MSTRG.12165.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12165.2.p1
Unique NameMSTRG.12165.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000090_pilon:1192361..1223932-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12165.2.p1 ID=MSTRG.12165.2.p1|Name=MSTRG.12165.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=31572bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000090_pilon:1192361..1223932- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATACACGAAACACCAAAAATCCACATAAACCAGCATTCGAATTACACATG TTATAATGTATGAGAAAAAAGAAAGGGGAAAGAAAAGTATAGAAAATTGG AGCATTGGTTCATTTGACAATGGCTTGGAGAAATCTTTAATGTAGAACCA AGGTATAGTGTGAACAATTTTTTCCATCTTTAATACCTTGTATTGTACAA CATTTAAAGTCTGATAACAACTTCGAATTCAGCAAAAATTGAAAAAAGGG GGACCCACCCCCTCTTTTTGGTATCGATACCAACTTGACTTTTTGAAATT CGAAAAAAAATTAACCCACCCTGAAGATGAAAAAATTCTTTTCCCAACTC TTATTGTGTTTTCCCTCCCAAGAAATGTTGAAATTCCCCTTCAGCTTTCA CAATTTATTGGTTTCTAGGTTATATTTCAAGCCCTACTGGACCATTTTTG AACTTTTGGTTCCTCAGATCCTAAGGTCCTAAGTCTTAAGTCTAGCGTTA AAACTCAAAGTTAAAACTCTACCCTTCGAACCTACTTTAGAGCACTTACA AATCGATTGTGGTTTCAAAACACCCCGGGTGATTTCCTTTTTGTGCCAAG TATTTTGTCACCGATTGTGGATCAGAGCAAATAATTGTTATGCACCTTTG ACATTTGCATTGCAGATTAACATGTAGTGTTTGAAAAAATGTCACTACAA GAGAAAAGAATAAATTGCTAATTATCCAAGAACAAGAACATCTGCCATGT GATTCGAGGAAGAAAAAACACGCATTTGTAACAAAAAGATGACAGAAGAC TGTCAAAAAGTCAAAAAGTTCTCCCCCCAACAAATTTTGTTGCACCTTTT TGAAACCCCCCATCCTGGATTTTCTTTTTTCCTTCCCACGATTTTACAGT GTCATTTTCTGTGTTTTGATTTCTTTTTGTCATGTTTGTTTACATTTTCT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000090_pilon:1192361..1223932-

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ACAATAAACTCAACAGTAGTGACAACAAAGCAAACAACGCCTATAACGGC
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TCTCAACGACGACAACAACAACAATGATCACTCGACAATCCTTAGCAACA
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AATGCCACACATCAACTTATTCGAATGATATCCAATCTTGTTTGTTACTC
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GTATTATGGTCTTGAAACGCTAAACTTGAGGAGCGGTCAATCAATCGGTT
ACGTGGTTCACGACAAAAATACCGACAGTCGAAAATTTAAAGGATGTGTT
ATCTCCCCAATGTCATCTTACTGGGACACCAGACAATGGAGTTCTTTGTT
TACTGGTGGTAGAGTTTTGGAGAATTTTCGATTCCTTAAAACTGGCGATG
GATTGAAAATGATTATGAAAGCTTTGTGCACTGATAAAACGTGTGTAAAA
TGTCAGTGCCGAAGCCAGGAAACGTATTTTCAACAGTATTGCTACCCTGA
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CGGCCATACAAATAGAGAAACGGAGAGGGACCAGAAAGAGCCAGAGATGT
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TTATTTGGGAACGGCGCCCCTTCCAGAAAAAACGATCCAAGACATTTGTT
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ATTGGTCATTCTTATCAGCCTCATTTTGTGCATCGTTTTTTGGTGTTGTT
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CTTGAAACGCTAAACTTGAGGAGCGGTCAATCAATCGGTTACGTGGTTCA
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GATTATGAAAGCTTTGTGCACTGATAAAACGTGTGTAAAATGTCAGTGCC
GAAGCCAGGAAACGTATTTTCAACAGTATTGCTACCCTGATCTACTTCAT
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AATAGAGAAACGGAGAGGGACCAGAAAGAGCCAGAGATGTTTGCTACTTC
