCAGTCTGTGGAGCGTTGGGGGCGAAATCC CCATTGATGTTCTGTCTGCAGGTTTTGTTTTTGCAGGTGTGAGTTTAGCT GTGAGCAGACCAGGTGTTCAACAACTTTGCTAGGGATTGACAATAGCGAT ATTGGTCTATAGTTTGAGCAGTCTGATTTGACACCTTTTTTGTATACTGG TGTTACTTTAGATGTTTTCCACTTTGCTGGGAAAGTACCTGTGTTTAAGC TTTGCTTGATGACGTAATGCAAACTATTGATTAGCTAAGCTTTTAgggca atgtttttggtttttctgaagcaTACAGAAGATAGAGGAAGACCTACTGA AAAGGGGAAATTAGGGGaacaattctatcaaaagttattggcaaAGAAAG TCACCTTTTGAGGTCGAAATTATAGTTTTtcttgcataactttttattgc agTACCCCCGTCCTATCCTGGTTTGACAACGGGTAGTCGAGTACATAACA AACATACGGGAATGTTTACACATGGACAGGATAAGTTTCCACGAAGCCCC AGCAAGAACAAAAGTTGGATTTagctgaaaatggctgaaattgaatcttt gatatattttttttggtaaaagctatggtaATTCTGTTTGGCTATATAAG AAGCTTATTTATTCCTTGTCAGgatactttttatttgaaattggtTGCTT TACCAGACAAAAAGATATTAAGTGTATTAAGTGGAAGCCATATAAAGATG AGAAAATCTGAATTTGGAAAACTTCTGTTCATACCAGCTAGTCATCAAAC TAAAATAATTGAGAGCAGGCTAGAAGGATACATGTAGTTGAACTAAATGG TTTTAGTATGATTGACCACTAGGTACATGACATTTAGAAgatttgtatat tataaaaagtcatttaattGTTGATTTAGTCCTCTAATCTTTAAATCTCt aaattatcattttaataTGGCTTACACAGAGTGCAGATGTCTTGAATTTG GAACTTTGGATGTCAATACCTTGGGATAGAATTACTGTTGACAACTTTGA CTTGAATTTTCCAAATGCTTTTCATGATAGCTTTGCCCTgacaaactttc attttttgtgcCGGAATCCCTTTAATATCTTTTTGggctgaaaaatatat ttcagtgatcaaagttcttccgtctcatacggatttccgtctcatagaaa aaacagaaaagttttcGGTCTCATTTAGAAATGGTTGTTTAGCAAGAAAT AGTGATTTTATTATTATCTAGAATAATTCCATCAGAAAGAAATCTTGTAT TAAAACTGTATGATaggcattttaagaacattctgaaTTGTTTTAATTAA CACATTTTAGTGCCTTTCTAGCCAACCTCTgggggggTAAAATATCTGAA GATTTTCTGGCCCTCGGCCCCAACCATTGTGGGGCCTGTGGGTGTCACTG TATACCTAAATATCTCTATCAAATAATTTTCTGTCTCACAGAGaaaaagt gctttttgaccacTGATAATTAAAACACTGTAAATTAAGGAATATTTGCT GCCAACAAACGATAAACGAATAAACGATACTGTTCTGAAACTATGGaaag aacattttcaatgtCATTTAAATACATCCTTTCCACGTGATGATTCCGCT ATCAATTCAATAAACATCGATGGACAAATTCCTACACAAATTGAGCCCAT CCTattctgtaccagagtgtatctcacgattatcgtagcatagtacactc tgtgtgcattgtctgtttgataaaaaatttcccgtacggagacctctgcg atgaagtataattttaaaataaaatggccgCCAAAATTACCACAATTGTA AACAAAGCGATGGGGTCCATGATTGAGGGTCACTTTCTAAGCAagttttg gctgttttttttaatttttttgagccaaactaaAAGCTAAACAGTAACGA AGACATAATCAaaattgtctaacagaaaattattttcccatTACCTATAT TTTCCATGTAGTCCGCCAAAGAAtaatataaactttttaaaaaaaagtta tgccaacaaaacaaactataaCCACTCTACATAGTTACATAGATCAAATG CAGTaaaaaaaaTACTGAATTGGAACATAAAAACATACAGAGATACTCTG AGTATATATTCTTTTGCAAAGAACTGAAGctaaaaccactttaaaaacaa gattccAATCAAACAACTTCTTTCTCACGTTCGTGAACTCAAAGAtctaa aatgtaaacaaaaaacattcgatttgtgcaaaaagagttatcatgcaata gaatgtcttcatttagagCTCTTTCAGtccaattattaaaaaataagaaG CCAGTTTTGTcatgaaaacactttttttcgacAAACTTTCTGACAATTCT