MSTRG.12208.2.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12208.2.p2
Unique NameMSTRG.12208.2.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000091_pilon:606017..622236+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12208.2.p2 ID=MSTRG.12208.2.p2|Name=MSTRG.12208.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16220bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000091_pilon:606017..622236+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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ATTTTCATTCGGATGAATTGATGAACCACCGTCAAAAGATCGCTGTAAAA TTGATTGAATTAGGAAGTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000091_pilon:606017..622236+

>MSTRG.12208.2.p2 ID=MSTRG.12208.2.p2|Name=MSTRG.12208.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4410bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000091_pilon:606017..622236+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGACGCCTAGAGAAGTTCTTCAAAAGACTTTGAGTTTCATATTTACAAA
AGATATCGTGCTATCTAAACCGTACGGTCATGCGTTGTTTGCCAGTGACA
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ACGCTATTTCATGTGGTGTCATTTGCATAAAGTTTGCGGAGTGTGTTTTA
AGGCACGAAAACCTTCCAAGTCATTTTCATTCGGATGAATTGATGAACCA
CCGTCAAAAGATCGCTGTAAAATTGATTGAATTAGGAAGTATGACGCCTA
GAGAAGTTCTTCAAAAGACTTTGAGTTTCATATTTACAAAAGATATCGTG
CTATCTAAACCGTACGGTCATGCGTTGTTTGCCAGTGACATCAAGAATAT
CATCAATCATTGGTTGAACGATACTGTAATTGATTCCTACATTAAGTACC
TGCTCGAAAATATTTCATCCACTGCCTACATAGAATCAGCTATTATGCAC
GAATTGATTAATGGAAGTAAACAATATGTTATGCCCCCTACAGTGCAGGA
CCTATTCTTAACCGACCAGTTGATTGGATTGTATAGTGTTGGAAAACATT
GGCGCTTATTGGTTGTATATCccaaaaaacaaattatttggTTAATCGAC
CCTTTTGGAGAATCCAGCAATATCATGGAGGAAACCAAGCGAGCTTGGGA
AGCAAGCATGTTGAGAAGTTTCCCTTCAAACAAGAATAAAGCGTGGGATA
TCATCCAGGTTGAGCATGCCAAACAATCTGACGCTATTTCATGTGGTGTC
ATTTGCATAAAGTTTGCGGAGTGTGTTTTAAGGCACGAAAACCTTCCAAG
TCATTTTCATTCGGATGAATTGATGAACCACCGTCAAAAGATCGCTGTAA
AATTGATTGAATTAGGAAGTATGACGCCTAGAGAAGTTCTTCAAAAGACT
TTGAGTTTCATATTTACAAAAGATATCGTGCTATCTAAACCGTACGGTCA
TGCGTTGTTTGCCAGTGACATCAAGAATATCATCAATCATTGGTTGAACG
ATACTGTAATTGATTCCTACATTAAGTACCTGCTCGAAAATATTTCATCC
ACTGCCTACATAGAATCAGCTATTATGCACGAATTGATTAATGGAAGTAA
ACAATATGTTATGCCCCCTACAGTGCAGGACCTATTCTTAACCGACCAGT
TGATTGGATTGTATAGTGTTGGAAAACATTGGCGCTTATTGGTTGTATAT
CccaaaaaacaaattatttggTTAATCGACCCTTTTGGAGAATCCAGCAA
TATCATGGAGGAAACCAAGCGAGCTTGGGAAGCAAGCATGTTGAGAAGTT
TCCCTTCAAACAAGAATAAAGCGTGGGATATCATCCAGGTTGAGCATGCC
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GTGTGTTTTAAGGCACGAAAACCTTCCAAGTCATTTTCATTCGGATGAAT
TGATGAACCACCGTCAAAAGATCGCTGTAAAATTGATTGAATTAGGAAGT
ATGACGCCTAGAGAAGTTCTTCAAAAGACTTTGAGTTTCATATTTACAAA
AGATATCGTGCTATCTAAACCGTACGGTCATGCGTTGTTTGCCAGTGACA
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ATTAAGTACCTGCTCGAAAATATTTCATCCACTGCCTACATAGAATCAGC
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ATGTGGTGTCATTTGCATAAAGTTTGCGGAGTGTGTTTTAAGGCACGAAA
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TCAAAAGACTTTGAGTTTCATATTTACAAAAGATATCGTGCTATCTAAAC
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TGGTTGAACGATACTGTAATTGATTCCTACATTAAGTACCTGCTCGAAAA
TATTTCATCCACTGCCTACATAGAATCAGCTATTATGCACGAATTGATTA
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AATCCAGCAATATCATGGAGGAAACCAAGCGAGCTTGGGAAGCAAGCATG
TTGAGAAGTTTCCCTTCAAACAAGAATAAAGCGTGGGATATCATCCAGGT
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AGTTTGCGGAGTGTGTTTTAAGGCACGAAAACCTTCCAAGTCATTTTCAT
TCGGATGAATTGATGAACCACCGTCAAAAGATCGCTGTAAAATTGATTGA
ATTAGGAAGT
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12208MSTRG.12208Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12208.2.p2.exon1MSTRG.12208.2.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.2.p2.exon2MSTRG.12208.2.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.2.p2.exon3MSTRG.12208.2.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.2.p2.exon4MSTRG.12208.2.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.2.p2.exon5MSTRG.12208.2.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.2.p2.exon6MSTRG.12208.2.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.2.p2.exon7MSTRG.12208.2.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.2.p2.exon8MSTRG.12208.2.p2.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.2.p2.exon9MSTRG.12208.2.p2.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.2.p2.exon10MSTRG.12208.2.p2.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.2.p2.exon11MSTRG.12208.2.p2.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.2.p2.exon12MSTRG.12208.2.p2.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.2.p2.exon13MSTRG.12208.2.p2.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.2.p2.exon14MSTRG.12208.2.p2.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.2.p2.exon15MSTRG.12208.2.p2.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.2.p2.exon16MSTRG.12208.2.p2.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.2.p2.exon17MSTRG.12208.2.p2.exon17Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.2.p2.exon18MSTRG.12208.2.p2.exon18Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.2.p2.exon19MSTRG.12208.2.p2.exon19Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.2.p2.exon20MSTRG.12208.2.p2.exon20Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.2.p2.exon21MSTRG.12208.2.p2.exon21Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.2.p2.exon22MSTRG.12208.2.p2.exon22Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.2.p2.exon23MSTRG.12208.2.p2.exon23Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.2.p2.exon24MSTRG.12208.2.p2.exon24Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.2.p2.exon25MSTRG.12208.2.p2.exon25Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.2.p2.exon26MSTRG.12208.2.p2.exon26Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.2.p2.exon27MSTRG.12208.2.p2.exon27Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12208.2.p2.exon28MSTRG.12208.2.p2.exon28Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12208.2.p2MSTRG.12208.2.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000091_pilongenomesc0000091_pilon:606017..622236 +