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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000006_pilon:167094..186932+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.1199.8.p1 ID=MSTRG.1199.8.p1|Name=MSTRG.1199.8.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=19839bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:167094..186932+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
attCATTTGTTATTTTATAGGAGAGTTTTGTAGAGTATGACCCAACTCTC
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TCTTGGACGTTTTGGTCCTAATCATGCTGCTGACCCTATTGCTACAAGGT
AAAGActtttttctttgccttttttctttgccttttAAATTATGTTTATA
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TGCATCTATAATGTATTAACCTACGATTTATGgttccttttttcaaaata
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AACTTTTTTACTAGACTAATATTCCTCCAGAAACCATGGTACATGTTTAT
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AATATTCAACGATTGATGAAAATAAGCATCAGTTGCAGTGATGCGAAACC
ACCGAAAGTTGCGAGCTCGAATCTCACCTTACTGGTTCACTTCTGAACTA
TTGTCATATATTTCCATGCCGAAACTTTAAGGCGATAGTGAattgtttta
ttgttgttatttattatctattacctcttattgccttgtttttatctttg
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GCATGGATGGAAACTGTAGCATGTAATTTCCATGATGACACTGGTGAAGT
CTTTGGTGAATTCCAATTAAAGGTAGGTGGAATATTTAAGTGTTTTAAAC
AGAATACAAACACCAAGAGCGTGTATTGAAGAATCTTCTTGCTTATACAG
TAGTAACATCTTCACTCTATCCCCTTAACTGATGGATTTTCAATAAATGC
TCATCGATTGTCACTCTATGAttttgctatttcttttttgaaggcttttc
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AAACATACCCTTATTTGCAAGCCACGTTGGCATACTCGAGCAAGTCGCTA
AAATGCATAACGCTGCCTTCTATTGATTTTCTATGATGAAATGGATGATT
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GGGGAAAACCCCGCTGCTTAGAAAGAGTATTTTAACTTTCTGTTGTTTTG
TAACCTTTATAGAGATTTGTGAGGATCAAAGGTGACCCTTACCGCCTGCA
AATGCCCATTACCATTTTTGCCTCAGTATCCCCTCCCCCAAGACCCAGGC
CTAGTGATGATATTGAACTTCGAAATTTTGAATACTTGAAAATGCATGTA
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tatgcttgatatttgaaacttttattttttataaaaatgcacttttattt
atttggtaGGGTCGATATTTAGCTCAGAACCTCATTTTGAAACTATATTG
TCTGTTTTACGAGGCAGAATTTGTGCTTACAATACTAAATTTACGTGTTT
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TATTACCATTACAAGATAGGGGGATTCCGCTTAAAAAATACACCAAATAA
GCAGCTGGTGTCAAACAAAttactggttcttatgaaaaagttCATAATTC
ATTAACGTCCTATTCAATGATATTTAATTAGATATCTTTCTCCATAATTA
GATCTATTGTTTTCGTTTCTTCCATGTCATTTTATAGGTcctttctttta
tagaaaaattaagagaaaaatAATACGATTATGTTGATGTCTGGTCAAAT
TCATTATGATTATTTTGGCAATGTGCGTGTGAAAGATCAAGGAAAATTGA
GAAgatatttttggtgtttcttTTACTTGGAAATTGGTTTTGGTTGACCT
GCAGCAAAGAGGATTTTTAGTCTGGAAATCTGTTTTCAAGAGGACTGGAC
CCGTTCTTAACAAGTAGTTATAAATTGAAGGTACCCTCGTTGAAGTTGAA
ATTGATTGGTCGTATTGACATGACTATCAGACCGCCTCGTAAGTTTAACT
TTCTTTTTGTATCGCTCTCCCTATGTATCAAAATAAGGATTTTCTTTAAT
GCATAAAAAAGTAATATTAATTTCAACGATAATTTTTACTTTAAGCAAGC
TTCAATTAGAAGTCTGCGAATATGTTTTTCGTGCCATAGCTGTCTATCAA
AAAGTTGCACTAAATGTTAATATTGTTTAGGTTTTGTTTGATACACACTT
ATTTTATAAGAccatccaaaaaatttgaagccttcggatgtttttaacgT
TTAatatttaagcctaaaaatgttctgaacatgttcttatttgcaccatt
ttgtgagaatttttttctattttcttaagaaattagcCGTTTTAAGAGTC
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catttctttgttcttatcgtattttaattgcatattttctcatgcttgat