GACGGCCATTTTCTTTTCTCGCCTCCGATTTCTTGCCAAACTCCAacagc actccatcgcagcaGTTGGTTTGAGAAATCTCAAagcagaaaagacaatg acaacagaccctctacggcaatgaattttgaaattagccgtagatatcgg gtttgtgtacagacaaagcCCATCCATACTAACGAAATCGTAAACGCCCT CaagagaatgaaaaataaaaaattaccaGGTGTTGACCAAATCACCACTA TGTATGACCGACCTGGATGTGCAATTCAAATTGATGGGAAATTAACTGAA TGGTTTGTAGTCAACGTTGGTGTCCGCCAAGGCTTTATATTGTCTCCCAC GGTCTTCAATGTATTTCTGGAATATGTTATGGATGAAGTGAAGAGCATTC CAGATGACCTAGAATTTGATGATACGCTATCAACTGATGTACTATATGCG GATGACGCTACCCTCATCGCTTTGATAtttgataaacttaaattttctaT AAATGAGCTTGATTCTGCCTGTAAAAAATGGGGCCTAAAAGTCAACGTGA CTCGTTATtcattgatgaagaagaagatgaacaCGATGCCAAATTCATCT TTCTCGGATCTGTTGTGCCTGATTTGATGATGTGTTAAGAAGAATAGCCC TAGCCTCAGCTGCCTTTggtaaactaaagaaaaatgtaTGGTCAAGAAAC CACCTATCTCTACGAATCAAATCGAGACTCTTCTACGCACTCACCATACC TGTGAAACTTggtctttaaagaaaaaaaatatctcaaagCTTTCAGTCTT TCAAAACAACTGCCTCAGAATCATGGCTGGGAAACGCTGAATCGGCAAAG CGTACTCTTGGTGTCAAGATGGATATCCTTGAAATGATCAAAAGGAGGAG AATGAACTGGTTTGGTCACATCGCAAGAAGATACCCCAATATCAACTATG TTCACAAGGCTTATAAGCGTGATTGTAAGGAAAAAGATGGAGCGATCTAA TCCGAGAAGACACAGGGATCACACTTCTTACTGCTGAGCGCCGTGTCCGT GACAGAGAAAAGTGGAAGCTCTTGTCCTGATCGTCGAGCACTCTTTGATG GAATCATCTATCACTTATTGACTATCGAGtccaaatctttaaaaagtgaC TTTAAAAAACTATTCTGCaaaaaaaTAAGGTGTAGACGAATTAACGTACA TCACTCTTGTTAAAGTTAAGGATTCtttttttATGTGTGAGAAGTTATGA GCAGTTTATTGGACCATGCCTATTGACGGGAGGCTACTGCCATCATCAGC ATAATCTTTTTGCTTTAATCGAAAGttaatttattcattttatcTTTACT ATTATAAACTATCTACCAAACCATGTCTTTATTCGACATTCAATGGGGGA AAACTAGCCTGAAAGTAcaaaactaggtcacagtgtggatctaaaccaca ctgaaacgaccgccttccatcacgcatcacgctcgcgaaagagcgcacgc acattattaacgcctacatgtcatctccagtacattttagattattcatt gaaaacagattacaatatagtcatttttcatgtctcgattattcaattcc gaataaaagacattcagggaaaaaaaagagaaacacctgggtaatctagt taaaaaaaccgaaagtaaatggcagacaaagtaatgagccaaggcaaaac gagattagcgtaccactatgaaagaaaccgcctccggcggtcgataagcA AGTTAGTATCCCTAAGTTTCAGGTATTCAGATGATGTCGAATTTGTCAGT GACCAAACAAAAATTTGGCTACTCTTCTCCTTTGACCGTTGTTTGAAGAA TGTCAAAAGAAACATTTagttttttagaaatctttttcCATTAAAATTTT AGGAATGTACGTCAAAGTATTGTTGGATGGACTAAAGAAACTTGGATGGT atgttctttttcttctttttttttttggcttgtTTCATGCAGTGGGCTCT GCAAGAAAAGAATATATCATTTTTCAGTTTGACTCCCCTAGACAATGGGA CTCTACCCCCGGATAAGAATTAGGAATGAGATAggaattttggccatcga aggtGTTAATTGACCCCCAATGtaagaacattttctggaagaacccAAAT TTAAAACcgttgaatttttaaaaagaaatcctCATGTCATTGTCTGATCT GACGGAATATTAATTTACGAGAGAAAATATTCGAGAAattaataaacaaa taaaaagtttgaaagttggGAAATGAATAGAAACTCTTTCGTAACTTTAA TAtgtccaaaaaaatcattttttttaattagggCCGTTACAAATGTGACA AGTTCTTGTTATATGTAAAGCCTCTTTGAATTCTCTTTGATTCTAAATTT