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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000090_pilon:651585..658140+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12137.2.p1 ID=MSTRG.12137.2.p1|Name=MSTRG.12137.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6556bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000090_pilon:651585..658140+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAGCCAGTAAATCTGGGATGTGATCTATACAGGGGTAAAAGGGAGCTGTA
GAAGTTGGAATTTCAGTCTTTTAGCAAGCATTTTATGTTTGGAGTTCTTT
AAaactaaaatatatatttttcttctttttagtttCACACTGACTGGATG
TTTTCTTCAGCATGGATCAATGATAACACTTTGGCAAccggtatgatttt
tttttcttactttctaAACATACATACGTTTTTATGGGCTCATATAATAC
AATACACATTCCTttaataagcaactccaatttttgggtcagggctgggg
ttgcttaAGCATTCTAggtcattttctgaaaaatttgctttgaccacccc
tgatattattGCACATTTATGGTTATTTtggtcaagggctatcgtttgcc
atgtTAGATTATCTAAGGAGCCTCAACTTTACAATATAATTAAAATAATT
GGCTAATTTCAGAGCTCGATCCTTAGCAacttggttgcttataaaaatgt
gtagTTATAGTTCATATTTTTCTATGTGTAAATTATGACCCCACACACAA
GATCTTTTCTAGGTTACACAAGAATTATCAGAAATAGGAGAATTATATAA
AAGCGAGAAAGTCATTTTTCACAAATCTGCTTTCATATAAAATGATATAT
GCATAACAGTTGTACAATGAACTACCCTGAGCTCTCTTTGTTATCTTTTG
CAAAGTATAATTATATTGAAATCTATTTTAATGAGATTTAACAGAGTTTG
CAGAGAGATTTATTTATCATCTGATTTTTCATGTTTGAAAAAGGGTTTTC
CTTTTAATTACATTTATCAAATTTCAGCTTTTGCTCTATTTGCATAGCAA
CGAGAGACTGTTTCAAACGTTTGCACATAAGATTAAAATTTCGACTTTTA
GATTAAAATACAGTTGACAGCCCAGCTcattaaaacttgaaatttgtTTC
CAAAATAAACATTCAATTTTCCCTGTCACCACCACTATCATTAGATTAAG
CTAATTAAATCTCGATCGTTGATAAGGAAGTCGTTGACGGGAAAGTCCCA
CGCGTCTGTTTTTACAAAGATTTATACTGCCTAAAGATCTTTGTTATGAC
AAAGTTATGCTGACTGATGAACTAGAAGAGAAAATAACTTCTCTGTAAGA
AACAAATCTGACTTTCTTTCTGATAACTCAGCAGAACATTttaataaacg
tttttttataagaacaaactatataagaacttaaggcttcgatggcgaaa
ataagaacatgttaagaacatccgaaggcttcagaaATTATGGAtgctct
cataaaaaaacgtataaacCGAGACTTTGTGACCTTTAACAATATGTAGA
CTCACCCCTCAGAGACCTACCTAGTAGATTGAGTTTTTTATCTTCTAGAT
TgatcaaaactttgaaacctCCATCAACTATACCTAAGACGTGTAACGTT
TTTACTCTATTGATGaaaaccccttctcacagactcagcTTGGGATTTTT
GAGCCAGTAGggttaaaaataacggaccaaaactcgacaGGGATTAACAT
TCCCATGCTTTTGTATGGCTGGGAATTTCAATTCGATCGTTTTCGAGCCG
GAAATTAAGTGGGGATTGAAAGAAtaacacaatattttgcagtgaggatt
tgcttatctgattattttcatcgGCGACAAAAATTATAGAATGATtgttc
cactggggacgatattttggccaatttttccagcgAGGAGAGGTCCCGGt
ggttctgtgagaaggggtgtacgAAATAATGAAATGCAGCGTTTGTTTTA
CAGGTTCTCGAGACAACCGACTTGCTTTTTGGACCATCCCCGACGAAATA