tggattcttttgaattctcaaaaactatgcacataatttgattattttca
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tcgccgcatcagattttgagaatctgtttttacgaccaataatcactttt
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TCTCACTGTTACCGTTTTCCCTATCTTAAAACTTTAACCTACTGTTTTTC
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ttttcattttccaaagtCTAAACTTAAGTCAAGATATTTCAttcgcaagt
tccacttttcgctacactttggtctaaaattgacaaTGAATGTCATCCTC
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gtgttgtttttacagatcacactgtggtgtttcaagatggcagctcaagc
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CGtttgctcaagcttttgtttatgttgaattttctgatacttttcatttt
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atagggttacccccacctgattcaaaaaatttgaaaatcatcaaccaacc
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aagggaaatttttcttaaaacgaTGCGCTttctcctcctcctcctccttt
TCCAGTGCGCGGTTTTTTACCGCCATTCTACGCCCATGTACAGTATTACG
CAACCGCCCTTCTTAAAAATATgcacttcagtcacgtgactaaaagtTGT
CGCGAAAATTTAGCGGGGaagcgtttttttataaaagacggggttttgga
ttttttcaaaaaatagtatacattcttctatcaaaatatggcagggGTTT
TTACTAGcctttcataaaacaaatgattgtgtgtaaagctcagaTGACTA
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CTACAGagctttgaaaatcttttttaatcataactttttataaactCAAT
TTTTAAATATAGCACACCCCAAGTATTATAGAGAAAGAACTTAACTTTCC
AAAAACTATAAACACTTTGTATCCAGTGTATTAGAGACCATGCCAAAATT
CAATATTGtggttttcaaatttccaacatgACCCCCGTCCCGaaatcact
ttcgattttgcaCTGGTTTTTTGAGATTCCGGATAAAGTAGCAGGAGAAG
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GTGAAAGCGACTGTCCCGCTTTGCGCCCAACAAcaattttactgaccaaa
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tcgactgtcccgcttcgtacccaagaCGACGATTGTCGACTGTCCCGCTT
tgtacccaaatcggaattacgccacacccttccactgtcccgcttcgtac
ccaaatccgAATTAGGCCAcgcccttccactgtcccgcttcgtacccaaa
taagaattgagccacaccctttcactgtcccgcttcaaacccaaatcgga
attatgccacacccttccactgtcccgcttcgcacccaaatcggaattat
gccacacccttccactgtcccgcttcgtacccaaataagaattgagccac
accctttcactgtcccgcttcgcacccaaatccgaattatgccacaccct
tccactgtcccgcttcgtacccaaataagaattgagccacaccctttcac
tgtcccgcttcgcacccaaatccgaattatgccacacccttccactgtcc
cgcttcgtacccaaataagaattgagccacaccctttcactgtcccgctt
cgcacccaaatccGAATTATGCCatacccttccactgtcccgcttcgtac
ccaaataagAATTGAGCCACGACCTTTCACTGTCCCACTTCgcacccaaa
tcggaattatgccacacccttccactgtcccgcttcgtacctaaatcgga
attacgccacacccttccactgtcccgcttcgtacccaaatccgaattac
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accctttcactgtcccgcctcgcacccaaatcggaattctgccacaccct
tccactgtcccgcttcgtacccaaagtgggattgtgccacacccttccac
tgtcccgctttgTACCCAAAGTGGGATACTGCCACACCcctccactgtcc
cgcttcttGGCCGAATTAGAATCTATATGacggagatggatgtccagtaa
tttatatgttcatgttatttTAAAGAATACGGTTTCTGATGTTTCTTGAC
gatttgaattttgatgttcacaCAGCTTTTCGAAAAGTTTCGTTTCAGAG
CGAAACAAACTATAACGTCTGAGCATATCTAAACTTTGtatagtggagtc
tctttaagtCGAATCTCTGTAACTTGAATGTCACTCAACctttcttcata
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AGTGATAGGAACTCCACTGTatatcgcaaaaaatagttGCACAggacatg
gaggtataaagaaaaacaggagttgaatatGTCGGTAATTGGTTGTTAaa
gtcttttcatttcttttataaaatgtatcaaaagaaattctaagctcacC
CGATGAAATAAGtcctttataagcacacacgatttcagactcaatttgta