CCTACTTTGTAAAAGTTTTGGCCAAGTAAAAAAGTGAGAGCTTGCGTCGT AGGGAGATCTCAAGTTAGAGTTACTCATTTGCATTAATAACCTGGGCTGt ctttttgtgtatttttctcTGGTCTTAGTATGATTCGAGACAACGGTGGC TCTTTTTTATTTAGTTCTATTCAGTTGCCTTCTGCTGGCCGTTGAAACAG AGTATAGCGCCAGCCCCCCTTCTAGTTTAgggttacaccctaaatttttc ccaaaaaaggacggagctggaagtacaccactttttcGGGGGAACCTATG TAGTTGgagggagctaaaatctcagcacttaacgtgggggctaaaataat tcagcttaatagttggctttAATTACCGAAATTGAAGTTCGTGAATCTGA ATCggcgcaatatttttataaaaagtgtgcATAATATCTTATTTTAAACT TAGAACTGAgcgcaatttacattggaaaaaacttttttactggatcaatt ttttgaaagtgtctagggtcaaaagtcctgggggctaacaaaaaattcat aaatctttggggggacttaaaactcaggggggccTAATTTTTgtctggga cctaaacccaggctaaCGCTATGCAGAGTTTGTTTAGCTTAGATACTATT TAGATACTATCATCGGCCAAAGAAAAAAGTATTCATGACCATGAATCGCC AATCTAGATGTTTCATTCGTTCGGTCCAAGCACATTTTAATGGATTTAAC CATAATACTTACTTTGCCAAGTATCCGCAAGCTTAATTGAAACTCACCAA AATCCTCCAcgttgtttttcttcttatttaGTGACACTGGTTTAGATACG AAGAATATTTGCTGTGAACCATGCGAACCCCGTTTGACTGCTGCTTTCGA TACTGATCGAAAAGAAgtaggtacacgtttttttataagaacatccaaaa tttttgaagcctccggatgttcttaactttttgagttttgagccttccta tttttaccattttttgagcaattttgcccatttttctaagaaaccggCTG TTTTGGAgtcggcaaagccttaaaatgttcttaacttgttcttattattt tggccatcgaagccttatgttcttatagaacaaagtttgaaaaattaaat cttgTCGTCAACAGGCGCTATTCTAATGTTAGTTTTGGAATTCAAACGTT CAAAAATCGGGAATCTGTGAGGAGTTACGCTGTCTAGTgtgtaaaagaat atgatatctATGGTACATCTCCGTAAAGTCTTCTGTGATTTACTGACACG TGTTCACTGAACCACAACATCTAAGGCTTGAGTCCTTTTTATTAGTCTTT TCAGAGAATTGACTTGTTCAGACTACGAACTCTTTAAAAACTCTAGACCT AAGTTAGGACTTAGAAACTTGCTATAGCTCCATGAAACTATGCTCATTAC TGGCTCGTATTTGGTGGGGTGATCTCATTCTGAAAAGTCGACCCCAATAT ATTGATGGAAAAGTTTCTTTTATTACTGCAAAATGCAATATCCGAGCGAG agagagaaattcaaaaatttgtaaattagTGTCAACAATACATCAAAAGT ATTTCAACAGAATAACTCCATTTTTCCTTCATTTATGTTCACAATACAAA ACATcaagtttttgattttccttAGATATATTTTAATTACGTGTATACTG TTCCTCCGTGTAGAAATTAATTTGGAGTGGTTGAAAATCACACAGAACAA gaagtcgatatttttatctaatttttgtttatttttaaagcTTACCAAAA CAGCGATAGTAACAGAATGCACTCGAAGTTTTTATAGAGTATAAGAAACA ATAACCAAAGAAACAGTCGTCATTCATTTTGATTACCTTTGTAAATGACG TTGCCAAAAACACATAACCTTTCATCAATGCTTATTTCGTGTAAtacaca ttttctttataagaacatccaagtcttcgaatgttcttaattttttgtta ttcaagccttaaaatgctcttcacttgttcttgacatttcggccatcgaa gccttatgttcttatatagtttgctcttataaagaaaacgtgtattgagT TTAGGGGGTTTAGCCATATAAAAGGGAGAGAAAATTATAAACTTTCGTTA TGAATTTTTTGATCGTTTAAAAAATAATCGAAGCTCTATCtgcgaaaaga aaatttaagtcAGATTTAAGCCTGATGAATTCACCACCTTGCGCTTCACA GAGTGTTATCGGAAATTGTAAAAAGAGCTCTCTTCATTCTGActttttct tctcaaaaatatttgtaatgACCATTTTGGAATAAACTCAATTTAGTATT AAAATTTAATAGAATGAACTATAATCATTTAGAGACCCTGCTGTAAATCA