MSTRG.12242.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12242.1.p1
Unique NameMSTRG.12242.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000091_pilon:1039815..1065665-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12242.1.p1 ID=MSTRG.12242.1.p1|Name=MSTRG.12242.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=25851bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000091_pilon:1039815..1065665- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000091_pilon:1039815..1065665-

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GGGAAACAAAAGTTTAGAATACTTTATGATCGGATTCATTAAACGGGCTG
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AGCGATCCCAAAGATTACTCTATCGTTGAAATCAAAGCTATTACGTCATT
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AGCCTGTTCCCACGGTAACCACCGAATCTGTAACAATTTTATTCACCGAT
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TTACATCTTTATCACCAAAGAGTACGGCAACGATAAATGGACTGAAATTA
CTTTTCGGTGATCAAACAGATAGTGTTCAATCAACACCCAAGGTATCTGT
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AAACCACAGCGAAAAAGTTCCGTTCCCATCGTAATCCCGAAGAATAATGG
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GTGACGGAAAAGGGCTTGTCTTTCTTAATTCTAGCTAGATTCGAGTTGGT
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GAACATGGGCGTTATGTTACCGCCATGGGCGTTGAAATGGTTCAAAATGC
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ATCAATAACATGGACGATATTCGAAAACACATCCACAAAATTGAAAAGAT
CCCTGACGAATTTCCACCTTCTATTCATGCAACGAACGATAAAAAGACTT
TATCGATGTACATTCAATCTAGCCTGGGAAACAAAAGTTTAGAATACTTT
ATGATCGGATTCATTAAACGGGCTGCTTTAGATCTTTTCGGAATTCGAAG
TCGTGTCAGTCTTAAACAAGAACGAAGCGATCCCAAAGATTACTCTATCG
TTGAAATCAAAGCTATTACGTCATTGATCAAGAAACCATCTTTGTCTAAA
CTGCAAATGTCCGGTAAATGCAAGGATCTCATCTTAGAACCTGACGTTAT
GGATCGTGTATTTCCATTCCATTTTATATTGAATGATAAATTAGAAATAA
CACAATTAGGAGACTCTTTGAATCGCTTACTGGAACAATTTATACGGAAT
TACGGTAATCATGTTCAAACTTATTTTCAACTCGATGAACCAGCCATAGA
CTTTACCTACTCAATGGTTCGTAAAAACTTGAACACTTCATTTGTCGTTT
CGTTACGCCGAGAATTCGTCGACAGTGAAGTTGCTGAAAACGAAATTGCC
GGCCTTGTGTTGAAAGGACAATTTTCATTTTTGGAGAGTTCTAAAAGCCT
TTGGTTTATTGGTTCACCAAAAGTAGATTATTTGAAGCATTTTAACGGTC
AAAGTAACCTGTTCTTAAGTGATATCCCATTGCATGACGTCACACGTGAA
GTTTTATTGGTAGGCGAACAAAAACATTCTGTTGAAACGCTAAAAAATCA
ACTCCAAATCATGACCAATCGATTGAAAGAAACATCTAAAGAACTTGCTT
TAGGTAGAATCAATACAGAATCTATTCTCGATGAGATGTTCCCGAAAGAT
GTGGCTGATAAACTAATGCGTAACCAGCCTGTTCCCACGGTAACCACCGA
ATCTGTAACAATTTTATTCACCGATATTGTTGGTTTTACGTCTATCTGTG
