MSTRG.12011.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12011.2.p1
Unique NameMSTRG.12011.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000089_pilon:323942..343438-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12011.2.p1 ID=MSTRG.12011.2.p1|Name=MSTRG.12011.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=19497bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000089_pilon:323942..343438- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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ATATATTGTATGGGGGTAGCGAAAAATCATCAAAATTTGCCTTGTCCGGG GGTAATTTTGCTCTGTCCGGGGGTAATTTGGGTTGTCCGGGGGGTCAACT GATGCTTGTCCGGGGGGCCAAAAGTCTCTTTGTCCGGGGGGTAAATCACC ATGTTCTTACAAAAAAGAGTGTACCAACCATTTCAGCTGTGCCATTTTAC TAAGTCTCTTATTAATTGACCGGGTTTCATTTTATGATTTTCAATTTCGT TTTTAAGCCTCCGGGAAAGAGCAGCTTAGAGCTGGTAGTTCGCACGTGGG CAGATAGTCCACAGACTGCATTCAAATGGATTCTTTTTTGATGGATGATA TGGTGTTTTGAAGAGTTTTCTATACTACCTTCTAACAATGAATAGACTAG TATTATGACTTGTTGCCATGACAGCATTTTGGTCAGCACCTTAGGGGTCA AAATGTTTACATCACCATTTTTCAACAAGGAGACAGATTTTTTGTGAGGG AAGTTACATCCAGTCACGATACGGCGTTGACGAACGTTTTTCCGTTCAAT TAGATTAAGTGAAGTATTTTGATGGGGGATTTAAACACATGAGATTAACC TCCCAGAATTTGTTTTTCTCGAAATTCAGTATCTGTAGGAAGGAGTGTTT GAGCGTATAAGGTGAAGGTTGAGCCTCCTCCTTTGTGTTTGTTTTGGTGA TTGAGAAGGTAATGATGATAAAAAGATCGGCTTGTTAAGATTAATCTCCT TCTCTATCTCTCTTTATCACTAATCGAAATCTGCTCAATTACAACATCAT AGAAAAAAGGGGAACGGATTCGAAGTGTTTTTTCACACGCTCTCTTCCTT CAACTTTTCTACTGTCTGGTTTCAAATACCTCCCGTCCTCAGGCCTCGTT TTGAAACTAGCTCGTGAGCGTCTACGTGTTTCTAATAATAGATCTTCGAA 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TTAACGAAGTAGCAAATCGTGGCCATTTTGTATTTGAAGGGCAGCTTGTT TGATTGATTGCTAATAAAGCGAAATAATTGGGTAGTTTGCGACTATCTAT TGTTCTTTCGTGGAGGACCAACCAAATTTTGGCTTTTGTGAACAGTTGTT CGTTTTGCGCGTGGATTATTATCATCATCATCAGTTGGACGACCTCTGAA AACAATTTTGTGACAATTTGCTCAGTGACGGGTAATTAAGAACGGAAAAG ACAATATCTTGCTACATAATAAAAAAGAAAAGATTGTTTCAAATAAAAAG AGAGAAACTTTGTCATTGATTATACTTTGTTTGATAGACAAGCAGTAGAG ACAGTGCGTTTTGTTTTGAATGTTTGCTGGTGTGTTGAAAGAGTAATGGT CGTTCACAAAATGTTACCTAAGAACTGGAAGTTACTGGAACATCTCTCCA TCGTGTTTATTCTACTATTCTTATTAATGGATATCTCTTGGTGTCGTCCT ACTCGCGACTTCTTATTTGGCGAAGAAAATTGTAAACTAAATATTGTGAC AGTACCCATTCGCTTACCAAACTGTCAACCCACTGTCGTCAAAGTGTTGG GGTGTGCAGGTTATTGTAAATCAGATACAACTATTGACTTGCATTCTGAG