GGAAAGAGAGCTGTGGTCCTTATTTTAAGTTGGTTGTTCTCGTGTAAGAT CCTTATTGAAGATGGACCAATGAAGAGGAAAATGAGCTTGTTCGAATtaa catttttataaataaaaaggaaaaattttcctGATAGGATACAAGTTAGT TTTTAATGAATGCCTTGGGAGGATTTTAATTGAAATTGTGACGCAAAGAG TAGGCTGGCTCCTTTTATCGCTATTCAAATTCATCTAAAAATGATCAGCA GACTTTTGATTGGACCTGGATATGCTCAAACTCTCTTCATTATGCCTTCG TAATCAATTCTATTGGTATATGAATGacatgctgaatattttcaTATCTG ATATTTTGAAGTTGGTTTAtcttattcttaaaattttcaagatccaatat tttttttttctctttcttttaagatttcagcccaattataaattttgaat aaaaactatacaaaaatataatttaaagtTTCGTTGAGAATTTGAACAGC TGTGTTTTTGAGAAACAAGTTTATTTGGAAACTGTTGAAATTTGATGACT TGTCTTGTCAAAGTCTATTCACAGGAAGGTTGATCAAGACTTAAGATGGG CAAAATGTTTAAAGACAAAGTTCTACCATTCGTGACTGCGGTCAAAGCTA AGAATGCTTGGAAAGAGGAAACTGTCCATAAGCGTGATAACTATATTGAG AATGTGACAGTTCATGGCGTAAGCAAAGCAGTCAATTCTAAACGAAGTGA AAGATATTTCTGGATTTCTTTGGTGATTTCTTGTGTCTTTGCATTGAGTT ATGGTTTATACCTCATGGTGCATAAGTACCGTTCGCGAGAAGTGAATCTT CATATCCAAGATCAAATCCATGATAAATTAGAATTACCAAGTATTACAAT TTGTAGTAACAATCGAATCAAATTTGATTATGTTCCTGGTGAACAAGGAC CCGGAGACTTGACGACAGCTTTTTCCGAAGGATTTTATGAATTTGCATCT AAATTTCCACCATTCTGCGCTCGTTTTAAGGGACATTGTAATTTTACCGA AGAATTTTCGACTTTCAGTCGGAACGATCCTTGCGTGACATGGAATATGG ATGGCCTGATCAAGCAGGAGTTACCAGGGCTGAACTCTGGTGTTAGAATG ATGTTTTTCGTCAACGAAACATCGGATCGCATGCAACAgggttttattga aaattctatctCAGTTGTTATCCATTTCGCCAGAGAATACCCATCAATAT ATTTTGATCGTCTCGAATTAACACCTGGTGTTGAAACCAGAATCGAGTTA tccaagaaaatgtttttgcgGCTGCCTGAACCATATCCATCTAACTGTCG CACAGACAATGCTTTCATGGATATTACAAAACGATGGAGTTACACGCGCA CTAGTTGTTTAGAGCTTTGCTACAATCGACAAGGTTTAAAAGAATGCGGT GATGTTTTACAGCCTCGTTTTCGCTGCCTAATCCCTGATTGGATGTACCA AAAGTATAAGCAAAATCGTACGGTAGCCGATATCAATGCGTGCTATTTta cattgtttcaaaatttcgatCTATCGAATAACGAGATCTGTGATTGTCCA TCCGCTTGTTCAGAAGTAATCTACTCGCGACGTGTCCATACTGTCCCGAt gaatgaaaaacaaatatTCCAACAGTTAGATTATTACGACGTAAATGTTG GTGATCAGCAGAAATTCAAGGAATCGTTGTTTGTTTTCTCCTTCTATTAC CCAAGGCTTGGGTTTGAACTGGTGTCCGAAAAACCAGCCTATGTATTGTC CGATGTCGCTAATGATTTCGGAGGGTTGCTGGGACTTTGTATTGGTGCTT CAATTATGTCACTTTTTGAActcatcattattttttgtttgagtGTCTTC CCTAAATGGCAATTTAAGGGAAAGTAAAAACTTTCATTGATTTTCTCCGT TGGAAGGGAGCTTTAAAAGTTGTAAATGGTGCGTTTCTGTATTTCTCTAA TCGATGGCCTCGCCGTACGATGTATCATTGATGAAACTGATATATAATGT AATCTATTCAATGCTGGCTGGTATGACTTTCAAAGCACGGCTAAGAAAAT CAACCTTGCACAAAAGGTCACGTGATGAGATATTTGTAAATCCGGACAAG TATAACAAACTTATTAACAGTATTGGTAATAATATTTCCAAAACATACGA TGAACTTGAAAGAACTCTGGTTTCgcatctttttctttattttcgtcCAG ACAGGATGAGTAACGACGATATAAGTGCGGTTTAACGTGACTAAAATGTA CGAAATACGGAACGTTCGACTGGTTGTAAAAATGCGAATAATCTTTATCT ATGTAGTGACTATCCATGTTAAATAAATCATTGTATATTTTAGCGTCTTT