AACAATGCGATCCTGAAGAAGTGACTGTCATGTTGAACAAGCTGTACATC
AATTTCGATTTGCTCTGTGAAAAATATCAAAATTACAAGGAGATCGTTGA
AACTTACCAAGGAACAGAAGAATATGTTTAAGAATGCAAAACATATCATG
TTTGATGATGAAATTACCGATAAAGTTCTGAACGCCGCTGCTAAACATTT
ACTTTGGTTACTTTAACCATTTTCTTTACATCTTTATCACCAAAGAGTAC
GGCAACGATAAATGGACTGAAATTACTTTTCGGTGATCAAACAGATAGTG
TTCAATCAACACCCAAGGTATCTGTCGATGAAACAGATTCAAACACATCC
CAAAATGGAGGAGGATGTTCATATACTGCTTACTCAACAATGATGGTGAA
TAAAGATACGTTCGAAAAAAAGACGAAACCACAGCGAAAAAGTTCCGTTC
CCATCGTAATCCCGAAGAATAATGGTCGTAAGTACAATGGATTTAACTCT
CTCCAACCCGATTACGAGAAATCGTTTACGCGTAAAATTACACCTACTCG
TAAAATATCCAATCCTGTCGATGTACCAATGATATTCGATCGAAAACGTA
GCGAAATTAATTACGATAATGATACTAATGAGAATTCGTATGATGATGAA
TTTATTTCATTTGATGCTTCACATATTCAAGATAATCAAACAAAGAATAC
CGAACTAACGAAAAACTATACTCGTAACTTGATCCAAAGGAATCGTAAAA
CGTCTGTCATGTTTAATTCGACACGATCTACAACACATTATTCGGAAAAC
GTTAAAAAGAAGAAGTCATCTTCAGGAGTCAGTTCTTCCTCATCAGATAA
TAATTTTCCGCTACATACTCATTTTACCGGACATAGTGAAACACCTTTTG
AGGATGATCGTAAATTTTCGGACATTTCTATTGACGAATTAATGAGCTCT
ACAGACTCATCACCAGCCGTTTCTCGAAGATCCAGTTCTAAGAAACTCTC
AGATATCAGTCGTGAAGATTTAGGATATTCATCTATGAAAGAGAAAGCAA
GAGTCCCTAAAACATCAAGTACTTTTAACTCGAATTTGAATAATAAACTT
GGTCGTCAATCAACCAGTAAGAAAATTGGATTATGGACTGAGAAAATTAA
TTCCCAACAAAAAGCAAATAATGAGACATCTACTATTTATAGTTTACGCG
ATAAAAAGAAACGCACATCTAAGAAAGAATCGAACGCTCAAGATAAAATT
AACGAGAACAATAAAAGCAACGAGAACAATAAAAGCAACGAGAGCGATGG
TCTGGATAAAATTAAACCAGCGCGTCGACGGAATACCACTATTACTTCTG
ACGAAACGGAACGAATTGAAAAAATTGAACCTAGACCTAAAGTTCATCGA
TCCATATCAGCGAAAGTTTCATCGTTTTTCGGTAAGAAACGTTCTCGAGA
TGTTACGAACAATTCAACAGGAGAAGAGGCTATTAAGAAAAAAATTTCAG
CCTCTGTCCAACCAGTAGAAGAAACAGTGACAGAGGAAAAACCAAAATCC
CGACCACCAAGTCGTAAAACTTCACAACACTTACAACTCAGTTCACAACA
AGTGACACAACTTCGGCGACAATCTGAAACAAACAATCGTTATAAAGAAG
AAGAACGTAAACTATCTTTTGTTGAACTTCATCGTAAATTTTCAGCCAAC
ACTCCGGCTCCACAGCGTCGGCGAACGAGTGCTGCCAATACTCAGTTAGT
TGACCAATCAACGCAAACGGTCGATATGGCAACACAGACAATTAACAACA
AACTTCATTATCTTCAAATTGTCAACAATCAACACTTTAATAACACTGAA
AGCCTTTCACCTTCTCCACCAAAAGAAAGGCGTCGCTCTCTACCAATGAG
AATGTTCGGAAGCACAAACTATGATTTCGGTGAAAAATTTTCTCCCTTAG
AACCTAACTCAACAATCCCTGAAAGTGAACTTATTGATCAACGCAAATCA
AGGAGTATGATTTGCCGATGTGGTAATTATACACTGGAATGTAATGACAA
TAAAAAGCATGATATAGGTCTGAACACTATTGATGATGTGAACGATGATT
GGGGAATCGCTGAGGAAAATGAGGACATTGATGATGAAGATGATTTAGAT
TTCGGAACATCAGGACCCGATAGTGATTTTAACACCGAAATCTCTGATAC
AGGTCTTCCTTCATGGCAAAGACAAGCTAAATTATCGTACCAGAAAGAAG
AATTTGGTGGAGTAAGCAGTAGTGAGGGTAATACTGATTTATCAGAATCT