CATGGTATAATTCCAAAATGTAATTGTTGTACTCCTACCAAAGATATTAC TGTTTTCACGAAAGTGTTGTGTCAAAATCCTGATACTCAGGAAGACGAAA TGCGAAGTGTGAAACTTTTAAGCGCAACGGAATGCGCGTGTTCGCCTTGT ATACGAAATTCAAGGCATAAGAATGCATAACAACAATGGAACAATTTTTT AACCCTTCTTTTCTTCTAATTATCGACTTTCTTGAACAAAAACTCTTCAA CCTGAATCTTCGATGGAATGTTTTTGTTTATCGAGGAATAATTTTTAACA GAAGCTTCAGATTAATTCTATAAGATATGGAAATATTATGATATATATGT AAATATAAATAGATTATAAAGTATTATTATTATTATCCTTATTTACATGA CAAAAAAATTAAAATATGACAAGCAGCAACAAAACTAAAAACAAAAATTG ACAGTTATCTTTTTTCTCTCTCGCAAATTGACGACATCTCTACTTTAGGG TCCTGTTTCCAAAGCTTTAACAAAGATGTACCGTAATTTCTCTAATTTAA TACGACCAAAAAAATAATTATTTTGGAGGTGTCGCACTAATAATAGGAGG ATATAAATTGCTCTGAATCTGGAATCTTTTTATCGTACTAATAATTAGAG GAAAAACTTTGTAAAGGCGCGCTAAATTGGAGGAAAAATAAAAAAGACAA TTTTTTTTATTTTCTGTTTTTTGTTTCTTTCTTTTTTAAGCTTTTTTCTA ACCCATATTTTCTTCTCTTTTCAAACTCTTCCAACTTTTCACGTGTC

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000089_pilon:323942..343438-

>MSTRG.12011.2.p1 ID=MSTRG.12011.2.p1|Name=MSTRG.12011.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2619bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000089_pilon:323942..343438- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GAGACGGAAATGGCGTCGATTGTGAACCGCCTGAAACTATGGTTGACAAT
GTACAAAGATTTCTTGGAAAAATCCTTCGAGGCGATCTTGTGTAAGTAAG
AAATGGAATGTGCTTCGCCTTCGTGTGGATTCTTTATCATACAATGCAGA
CCAACTCATCTTGGGAACAGTGCTCTTCACCATTCTCTTGTTCTTACTAC
CAACAGTGGCTTTGTATTACTTCGTTTTCATCATCATTCGACTCCTCATT
TCTTTGCTACAAATGTTCTTTCAATTGATGGCTAATAGTTTGTTGAATAA
ATTACACTCTTTGGTATGCTCAAATGAGAATAGCATAGATGACAAACACA
TTGTTAGAAATGAGTTACTTATATCGCCACTTATACAAACTGAAATTGGA
AATGCAAAATACTAAATCGAGAAAGATGTTACTTTACCGTCAATTGATGG
ATTGTTTACTTGGTTTGGTGTTATATTTGGTATTGAAAAGAACGATAGAT
GGGTTGGATATTGATTCGAATTTTACAGATTTCGTATTACTGGTTCAAGA
TGATCTAACGAAGCTTTTGCAATGGTTGATGGGAGCACCTGCTGGTCTGA
AACTGAACGAAGAACTTTCATTTTTCCTTGGAAATGTGTTCCTTTACCAC
GTCAACGTGTGGGTTGCTTACGTTCTCACCATCAAAACTTTCCTTCCACA
AATCATACAGATTCTCATGATGTCCAATATTCTCGGTCTCGGCATTTTTT
TCTGTTTGATCAATGACGTTATCAGTATTTTGAGCGTCCACCTTCACTGT
TTTTACTTCTATGCTTCCAATCTTTATCGGATACAATTGAAATCATTGAT
GACACTTGCAAGACTTTTCAGAGGAGACGGAAATGGCGTCGATTGTGAAC
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CGAGGCGATCTTGTGTAAGTAAGAAATGGAATGTGCTTCGCCTTCGTGTG
GATTCTTTATCATACAATGCAGACCAACTCATCTTGGGAACAGTGCTCTT
CACCATTCTCTTGTTCTTACTACCAACAGTGGCTTTGTATTACTTCGTTT
