MSTRG.12208.4.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12208.4.p2
Unique NameMSTRG.12208.4.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000091_pilon:606156..618464+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12208.4.p2 ID=MSTRG.12208.4.p2|Name=MSTRG.12208.4.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12309bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000091_pilon:606156..618464+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAAATTGGAAAGTGCAGTAAATACTAAACGTCTTTCCAAAGACAAGAACA
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AAGTTATCAACCAGTCTCTTGGATCTCAGCGCTTTCAAACAGCCGCAAAC
CAggaacaatgatttttttaggaTGGCGTTATGAAATTCAAACGCAGGCG
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cgattCTCACTGTAGTACTACgcttcacttggcaagtgaacgcaccttcg
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GaaaggagtaggacccattccccaTGGGGAGGgcctatctatctatctat
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CTCTCCTGGGATGGATTGAAGATTGATCTGAATgtcttaaattttttgtt
taaaaaatatataaatttatttGCTTTTATAGTACTTTGAAGAAAGAATG
TCCGCTCTTCATCAGTCTTGGTACTGATAAGGATGCACAGTCATTGGTTG
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ATTATAATTAGTGTTGTTATTATAGCAATAAATTGATAAAGGTTTGTTTG
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AttcaaagtaaatatttttaaatatgatACTTTATTCGGATTAACTTTTG
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aaaaaatataaaatcactCATTCGCAAAAAGTTTATCTCACAAACAAAAT
TATTAGATTTTTCCTGTTCCCGAAAGTTTATCCAGTAAATTTTTTCCCAA
ACTTTTGCTGTAGTTTTCCGTCTAACCTTAGTAGTTTTTTAGAATACAGC
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ttttttttctaactaagtccaaaactttttcaaataattcCTTTATTctc
gcaaaaaaaattaatcaatttcTCCATTTGTGAAAGTTATCCCTTaacta
aattttgcaaattCTTTACCTCGCAAAAGTTGATCCGAATAAAGTAGGTG
ttatttatattgttattattattattataatattgACATCAATGTGGCAg
tctttgacaaaaattatagaaattttttaacaTACACTTTTGCCAATCAG
GCTGAATCAAGCAGAAAAAGAATTGTAATATATAAAGATTCACAGCTGAT
AATGAAACTTTTCTTCATCTAGAATCTATTCAGACATTATGCTCCTCAGC
GGAAACTATCTGGCAAAATCAAAGAGGACGCTATTGGTTTATTGAAAGCA
AAGGCCAACAAAAAGCTTGTAAGATTAGAACTGGCAaagaaaacaggaaa
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TGGATAAGACTCGAAATGATTTACAAAGTGTTGTAAACATATTAAAAAAT
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ACAAGAGTTAATAAAAACTTGCTCCCTTTTATTATTAACCTTGATTTTCT
