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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000091_pilon:812562..819315+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12224.1.p1 ID=MSTRG.12224.1.p1|Name=MSTRG.12224.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6754bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000091_pilon:812562..819315+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TGAAGCTGACCAGATCACTTTGATACTCTATAAACCTGATAACACAATTT
GGTATGTTTGATTCTTTTAAACTTAAAGCTTATAACTATTTTGCCAATGT
TTTACTTGACTTGACATTATTTGCACGTCATTCAATGAGCTCCCACCAAA
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gccaaagcggaaataaatactatctttcattACGTgaacactatctttca
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CTATCATTAATTTCGGGACACATTTCGCGATACTATCTTTATTAAAATga
cactatctttttttaaacgatactatctttccaAAATTACATTatcttaa
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attttaaaaaagaatatttaattttagaaaaataaattttcaatttagaa
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GATTTGCCTTTGCGTATTATTGACGATTTGGTtcaaccattttcaaaaca
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tcaggacctcatttcactttatcgatattacgcaaacggcagtgttcgct
aaataatcttggtttcgcttacgaacaaaaaaagaatcaaatttaatatt
tgtttcctatctagattatatttcgcgatggTTGTACGCCCAAACGCGCC
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accacgtggataaaaaacgtacggaatgaaacctgacagaaggttttcaa
ccagatttattcagataaagctataagaggttcattaattgtggatttta
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tttttctcatttttctcttttttttcctaaaaaaaatgttttttcctaaa
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gactatgttcgattggttcgattaattgtcaatttcattcgattaatctt
cgatttcgttcgattacaaTTATATTCGATGAGTTGCGATTTGCGAGTTG
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tccactcaagaatatctttttaacgagcacaaaattgcaacttgattcga
attctatcaaaagttacagccatttttgtctccagctgcaaattattttg
agacagactttagtaacaATGATAATAACATTGATGTTATTATCATTGAT
GACACAAGCagtcaacaaaagaaatcaatgaaattagATCAAAGAGAAAA
GCTGCACacacaagcaaaaagaattatttGCCAATCTTGTGGATTTGTAA
AACTCAAAATCATGTTAGCAATTTCCATGAGCTTTCCTGTAATGAAGACT
TCTTGAATTGATTactttgaagaaatagaaagaAAACTAAGAATTCGCCC
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CTTGTCTTCCAAGCCCCTGTGAGATAAAAGGGAGATAAAACGCTGTGTTT
TCAGTCAATGTTTCAGTTACCTTGTTTATTTAAACTGGTTCATCCAGTAT
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TTAGTCACCAATATGGCAAATCTATCTGGTCATCGGCAGTCTTTTCTCCC
ATCTAATTTAACAAATTGTCAAGATGAAAACATTAATTGGCATTTTGATA
AAGATATTGGTTGGTTTGGCTTTGACTTTTCCGGGAGATACTACACATTC
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TGTATCattttgataaacaaaaagaacaacTTCATTCTAGTTACGTCAAT
CTATTGAGCAGAGATTACTCTAAAGTAAAAAGTTCATGCTATGATCCTGT
TAACATGAGATGGTTTGAAATTgtcaaatcttcaaaaaatgataaGGAGA
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TCCTCTACAACAATTTATACCAACGATGTCAGGGAATATAACACAATCAA
TCTAACTTACCCAAAGAATATGAGAATCACCTTCGATTTTGAATTTGTTA
GAACTACCTCTGGAAATTTCCTCATTTTGATGTCCTGTTATCCAGATAAA
GGAAGGTTCACCATGGATTTGATACAGTACGATGATGAAAAGATTTCCCA