CCGCATTCAGAGAACGATGAAGGGGAACGGGGAAAACTTTATCCAATTGT
TCAACCTGTACAACATTTTCAAGGGGTTGGAAACAAAGACAAAGTTCGCG
CTATGGTTTATAATAGTCTCTCTGGGGTATGTTTTAAAGCTTCTTTTTCA
CATTCGTTTTTTATTAAGGACCGTTCTTTATACCGTTCCATGACAACTTT
CGAGATTTGATTCAATTAGatgtaaatttattttgtattttgttagTCAA
TTCATGAATCAATTCACCTATAATACAAGTTTGCAAGCGTGATCGAGCCG
ATAGGTTAAGCTTTGTCCCATTTTTGGAAAGCATATGAATTTACCTCCTG
TTTTTCTGTACACAATGATCATTTAAGTATGACTTATTCGtatagatttt
ctttttgattacaGTAAGATACGTAAATTCTGCCTTTgaagaaaacattc
gatttgcgtGAAGAATCGCCTTTTCAAAATCGAacattatttcattattt
tattctGTGTAAATTACGTAGATTAACCAAACAcacaaaaaatcataata
ttttCTCTTACTCGTACCAGCACTTAGCGACCATCGCATCGAACGGCTAC
TTGCACCTTTGGGATGTTAACACGTGTCAACGAGTGagtatcattttttt
tcaaataagttACTTGGTGCTCTTGGACGTATTAGTATAGtattaatttt
atttattaattagCCGTTTTTCGATGTAACAAAAGGTCAACGGAAAGTTA
CAGTTTCATTCCTTAAAAGATTGAAATATGTCATTTGTCATTAGGcgaga
caaatttaatttgttgttctacgggcagatcgttagaaaaatacGGGTCG
GTCAGtcagtaaaataagaataaatctttcatttatcagggttggtataA
AGGtaccgaaaatattttccaaaaaatacctggatcaaaaattcatattt
tttcttcgatgaagatcataataaaattttagtgtatggaatgctcgatt
ttctaaatttttcaatttcttgaattaattttcagctttattcaaattta
attcttacagataactagtgtgtaaaatatattgtagtggaaattcaata
ttattatttttttgattttagcaaaaatagggtcggtcgggccgtagaac
aaaaaattaaattggttTCGCCTTAGTCAACAGAAATCACCTAATTGACT
TAAGAAGTCGACTTTCTGTAGACTTCCGTCGAGAATAAGAAAGTCAACGC
AAAAAGAAcatctaaactagagctaagcaATTCTTGGTCTAAAATTAACG
ATGATAGAAGAGCTTCGTTTCTCTTCAGAAAGATATgactatattttttt
aaactcgaTTACAATCCCCGTGTTGCGTAAATTgtacagtcgactctctc
taattcgatcttcaagggaccaaggattttgttcgaattagagaaagatt
tgaattacagagagtattttatactgATTTCTAGTCGAGGGggccaatat
tttagttcgaattatagaaggattcgaaaggttcgaattagagagggttg
ACTGTAGTATTACTCTTCATAACTCTCTTCTCGTTTTATTATAGACGATG
ACAACAACGCTACCATTTATGAAAGAGAATGTTTGTATAGCAcacgagaa
aaaaaataatttgctgTATGCTGTTGGATCTCTATCTCACGTCTCTCTGG
TAGATACTCACGGAGGGAAGTCGGTCGCTAGTCTATGTTCCAGTGAACAA
GGAGCTGGTAAGTGAAGACGGgattgaaaatttctatctttaTTAATGAT
TAAAGATTATGGGGACAAGGTTACTCACtttttttGGAGGGTCTAAAGGT
ATATGATGGTTgatttcttcatcaattttccttaaaatctTTATGTTTAG
GCAAACGAAATCTAGGGTAGTAGTAATTTCTTGAAATAACATAATTTCGT
GGTACAGTAgagtctttttaactcgaaaccCTATAAcacaaatgtctcct
taactcagacaagttttcttgtcccttcagttaacaatgccttgtgaact
ttactccataactcgaaaaaattgtgtttcccgtgcgtgttcgagttata
gagactcatGTGTATACAACTTTATAAAAttataactttataaaaaaaag
acaaaaaatcatATTGGACATCATTTTGTTAACAAATGTCCAAGGGGTCA
AAAGTTGGGTTCAAGATTGAGGATATTCATCAAGATAGATTTCGCTCTAT