TTTGTCGTTTGCCGTGTTTTTTCCCGCATTATGATATTAATGATATATTT
GCTTCATTTAAATCGTAACATTTTCATGTGTGACTAGCTGCATTAAAAAG
ATCTTCACGATTTCTTTAAACTTTAGTCACTCATgagaaagataattttt
ttttaagagtaAATACATCATAACCCTTTATGAAAacgttgaaattttaa
attggaACCAAAACAATACTAAGAATTAGTACAAAGAATTAGAtccattt
tccttggaaaatacaaagaattttaaatccattttccttgaaaaatacaa
agaatttgaTCCATTTCCCAAAAAtgtagagaaacttttttgatgtttcg
AAATTTTGTCATTTATATTTTCGTAGAGCTAAATACACCTGAAATCTGTT
TgggcattttttttttgccttaaaacaAACATAATATTGAAGAATTAATT
GTGAAATAACTAATTAATGACTTGCCTACTATACTATAAACACAATTTGT
ATTGGAAAGATGCTGGTTAAGTCCAGCCTACCTATATTTATTTATGATCA
ATTTGATTATAACACTCATTTGGACAAGGAGTAGCTTAAGTCAAAGGCCC
CAATACATTATgttaaacattatttttttgcaatcAGTCTCTGCAGCATA
CAGCATTTAAACAAATCTTCATAGTTGAAGCCAatctaacttttatttat
aaaattatttcactgagagctattttaaaatattttgcaggGATATATTT
TTGCGGATCAGGTCGAAAtcatccgcaaaattttatccATTAAAGTAATG
ATAAAATCCAATATAATAAAATCAAAGCAAGAGCTAtctctctaaaaatt
ttcacttttctctctattttgaagattctttcacaaatttttctttGccc
ccccccatattttatttataatattttcccCTTTTCATAccccccccTTA
AGCTTCAAAAAGTACTCTCCTCTTGACAATTTTCTCCATAAGACCCCTTT
ATAAAAGGGGGTACGGCACTATGAGTAATGCTAatgaattgatatttttt
atcaatgaaactttgaaaaaaaattcatcaaactaATGAAACTAATTTCA
TCAGAAGATATTATGAGAATAATAACCTGCAGTATCTTAAAGACTTAAAG
TGCGAAATTTATAGGATCGATAATTATATGTAACAAAAGAGACTTTCAGT
TCACATCAggcttttcttcttttttaattgcaGTCTAGTGACTTTTTAAT
CATAACGTGCGTTATGCAAATAAGAGCAGCTTTAAAAAACATTGTAATAA
ACCAGAACGGCAAAATTGGACAAACTGATTTAACTTAAATCTCTAGTTAA
TTGATGATGAAGATGTTTAAAAGACCATCTTCTTGATTTTTTAAGGTTGT
TCAGTTAACTTGCACAAAGACAACGAAGATAACTTCCTCGGTCTTTTCTT
TCAAGACGAGTCAATGAAAGTGAACTTTGATCGATTTCCTGAAATTTTAT
TTGTTGATGCCACCTACAAGGTTAACGAGCTTCGGATCCCAGCCTACATT
TTCCTTGTAGAAGACTCACTGGGACAAAGTGAAGTTGTTGGTGTTGCTCT
AATGGTGAACGAAACAAAGGAAAACCTCGCTTGGCTGATTGGCACCTTTG
CCGAGGAAAACCCAACCAAAAAACTACGAGTTGTAATGGCCGATAAGGAT
ATCAACGAAAGAAATAGAATCTCAGAGCTGCTCGGAGTGCCCATTTTAAT
TTGTCTCTATCATGCATTGAAGATTTTCAAACGTGAACTATCCACCCTTT
CGCTGACCCCTAACATCAAAGATGCAGCGAAAGGTCTCTTCGAAAGTATG
TGTTACGCATACACAAAATCTGATTTTGAAAGGTTTGAAAAAGAATTCCA
AACGCTAGAATCGTCAGCCCTGCTTGAATACTACGATAAAAATTGGAAAC
CTATTTCTAAAGAATGGGTAAAATGTTTTAAGGCAGAAGCTGGAGACTTT
CTTAACTCGACAAACAATCGGCTTGAAAGTTTCAATAGCAAACTGAAAAC
TGTTGTTGACAACCATTGTAGTCTTGAGGAGTTCGTACGTGGGTTTTTCG
TTGTACTTGACGCCTTACGCACTGAAAGAGACGCAAATGTTGCAAAAGAG
