|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000089_pilon:697599..700275- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12048.1.p1 ID=MSTRG.12048.1.p1|Name=MSTRG.12048.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2677bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000089_pilon:697599..700275- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GCGCAAAGTTTTCTTTTTTTAACTTTAGAGATTTTTCTCCATTCGTAATT
TTCCACTTATCTTGGACTAGAATTCTTTTTTATTTTGGGGTTGTTTGCTG
ACCGAAGAAATCCAAGGTATATTGTCACTTCTTCTGTTTTTCTTGCACTT
TAAATAAATGATTGTTAGGCCGTTTATCTATCAAGCAAATATTTTTTCAA
AATTTCTTTAATCTCGTGTATGTATGATAACCTCTTTATGACAAAGAAAG
CTTATCTTCAAAAGAGTTATACAATAAAAGATTGAAGGCAAATGATATTA
TAAATGATGAGAAAAATATTTCATACCTTTCCTCCTACTGTAAGCTTGTC
CCTTTTTCTTTAGATGAAATTGACATTGGTCTGTGTGGCTTTATTCGTCG
TTTTCTACGGCGCCGAAGCTCTTAAACTAAGAAAAAAGAGTAAGTTGTTA
GTTTAAATGGTGCAACGAGATTTAACCTTGTATAGTGATAAAGAAAATCT
GAACGTTTCAACTTATTGTTCGATTTTTAATGAATACACGTTTTTTTTAA
GAAAGTTTTCGCCTTAGCCTTTTCTTAAATGTTTCTTACATGTTTCTAAA
CTTTGTCAAGCTTAAAGGACACTTTCTCAAGTATTTCTAACTGTTATGTA
AGTATTTTTCTGGAACTTTGATTGGAAGGTTTCTTAAAAAAAAACGAATT
AAAAAATGTTATCTTCTCATTCTCAGCCTCAGTATGTTTCTTAGTTTTCA
GGCATTCTGAGCCTCATGTTTCTTAAAAGTGAGTTTCTTAAAAAAAACGT
GTAATTTTAAACAGGAAAGCATGAGCGCTAATAGTAAAATTTTATGAAAG
GAAGCCATGGTTAAAGATTATGACAACGATTTATTTCTTTTGTTATTTCA
AGGAAACATTCCATTGAATGCTTACTACTTACCCAAAGACAAAAACTTGG
AACGAGAACTTGGTAAGTGTACATCTATCAACATTTTTCATTTTGATTTG
ACTTTCTTGTTTACTTTTTATTTTTATCTGAACCTGAAAGAGAGAGAGAA
TACAAAAAAGCAATACTTCATTGTTTATTATTAATTCTGAATATCATCAT
AAATAACATGTTTTCTTATTTTAAAGAGATCGAGAAGAGAAGTGCAAACC
CATGTGGAATGGGATGTGCTGCCGCATGTGCACCAGCCTGCCAGCCAAGC
TGCTGCGCTGCACCACCTCCACCACCACCACCACCACCTATGCCAGCCTT
TGGCTGCGCACCAATCTGTAGTCATTGGTCATCCATGATCGCTGCACAAC
CTGCTGCACCTATGCCTTGTCCATCACAATGTCAAGCTATGCCAGGGTGT
TGTAACGCTCCACCTCGACCCCCCCCTATGCCATGTGCTGCACCTCCATG
CCCCACACCCATGCCATGTGCTGCACCTCCATGTGCCCCACCACCCATGC
CATGTGCTGCACCTCCATGTGCCCCACCACCTATGCCATGTGCTGCTCCA
CCATGTGCACCACCACCTATGCCTTGCGCTGCTCCACCATGTGCCCCACC
ACCAATGCCTATGCCTATGCCATGTGCTGCACCTCCATGTGCCCCACCAC
CCATGCCATGTGCCGCCCCACCATGTGCCCCACCACCTATGCCAGCTTGT
CAGCCCTCTTGTGCTCCTGCTTGTTGCATGCCACCACCTCCACCCCCTAT
GCCTATGTGCCAACCCTCATGTGCACCAGCATGTTGCATGCCCCCTCCTC
CACCACCACCAATGCCTATGTGTCAACCATCTTGTGCACCAGCTTGTTGT
AGACCTGCTCTCCCACCACCTGCTCGAGCTCCCCCACCATGCCCTGCTGG
ATGTCCAAGAGCTTGCTACCCCGCTTGCCGACCAAGCTGTTGCGCACCAC
CTCCTCCACCCATGCCATGTGCAGCTCCACCATGCATGCCTCCACCAATG
CCAATGGCCATGCCATGTGCAGCCCCACCATGTGCACCACCACCTATGCC
TTGTGCCGCCCCACCATGCGCACCACCACCTATGCCATGCGCTGCTCCAC
CATGTGCACCACCACCTATGCCATGTGCTGCCCCTCCATGTGCACCACCA
CCTATGCCATGTGCTGCCCCACCATGCGCACCACACCTTTCCCTCCCCAC