TATCTTATCAAGATAGATTTCGCTCTTTTATCTTGCTATACAATATGcgg
ttttttaattattcaggCTTTTGGGGATTATCGTATAAAGAGAATTAAAA
CTCGATTTTCTTATGATCTTGTTATTATCTTGATCCCTTTCAGAATCAAA
ACAATCTCCAATCTCctattatcatgaaaatttagCTTTAAAAACCCTAT
TTTACTTTATAATAGCAAAAATGAAATACCCCATTTGAAAAAATCTCTTA
CTGGGCCAAATaagtttaaataaaaatttaaccCCCTTTGCTCTATGTTT
TCTTGTATTTTGTCgtatatttttgcttttctttacacttcaaaacttta
taaatcttcaaattattattttctacGCTGGAGTCTTTATAAAAGTCCAA
AGAACACGAATaactaaaatttgttcaatttatgTATTGAAGTTCAAgaa
gttaaggagacattcgagttataggaGATATTCGATTCACAGAGACTTAA
GTTGTGGAGATTCTACTTAGAAAATCGCTCAACTTAAAACAGTATATTAA
CTTGaatttctttctctctttttgcaGGCGTACGGTCAGTCAGTTTTAAT
GATTGCATTGTGACAGTTGGGACTGGGTACGGGTCATTATTATTTTACGA
CATTCGAATGAACAGACTTCTTCAGCGGCAAGATGGAACACAATGTCAAC
TCAAAGTCGGTCACGGTTGGCTGGTAAGTAcaatcgatttttttttcgag
tcTCGATTAATGCGATTATTTTTCTTCAGCTTAAAGGGCTTAATCAAACT
GTTTGACGACCACGACCAAGTGGTAATTTGCTCCTATTGTCCTGAAAAAA
CCACAAACCTTTACCTAAATCCCTTTATAAAACTTTGTGCGTgaaacggt
gaaaaagaatgcggctattcataatatgcaccattgcaaagtcttccacg
gacccaacagctgattggttgaaagtgacgtattgacatattttacgtca
cttacaaccaatcagctattggggcAGTGATGTCATGTCAGAAGACAttt
caatggtgcatatcatgaattataatttgatgttcccctttttaaaaatt
tgttaatAATCCGGCAtcacaattttttcaattgttAAAGTTTGATGTCA
GTTGTTTTCTTGACTCATTTCGAATCCTTGTTTCAGTTCAGTCATTAGGT
AGCTGACCTGACTGATCTGGAACCCAGTGCATACAATCGAAAGAATGTCT
AATGTCTAAAAGTTCTGCATTAATGTCTGCTATCCATGTAAAATACCGAC
TCTAAACTTTTCTCTACCTTTTCCTTAGCGGCGTGATTTAGTTTACCAGC
AGTATTTCTGGGAAGCAGAATGTTATCCGAACGCTATCTATGCACACAGT
TATCATCCAACCACCATGAAACTTCTGTCGGCTGGTGGTCCACTAGCTCT
GGGGTTATATGGTAATTATCTGGCTTACTGGGATTGATGCTCATATGTTA
TACTTAGATCTGTTAATATATATGATTTGATGATATACATGTTACATACT
TGGTGTTATATGACACATTATGCCTTCAAATGATGAATGGTGCGTACATA
TCATGAATGTTGGTATGGTACATCTTGTTGTTATGGCGTCCAGCAATGAT
GTTACGGAAATTTTGATCTACTAAAGTAAAGACCTCACTACACTGGTTTC
GAAAGGTAACAAATTTCTGACTTGTTTTAGGGTCAAATGTTTCTTTCCTT
TAAGATTTATGCGAAACATATTACATCAAGAAAAACGTGTTACAGCAGAC
TACAAATTCCTTGCTGAATTAGATAATTGCTCATTTTAAGGGCGAATATT
ACATACTTTAGTAAACTCAAACTTCGAAATTTCTAACTTTAAATACACTG
TTTGTATCGGGTACGGGTGAAACTTTTGTCGCTTTCATTTCTGTAATCGA
TAGCTATTTTTGACCCATCCCCATTGTTATTTGGTtaattgtgttttttt
ctttctccgTCCAATTTGTAAATATTGTATATATGGTAGAATACAGTCAA
gttttttaaagtgaaattgtTCAAAACTTTCCTCAAGGAAACTGAAAAAT
ATTGGTCTTGATAGACTATATTTTATAGAAATTAAACTGATCCTGACTGA
TTCAAAGACAAAAAATGGAAGAATATAGGCCCGTTCAGTACCGTTTGATT
acactcttctttttttttacaagaacaattttattagaagaaaatgccaa