GAGGAGCCATCTTCGTTACCTTCTTGGCAGAAAAATGCTCTTGCCAATGA
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AGCGATCCCAAAGATTACTCTATCGTTGAAATCAAAGCTATTACGTCATT
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GTGACGGAAAAGGGCTTGTCTTTCTTAATTCTAGCTAGATTCGAGTTGGT
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GTATTGTTTATTCGGTAAAAATGTAACACTGGCTAACAAGATGGAGTCGT
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GAACATGGGCGTTATGTTACCGCCATGGGCGTTGAAATGGTTCAAAATGC
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CAAATTGCTGTTGAGTAAATATGGTATGAAGTATTATGAATATTGCTCGG
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ATGATCGGATTCATTAAACGGGCTGCTTTAGATCTTTTCGGAATTCGAAG
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TTGAAATCAAAGCTATTACGTCATTGATCAAGAAACCATCTTTGTCTAAA
CTGCAAATGTCCGGTAAATGCAAGGATCTCATCTTAGAACCTGACGTTAT
GGATCGTGTATTTCCATTCCATTTTATATTGAATGATAAATTAGAAATAA
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CTTTACCTACTCAATGGTTCGTAAAAACTTGAACACTTCATTTGTCGTTT
CGTTACGCCGAGAATTCGTCGACAGTGAAGTTGCTGAAAACGAAATTGCC
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TTGGTTTATTGGTTCACCAAAAGTAGATTATTTGAAGCATTTTAACGGTC
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TAAAATATCCAATCCTGTCGATGTACCAATGATATTCGATCGAAAACGTA
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GAGGAGCCATCTTCGTTACCTTCTTGGCAGAAAAATGCTCTTGCCAATGA
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GATGATCAACCAAAAGTCTCTGTCATCCATCGTCCTGATTTATCACAAAT
CGCTCTTCAACGTGAGCGATCTTACTATGATGATCATAATGATGGTTTAG
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TTGACAATAATATGCCAAATGAATTTCGTAATATGGTACCAGAGCTACCG
GCAACATTGCCAAGGCAACGACGTCGGAAAACTGGTATCGTGCATCTACA
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GCAAGATGACGCCAATGATTCTGGTCCAACACGAAAAATGTCAACTGCAT
TTGCAGCCATGCCATATCCCCATCTTCCAGAAGAAGTAGAATTAGTATCT
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ATTTTCTGGCAACGTGATCGAAGCTGTATGCCAAATCTTATTGACCAATC
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AAAGTATTATCGCACCTTCGAAAAACATCACATCTAAAAAGTCCAAAACC
AAACAGCCGTATATGCAATCACAACATTTTGATGCGCAATCTTCCCGCTC
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TAATTCTAGCTAGATTCGAGTTGGTATTCATTCTGGTTCAGTGGTTGCTG
GTGTAGTTGGTACCTTAATGCCAAGGTATTGTTTATTCGGTAAAAATGTA
ACACTGGCTAACAAGATGGAGTCGTCAAGTGAAGCTGGCAAAGTTCACAT
CAGTCCTTACACATACTTGTTGAAACTATAGGTGATGCCTACATGGCAGT
TGGTGGCCTGCACCAAAGTGAAAGTGAACATGGGCGTTATGTTACCGCCA