TTCCAAAAGCTGAAGCTTTCGCTGCCTCACGATCCGTGTGTTAAAAGTAT
TTACGATCATTTAACTTCGTATTCTGCTAACTTTGTATGTGAGCAGCTAG
CAGCAATCGAAAAAACAACAGTACGTAACAGTACAATTAACTCGTGTGAC
TGTTGTTTTTATCTTTCAATGGATCTCCCATGCAGGCACATCTTTCTCTC
GAGATCATTGTCAGGGTGTGTGCCTCTTTTCGATCCCGTTCTTTGCGCCG
TTCGATGGTCGAAAACTTATTATCGTCAAAGCCAACGGCTGTTTACACAA
ACAATCAATAAATTTGACAAGTTAACGACCACTTCGTCTTCATTCCGCCC
TCTAAAAGCCCTTAACTTTAACGAAAGATATAGAAAGGCAGACGctgtat
gcaaaaatatttcGATGTTGGCTTCAGAGCCTGGAGGCACAGAATTTGTC
GAGCGAATGACCCTTCTTAGAACACTTGAAGACATGTGGCGAAATGGTCA
AGAGGTTCATTTACTTTCGCTACCATTGAAATCAACGGAGAACGAAAATC
CTTTTTCATCTTTCTCTCAAGATCATTGTCAGGGTGCGTGCCTCATTTTT
ATTCTGTTCTTTTGCGCCGTTCACTGGTTGAAGACTTATTTCCATCAAAG
TCAACGGCtgtttactttttctaaattttatgatttgaaaatatcCCCAG
TGCGATTATCTTTTCTACAAACACACAATCACAGATTTATTTGTGCTTTA
AAAGTTTTACTGACATCTCGTTTGATATGGACTAATTTGATAGAGCTTAA
GATTGTATTGATTACACCATTATGTGTTAAGGGGTAATGTTAatacattt
aaaacaaaattttctatgAATGTTTAGGTCACAAAGACAATACCAGTGAC
AAAACTTTGCCTAAAGTCCCGAAGATTCAACCCGGGGTAAGTCATAATCT
ATCGtcaaaatgaattttctttaaaggAGTAAACCGATGCAATTTATATT
GAGAGTTGTTTATTATTAATTGAAGAACATTCTCCAGATACAAAGATGAT
GGTGACAGTAAAGCCAAAGCCTGATGTTTCTCTGAATATTATTAAATGCT
GCACGCAAACTGACCCTCGACTTTCTTTTTCAGAACCCAAATGTTACTGG
CGTCATCAACAATTCGCCTTTGAAATCAACGGAGAACGAAAATCCTTTTT
CGTCTATCTCTTCAAATCATTGTCAGGGTGCGTGCCTCTCTTTTTTATTC
TGTTCTTTGCGCCGTTCGCTGGTCGAAGACTTATTTCTATCAAAGTCCAC
GGCTGTTTactatttctaaattttatgatttgaaaatatcCTCAGTgcga
ttatcttttcaacaaacacacaatcacatattttaattcgtactttttaa
agttttactgACATCTCGTTTGATATGGTCTAATTTGATAGAACTTGTGA
TTGTATTAATTACACCATTATGTGTCAAGGGGTAAAGTTAatacatttaa
aacaaaattttctatgAATGTTCAGGTCACATAGACAATACCAGTGACAA
AGATTCGCCCAAAGTCACAAAGATTCAGCCTGAGGTAAATCATAACCTAC
CGGCATCGGCAAATGAAGTTTCTCTAAAAGAGTCTTTTCATAACCAAAGC
GACAAGCATATCGACATTCAAGATTTTGATGTCAGTAATGTTAAATTACC
ACCAAGGAAAAAGCCGAGAGGAAGACCAAAAGGACACAATTTAACAGTCA
TCGGAAGACAGAAGAAACGGAAATTGAATAATGGTATTTTGcatgttgtt
tttttagctagtttttaccactatattactttttctaaattttattgttt
aaaaatatccTGATCgcgattatcttttcaacaaacacaCAATCACAGAT
TTAAttcgagttttttgaaattttactgacagctaatttgaaatagacta
aTCTGATGGAACTTAAGGTTGTATTATTACACCATTGTTTTAAGGGGTAA
AGATGAaacacttttaatttttttttctatgaatGTTCAGGTCGCAAAGA
TAATACGAATAACAAAGCTTTGCCCAAAGTCCCGAAGATTCAACCCGAGG
TAAGTCATAATCTATCcacaaaatgaattttctttaaaagagtAAACCGA
