MSTRG.12242.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12242.2.p1
Unique NameMSTRG.12242.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000091_pilon:1040011..1077931-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12242.2.p1 ID=MSTRG.12242.2.p1|Name=MSTRG.12242.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=37921bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000091_pilon:1040011..1077931- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GAAAAAGCCCGCGAAAATAAAAAAGTTATACTTTCGATTTCTTGGTCCGG GCAGCGTGTTTGAGGAAAAAAGCAGATCTAAAAGTCTAACCCAATGACAG AACAGAGGAGGATTGATTTTAGTTTATCTTCTTTTATGTGATAGTACCAA TCGTCCTGTAACAAGTACATACAAATGACCCTTATGGTAAGAGACGTTTT TTCTTTCAACTCATGCCCTTAAGCTGTTAAGATGACTTAAGATGTCTAGA CGGCGCCTGCTGATGTCAAGAACAACACAGTGGTTTGGTCAAATTTTTTA TCTGGCCACTTGGAAATTTTGAGCACATGTTCCAGGCATGTTCTGGCCAG GTTTTGGGTTTTTGGAGGCAAAAACCTAAAGTTTTGTGGCTGGAACTTGG CCCAAACATTAATTAAATGTTTGGGCTGAATGTTTGGGCTGCGAAAGAAT ATTTTGCTATTTTTTGGCCCTAAACATGACGGTGATGGCTTCCTCGTAAA AGCAAAAGACACGGATCCGGCATGCAGAAATAGTGTCAGGACCTATAGGC AGCCTAGTAAGGTTGTGTATGGGTGTGGTTTGGGTGTAGTTTGGGTGGGG TTAGGGTTTGAGCTCGAAACAAGCGCAACATTATTTTGTGATTTTCTATT AATTGCCACCGGAGGAAGCCTAAAGCTTCTGAGGATGGCATTCATAGCCT CACGCGTAAGGAAGTTGGGCAAACATCTTATAATTTTGCGCATTTTTCAG TATTTTAGTTCCGCTTAACGGTAGTATTCTTATCTTACGGTCTCTCTATT GTTTTATCATCATCAAAAAGACTTTTCCGGAGTTATTTTTATCTGATTAC TCATTTTGAAATGTCAGTTTGTCTTTTTCTTATCCCTAGAAAGTTAAATG AATTTCCCTTTTCTGGGATTTTCCCTTTTTATACCACAAGTAGTTATTAA 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AATACTTTATGATCGGATTCATTAAACGGGCTGCTTTAGATCTTTTCGGA
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TATGTCAGATATTCTTAGTCCAAATATCCCAGAAAATCTACGAGAACAAA
TTGAAGCGCTCGACAAAATCAATGGTGACGGAAAAGGGCTTGTCTTTCTT
AATTCTAGCTAGATTCGAGTTGGTATTCATTCTGGTTCAGTGGTTGCTGG
TGTAGTTGGTACCTTAATGCCAAGGTATTGTTTATTCGGTAAAAATGTAA
CACTGGCTAACAAGATGGAGTCGTCAAGTGAAGCTGGCAAAGTTCACATC
AGTCCTTACACATACTTGTTGAAACTATAGGTGATGCCTACATGGCAGTT
GGTGGCCTGCACCAAAGTGAAAGTGAACATGGGCGTTATGTTACCGCCAT
GGGCGTTGAAATGGTTCAAAATGCAAAGAAAGTCAAAATACCAAGGAAGA
ATGAGAATATTCAGTTGTTAATTTCAAATTGCTGTTGAGTAAATATGGTA
TGAAGTATTATGAATATTGCTCGGAGAAATACGGAGGTATCCTCAAATCT
ATTGCAACCAATCTCACCGACTTTATCAATAACATGGACGATATTCGAAA
ACACATCCACAAAATTGAAAAGATCCCTGACGAATTTCCACCTTCTATTC
ATGCAACGAACGATAAAAAGACTTTATCGATGTACATTCAATCTAGCCTG
GGAAACAAAAGTTTAGAATACTTTATGATCGGATTCATTAAACGGGCTGC
TTTAGATCTTTTCGGAATTCGAAGTCGTGTCAGTCTTAAACAAGAACGAA
GCGATCCCAAAGATTACTCTATCGTTGAAATCAAAGCTATTACGTCATTG
ATCAAGAAACCATCTTTGTCTAAACTGCAAATGTCCGGTAAATGCAAGGA
TCTCATCTTAGAACCTGACGTTATGGATCGTGTATTTCCATTCCATTTTA
TATTGAATGATAAATTAGAAATAACACAATTAGGAGACTCTTTGAATCGC
TTACTGGAACAATTTATACGGAATTACGGTAATCATGTTCAAACTTATTT
TCAACTCGATGAACCAGCCATAGACTTTACCTACTCAATGGTTCGTAAAA
ACTTGAACACTTCATTTGTCGTTTCGTTACGCCGAGAATTCGTCGACAGT
GAAGTTGCTGAAAACGAAATTGCCGGCCTTGTGTTGAAAGGACAATTTTC
ATTTTTGGAGAGTTCTAAAAGCCTTTGGTTTATTGGTTCACCAAAAGTAG
ATTATTTGAAGCATTTTAACGGTCAAAGTAACCTGTTCTTAAGTGATATC
CCATTGCATGACGTCACACGTGAAGTTTTATTGGTAGGCGAACAAAAACA
TTCTGTTGAAACGCTAAAAAATCAACTCCAAATCATGACCAATCGATTGA
AAGAAACATCTAAAGAACTTGCTTTAGGTAGAATCAATACAGAATCTATT
CTCGATGAGATGTTCCCGAAAGATGTGGCTGATAAACTAATGCGTAACCA
GCCTGTTCCCACGGTAACCACCGAATCTGTAACAATTTTATTCACCGATA
TTGTTGGTTTTACGTCTATCTGTGAACAATGCGATCCTGAAGAAGTGACT
GTCATGTTGAACAAGCTGTACATCAATTTCGATTTGCTCTGTGAAAAATA
TCAAAATTACAAGGAGATCGTTGAAACTTACCAAGGAACAGAAGAATATG
TTTAAGAATGCAAAACATATCATGTTTGATGATGAAATTACCGATAAAGT
TCTGAACGCCGCTGCTAAACATTTACTTTGGTTACTTTAACCATTTTCTT
TACATCTTTATCACCAAAGAGTACGGCAACGATAAATGGACTGAAATTAC
ATG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12242MSTRG.12242Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12242.2.p1MSTRG.12242.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12242.2.p1.exon8MSTRG.12242.2.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12242.2.p1.exon7MSTRG.12242.2.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12242.2.p1.exon6MSTRG.12242.2.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12242.2.p1.exon5MSTRG.12242.2.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12242.2.p1.exon4MSTRG.12242.2.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12242.2.p1.exon3MSTRG.12242.2.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12242.2.p1.exon2MSTRG.12242.2.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12242.2.p1.exon1MSTRG.12242.2.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000091_pilongenomesc0000091_pilon:1040011..1077931 -