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AATGAGAATATTCAGTTGTTAATTTCAAATTGCTGTTGAGTAAATATGGT
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AGCGATCCCAAAGATTACTCTATCGTTGAAATCAAAGCTATTACGTCATT
GATCAAGAAACCATCTTTGTCTAAACTGCAAATGTCCGGTAAATGCAAGG
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TTCAACTCGATGAACCAGCCATAGACTTTACCTACTCAATGGTTCGTAAA
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CATTTTTGGAGAGTTCTAAAAGCCTTTGGTTTATTGGTTCACCAAAAGTA
GATTATTTGAAGCATTTTAACGGTCAAAGTAACCTGTTCTTAAGTGATAT
CCCATTGCATGACGTCACACGTGAAGTTTTATTGGTAGGCGAACAAAAAC
ATTCTGTTGAAACGCTAAAAAATCAACTCCAAATCATGACCAATCGATTG
AAAGAAACATCTAAAGAACTTGCTTTAGGTAGAATCAATACAGAATCTAT
TCTCGATGAGATGTTCCCGAAAGATGTGGCTGATAAACTAATGCGTAACC
AGCCTGTTCCCACGGTAACCACCGAATCTGTAACAATTTTATTCACCGAT
ATTGTTGGTTTTACGTCTATCTGTGAACAATGCGATCCTGAAGAAGTGAC
TGTCATGTTGAACAAGCTGTACATCAATTTCGATTTGCTCTGTGAAAAAT
ATCAAAATTACAAGGAGATCGTTGAAACTTACCAAGGAACAGAAGAATAT
GTTTAAGAATGCAAAACATATCATGTTTGATGATGAAATTACCGATAAAG
TTCTGAACGCCGCTGCTAAACATTTACTTTGGTTACTTTAACCATTTTCT
TTACATCTTTATCACCAAAGAGTACGGCAACGATAAATGGACTGAAATTA
CTTTTCGGTGATCAAACAGATAGTGTTCAATCAACACCCAAGGTATCTGT
CGATGAAACAGATTCAAACACATCCCAAAATGGAGGAGGATGTTCATATA
CTGCTTACTCAACAATGATGGTGAATAAAGATACGTTCGAAAAAAAGACG
AAACCACAGCGAAAAAGTTCCGTTCCCATCGTAATCCCGAAGAATAATGG
TCGTAAGTACAATGGATTTAACTCTCTCCAACCCGATTACGAGAAATCGT
TTACGCGTAAAATTACACCTACTCGTAAAATATCCAATCCTGTCGATGTA
CCAATGATATTCGATCGAAAACGTAGCGAAATTAATTACGATAATGATAC
TAATGAGAATTCGTATGATGATGAATTTATTTCATTTGATGCTTCACATA
TTCAAGATAATCAAACAAAGAATACCGAACTAACGAAAAACTATACTCGT
AACTTGATCCAAAGGAATCGTAAAACGTCTGTCATGTTTAATTCGACACG
ATCTACAACACATTATTCGGAAAACGTTAAAAAGAAGAAGTCATCTTCAG
GAGTCAGTTCTTCCTCATCAGATAATAATTTTCCGCTACATACTCATTTT
ACCGGACATAGTGAAACACCTTTTGAGGATGATCGTAAATTTTCGGACAT
TTCTATTGACGAATTAATGAGCTCTACAGACTCATCACCAGCCGTTTCTC
GAAGATCCAGTTCTAAGAAACTCTCAGATATCAGTCGTGAAGATTTAGGA
TATTCATCTATGAAAGAGAAAGCAAGAGTCCCTAAAACATCAAGTACTTT
TAACTCGAATTTGAATAATAAACTTGGTCGTCAATCAACCAGTAAGAAAA
TTGGATTATGGACTGAGAAAATTAATTCCCAACAAAAAGCAAATAATGAG
ACATCTACTATTTATAGTTTACGCGATAAAAAGAAACGCACATCTAAGAA
AGAATCGAACGCTCAAGATAAAATTAACGAGAACAATAAAAGCAACGAGA
ACAATAAAAGCAACGAGAGCGATGGTCTGGATAAAATTAAACCAGCGCGT
CGACGGAATACCACTATTACTTCTGACGAAACGGAACGAATTGAAAAAAT
TGAACCTAGACCTAAAGTTCATCGATCCATATCAGCGAAAGTTTCATCGT
TTTTCGGTAAGAAACGTTCTCGAGATGTTACGAACAATTCAACAGGAGAA
GAGGCTATTAAGAAAAAAATTTCAGCCTCTGTCCAACCAGTAGAAGAAAC