CATGCGCACCACCACCTATGCCATGTGCCGCCCCACCATGTGCTCCACCA
GCCCCAGCCCCTTGCGCTGCACCACCATGCCAACACGTCAACCTTCCACC
AACAGTCATCAACCTTCCAGCTCCACCACCTCCACCAATGCCATGTGGTC
CAACTTGTGCTCCAACTTGCGCACCTGCTTGCTCTAAAGCTTGTTGTAGC
AAAAAATAAACACACATGTTAGAGAACTAGACCTTTAATGTCAAAGCAAT
GAAACATCTGTGAAAACAAACAGTGCACAAATAAGTGGTTTGCTCCGAGA
AGAATCGGCACTACGTGTTTCTGAGTAAGATCAAAAGAAATATTCGAATA
TTATGTAAATAACACAAGAGAAGTGGTTTATTTTTTTAACAAATTATTAT
ATGTGTTTTCGACCTTCATTAACTGATAAGTATATAATAAAATATTGAAA
AGGGGCATGTGTTGTTATGTATTAGAGACAAGAAACTGTTCACCACCACT
GGCAATAAAAGCGACATTACCAAACAT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000089_pilon:697599..700275- >MSTRG.12048.1.p1 ID=MSTRG.12048.1.p1|Name=MSTRG.12048.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4041bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000089_pilon:697599..700275- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AGATCGAGAAGAGAAGTGCAAACCCATGTGGAATGGGATGTGCTGCCGCA
TGTGCACCAGCCTGCCAGCCAAGCTGCTGCGCTGCACCACCTCCACCACC
ACCACCACCACCTATGCCAGCCTTTGGCTGCGCACCAATCTGTAGTCATT
GGTCATCCATGATCGCTGCACAACCTGCTGCACCTATGCCTTGTCCATCA
CAATGTCAAGCTATGCCAGGGTGTTGTAACGCTCCACCTCGACCCCCCCC
TATGCCATGTGCTGCACCTCCATGCCCCACACCCATGCCATGTGCTGCAC
CTCCATGTGCCCCACCACCCATGCCATGTGCTGCACCTCCATGTGCCCCA
CCACCTATGCCATGTGCTGCTCCACCATGTGCACCACCACCTATGCCTTG
CGCTGCTCCACCATGTGCCCCACCACCAATGCCTATGCCTATGCCATGTG
CTGCACCTCCATGTGCCCCACCACCCATGCCATGTGCCGCCCCACCATGT
GCCCCACCACCTATGCCAGCTTGTCAGCCCTCTTGTGCTCCTGCTTGTTG
CATGCCACCACCTCCACCCCCTATGCCTATGTGCCAACCCTCATGTGCAC
CAGCATGTTGCATGCCCCCTCCTCCACCACCACCAATGCCTATGTGTCAA
CCATCTTGTGCACCAGCTTGTTGTAGACCTGCTCTCCCACCACCTGCTCG
AGCTCCCCCACCATGCCCTGCTGGATGTCCAAGAGCTTGCTACCCCGCTT
GCCGACCAAGCTGTTGCGCACCACCTCCTCCACCCATGCCATGTGCAGCT
CCACCATGCATGCCTCCACCAATGCCAATGGCCATGCCATGTGCAGCCCC
ACCATGTGCACCACCACCTATGCCTTGTGCCGCCCCACCATGCGCACCAC
CACCTATGCCATGCGCTGCTCCACCATGTGCACCACCACCTATGCCATGT
GCTGCCCCTCCATGTGCACCACCACCTATGCCATGTGCTGCCCCACCATG
CGCACCACACCTTTCCCTCCCCACCATGCGCACCACCACCTATGCCATGT
GCCGCCCCACCATGTGCTCCACCAGCCCCAGCCCCTTGCGCTGCACCACC
ATGCCAACACGTCAACCTTCCACCAACAGTCATCAACCTTCCAGCTCCAC
CACCTCCACCAATGCCATGTGGTCCAACTTGTGCTCCAACTTGCGCACCT
GCTTGCTCTAAGAAACATTCCATTGAATGCTTACTACTTACCCAAAGACA
AAAACTTGGAACGAGAACTTGATGAAATTGACATTGGTCTGTGTGGCTTT
ATTCGTCGTTTTCTACGGCGCCGAAGCTCTTAAACTAAGAAAAAAGAAGA
TCGAGAAGAGAAGTGCAAACCCATGTGGAATGGGATGTGCTGCCGCATGT
GCACCAGCCTGCCAGCCAAGCTGCTGCGCTGCACCACCTCCACCACCACC
ACCACCACCTATGCCAGCCTTTGGCTGCGCACCAATCTGTAGTCATTGGT
CATCCATGATCGCTGCACAACCTGCTGCACCTATGCCTTGTCCATCACAA
TGTCAAGCTATGCCAGGGTGTTGTAACGCTCCACCTCGACCCCCCCCTAT
GCCATGTGCTGCACCTCCATGCCCCACACCCATGCCATGTGCTGCACCTC