TGCAATTTATATTGAGAGTTGTTTATGTTAAATTGAAGAACATTCTCCAG
ATACAAAGCTGATGGTGGCAATAAAGCCAAAGCCTGATGTTTCTCTGAAT
ATTATTAAATGCTGCATAAACTGACCCTCGACTTTCTTTTTCAGAACCCA
AATGTTACTGGCGTCATCAACAATTCGCCTTTGAAATCAACGGAGAACGA
AAATCCTGTTTCGTCTTTCTCTCAAGATCATTGTCAGGGTGCGTGCATGC
CTCTTTTTTATTCTGTTCTTTTGCGCCCTTTACTGGTCGAAGACTTATTT
CCATCAAAGTCAACGGCtgtttactttttctaaattatatgatttgaaaa
tatctCCAGTgcgattatcttttcaacaaacacaCAAATAACAGGTTTTA
AGTTGTGCTTTTTAAAGTTTAACTGGCATCTCTTTTGAAATGGACTAATT
TGATAGAGCTTAAGATTGTATTAATTACACCATTATGTGTTAAGGGGTAA
TGTTAatacatttaaaacaaaattttctatgAATGTTCAGGTCACATAGA
CAATACCAGTGACAAAAATTTGCCCAAAGTCACGAAGATTCAACCCGAGG
TAAGTCATAATCTATCGacaaaatgaattttctttaaaggAGTAAACCGA
TGCAATTTATATTGAGAGTTGTTTATTCTAAATTGAAGAACATTCTCCAG
ATACAAAGCTGATGGTGACAGTAAAGCCAAAGCCTGATGTTTCTCTGAAT
ATCATTAAATGCTGCATAAACTGACCCTCGACTTTCTTTTTCAGAACCCA
AATGTTGCAGATGTCACCAACAATCATCCTGACAGATTGGTGGATCATCT
ATCGTAAATTTATCCTTCTTTCTCGGACTGAACGTTTCCAAATGtttttt
ctatcaaatatattccagatcttttttatcaaatttctgtctcattttat
cgtttttttCTATTGCGAGGCATTACTAAAAACGCATTTTCAGATATGGA
TTAAGATATAGATTTTGCTTTTTCCAAGGCTCTGGTCATTGAGATTGCTC
ATTGGTCATTTGAACTCTTTTTAACTTGTATAATATAagtttgccaattt
ttttttgctttattttcagGTTTATTTGTGACCCCAGTCAACGAGCGGTA
ATCGAGGTTCCGGGTGATGGTCATTGCTTGCTATACGCTTGGGAAATATG
TCTCAATTTTTCTGAGAACTCTTCCTTGAAGCCTTCCTATGTTGCATTAA
GTTCAATGGTTATGCAGCAATATTTATTAAGGAAAAAAGAATATAAGAAA
TTTCTGTGTGATAACGAGTTGAACGTCGATATGGATAATGAGATAAGGAA
ATACCTGAATGAAAAAAGTTACGGCCGTCAGATTGGCGATGAGCCGATTT
TTGACTCTCTAACAAATGCCACAAATGTCAAAGTTTTTACATGGGAAAGT
GCAGAAAATGGATCCTTGATACAGATTGGCCACCGCGTTCCTTCAGACAA
CAACTGGTCTAATGGTACGATCCACCTTCACAAAATGGGTCAGCATTACG
AGCCAATCGTtgccaaaaagtttcaaggtttGTTGGGTagactattttct
ttttataagcaacccaTTGAGCTTAGGGCTGGAATTATTGCTAAgcattt
ttcgaaatccaggGCTAAAGTTGCTTATAAGGTCgcttaaaaaatttcta
attttagaAGGACAGTAAAGGACTTTTTTGTatcaaagatattttttatt
tgctgTAAAAAAGGTTGCTATGGGGATTTCAGGGCTTTGTCGACAGAGGT
CAAGAATTTACCTCTGAAACTCAGTGTAGGATCTCTAGGGGGCctttaac
caatcaaatcattttgGTATGTTTCTATATATAGAAATGGCAAAGTCCTT
ATCACGTTCACATGGAATTTCAATGCAAGAGACTCAGCGCATGTCAGAAG
CCTGTAAGATGAAAATTAGATTCTACGAATCGCCTTTTTCGTTCAAATTT
CTCATTAGTGTGGAAATATGATTGTACAATGGAAAACGATTTCAACCATT
TCGcccccccccATATGTTAAATTCCGCTCAGAAACTATATGGACCAATT
CCTGCCACCATGTGGAAACCAAGACATCCTAGTTACACTAATTTCTTTGA
GCCACATTTTGGTAGCCGGAGCTAGTGCAAAAGACTTTAACTTTACATTA
