MSTRG.12207.1.p4 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12207.1.p4
Unique NameMSTRG.12207.1.p4
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000091_pilon:564503..597071-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12207.1.p4 ID=MSTRG.12207.1.p4|Name=MSTRG.12207.1.p4|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=32569bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000091_pilon:564503..597071- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGAAAGTGGACTTCATTTTGCAAGCAAAGCAAAAAAGTGCAAAAACGAAA AAAGTCACAACTGACAAACAAACAAGAAATATCATCAAGAAAACTTATGT AGATGTAATCAATATTCAATGATGAACTAAGGTGATTTAAATTGATACTT ATATTCGTGAGTAGACTAGAGGGCTCTTAGAAGACAATCTTGGTTGTCAG GTTTTTTTTCAGTTTCTTTCTTACAGTCTCATGCAATTTTTCTTATTTCG AACAACAAAACTAATGGAATTCCATGGATAGCCAGAGTGTCAGACGTGAT GTCTAGCCTCGGTTCAACAAGTTTTCACAACACTTATACAAACGCCTGAT CACGCCTGACAGGCTAGCTCTAAACCAGACCCGATCAGTCGAACTAATCG AACCGATTTTTTAATCGAACTAATCGAACCCGATCGAACCTAATCGAACG ATTAGAGTTCGATTAATCGAACTAATCGAACTTTCAGATTTTCCTTAAAA TTGTGAGTGTTCGATTAAGTTCGAGTTTGTTCGATTAGTTCGATCAACAT ATAGTTCGATTAGTTCGATTAGATTTAATGGTTCGATTAGTTCGACCAAG ATATAGTTCGATTAATTCGATTTGATCGCCTTAAAATGACGTCACAGCCA GTGAAAGTAGGGCGTTTAGCATAGAATTGGGAAGTAAGCCACAGTAGCCG AACGGTCTATCGACCCTAGTTCACCAACCACTAGTCCGTTATGCTTCATA TTTGGACCACACCTTCCTTAAGGTGTGGCCCGACCCCATCCGGGTGTTCC GGACTTTTCAGACCCCTCTGGAACTCCCCGGCAAACCTCCGGAACTCGCG ACTTTCTGCAAGCTTTGGGGGCTCCTGCAAGGCCCCCAAAGGCCGGCGAA AGTCCGGAACGAATCCGGAAAACCGTTAATGCCAACTTTTTAAATCTCCG 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CTCTTCCCGACTGACGGGGTTAGCCCGGAAAATGGACACATTTTTTGAAA TTTGTACTAAAAATTACTAAAAAAGTGACCCTGAACTGGACTAAAATCCC AAATTTTGCTTAAGTTTTCCTCAATCTTTACAATATCAGTCCCTACCAAG TACTTAGAAAAGTACTCTGTTAAGCAGCACATCTTTTTGTCTAAGTGCAC ACCCAATAAAAATAATTTGACAAATTTTGAATATCAGTCACTTTTAAGCC AAATCATAATCAACTGATTTTGAAATTATTGAAATCATCTTTCTTTTTGA AAGACTACTACTAAAGTCCTTTCAAAAATTTCATGGTTTGGATTACCCAT TCAGGAATCTTTATAGGACAAAAATCTAAGCAATGTTATGGGTAAATCTA AGGATAATTATAGAAATCTTTATGTTTAAGGATTCTTGCAACTCCACCAC AACACCGCCAAGCTTCGAAGAGTGTTTTTATCAAATACGGAAAGAAATTA CTGGTGCAAGTGATCAAAAGACATTCAAAGGTTACGAATTCCTCGAATTC CTTTCACCAGGTTGGCTGCAAAATAAAATTGAAGCCAAGCAAAACGATGC AGAGCTTTTACAGTATTATAACCAATTGAATGAAGACAGGAATCGAAACA AAAAACAACGAAAAGAGCAGTCGAAGGCTGTTGGGAGAAAACTTCTTCGT GATTTCACCGATTGCAATAAGATGGCACAAAGCTTGAAACTGAAGTCAGA GGACGAACGAGCATTGATTATCTGTGAGTTTTCTTTTTTTTTGTTGGCAC ATATTTCTTTTCGACATTTTCTTTTTTGTTAGATACGAAACCAATCACTC TCAGACTGAAATGATTTACACGTTTTTTATAAGAACATTCGGATGTTCTT AACATGTTCTTATTATTTTTAATTATTTTTTTATATTCTTAGTATTTTTG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000091_pilon:564503..597071-

>MSTRG.12207.1.p4 ID=MSTRG.12207.1.p4|Name=MSTRG.12207.1.p4|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2124bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000091_pilon:564503..597071- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CCCGAAATCATGCGCTTTGAATGTTAGAAAAATAGAGGATTCACAGTCAA
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CCAATCAATGAACCATGCTACACCAAATGCATGGATTGGTGAACGTCTTA
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TCAAGATATTGGGAAACATATTAAACTAACGGAAGTATTTGAGGCTCTTT
GGGTAGCTGAAAACAAAGAATGGAAAAAATTCCCGAAATCATGCGCTTTG
AATGTTAGAAAAATAGAGGATTCACAGTCAAGAAATTCCAAAGGCTTTTC
ACATCTTTCAGTAAGTAGCATCTCTCTCATTCAACTTATTGAAAGTAATT
TTTGAGCACAGTAATCATCGGTTAAATCTACATACATTCTTCAAAGGGTT
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AGAATTTGGATCCACAGAATACATCAATCAATTGAATGATCTTCTCAGTG
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ATGGAAAAAATTCCCGAAATCATGCGCTTTGAATGTTAGAAAAATAGAGG
ATTCACAGTCAAGAAATTCCAAAGGCTTTTCACATCTTTCAGTAAGTAGC
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ACACCTGTTACTGGGGCAAGAGGATCTATTTCTTCACTGACATCACACAA