CATGTGCCCCACCACCCATGCCATGTGCTGCACCTCCATGTGCCCCACCA
CCTATGCCATGTGCTGCTCCACCATGTGCACCACCACCTATGCCTTGCGC
TGCTCCACCATGTGCCCCACCACCAATGCCTATGCCTATGCCATGTGCTG
CACCTCCATGTGCCCCACCACCCATGCCATGTGCCGCCCCACCATGTGCC
CCACCACCTATGCCAGCTTGTCAGCCCTCTTGTGCTCCTGCTTGTTGCAT
GCCACCACCTCCACCCCCTATGCCTATGTGCCAACCCTCATGTGCACCAG
CATGTTGCATGCCCCCTCCTCCACCACCACCAATGCCTATGTGTCAACCA
TCTTGTGCACCAGCTTGTTGTAGACCTGCTCTCCCACCACCTGCTCGAGC
TCCCCCACCATGCCCTGCTGGATGTCCAAGAGCTTGCTACCCCGCTTGCC
GACCAAGCTGTTGCGCACCACCTCCTCCACCCATGCCATGTGCAGCTCCA
CCATGCATGCCTCCACCAATGCCAATGGCCATGCCATGTGCAGCCCCACC
ATGTGCACCACCACCTATGCCTTGTGCCGCCCCACCATGCGCACCACCAC
CTATGCCATGCGCTGCTCCACCATGTGCACCACCACCTATGCCATGTGCT
GCCCCTCCATGTGCACCACCACCTATGCCATGTGCTGCCCCACCATGCGC
ACCACACCTTTCCCTCCCCACCATGCGCACCACCACCTATGCCATGTGCC
GCCCCACCATGTGCTCCACCAGCCCCAGCCCCTTGCGCTGCACCACCATG
CCAACACGTCAACCTTCCACCAACAGTCATCAACCTTCCAGCTCCACCAC
CTCCACCAATGCCATGTGGTCCAACTTGTGCTCCAACTTGCGCACCTGCT
TGCTCTAAGAAACATTCCATTGAATGCTTACTACTTACCCAAAGACAAAA
ACTTGGAACGAGAACTTGATGAAATTGACATTGGTCTGTGTGGCTTTATT
CGTCGTTTTCTACGGCGCCGAAGCTCTTAAACTAAGAAAAAAGAAGATCG
AGAAGAGAAGTGCAAACCCATGTGGAATGGGATGTGCTGCCGCATGTGCA
CCAGCCTGCCAGCCAAGCTGCTGCGCTGCACCACCTCCACCACCACCACC
ACCACCTATGCCAGCCTTTGGCTGCGCACCAATCTGTAGTCATTGGTCAT
CCATGATCGCTGCACAACCTGCTGCACCTATGCCTTGTCCATCACAATGT
CAAGCTATGCCAGGGTGTTGTAACGCTCCACCTCGACCCCCCCCTATGCC
ATGTGCTGCACCTCCATGCCCCACACCCATGCCATGTGCTGCACCTCCAT
GTGCCCCACCACCCATGCCATGTGCTGCACCTCCATGTGCCCCACCACCT
ATGCCATGTGCTGCTCCACCATGTGCACCACCACCTATGCCTTGCGCTGC
TCCACCATGTGCCCCACCACCAATGCCTATGCCTATGCCATGTGCTGCAC
CTCCATGTGCCCCACCACCCATGCCATGTGCCGCCCCACCATGTGCCCCA
CCACCTATGCCAGCTTGTCAGCCCTCTTGTGCTCCTGCTTGTTGCATGCC
ACCACCTCCACCCCCTATGCCTATGTGCCAACCCTCATGTGCACCAGCAT
GTTGCATGCCCCCTCCTCCACCACCACCAATGCCTATGTGTCAACCATCT
TGTGCACCAGCTTGTTGTAGACCTGCTCTCCCACCACCTGCTCGAGCTCC
CCCACCATGCCCTGCTGGATGTCCAAGAGCTTGCTACCCCGCTTGCCGAC
CAAGCTGTTGCGCACCACCTCCTCCACCCATGCCATGTGCAGCTCCACCA
TGCATGCCTCCACCAATGCCAATGGCCATGCCATGTGCAGCCCCACCATG
TGCACCACCACCTATGCCTTGTGCCGCCCCACCATGCGCACCACCACCTA
TGCCATGCGCTGCTCCACCATGTGCACCACCACCTATGCCATGTGCTGCC
CCTCCATGTGCACCACCACCTATGCCATGTGCTGCCCCACCATGCGCACC
ACACCTTTCCCTCCCCACCATGCGCACCACCACCTATGCCATGTGCCGCC
CCACCATGTGCTCCACCAGCCCCAGCCCCTTGCGCTGCACCACCATGCCA
ACACGTCAACCTTCCACCAACAGTCATCAACCTTCCAGCTCCACCACCTC
CACCAATGCCATGTGGTCCAACTTGTGCTCCAACTTGCGCACCTGCTTGC
TCTAAGAAACATTCCATTGAATGCTTACTACTTACCCAAAGACAAAAACT
TGGAACGAGAACTTGATGAAATTGACATTGGTCTGTGTGGCTTTATTCGT
CGTTTTCTACGGCGCCGAAGCTCTTAAACTAAGAAAAAAGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000089_pilon | genome | sc0000089_pilon:697599..700275 - |
|