TTATATCATAGATATCCTCAAAATGGTCGATAATGAAATTCCAAGCACCT
CTGGGCATTGTAAGTTTGTTGCTTAAAATTATTAGTATATCAACCAGTTT
AAAGTTTCTCTTTTCATCACTTCGGAGTGAAGTGAACTTAATGCTTAATT
CTACCTTTTTTAGGTTCTATTGAAGGGAAGGATTCTCAAATTCAGactga
aaaaagacaaaagactaCCTCGGTTTGTCActaaataatattttgatttt
agttaATTTTTAATGGAACCATAAATAACAATGCAAGTGAAGGGAACTGA
ACTCGATTTTGGTTCTAATTTGTTTAGTGAAAGCTTTGATTAAAACTAAA
CCTTAAAGCAAGATaatgttttatttcaataaatCATTATATCTCAAAGT
AGCGCGCCCAATCCTAAGAAGTTAAGACGAAATTGTACCATAAAACACGT
GCTTAGCAAAGTTGCCTCGTGCGTTGTGGTATATATCCTTCTGTATGAGa
ttaaagaaaatcttttgttctctttttagAATGCAGAGTCAGATTATTTC
AATCAATCATATAACAGTTTAGATGATCAGACACTGTTACAACACGTCGA
AGGTACttcctcttttcttttttatcaaatagaaCAGGTAAATCCTTGAA
GTACGAAAACTAATTATCGAGGAGTTTATAGGCTTCTTTACCCTATGATG
TCGAGGTAATTTCTTGGAATTACTTGAAACTTTGATAAtatgtaccgggt
gacccacgaaaaagttcggacctttctcggcgtcttgagacCGAACAAAT
GTCACAAAGTGCTCGgagttttggtatttaaaaagtagatatcctaactt
aaaatttgagctatcactttttaaatttgaccagctagttctctacttat
gaccttttaaactcaaaattcacttttcggaaagtgtaaaaaatacgtaa
aaaagaggtattaaattaatgcaataaattagaaaatctcttataaattg
acttatttaacgagttttatgacattaataattattaaaaacacctttga
aagtagtttttgtttaaaacaagactagtttttatcaaaattggcacttt
caaggaattttctcaaaaactgtatatcaaaaacgtctaaaaatacctaa
tttgataccccttttttacctgttttttacactttccgaaaagtgaattt
tgagtttaaaagctcgTAACTAGGGAGcttgtgcgtcaaatttaaaaagt
aacgGCTaggattttaagttaggatatctactttctaaataataaaactc
caagcactttgggacatttgttcggcctcaagacgccgagaaacgtccga
actttttcgtgggtcacccggtagctTACTCATTATTTATCTCGAATCCC
TTTTTAGGCATTGACGAGGTTGTGGCCGCATTGGAGGTAAACAATTTCTT
ATTACTTTGCCGCTTTGTTCAAAGTTTCTTTGTAGTATAATCTTCAAAAA
CGAATAATGTATTACTTGAATTATATTATTtgactttctttattttttag
acTTCTGTTTTAAAATCTTCCGATCTTATCGATTTGTAAGTTTTCTTTGT
CattatgtttttattatttcttcTGATAAGAATAAGGACATCTAGgataa
aatgaacaaattttgtGTTTCTGGAATACAGGTGATAGGAATAAATGTTC
ACCGGCCCGCAGCaaaaaaaGTTTCGGGAAAGAAAAAAGGCTTACGTATA
TCACAAACGCTTTAAGTTTACTGACTAGTTTCTTTAATTTCCCTATTTTA
CAGGAGAGATGACGTTAATTGCGAAGATGTTAATATTGATGAGTTGGACC
CTCTAACGATCAATGTAACTCCACAGAAATGCTCGCGTGAGTAGAGAAAT
ATGTACATTTCAAGTGTTATTATAACTTAGAACGCCGAAGATTTGTCCTT
AAAATCCTAAAAAGGagagcaaaattagcgatttttaagaaaggattttt
taaatttcctcatGTCGGTTGGGGCCTCTACGTAGAACCCCTTTGTTTTA
ATGCAAAGTAATTTTGAAAACGGTGCTTTCAAACAAACTAACTAAacgtt
tttgccacccttaagggGGTTGGGGTGCGAAATTGTTTTTCAATCTTAGG
