MSTRG.12226.2.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12226.2.p2
Unique NameMSTRG.12226.2.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000091_pilon:883954..905026+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12226.2.p2 ID=MSTRG.12226.2.p2|Name=MSTRG.12226.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=21073bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000091_pilon:883954..905026+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGTAGCACAAAATCAAGTTTTAGCATtggaaataatttaatttttttata aatacttctttatttttataggtGAAGCCAGAGGATGTGAAAGTTCCAGC AGAAACTCCAGATTTTATCGAATCCCCAGATTTAGAATTCAATCTTTGGA CATCACCTGATGCAGCTGGCACACCATACGAAAATGGGAATAGAACCTGG TTTTATTTCAGCGTTAGAGGTGGTTCTCTACCAAACAAAACGTTACGATT CAACATCATGAATTTGAACAGACAGAGTAGATTATACTCACAAGGATTGA ACCCTTTCTTCAGAGTATCCCATGGCAAACATTCATCATGGCAACAAGTC AAAGATCGATGCACGTATGAAACAGTGGATGGCAATTTTCAAATCAGTTT TTTACATTCTTTTACTGATGTGACCCGGATGTCAACAACTTATTTTGCAT TTTGTTACCCTTACTCTTATACTGAATGTCAACAATATATGAACTCGCTA GAGGAGAAATATGTCCAAGATGAGGATAAGAACTCTCAAGATACAGGTAA GCAAAGTGTTCAAGTTCTGAACTTGTTACACCCCTATGTCACAGACCTGG TTTGACGTCTAGAATTTTTATTCCATTGGGGCTGTTAGACGGGATTTTTG TAATTGTACAATATCATTCAATTAAATTATTTCATCGGTATTTTCTATTC TTTATCCCAAATaaaaaaaCCATCCATTGGCAATTCTTAAGGATATTCTG CACgtatgaatttcaaatttttgacattgtGACTGTTGaaaaaaaCGCAA ATCTTTACACTTTGGGTTTGGtattttttctccgctataatattaattag tttaccattttcattttcttttagacatttatttcCACCGTGAGACATTG GTCACTTCAAACGATGGATTAAAGGTTGAACTGTTGACTGTCTCTTCAAT 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TATCACGACATCACGCTAACTGCTTTGAGAGACCTCTAAAAATACTGGTA GATGCTCGGTATTGGAGGGGGAGGGgtagtactcttaggtgccaaaaaaa cgggggggggttggaaaattttcgaaatcttaataaacagggggggccTA ATTGGGTTGGAGattgtacttttgaaaaaatgaggtaaatataggctaaa atcaggctttttggagaaaaataaGGCGACTTCTTCTTgctaactgaaaa tattcttaaaaattaataaacggggggggggggggtcctaataaggtccg gaggggttggaaaatttccgaaaaattaacaagtgggaggggggcgttta tttggcacctaagagtaaaagGTGTCAATCAAAATTAgtgatttttcaat aaaaaagattGACCCAGGCAAGGGCAAGTGGCCTTAAATTAGTTTGTGCA AGCCATCgatatgatattttttatattattgacatttttttcatttttga gggGGTAGTGGAAAGAGGGTTggccaaaataattattttaagcTGTTTGG CGTTCCCCAGGagttatttttactttatcagAAATTTATCGACGATCCTT GATTCAATAATAAGTTAGTTTATAATCTTCTTGGAATacccttttatttt tttatattttgtaggAATTGTGATAACCTTATTTCATCCAGGGGGTGATT TTACACCATCCTCGTACTTTTCTGGTCATAGCTCCATGAAAGTTTGCCAG AGCTTATGAACTTTGTGAATTTTGATATTATCATTTAATGCATATCAAAT TTAAAGTCAACTAGGTATGGCGGATTTTATGACTTAATATACTGGTATGC GATTTAGTGTATAAAAGAAGGTGAATCCCTCCTGTAACTCTAGTTTGGAT ATGAAATCTTAGAACTGCTACCCTTTTTGAGATTTAGACCTTTTTTGAAC AACAAAAaacgatttgaagttttaccacttcCGTCTTTCTGGGACCAGAG