ACCTTCTCTTAAAACCCAATTAAATATCTCCATGTCTAAGATACTTTCCT TGTTACGATATAGATCATTCAAATTCTTCGATAGTGCGAATTGGAATCTA TCGCTAAGACTTTTACTTAAATCTGCCACAAAGATGCTTGATGTTAACCA TTTTTTGGGGAAATACCAATTGCAGTATGATGCTCCAATATTGTGAGGGT TTAAGCTCTCTGTAAGCAATGGGTACGGGTCCTTAAAGAAGACTCCATCT ACATCAGTGAAGACAACTCGGTCATATTGTTCATATAACCGAAACACTTC AAGCTTTATGAAACAGTCTGAGAAATAACCATCGTGGTTCCTCAGCTTCA AAGAGTGCTTTTTGACTGGGATAAGTTGTATTCTTTTGAATCGATGTAAC GTCTCTTTGAATCTGTATCCCTTATCATGTAAGATAACGAAATCCACTTC ACAAAGACGCTGATATTTGACTTGTAAGATATGCAAGTTGACATAAAGGT AACATTCGTACTCTGGCTTCGATCGAGTGATGTAAAACACGAACGCTAAG TTTCTTTGTTTAGCTACAGCGTTAGGTTTACATTTCTTCGTTTGGTTCTC CTTCGTCTGTGCTTGAACTTCATCTTTGTTGATACACGTGCTTCTTATAG GTGTCTTCAATATCTTCTTAGGTGCcgagaaaatttgtaaatagaTGAGG GTGCCTtgtaaaacaacaagaaaaacgaagaaataaatataaacaaattt tcGACAACAGGCTATTGCTGATACCATTTCTTCAGGAAATGAAATTCATT CCCGAATTCATTCtcaatagaaaaaaactttcaataatattCTCAAGTAT GCGTGTTTTGCAATATTGATCGATTGTGATTGTGTTATTCATATTTTATG ATACATACTTCATTGTGAACAATGGGAATATTTCATTAAACTCAGATACA TTTCTCTGTTGGCTAAGCGGTACTCTTacaatcaaaaatataataGATAT TAAATATTGAATAAACTTGATGCGTGAGCTCCAAAGGAACATTCAATCTT CCCCATGAAAAActaattcaagatttttattcTGTCTGCATTAGCAAGCT ACAACTAATTTTAATTTGTGCCACCCTTCTTTTCAATGCATCTTTCATAT GAAGTTCAGATGAGCTATGTTCGTGACTCGTTAAAGAAACTCGGGGAAAT TAACGTCATATTATTATATCATACGGTTGATTCTAAGCGGGCaaataatg ggctcttccagaaaaaatccgttcatggggggtggaggatatattagtTT TTTCATGCATTACCCctagacattttgatttttaaccccctggacacggg ttatacccctggacaaacatcaaatcaaccccgtggacacaaaaaattac ccctggacatttgaatttaccccctggacattgcaattttttggtatttt ttcaatacccctggacaattcatcctccaccccccatgaacggatttttt ctggaagagcccaatgtgaCATATGAATAAATCGTCTCACAAGCGATTAA AAGAAGTAATTGAACGGTCTTGGGGTGTCCCGAACGAACGTTCATGAAAG TTCCATAGCACTCATTGAACGCACACAAGCGCTCTGGGCCCTCCTTAAAG TTTTGGAATGTTCTCAGACATCCCCGAACTAGTATAAATAAGAGCAAACG ATCAGACAAGTTTAAGAAAATTATTCTCTAGTTTCTTTGCTTTTAGCTTT TAATTGTCAGAAAATAATATTTGGGGATGGTTACATTTTCATAGCAGTAT TCAATTCGTTATATCTAATCTCTCTTTAATTGAACTAAATTATTGGTCCT TTAAGGTGGAATTTCGCATAAAATACCCTCAAtatttcaaatctttctct aattctaaaaaaattctcGGTTCCTTGAATTCGACTTAGAAAGAAAGTCG ACAGTAATCTTTTTCGTATTTATGACCAGAAAGAGGAGGAGTCCGTTAAA CAATTAGCTGACCAGGAAACTTTTGAATTATGAATGTCATAACAACACGT AAACAatttttcgtgtaaacaataacaacaacattAACTCCAGGGGATCT CAATGATTTTCTTCTCTCCAGGGATGAGGATCATTGAGCCTTTCAttgag aaagttttgaatcctATTTGAGAGCTATGACTAGgagtttactttttttt gacaaTAATAAATATGACAGATATGATTTCCTTTTCTTTTAATGTTCTTT ATAGTACCGTTAGCTTAGATCATTTGTAGAGCTTACTTTTCTTTTATCGG GTACGGATCGCTTAAAATCAAGCCTCCGTCCTGTCTTTGAAGACGggaca ttttaatattttaactaAATTGACCTACAATTTTGCTTAAATTTAGCTAT