aagataagaacaacttaagaccAATGTTTAGCCTCAAACGGGCGATCTTA
AGGCAAATTAAAGGTCAAATAGATAAAATAAGGTATTGAAATTCAAGAAT
ATCTCTAATTTTGAACGACgaaagaattatttttccaaCAACCTACAGTA
TAGTATGTTAAAAGAGAGCTTTCTATTATTGTATTGTGTGtaaatataga
agagat Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000090_pilon:651585..658140+ >MSTRG.12137.2.p1 ID=MSTRG.12137.2.p1|Name=MSTRG.12137.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3852bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000090_pilon:651585..658140+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTTTCTTCAGCATGGATCAATGATAACACTTTGGCAAccgGTTCTCG
AGACAACCGACTTGCTTTTTGGACCATCCCCGACGAAATACCGCATTCAG
AGAACGATGAAGGGGAACGGGGAAAACTTTATCCAATTGTTCAACCTGTA
CAACATTTTCAAGGGGTTGGAAACAAAGACAAAGTTCGCGCTATGGTTTA
TAATAGTCTCTCTGGGCACTTAGCGACCATCGCATCGAACGGCTACTTGC
ACCTTTGGGATGTTAACACGTGTCAACGAACGATGACAACAACGCTACCA
TTTATGAAAGAGAATGTTTGTATAGCAcacgagaaaaaaaataatttgct
gTATGCTGTTGGATCTCTATCTCACGTCTCTCTGGTAGATACTCACGGAG
GGAAGTCGGTCGCTAGTCTATGTTCCAGTGAACAAGGAGCTGGCGTACGG
TCAGTCAGTTTTAATGATTGCATTGTGACAGTTGGGACTGGGTACGGGTC
ATTATTATTTTACGACATTCGAATGAACAGACTTCTTCAGCGGCAAGATG
GAACACAATGTCAACTCAAAGTCGGTCACGGTTGGCTGGTAGCTGACCTG
ACTGATCTGGAACCCAGTGCATACAATCGAAAGAATGTCTAAATGTTTTC
TTCAGCATGGATCAATGATAACACTTTGGCAAccgGTTCTCGAGACAACC
GACTTGCTTTTTGGACCATCCCCGACGAAATACCGCATTCAGAGAACGAT
GAAGGGGAACGGGGAAAACTTTATCCAATTGTTCAACCTGTACAACATTT
TCAAGGGGTTGGAAACAAAGACAAAGTTCGCGCTATGGTTTATAATAGTC
TCTCTGGGCACTTAGCGACCATCGCATCGAACGGCTACTTGCACCTTTGG
GATGTTAACACGTGTCAACGAACGATGACAACAACGCTACCATTTATGAA
AGAGAATGTTTGTATAGCAcacgagaaaaaaaataatttgctgTATGCTG
TTGGATCTCTATCTCACGTCTCTCTGGTAGATACTCACGGAGGGAAGTCG
GTCGCTAGTCTATGTTCCAGTGAACAAGGAGCTGGCGTACGGTCAGTCAG
TTTTAATGATTGCATTGTGACAGTTGGGACTGGGTACGGGTCATTATTAT
TTTACGACATTCGAATGAACAGACTTCTTCAGCGGCAAGATGGAACACAA
TGTCAACTCAAAGTCGGTCACGGTTGGCTGGTAGCTGACCTGACTGATCT
GGAACCCAGTGCATACAATCGAAAGAATGTCTAAATGTTTTCTTCAGCAT
GGATCAATGATAACACTTTGGCAAccgGTTCTCGAGACAACCGACTTGCT
TTTTGGACCATCCCCGACGAAATACCGCATTCAGAGAACGATGAAGGGGA
ACGGGGAAAACTTTATCCAATTGTTCAACCTGTACAACATTTTCAAGGGG
TTGGAAACAAAGACAAAGTTCGCGCTATGGTTTATAATAGTCTCTCTGGG
CACTTAGCGACCATCGCATCGAACGGCTACTTGCACCTTTGGGATGTTAA
CACGTGTCAACGAACGATGACAACAACGCTACCATTTATGAAAGAGAATG
TTTGTATAGCAcacgagaaaaaaaataatttgctgTATGCTGTTGGATCT
CTATCTCACGTCTCTCTGGTAGATACTCACGGAGGGAAGTCGGTCGCTAG
TCTATGTTCCAGTGAACAAGGAGCTGGCGTACGGTCAGTCAGTTTTAATG