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TGATTTCACTGGTAATGAATTGTTTACAGTTGAAATCCCTGAACAACTTT
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GTTTCAAGAGATGTGAATTTTGCTCTAATGAGTATTAGTACTAATGGagt
gaaaatttgtaaacaattcAAATTAGATAAAGCTCCCCATGGTGAAATGT
TAACAAACTCGTATAAAGTATTGAAGCGTTTTGACAAGCATTTTCTTTGT
GTCAGCAGCAGGAGTGTATGGGATGATTGCTCCTACCATCTTTTTGATAC
GGAAACAGAAAAATTGGTTTACAAACATTCTACTGATGCCACATCTATAA
TTTATTGGGAGTTTAACTGGAACTTACAAGAATTTGCTTGTTGCACAaat
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GGATAAAGCTCGACAAGCTTGTTTGGAATCTTACAATAAAGATCAGTTAA
ATGCAAACCTTCCCTCTTCCCTTGTGAAGTATATCGATGCTTAATTACAC
ACTGTATGATGAATTCATTTGTTAGAACCTGCACTATGTTCCTATTTTTA
TAGAATATTACACTTTGTAATATATTTGACATcttctgtttatttttatt
cacaATATTTAAACACTGACTGGTAAAATATTGACTTCCGTTTCTCTCCT
CCTCTCTATAAGgaatattttgtttaaaatatagaaaattttcattttat
tacagATCCATTTACCTGATGATCGTGTAAGCGTGAAACAGACTGtagta
tgttttaatttttgtgagaacaaaatttttgattttattacatGATTAAA
ATGATTTAAACTGCTATCTTCATAAATTGATTTTCATGTCTTAATTACAA
ATCTGTTCCAGACCATATATATTTGCGATGGGCATGGCAGCCTCCGTTGG
TGGTCAAAAAGGAcacttttcaatttaaaaggcTGTTTTAAGGAGGGGCA
GCGa Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000091_pilon:812562..819315+ >MSTRG.12224.1.p1 ID=MSTRG.12224.1.p1|Name=MSTRG.12224.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1332bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000091_pilon:812562..819315+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAAATCTATCTGGTCATCGGCAGTCTTTTCTCCCATCTAATTTAAC
AAATTGTCAAGATGAAAACATTAATTGGCATTTTGATAAAGATATTGGTT
GGTTTGGCTTTGACTTTTCCGGGAGATACTACACATTCCATTTTGATGAT
GGGAAGATATATCCTGATGGCAATGAACGTCCTATAGAAGCTCCAGCCGA
TTTTGATTGGAACAGCattttttctagaattttcaaAGTGTATCattttg
ataaacaaaaagaacaacTTCATTCTAGTTACGTCAATCTATTGAGCAGA
GATTACTCTAAAGTAAAAAGTTCATGCTATGATCCTGTTAACATGAGATG
GTTTGAAATTgtcaaatcttcaaaaaatgataaGGAGAAAACTTATACAA
TTTATAGTGGCTGTATTAGAAGCTTGCTTGGGATTGGTTCCTCTACAACA
ATTTATACCAACGATGTCAGGGAATATAACACAATCAATCTAACTTACCC
AAAGAATATGAGAATCACCTTCGATTTTGAATTTGTTAGAACTACCTCTG
GAAATTTCCTCATTTTGATGTCCTGTTATCCAGATAAAGGAAGGTTCACC
ATGGATTTGATACAGTACGATGATGAAAAGATTTCCCACTTCCGACGTTT
TTCTTTTGCCCATGATCATGGCTCTGATGAAGAAGGTGAAGAAGCAGGCA
TGGATTTTTATAACGTGGGTTTTGACTTAGAATCAAACATTTTTTACGTA
ATTGAAAAAGGGAGCAAGCCTTGGAAGGTTTCTGCTTTTGATTTCACTGG
TAATGAATTGTTTACAGTTGAAATCCCTGAACAACTTTCAAAAGTTATAT
CCTACATGTCCCTCATTTCAGGCTCACTATTTTTTATGGTTTCAAGAGAT
GTGAATTTTGCTCTAATGAGTATTAGTACTAATGGagtgaaaatttgtaa
acaattcAAATTAGATAAAGCTCCCCATGGTGAAATGTTAACAAACTCGT
ATAAAGTATTGAAGCGTTTTGACAAGCATTTTCTTTGTGTCAGCAGCAGG
AGTGTATGGGATGATTGCTCCTACCATCTTTTTGATACGGAAACAGAAAA
ATTGGTTTACAAACATTCTACTGATGCCACATCTATAATTTATTGGGAGT
TTAACTGGAACTTACAAGAATTTGCTTGTTGCACAaatgagaatattttt
aagGTATTCACCACTGGATACAAATCCGATAGCTTGAAGGATAAAGCTCG
ACAAGCTTGTTTGGAATCTTACAATAAAGATCAGTTAAATGCAAACCTTC
CCTCTTCCCTTGTGAAGTATATCGATGCTTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000091_pilon | genome | sc0000091_pilon:812562..819315 + |
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