GAGGAGGGATGCGAATttttcgaattaaaaaaaatcctcCGACCCACCAT
AGTAGATAATTTATGACCGCTGACAAGTGTCTTTCTGAAGAACGTTTTTC
TAtacaaatacattttttttcttaaacaaGAAATACATTTTTGCGCATTT
ACTCTTAGGATTACACAATGACAAATGACACGATCGTGAATAATAGAACC
CTTTACCGCTGACTGACAAATGACATACAACATGACTGAAACAAACTACT
AAGATTGatgagattttttaaattattttctatttataaCTTTGAAATTA
GATACTAGATACTTGTAGATACTTGACACTTCCACCAACCATTGAAAGTT
TAGTATCTATAACGATTTTTCTTATCTAAGGTCTAAGGGCATGGAATCGA
ATACCATGATTTCCTTTCATATCTTccttaatagaaaaaaatacgaTATT
GTGCTATCTTTCGTTTTTTAGTTGTTTCGCAAGATCGAGAGAATTCAACT
AATCACCAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000091_pilon:606156..618464+

>MSTRG.12208.4.p2 ID=MSTRG.12208.4.p2|Name=MSTRG.12208.4.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4263bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000091_pilon:606156..618464+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTATGCAGCAATATTTATTAAGGAAAAAAGAATATAAGAAATTTCT
GTGTGATAACGAGTTGAACGTCGATATGGATAATGAGATAAGGAAATACC
TGAATGAAAAAAGTTACGGCCGTCAGATTGGCGATGAGCCGATTTTTGAC
TCTCTAACAAATGCCACAAATGTCAAAGTTTTTACATGGGAAAGTGCAGA
AAATGGATCCTTGATACAGATTGGCCACCGCGTTCCTTCAGACAACAACT
GGTCTAATGGTACGATCCACCTTCACAAAATGGGTCAGCATTACGAGCCA
ATCGTtgccaaaaagtttcaagAAATGGCAAAGTCCTTATCACGTTCACA
TGGAATTTCAATGCAAGAGACTCAGCGCATGTCAGAAGCCTATATCCTCA
AAATGGTCGATAATGAAATTCCAAGCACCTCTGGGCATTGTTCTATTGAA
GGGAAGGATTCTCAAATTCAGactgaaaaaagacaaaagactaCCTCGAA
TGCAGAGTCAGATTATTTCAATCAATCATATAACAGTTTAGATGATCAGA
CACTGTTACAACACGTCGAAGGCATTGACGAGGTTGTGGCCGCATTGGAG
GAGAGATGAATGGTTATGCAGCAATATTTATTAAGGAAAAAAGAATATAA
GAAATTTCTGTGTGATAACGAGTTGAACGTCGATATGGATAATGAGATAA
GGAAATACCTGAATGAAAAAAGTTACGGCCGTCAGATTGGCGATGAGCCG
ATTTTTGACTCTCTAACAAATGCCACAAATGTCAAAGTTTTTACATGGGA
AAGTGCAGAAAATGGATCCTTGATACAGATTGGCCACCGCGTTCCTTCAG
ACAACAACTGGTCTAATGGTACGATCCACCTTCACAAAATGGGTCAGCAT
TACGAGCCAATCGTtgccaaaaagtttcaagAAATGGCAAAGTCCTTATC
ACGTTCACATGGAATTTCAATGCAAGAGACTCAGCGCATGTCAGAAGCCT
ATATCCTCAAAATGGTCGATAATGAAATTCCAAGCACCTCTGGGCATTGT
TCTATTGAAGGGAAGGATTCTCAAATTCAGactgaaaaaagacaaaagac
taCCTCGAATGCAGAGTCAGATTATTTCAATCAATCATATAACAGTTTAG
ATGATCAGACACTGTTACAACACGTCGAAGGCATTGACGAGGTTGTGGCC
GCATTGGAGGAGAGATGAATGGTTATGCAGCAATATTTATTAAGGAAAAA
AGAATATAAGAAATTTCTGTGTGATAACGAGTTGAACGTCGATATGGATA
ATGAGATAAGGAAATACCTGAATGAAAAAAGTTACGGCCGTCAGATTGGC