TCATCATCATTCGACTCCTCATTTCTTTGCTACAAATGTTCTTTCAATTG
ATGGCTAATAGTTTGTTGAATAAATTACACTCTTTGGTATGCTCAAATGA
GAATAGCATAGATGACAAACACATTGTTAGAAATGAGTTACTTATATCGC
CACTTATACAAACTGAAATTGGAAATGCAAAATACTAAATCGAGAAAGAT
GTTACTTTACCGTCAATTGATGGATTGTTTACTTGGTTTGGTGTTATATT
TGGTATTGAAAAGAACGATAGATGGGTTGGATATTGATTCGAATTTTACA
GATTTCGTATTACTGGTTCAAGATGATCTAACGAAGCTTTTGCAATGGTT
GATGGGAGCACCTGCTGGTCTGAAACTGAACGAAGAACTTTCATTTTTCC
TTGGAAATGTGTTCCTTTACCACGTCAACGTGTGGGTTGCTTACGTTCTC
ACCATCAAAACTTTCCTTCCACAAATCATACAGATTCTCATGATGTCCAA
TATTCTCGGTCTCGGCATTTTTTTCTGTTTGATCAATGACGTTATCAGTA
TTTTGAGCGTCCACCTTCACTGTTTTTACTTCTATGCTTCCAATCTTTAT
CGGATACAATTGAAATCATTGATGACACTTGCAAGACTTTTCAGAGGAGA
CGGAAATGGCGTCGATTGTGAACCGCCTGAAACTATGGTTGACAATGTAC
AAAGATTTCTTGGAAAAATCCTTCGAGGCGATCTTGTGTAAGTAAGAAAT
GGAATGTGCTTCGCCTTCGTGTGGATTCTTTATCATACAATGCAGACCAA
CTCATCTTGGGAACAGTGCTCTTCACCATTCTCTTGTTCTTACTACCAAC
AGTGGCTTTGTATTACTTCGTTTTCATCATCATTCGACTCCTCATTTCTT
TGCTACAAATGTTCTTTCAATTGATGGCTAATAGTTTGTTGAATAAATTA
CACTCTTTGGTATGCTCAAATGAGAATAGCATAGATGACAAACACATTGT
TAGAAATGAGTTACTTATATCGCCACTTATACAAACTGAAATTGGAAATG
CAAAATACTAAATCGAGAAAGATGTTACTTTACCGTCAATTGATGGATTG
TTTACTTGGTTTGGTGTTATATTTGGTATTGAAAAGAACGATAGATGGGT
TGGATATTGATTCGAATTTTACAGATTTCGTATTACTGGTTCAAGATGAT
CTAACGAAGCTTTTGCAATGGTTGATGGGAGCACCTGCTGGTCTGAAACT
GAACGAAGAACTTTCATTTTTCCTTGGAAATGTGTTCCTTTACCACGTCA
ACGTGTGGGTTGCTTACGTTCTCACCATCAAAACTTTCCTTCCACAAATC
ATACAGATTCTCATGATGTCCAATATTCTCGGTCTCGGCATTTTTTTCTG
TTTGATCAATGACGTTATCAGTATTTTGAGCGTCCACCTTCACTGTTTTT
ACTTCTATGCTTCCAATCTTTATCGGATACAATTGAAATCATTGATGACA
CTTGCAAGACTTTTCAGAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12011MSTRG.12011Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12011.2.p1MSTRG.12011.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12011.2.p1.exon5MSTRG.12011.2.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12011.2.p1.exon4MSTRG.12011.2.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12011.2.p1.exon3MSTRG.12011.2.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12011.2.p1.exon2MSTRG.12011.2.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12011.2.p1.exon1MSTRG.12011.2.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000089_pilongenomesc0000089_pilon:323942..343438 -