GCTAATCAGGCTAATcacattgacttccaagcccgaagggctagactgga gactcctggatgggaaatgaagccacttatttcccatccagaacgcctgt gtgtggtttttacacaaacgccggattaaatgtaaaatctatcgctagat ttataaaaatgtagtccttaaaaacaaaggaaccgctagatacaagcCGT CTTCGGGATTGTGGCGTGTTCTAGACGCgctctggatgggaaataagtgg cttcactttttcttgcctgcaaaaggttagagattctactccaGCCCctc gggcttcaaactcaatggctAATCAGATATTAAATTTGTTGTTCACTTCT TTACTTTTCAGGCCTCGAACAGTccctcttcaaagttgaaaggAAACTGG TGAGTAggattttttcactttgattgtaaagtttttttcttccatATGGA ATCCTATTACTTGtaaatgatattttgaatttttatatgATACGAGGGAT CATAAAGGTTGTGTTATATAAAATTTGGGGATGAAAAGTGGAAATTGGGA GGGCTAAAAACACTGACTTTTAGAAACCCTGGAGTACTTTATCCTCTATA TCTTTGATTGGACTATAGAAAAGTCGGGATCTCGAAAGTGACCCCATATT AAGCTCAGTGGTTAGATAGCGGGTAGCTAGAAAGCGGGAAGAATTTAGAA CATAAAATGCCCCAAGACATCCTAAAACATTTTGCAACAAAAGGGATTTT AGAGTTTTTTGAGAATCACTTTTAACAACAGGTTATTTAAATTCTTGGTT TAAGAAAGAAGtgcccaaataagaaaaaatatatcccaATTCAGGCCTCA AATTCAcagttttttagaaatattcaacTTTGCTATGTTTCCCGACtgtt ttttactgattttttctTCCAGTTTAAAGACGCGAACAGCCAGCAAAAAT CAACAAGAATCTGTTTCATTGAAAGATGTTTACCATAATGGTGTCAGTGT TTCAAAAGAAAGTAAGATTTAAGGATTTATTTGACTGGCAACGATGTTGT TCcaaaaattcttcttctttctcttcatGTTAAAGAATACCGTTATACCG TAACACCGTTGAAAAGATGTTCTCAAGGAATGTTATCTTTTAAGATTTGA GATTAATAAAACtcccccgtgtcacagacccactagaaAATTAAGCAAAG ATTTCGTCTtcagtgggaaaatacccttgaatttcagcgccagttggaaa ttgactttgatttcatccctactCGAAATTCCAcgtttagaaattgcact ccaaaaccatccccactgagtttttcaaccttggaacaatagaatttcta tccccattagggTTTCAATAGgggtttttatccccactgaggaagaaagt tttttaaaatagGGCTGTgttaggagaacgagcaaaagttggcgAGAGAG TGCATTAACAATGAACATTCTGCCAAAGTTCATTCATTTCGACACTGCTG AAATCTAGCAGTGCAAGATTAGGGATCGAGCATACCATTTTTTCCTTCCT GGCGTTTAGCtccaaacaaaatttcttcctacgttTACCTAAAGTGTTTT TCGCGTGTTATCGTTCCCGCCCGACTTGCTATCGTTCTATGCCACGCTAA CAATGATCATGACATGCTACGTTTTTATATTTACAGAGGCGAAGACAACG AAAGTTAGTCGACGAAAGTGATCTGCTTTAGAAACGACCTTATCATCATT CAACATGGATGACATACTTAAGCAACCGAAACCGTTATTGTGACAATTAT ACAACAACAAAGCCTCTCTTTACGTTActttaatgtcagaaattttcGCG GCCAGAAAATCTCGCCAGTCAGGTCAGAGGCCATTCACGAAATCATGAGG ATAGAGTGAAAAACTTTGAGAGTGAAAGTATTTGTTTTAAAGATTGTTaa agcaacgatgtaaaaataatagataaccaacttgccttgattctcaaaaa acatccgtgttacggttgtaaaa

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000091_pilon:883954..905026+

>MSTRG.12226.2.p2 ID=MSTRG.12226.2.p2|Name=MSTRG.12226.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1602bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000091_pilon:883954..905026+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAATTTGAACAGACAGAGTAGATTATACTCACAAGGATTGAACCCTTT
CTTCAGAGTATCCCATGGCAAACATTCATCATGGCAACAAGTCAAAGATC
GATGCACGTATGAAACAGTGGATGGCAATTTTCAAATCAGTTTTTTACAT