GATGAGCCGATTTTTGACTCTCTAACAAATGCCACAAATGTCAAAGTTTT
TACATGGGAAAGTGCAGAAAATGGATCCTTGATACAGATTGGCCACCGCG
TTCCTTCAGACAACAACTGGTCTAATGGTACGATCCACCTTCACAAAATG
GGTCAGCATTACGAGCCAATCGTtgccaaaaagtttcaagAAATGGCAAA
GTCCTTATCACGTTCACATGGAATTTCAATGCAAGAGACTCAGCGCATGT
CAGAAGCCTATATCCTCAAAATGGTCGATAATGAAATTCCAAGCACCTCT
GGGCATTGTTCTATTGAAGGGAAGGATTCTCAAATTCAGactgaaaaaag
acaaaagactaCCTCGAATGCAGAGTCAGATTATTTCAATCAATCATATA
ACAGTTTAGATGATCAGACACTGTTACAACACGTCGAAGGCATTGACGAG
GTTGTGGCCGCATTGGAGGAGAGATGAATGGTTATGCAGCAATATTTATT
AAGGAAAAAAGAATATAAGAAATTTCTGTGTGATAACGAGTTGAACGTCG
ATATGGATAATGAGATAAGGAAATACCTGAATGAAAAAAGTTACGGCCGT
CAGATTGGCGATGAGCCGATTTTTGACTCTCTAACAAATGCCACAAATGT
CAAAGTTTTTACATGGGAAAGTGCAGAAAATGGATCCTTGATACAGATTG
GCCACCGCGTTCCTTCAGACAACAACTGGTCTAATGGTACGATCCACCTT
CACAAAATGGGTCAGCATTACGAGCCAATCGTtgccaaaaagtttcaagA
AATGGCAAAGTCCTTATCACGTTCACATGGAATTTCAATGCAAGAGACTC
AGCGCATGTCAGAAGCCTATATCCTCAAAATGGTCGATAATGAAATTCCA
AGCACCTCTGGGCATTGTTCTATTGAAGGGAAGGATTCTCAAATTCAGac
tgaaaaaagacaaaagactaCCTCGAATGCAGAGTCAGATTATTTCAATC
AATCATATAACAGTTTAGATGATCAGACACTGTTACAACACGTCGAAGGC
ATTGACGAGGTTGTGGCCGCATTGGAGGAGAGATGAATGGTTATGCAGCA
ATATTTATTAAGGAAAAAAGAATATAAGAAATTTCTGTGTGATAACGAGT
TGAACGTCGATATGGATAATGAGATAAGGAAATACCTGAATGAAAAAAGT
TACGGCCGTCAGATTGGCGATGAGCCGATTTTTGACTCTCTAACAAATGC
CACAAATGTCAAAGTTTTTACATGGGAAAGTGCAGAAAATGGATCCTTGA
TACAGATTGGCCACCGCGTTCCTTCAGACAACAACTGGTCTAATGGTACG
ATCCACCTTCACAAAATGGGTCAGCATTACGAGCCAATCGTtgccaaaaa
gtttcaagAAATGGCAAAGTCCTTATCACGTTCACATGGAATTTCAATGC
AAGAGACTCAGCGCATGTCAGAAGCCTATATCCTCAAAATGGTCGATAAT
GAAATTCCAAGCACCTCTGGGCATTGTTCTATTGAAGGGAAGGATTCTCA
AATTCAGactgaaaaaagacaaaagactaCCTCGAATGCAGAGTCAGATT
ATTTCAATCAATCATATAACAGTTTAGATGATCAGACACTGTTACAACAC
GTCGAAGGCATTGACGAGGTTGTGGCCGCATTGGAGGAGAGATGAATGGT
TATGCAGCAATATTTATTAAGGAAAAAAGAATATAAGAAATTTCTGTGTG
ATAACGAGTTGAACGTCGATATGGATAATGAGATAAGGAAATACCTGAAT
GAAAAAAGTTACGGCCGTCAGATTGGCGATGAGCCGATTTTTGACTCTCT
AACAAATGCCACAAATGTCAAAGTTTTTACATGGGAAAGTGCAGAAAATG
GATCCTTGATACAGATTGGCCACCGCGTTCCTTCAGACAACAACTGGTCT
AATGGTACGATCCACCTTCACAAAATGGGTCAGCATTACGAGCCAATCGT
tgccaaaaagtttcaagAAATGGCAAAGTCCTTATCACGTTCACATGGAA
TTTCAATGCAAGAGACTCAGCGCATGTCAGAAGCCTATATCCTCAAAATG
GTCGATAATGAAATTCCAAGCACCTCTGGGCATTGTTCTATTGAAGGGAA