TCCATATGATGCGCCCTATGTTGCAAAACTATGATAGTCtcgcaaccaaa ataaaaataaatcgcTATCGAAAAACGTCTTTTTCCCACctttaaaactt caatattCGCTATCGAAAAGGTCGATTTTCCGCTATCCAAAAGGTCGATT TTTCGCTATCAAAAAGAATGATTTTTCGCTATCGAAAAAGGTAGATTTTT CGCTATCGATAAAAGTAGatttttctctatcgaaaaaggtagattttttg ctattgaaaaggtagatttttcgcttttttttatatttttgggcCTCCTT GTTATTATATAATATTTGTTCTCaaaaaaaGGCCAGCATGGTATAACATC ATTGTCATCAAAAAAGAGACTCTTATCTTGAGAAgccatttcatttcaaa aagaaTAGTaaaaaaaTTGTCCCCTGATGATAAGAAGGGTTAATTTTGta cagtgaaaatgaaaaagaaaacagttttgaattgaaaattttaacattaa aCACAAAGGGTAAAATCCTCATTAGTAGGTACCCGAAAGAAAATTctcct tttttcaaaatgacaagtGAGATATAAtacaaaaacgaaaataaagaCAA GCCTTGAACTTTTTTAAGGCTTCTTCTCTGTGAGAGAGAAAAAAGATGTT GTTCTCGCTAGCATcagcaaaatattaaaaaaggaAGTCTCTTTAAATAA AATGGTTCATGATTTTTTACTACTACAAGTGAAGAACAGCGTCATGAATC AGGAAAAAGATGAAAAGCCAAGGAAAAGCGTCGCAGCCAAATGGGAAGAC TTTTGTAGTGAAACAACCCTGCATGGTTTCCGAGCTGCTTTCTACTCCAA AAATATCTACAAGCGCTACTTTTGGAGAGTTTTACTGGTGTGTGCAACGG TTCTcgctatttttctcttttacggCGTAGTGGATGCTTACAAGAAATAT GAATTTAAAGTATCAAAGGAAATCAATTTCAGTATGGATGACATCGAGTT TCCCAGAGTCACAATATGTAATCTGAACTCCCTATCCAAAATGAAGTTGG TTCAATTAGGATTCACTGAAGAGGCTgatgatttgattgatttttaccaT AAAATGCGAGCCATGACTTTGAATATATCTGATCCAGACACGAAACGTAT CTTGAATCTATTTTACGCAAAAGGTATGAACACGACACATGAAATTATAT CGGCTTTTGATCTCGGCAAAAACGAAATGCTAAATGATGAATTCTTGGCA AAATTAATTCCAAAAGGTGTTTGTAGTTTCGAAGACCAAAAATGCAATAT GGACAATTTCACTGAAATTTATTCGACAAAATTTGGTAAATGTCTTGTGT TTCCTCAAGAAGATAGCCAGCCTTTAATGAGCACTACCCAGGGTGATGGT CTTTCTCTTTTCCTGAACATTCACGAGGATGAGATGCTGGATAGTCGTTC CATAGCCAATGGTTTAGTGGTATTCATACATCCCCATGAAGAAACATTCC AATCAGCTTTATCAAAGAGGATCTTTATTCAACCTGGAACAATAAGTGAT ATTCATGTTACTGTCAGCAAGGTATTTCTGTtatgttttgacttttaaac gctcttgttttttttatctacGGAGTTGAAAATTATTACTCCAAATAGTT TTCTTTGCTTGACAAAAGAAAAcctatattttcattttacctTTAAAAGA TACGTTGTCTTTACATTGGTATCGGTTccgttgttttgttttgttttgtt ttttaggtgcctaataaacgcccTCCCTTTGTTAATTGTCCGATTTTTGt ccaactcccccccccccccgtcaatctttttttgaaaatttttttaactg tcAAAGAAAAGTCGCTTTTGCTTTAaatcaggggggggtcggtagtaaaa tctcagacatatatgagtagtaaaaggatttttacgaatttttacatacc accacccagactcttggaagagatattttttactaccctggtagtaaaag tttttgggacaatttgtcatggagaccacctattttttggttgcttttcg gactgattttgcaaaaaaagctgaaaaatgattatttatgtgacacattt ttcacgtagtgcaaaaattaatgttttgcacttagaattaaagtcttttt tatattgacaaaaaatttcgagaattttttgtttgcagcaaacaactttc caacagaaaattttttaaaattataaaaattttcagattttttcagaaaa gtcatccaaaaaatttaaagaattacaaaaatagctaaaatttgctaatt ttaccagtcttaactacccaggtagtaatttttttttcaaatttaacaca tagataccacccattttagtatttaactaccctggttagtaaaaaatttt