TCTTTTACTGATGTGACCCGGATGTCAACAACTTATTTTGCATTTTGTTA
CCCTTACTCTTATACTGAATGTCAACAATATATGAACTCGCTAGAGGAGA
AATATGTCCAAGATGAGGATAAGAACTCTCAAGATACAGacatttatttc
CACCGTGAGACATTGGTCACTTCAAACGATGGATTAAAGGTTGAACTGTT
GACTGTCTCTTCAATGAAAGGAATTACTGAGAATCGAGAGAAAACATTAC
TTGGTCTCTACCCTGATCGAGAGAAGGAGAGAGCAAGAATTTTCAATAAC
AAGAAAGACTTATCAAAATCCAGATGCATTTCGTCAACCATCTATATTCG
CCATCAAAACACTTATGATGTATCATCATTTTAAATGAATTTGAACAGAC
AGAGTAGATTATACTCACAAGGATTGAACCCTTTCTTCAGAGTATCCCAT
GGCAAACATTCATCATGGCAACAAGTCAAAGATCGATGCACGTATGAAAC
AGTGGATGGCAATTTTCAAATCAGTTTTTTACATTCTTTTACTGATGTGA
CCCGGATGTCAACAACTTATTTTGCATTTTGTTACCCTTACTCTTATACT
GAATGTCAACAATATATGAACTCGCTAGAGGAGAAATATGTCCAAGATGA
GGATAAGAACTCTCAAGATACAGacatttatttcCACCGTGAGACATTGG
TCACTTCAAACGATGGATTAAAGGTTGAACTGTTGACTGTCTCTTCAATG
AAAGGAATTACTGAGAATCGAGAGAAAACATTACTTGGTCTCTACCCTGA
TCGAGAGAAGGAGAGAGCAAGAATTTTCAATAACAAGAAAGACTTATCAA
AATCCAGATGCATTTCGTCAACCATCTATATTCGCCATCAAAACACTTAT
GATGTATCATCATTTTAAATGAATTTGAACAGACAGAGTAGATTATACTC
ACAAGGATTGAACCCTTTCTTCAGAGTATCCCATGGCAAACATTCATCAT
GGCAACAAGTCAAAGATCGATGCACGTATGAAACAGTGGATGGCAATTTT
CAAATCAGTTTTTTACATTCTTTTACTGATGTGACCCGGATGTCAACAAC
TTATTTTGCATTTTGTTACCCTTACTCTTATACTGAATGTCAACAATATA
TGAACTCGCTAGAGGAGAAATATGTCCAAGATGAGGATAAGAACTCTCAA
GATACAGacatttatttcCACCGTGAGACATTGGTCACTTCAAACGATGG
ATTAAAGGTTGAACTGTTGACTGTCTCTTCAATGAAAGGAATTACTGAGA
ATCGAGAGAAAACATTACTTGGTCTCTACCCTGATCGAGAGAAGGAGAGA
GCAAGAATTTTCAATAACAAGAAAGACTTATCAAAATCCAGATGCATTTC
GTCAACCATCTATATTCGCCATCAAAACACTTATGATGTATCATCATTTT
AA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12226MSTRG.12226Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12226.2.p2MSTRG.12226.2.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12226.2.p2.exon1MSTRG.12226.2.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12226.2.p2.exon2MSTRG.12226.2.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12226.2.p2.exon3MSTRG.12226.2.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12226.2.p2.exon4MSTRG.12226.2.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12226.2.p2.exon5MSTRG.12226.2.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12226.2.p2.exon6MSTRG.12226.2.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12226.2.p2.exon7MSTRG.12226.2.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12226.2.p2.exon8MSTRG.12226.2.p2.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12226.2.p2.exon9MSTRG.12226.2.p2.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12226.2.p2.exon10MSTRG.12226.2.p2.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000091_pilongenomesc0000091_pilon:883954..905026 +