GGATTCTCAAATTCAGactgaaaaaagacaaaagactaCCTCGAATGCAG
AGTCAGATTATTTCAATCAATCATATAACAGTTTAGATGATCAGACACTG
TTACAACACGTCGAAGGCATTGACGAGGTTGTGGCCGCATTGGAGGAGAG
ATGAATGGTTATGCAGCAATATTTATTAAGGAAAAAAGAATATAAGAAAT
TTCTGTGTGATAACGAGTTGAACGTCGATATGGATAATGAGATAAGGAAA
TACCTGAATGAAAAAAGTTACGGCCGTCAGATTGGCGATGAGCCGATTTT
TGACTCTCTAACAAATGCCACAAATGTCAAAGTTTTTACATGGGAAAGTG
CAGAAAATGGATCCTTGATACAGATTGGCCACCGCGTTCCTTCAGACAAC
AACTGGTCTAATGGTACGATCCACCTTCACAAAATGGGTCAGCATTACGA
GCCAATCGTtgccaaaaagtttcaagAAATGGCAAAGTCCTTATCACGTT
CACATGGAATTTCAATGCAAGAGACTCAGCGCATGTCAGAAGCCTATATC
CTCAAAATGGTCGATAATGAAATTCCAAGCACCTCTGGGCATTGTTCTAT
TGAAGGGAAGGATTCTCAAATTCAGactgaaaaaagacaaaagactaCCT
CGAATGCAGAGTCAGATTATTTCAATCAATCATATAACAGTTTAGATGAT
CAGACACTGTTACAACACGTCGAAGGCATTGACGAGGTTGTGGCCGCATT
GGAGGAGAGATGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12208MSTRG.12208Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12208.4.p2.exon1MSTRG.12208.4.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.4.p2.exon2MSTRG.12208.4.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.4.p2.exon3MSTRG.12208.4.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.4.p2.exon4MSTRG.12208.4.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.4.p2.exon5MSTRG.12208.4.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.4.p2.exon6MSTRG.12208.4.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.4.p2.exon7MSTRG.12208.4.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.4.p2.exon8MSTRG.12208.4.p2.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.4.p2.exon9MSTRG.12208.4.p2.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.4.p2.exon10MSTRG.12208.4.p2.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.4.p2.exon11MSTRG.12208.4.p2.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.4.p2.exon12MSTRG.12208.4.p2.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.4.p2.exon13MSTRG.12208.4.p2.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.4.p2.exon14MSTRG.12208.4.p2.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.4.p2.exon15MSTRG.12208.4.p2.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12208.4.p2MSTRG.12208.4.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000091_pilongenomesc0000091_pilon:606156..618464 +