ttcgatttttcgtcacaccaccaccgtagtaaacgtcattatgtctgaga ttttactaccgacccccctgtTTAAATAGCCTGGGTTTAGAAGTCTATAA TTACCGAGCACTTAAAtgaattatacggtgttatatacacccgactcgtc tgaaactgatgtcagcaaaattttaataaaagagtcctttcaaatttgta aataaaaggaagaaaaaaatcttgctccacatttttcttcattcattaca aaagattctattatttcaatctgctgaatcaacatacattataactatgt aaaaggtcaatggctttaaagAGGTACAATTTCAAAaacccccggcaatt agcccaCCTGGGAGTATAAACAGACTTGAATTGGATTTTTAAAATTATAC CCTCTTTTCTTCCAGCTTCGATCATTACCAGCACCTTACAAGACCGATTG TGGAAAGAAGGCACTTCGATTCATTGATGAAAGTTATGGATACTCGGCAA ATTTGTGTGCAATCGATTGCATTTCTGAAATGTATTATAGTACATGTAAA TGCTTACCTTCAGAGCTAAAAATGTTTGTTGAAGGTATGACTACTCCTTT GACTCTTACACGAGGTTATTGAGTACAATGTGTAAAGCAATCTAATGCTC CAAAGTATGGCTTACGGTAAAAAGGATTTGATAAGATACAGAAAATCTc

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000091_pilon:1129975..1147423+

>MSTRG.12247.3.p1 ID=MSTRG.12247.3.p1|Name=MSTRG.12247.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3150bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000091_pilon:1129975..1147423+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAGAACAGCGTCATGAATCAGGAAAAAGATGAAAAGCCAAGGAAAAG
CGTCGCAGCCAAATGGGAAGACTTTTGTAGTGAAACAACCCTGCATGGTT
TCCGAGCTGCTTTCTACTCCAAAAATATCTACAAGCGCTACTTTTGGAGA
GTTTTACTGGTGTGTGCAACGGTTCTcgctatttttctcttttacggCGT
AGTGGATGCTTACAAGAAATATGAATTTAAAGTATCAAAGGAAATCAATT
TCAGTATGGATGACATCGAGTTTCCCAGAGTCACAATATGTAATCTGAAC
TCCCTATCCAAAATGAAGTTGGTTCAATTAGGATTCACTGAAGAGGCTga
tgatttgattgatttttaccaTAAAATGCGAGCCATGACTTTGAATATAT
CTGATCCAGACACGAAACGTATCTTGAATCTATTTTACGCAAAAGGTATG
AACACGACACATGAAATTATATCGGCTTTTGATCTCGGCAAAAACGAAAT
GCTAAATGATGAATTCTTGGCAAAATTAATTCCAAAAGGTGTTTGTAGTT
TCGAAGACCAAAAATGCAATATGGACAATTTCACTGAAATTTATTCGACA
AAATTTGGTAAATGTCTTGTGTTTCCTCAAGAAGATAGCCAGCCTTTAAT
GAGCACTACCCAGGGTGATGGTCTTTCTCTTTTCCTGAACATTCACGAGG
ATGAGATGCTGGATAGTCGTTCCATAGCCAATGGTTTAGTGGTATTCATA
CATCCCCATGAAGAAACATTCCAATCAGCTTTATCAAAGAGGATCTTTAT
TCAACCTGGAACAATAAGTGATATTCATGTTACTGTCAGCAAGCTTCGAT
CATTACCAGCACCTTACAAGACCGATTGTGGAAAGAAGGCACTTCGATTC
ATTGATGAAAGTTATGGATACTCGGCAAATTTGTGTGCAATCGATTGCAT
TTCTGAAATGTATTATAGTACATGTAAATGCTTACCTTCAGAGCTAAAAA
TGTTTGTTGAAGGTATGACTACTCCTTTGACTCTTACACGAGGTTATTGA
ATGAAGAACAGCGTCATGAATCAGGAAAAAGATGAAAAGCCAAGGAAAAG
CGTCGCAGCCAAATGGGAAGACTTTTGTAGTGAAACAACCCTGCATGGTT
TCCGAGCTGCTTTCTACTCCAAAAATATCTACAAGCGCTACTTTTGGAGA
GTTTTACTGGTGTGTGCAACGGTTCTcgctatttttctcttttacggCGT
AGTGGATGCTTACAAGAAATATGAATTTAAAGTATCAAAGGAAATCAATT
TCAGTATGGATGACATCGAGTTTCCCAGAGTCACAATATGTAATCTGAAC
TCCCTATCCAAAATGAAGTTGGTTCAATTAGGATTCACTGAAGAGGCTga