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TACAGTTCTACCGAAGATACCACTCATCCAGCAGCCATAAATACTGATTT
CAGTCACATCCGCGCCCCAAATTATTGTGATGAGGATGAATTATTTGGGA
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ACGCGAAAGAGAGGCGAGAAATGATGACAGCGTTGATTTTATTGGTCATT
CTTATCAGCCTCATTTTGTGCATCGTTTTTTGGTGTTGTTGTTGCAGAAG
GAAAAGACAATCCTATCGCCCCAACAACAACGACAACTACATCTACAACA
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GACAACAAAGCAAACAACGCCTATAACGGCTCATGCAACAAATCTCACAA
CATTATCGACCAACTCCCTACCAACAGTGTTCTCAACGACGACAACAACA
ACAATGATCACTCGACAATCCTTAGCAACACACACAACAACAAGACAACC
ATCTTCCTCCCTCGTACCTAATACTGAATTTCAAGGAACATCACTTCTAT
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TCGAATGATATCCAATCTTGTTTGTTACTCAAAATTGCTGGCGAAAGAGA
ATAATGTGGTCTTGCGATTGAAGACAGTCAGTATTATGGTCTTGAAACGC
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GCTTTGTGCACTGATAAAACGTGTGTAAAATGTCAGTGCCGAAGCCAGGA
AACGTATTTTCAACAGTATTGCTACCCTGATCTACTTCATACTACAATTA
GTTGACCGACCAGCATCGAGGGCATACGAAAGCGAAGACAATTCGTCGTA
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AAAATTTGGCTGTCAATAGCAGCACCAGGTCGGCCATACAAATAGAGAAA
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AAATTAAAAGGGTGCCACTTTGATCCAATCAACAGCTTCTTACAGTTCTA
CCGAAGATACCACTCATCCAGCAGCCATAAATACTGATTTCAGTCACATC
CGCGCCCCAAATTATTGTGATGAGGATGAATTATTTGGGAACGGCGCCCC
TTCCAGAAAAAACGATCCAAGACATTTGTTGATTCTGAGTACGCGAAAGA
GAGGCGAGAAATGATGACAGCGTTGATTTTATTGGTCATTCTTATCAGCC
TCATTTTGTGCATCGTTTTTTGGTGTTGTTGTTGCAGAAGGAAAAGACAA
TCCTATCGCCCCAACAACAACGACAACTACATCTACAACAACATCAACTA
CAACGCCTCCAACAACACTCACAATAAACTCAACAGTAGTGACAACAAAG
CAAACAACGCCTATAACGGCTCATGCAACAAATCTCACAACATTATCGAC
CAACTCCCTACCAACAGTGTTCTCAACGACGACAACAACAACAATGATCA
CTCGACAATCCTTAGCAACACACACAACAACAAGACAACCATCTTCCTCC
CTCGTACCTAATACTGAATTTCAAGGAACATCACTTCTATACACTGGAAT
GTTGATCAAACTGCAGCTGGAATGCCACACATCAACTTATTCGAATGATA
TCCAATCTTGTTTGTTACTCAAAATTGCTGGCGAAAGAGAATAATGTGGT
CTTGCGATTGAAGACAGTCAGTATTATGGTCTTGAAACGCTAAACTTGAG
GAGCGGTCAATCAATCGGTTACGTGGTTCACGACAAAAATACCGACAGTC
GAAAATTTAAAGGATGTGTTATCTCCCCAATGTCATCTTACTGGGACACC
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GGTGCCACTTTGATCCAATCAACAGCTTCTTACAGTTCTACCGAAGATAC
CACTCATCCAGCAGCCATAAATACTGATTTCAGTCACATCCGCGCCCCAA
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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12165MSTRG.12165Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12165.2.p1MSTRG.12165.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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MSTRG.12165.2.p1.exon6MSTRG.12165.2.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.12165.2.p1.exon4MSTRG.12165.2.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12165.2.p1.exon3MSTRG.12165.2.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12165.2.p1.exon2MSTRG.12165.2.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12165.2.p1.exon1MSTRG.12165.2.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000090_pilongenomesc0000090_pilon:1192361..1223932 -