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GTGAACGTCTTATGTGATGGCAACACCGTCCACAACAAATATTGTACAGC
TACAGGCTTTACAACTTTATCACATAATCAAAGAATTTGGATCCACAGAA
TACATCAATCAATTGAATGATCTTCTCAGTGATAGGATCAACTATGCAAC
TGTTTCTGATGTTCAAGATATTGGGAAACATATTAAACTAACGGAAGTAT
TTGAGGCTCTTTGGGTAGCTGAAAACAAAGAATGGAAAAAATTCCCGAAA
TCATGCGCTTTGAATGTTAGAAAAATAGAGGATTCACAGTCAAGAAATTC
CAAAGGCTTTTCACATCTTTCAGTAAGTAGCATCTCTCTCATTCAACTTA
TTGAAAGTAATTTTTGAGCACAGTAATCATCGGTTAAATCTACATACATT
CTTCAAAGGGTTTGATCTCTCAAATTGGAATACACCTGTTACTGGGGCAA
GAGGATCTATTTCTTCACTGACATCACACAATTCATCATTGCTCCAATCA
ATGAACCATGCTACACCAAATGCATGGATTGGTGAACGTCTTATGTGATG
GCAACACCGTCCACAACAAATATTGTACAGCTACAGGCTTTACAACTTTA
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ATCTTCTCAGTGATAGGATCAACTATGCAACTGTTTCTGATGTTCAAGAT
ATTGGGAAACATATTAAACTAACGGAAGTATTTGAGGCTCTTTGGGTAGC
TGAAAACAAAGAATGGAAAAAATT
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12207MSTRG.12207Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12207.1.p4.exon28MSTRG.12207.1.p4.exon28Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12207.1.p4.exon27MSTRG.12207.1.p4.exon27Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12207.1.p4.exon26MSTRG.12207.1.p4.exon26Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12207.1.p4.exon25MSTRG.12207.1.p4.exon25Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12207.1.p4.exon24MSTRG.12207.1.p4.exon24Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12207.1.p4.exon23MSTRG.12207.1.p4.exon23Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12207.1.p4.exon22MSTRG.12207.1.p4.exon22Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12207.1.p4.exon21MSTRG.12207.1.p4.exon21Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12207.1.p4.exon20MSTRG.12207.1.p4.exon20Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12207.1.p4.exon19MSTRG.12207.1.p4.exon19Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12207.1.p4.exon18MSTRG.12207.1.p4.exon18Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12207.1.p4.exon17MSTRG.12207.1.p4.exon17Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12207.1.p4.exon16MSTRG.12207.1.p4.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12207.1.p4.exon15MSTRG.12207.1.p4.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12207.1.p4.exon14MSTRG.12207.1.p4.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12207.1.p4.exon13MSTRG.12207.1.p4.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12207.1.p4.exon12MSTRG.12207.1.p4.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12207.1.p4.exon11MSTRG.12207.1.p4.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12207.1.p4.exon10MSTRG.12207.1.p4.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12207.1.p4.exon9MSTRG.12207.1.p4.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12207.1.p4.exon8MSTRG.12207.1.p4.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12207.1.p4.exon7MSTRG.12207.1.p4.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12207.1.p4.exon6MSTRG.12207.1.p4.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12207.1.p4.exon5MSTRG.12207.1.p4.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12207.1.p4.exon4MSTRG.12207.1.p4.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12207.1.p4.exon3MSTRG.12207.1.p4.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12207.1.p4.exon2MSTRG.12207.1.p4.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12207.1.p4.exon1MSTRG.12207.1.p4.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12207.1.p4MSTRG.12207.1.p4-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000091_pilongenomesc0000091_pilon:564503..597071 -