ATTGCATTGTGACAGTTGGGACTGGGTACGGGTCATTATTATTTTACGAC
ATTCGAATGAACAGACTTCTTCAGCGGCAAGATGGAACACAATGTCAACT
CAAAGTCGGTCACGGTTGGCTGGTAGCTGACCTGACTGATCTGGAACCCA
GTGCATACAATCGAAAGAATGTCTAAATGTTTTCTTCAGCATGGATCAAT
GATAACACTTTGGCAAccgGTTCTCGAGACAACCGACTTGCTTTTTGGAC
CATCCCCGACGAAATACCGCATTCAGAGAACGATGAAGGGGAACGGGGAA
AACTTTATCCAATTGTTCAACCTGTACAACATTTTCAAGGGGTTGGAAAC
AAAGACAAAGTTCGCGCTATGGTTTATAATAGTCTCTCTGGGCACTTAGC
GACCATCGCATCGAACGGCTACTTGCACCTTTGGGATGTTAACACGTGTC
AACGAACGATGACAACAACGCTACCATTTATGAAAGAGAATGTTTGTATA
GCAcacgagaaaaaaaataatttgctgTATGCTGTTGGATCTCTATCTCA
CGTCTCTCTGGTAGATACTCACGGAGGGAAGTCGGTCGCTAGTCTATGTT
CCAGTGAACAAGGAGCTGGCGTACGGTCAGTCAGTTTTAATGATTGCATT
GTGACAGTTGGGACTGGGTACGGGTCATTATTATTTTACGACATTCGAAT
GAACAGACTTCTTCAGCGGCAAGATGGAACACAATGTCAACTCAAAGTCG
GTCACGGTTGGCTGGTAGCTGACCTGACTGATCTGGAACCCAGTGCATAC
AATCGAAAGAATGTCTAAATGTTTTCTTCAGCATGGATCAATGATAACAC
TTTGGCAAccgGTTCTCGAGACAACCGACTTGCTTTTTGGACCATCCCCG
ACGAAATACCGCATTCAGAGAACGATGAAGGGGAACGGGGAAAACTTTAT
CCAATTGTTCAACCTGTACAACATTTTCAAGGGGTTGGAAACAAAGACAA
AGTTCGCGCTATGGTTTATAATAGTCTCTCTGGGCACTTAGCGACCATCG
CATCGAACGGCTACTTGCACCTTTGGGATGTTAACACGTGTCAACGAACG
ATGACAACAACGCTACCATTTATGAAAGAGAATGTTTGTATAGCAcacga
gaaaaaaaataatttgctgTATGCTGTTGGATCTCTATCTCACGTCTCTC
TGGTAGATACTCACGGAGGGAAGTCGGTCGCTAGTCTATGTTCCAGTGAA
CAAGGAGCTGGCGTACGGTCAGTCAGTTTTAATGATTGCATTGTGACAGT
TGGGACTGGGTACGGGTCATTATTATTTTACGACATTCGAATGAACAGAC
TTCTTCAGCGGCAAGATGGAACACAATGTCAACTCAAAGTCGGTCACGGT
TGGCTGGTAGCTGACCTGACTGATCTGGAACCCAGTGCATACAATCGAAA
GAATGTCTAAATGTTTTCTTCAGCATGGATCAATGATAACACTTTGGCAA
ccgGTTCTCGAGACAACCGACTTGCTTTTTGGACCATCCCCGACGAAATA
CCGCATTCAGAGAACGATGAAGGGGAACGGGGAAAACTTTATCCAATTGT
TCAACCTGTACAACATTTTCAAGGGGTTGGAAACAAAGACAAAGTTCGCG
CTATGGTTTATAATAGTCTCTCTGGGCACTTAGCGACCATCGCATCGAAC
GGCTACTTGCACCTTTGGGATGTTAACACGTGTCAACGAACGATGACAAC
AACGCTACCATTTATGAAAGAGAATGTTTGTATAGCAcacgagaaaaaaa
ataatttgctgTATGCTGTTGGATCTCTATCTCACGTCTCTCTGGTAGAT
ACTCACGGAGGGAAGTCGGTCGCTAGTCTATGTTCCAGTGAACAAGGAGC
TGGCGTACGGTCAGTCAGTTTTAATGATTGCATTGTGACAGTTGGGACTG
GGTACGGGTCATTATTATTTTACGACATTCGAATGAACAGACTTCTTCAG
CGGCAAGATGGAACACAATGTCAACTCAAAGTCGGTCACGGTTGGCTGGT
AGCTGACCTGACTGATCTGGAACCCAGTGCATACAATCGAAAGAATGTCT
AA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000090_pilon | genome | sc0000090_pilon:651585..658140 + |
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