tgatttgattgatttttaccaTAAAATGCGAGCCATGACTTTGAATATAT
CTGATCCAGACACGAAACGTATCTTGAATCTATTTTACGCAAAAGGTATG
AACACGACACATGAAATTATATCGGCTTTTGATCTCGGCAAAAACGAAAT
GCTAAATGATGAATTCTTGGCAAAATTAATTCCAAAAGGTGTTTGTAGTT
TCGAAGACCAAAAATGCAATATGGACAATTTCACTGAAATTTATTCGACA
AAATTTGGTAAATGTCTTGTGTTTCCTCAAGAAGATAGCCAGCCTTTAAT
GAGCACTACCCAGGGTGATGGTCTTTCTCTTTTCCTGAACATTCACGAGG
ATGAGATGCTGGATAGTCGTTCCATAGCCAATGGTTTAGTGGTATTCATA
CATCCCCATGAAGAAACATTCCAATCAGCTTTATCAAAGAGGATCTTTAT
TCAACCTGGAACAATAAGTGATATTCATGTTACTGTCAGCAAGCTTCGAT
CATTACCAGCACCTTACAAGACCGATTGTGGAAAGAAGGCACTTCGATTC
ATTGATGAAAGTTATGGATACTCGGCAAATTTGTGTGCAATCGATTGCAT
TTCTGAAATGTATTATAGTACATGTAAATGCTTACCTTCAGAGCTAAAAA
TGTTTGTTGAAGGTATGACTACTCCTTTGACTCTTACACGAGGTTATTGA
ATGAAGAACAGCGTCATGAATCAGGAAAAAGATGAAAAGCCAAGGAAAAG
CGTCGCAGCCAAATGGGAAGACTTTTGTAGTGAAACAACCCTGCATGGTT
TCCGAGCTGCTTTCTACTCCAAAAATATCTACAAGCGCTACTTTTGGAGA
GTTTTACTGGTGTGTGCAACGGTTCTcgctatttttctcttttacggCGT
AGTGGATGCTTACAAGAAATATGAATTTAAAGTATCAAAGGAAATCAATT
TCAGTATGGATGACATCGAGTTTCCCAGAGTCACAATATGTAATCTGAAC
TCCCTATCCAAAATGAAGTTGGTTCAATTAGGATTCACTGAAGAGGCTga
tgatttgattgatttttaccaTAAAATGCGAGCCATGACTTTGAATATAT
CTGATCCAGACACGAAACGTATCTTGAATCTATTTTACGCAAAAGGTATG
AACACGACACATGAAATTATATCGGCTTTTGATCTCGGCAAAAACGAAAT
GCTAAATGATGAATTCTTGGCAAAATTAATTCCAAAAGGTGTTTGTAGTT
TCGAAGACCAAAAATGCAATATGGACAATTTCACTGAAATTTATTCGACA
AAATTTGGTAAATGTCTTGTGTTTCCTCAAGAAGATAGCCAGCCTTTAAT
GAGCACTACCCAGGGTGATGGTCTTTCTCTTTTCCTGAACATTCACGAGG
ATGAGATGCTGGATAGTCGTTCCATAGCCAATGGTTTAGTGGTATTCATA
CATCCCCATGAAGAAACATTCCAATCAGCTTTATCAAAGAGGATCTTTAT
TCAACCTGGAACAATAAGTGATATTCATGTTACTGTCAGCAAGCTTCGAT
CATTACCAGCACCTTACAAGACCGATTGTGGAAAGAAGGCACTTCGATTC
ATTGATGAAAGTTATGGATACTCGGCAAATTTGTGTGCAATCGATTGCAT
TTCTGAAATGTATTATAGTACATGTAAATGCTTACCTTCAGAGCTAAAAA
TGTTTGTTGAAGGTATGACTACTCCTTTGACTCTTACACGAGGTTATTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12247MSTRG.12247Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12247.3.p1MSTRG.12247.3.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12247.3.p1.exon1MSTRG.12247.3.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12247.3.p1.exon2MSTRG.12247.3.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12247.3.p1.exon3MSTRG.12247.3.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12247.3.p1.exon4MSTRG.12247.3.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12247.3.p1.exon5MSTRG.12247.3.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000091_pilongenomesc0000091_pilon:1129975..1147423 +