AGTGACAGAGGAAAAACCAAAATCCCGACCACCAAGTCGTAAAACTTCAC
AACACTTACAACTCAGTTCACAACAAGTGACACAACTTCGGCGACAATCT
GAAACAAACAATCGTTATAAAGAAGAAGAACGTAAACTATCTTTTGTTGA
ACTTCATCGTAAATTTTCAGCCAACACTCCGGCTCCACAGCGTCGGCGAA
CGAGTGCTGCCAATACTCAGTTAGTTGACCAATCAACGCAAACGGTCGAT
ATGGCAACACAGACAATTAACAACAAACTTCATTATCTTCAAATTGTCAA
CAATCAACACTTTAATAACACTGAAAGCCTTTCACCTTCTCCACCAAAAG
AAAGGCGTCGCTCTCTACCAATGAGAATGTTCGGAAGCACAAACTATGAT
TTCGGTGAAAAATTTTCTCCCTTAGAACCTAACTCAACAATCCCTGAAAG
TGAACTTATTGATCAACGCAAATCAAGGAGTATGATTTGCCGATGTGGTA
ATTATACACTGGAATGTAATGACAATAAAAAGCATGATATAGGTCTGAAC
ACTATTGATGATGTGAACGATGATTGGGGAATCGCTGAGGAAAATGAGGA
CATTGATGATGAAGATGATTTAGATTTCGGAACATCAGGACCCGATAGTG
ATTTTAACACCGAAATCTCTGATACAGGTCTTCCTTCATGGCAAAGACAA
GCTAAATTATCGTACCAGAAAGAAGAATTTGGTGGAGTAAGCAGTAGTGA
GGGTAATACTGATTTATCAGAATCTGAGGAGCCATCTTCGTTACCTTCTT
GGCAGAAAAATGCTCTTGCCAATGATGTTAGAAAAACAAGCAAACCGCGC
CGAAAGTTTTCGTACAACCCACAACCTACACAACCTATTAAGAAGCCGCT
ACGAAGGAATAAATCACACGAAATAAACAGTATTAACCATCCATTATCGA
ATGCGCCATGGTACCAAGATGAAACTCCTGTGGTACCGAATATAAGGACG
ACAGCTTTGAGTACTAGCTTATCACAGGATGAAACAGAAACGACCAGTCA
GAGTTGCAGTGCTAGTGAAGCTGTTGATGATCAACCAAAAGTCTCTGTCA
TCCATCGTCCTGATTTATCACAAATCGCTCTTCAACGTGAGCGATCTTAC
TATGATGATCATAATGATGGTTTAGACGATTTTGACAAACCAACGGAAAA
GAACTACGTGAATCTAAAGGATCTGAAAAATGCACCTAACATTGATTTAA
CTTCAAATTTAGAAGCTATCTCATTAGATCCTTTAGACCCTTTAGAAGAC
CAAATCAGAAGTCGTGCAAATACTTTTGACAATAATATGCCAAATGAATT
TCGTAATATGGTACCAGAGCTACCGGCAACATTGCCAAGGCAACGACGTC
GGAAAACTGGTATCGTGCATCTACACGCGTTGGATTCCTTACCGCAGCGG
CGACGTTCTGTTTACCAACGTGACACGTCGGAAATATCCAACTCGTTCGA
TGGTGTTGCTGAACCATCCAGTAGTCTAAGTCGTAAGATCTCCACAGCTT
TTGGAGGAGGATTCCCACATTTCATGCAAGATGACGCCAATGATTCTGGT
CCAACACGAAAAATGTCAACTGCATTTGCAGCCATGCCATATCCCCATCT
TCCAGAAGAAGTAGAATTAGTATCTGATCAAAACACGTTAAACGTTATCG
TGGACAGTTATGATGCATTGAACATGGATGTCGATATCGCTGGAGGGACA
TCAGGAATGGCTTCGGTGCAGCCTTTTGATAACAACAACATACATCTTCT
CTACCGACAACAGCTGGATAACCTGGAGGAGGAGGAGCAAGACCAGGAGA
TCATGACCCCTACTGCTGGCACAACACCACCTTTTTCAGAAGATAGCTAC
CAGAATATGTCAGGCTTTTTGGAAAAGCGAAGACGTGAGCTATTGGTCAA
ATCAGATGCAACGAGGGAACATGCAAGCTCACCACAAACAAACCGTAAAT
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12242MSTRG.12242Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12242.1.p1MSTRG.12242.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12242.1.p1.exon8MSTRG.12242.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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