gacataaagtcactggagaattttgaaggaaagtatcaagcaatagagtt
caccttaaagaaaacattgatcaaaaaatcttatcatttgatgaaggatt
gccaagtttacaggtctttttttagtccaaatattttcttactcggatgt
cagaaacaatgaatctcgtctcattcaatttctaaagcttaaatgagcca
ataaaatttcacctatggataaaagagctcattaaagatatgagcatgca
tacaccgtaacttttttaatcgtagggcgagcttggttacaatagtatac
ttctcctgtttctttatacctccatgcatAGGAGTactctttttgaaaaa
cgaaaGTTACCATTGCATCGAGGATAATCTAACGCCATTTAGTTGAGGTA
TTTCGAATTTTAACACATTCGCTGCCAAATACGAGTATACTCGTATGCtt
aagcttggtactcacttgtgcaaaaaatcgcgcTTAAGTGCGTCGAACAC
ATCTTTGCTTTATAGTGAGTACGTTTGCTAAACGAAATTAAGCGCACTTA
GACGGAAGGTGATAGAAATTGACCGTCAATCGAACATCactcttctgttt
ttctacttctctatctccttttctattttctgactttctgagacttgttt
tctgatttctactaacttttctatgaatttgatatttcaaactttctcca
aatatcgacccgaccgggattcgaacccaccaaatggaAGAgtctctgat
cagaaacccagcgcgctatccgttgagccacactcgcacagcaaaGCACa
caatttgtaaatacttatagaatgactaaaaagacgggggtaatgttatt
atagtatgggtaaaattgccccttttttaacctgactgaaattcgagccg
ttactagcaaccctgcggggcccaaggcgccgagtatgcacccggcacag
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atttgaaacaacaaaacccccggaaacacaaaatcgtagataggaaaaaa
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ACATACGCACATGAACGCCTTGATTTTGCTAGGCGCGCTTAAACGCGAAT
ATGAAAAAGTTTCGATATTTCGATGCGATCATCAAAGACACCGCGTGTAA
ACACTATTCAGttcttttgaatttgaagaactTAGACGCACTTAGACGCA
CTTAAACACGATATTTTTGCACAAGTGAGTACCGGGCTTTAAGAGCCTTT
GATAAGATAACTTTGATATAAAAACTTTTGCTtttctttcagattttttt
aatcaaagtgAAATTCTACGTTGATTggtataaaatttcaatttcaaggc
ATTTAAAGTATAATGGAGGCCACAACCCGACTGAGACTTTCGATAAAATT
CAAAGAggacaaattttcaatttctcaaaAGGTTTAAAATAGCTCTGCGC
TCCACCGCAGAGACTTGAACAACGCACAAAATAACTGCTAACAGTTAACA
AAACGTACTCCACGGTTTTTTACATGAAAAAGGAAGGCTACTGAGGCGGA
TATGAGTAAATATGCAAGGAGTAAAATGCGCAACGCACTCAGTTAAACTT
CAGTAGCTTAAATTATTCAAAGGCCAAATTTTagcaaaccaaacaaaaaa
gcTAGTGCCCAGatcccAaaaatcTttttttataagaatgaaaaaagccc
agatattcacccaaggaacaactgtgccaaatttcagccaagtCTGATCG
TTTTTGAAGTCTCAAGGCTGCGCCAAGGTTTTTTCTCAGAGAAAGGAGTT
TCTCAgtttctagctcaactgaagttgagaattaatAGTACACTTAAGAT
ATCTTCATTTATGACCCAGGATCAATTTGCTTACAATTTTATTTGATGAG
ACCCTGCTTCTTCCGTGTTccattcagttcatagataggtGAATCAGCTA
GTCGTAAACTCCGTCAAAAACCCCCCATCAATGTCAGTTGATTATCACCC
TGGTGTGTAAGCTggcttgttttgaattttgaggttgatatttttttgcc
cATCATCTttgatcacgtgatcaaaatCCACGTCAGAGAATGGTCATAAA
TCGGGGAACTCATGCGCACTCATTTGGAAGGGCAATGTAACGTTACCCAG
CTAAATTAATGTAGATTACTGTaaaaaaaCTGAATTCATAATTCTGCCTG
ATCAGATCAATCGTCAAAAGTATTAGTGCCATTATAATAAGAAGTGGAAA
TTCTAGTTTAGATTTCTAAAATGGTCCTGTGCTTCAAAGCTAAAATTAGT
GGGCTGAAATTTGATAAGTGATTATTAACTGTTTGCATAGCCCTTCGACT
TAAAGTTCGAGCATCTTCTCACTTTTTTACTAGGGtaagcatttattttt
ctttggagGGGctgtctggttggtattttacagaccagaatgtaaacttg
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TGCAGAAcgatctgtaaaatacacgttcaTCGCCTGCTGGAACTCAGGAA
ATACTGGAGCTGGAGAAATTCTTCCTAGTCATAAATATTGGCCATCTAag
acagtgtgcaaaattttacaGATCGGTCCGTATCCTACCTGAAATATACT
CACTCTCAGCACCAACACCAACACCACTCGtctgattttgctgaaatttg
acCGCAAATGTGTACTATCAATACCTAACACTTGTCAAATAATCAGTCAA
TAAACATTTACTAATCAGTCATTGCAGTATCCTAGGGCTGATTTAAGCAA
AAAGGGCATATTTGGAAGCAATGTCCTAGAACCCAAATTAGCTACTTTTG
GGGTAGGGAATCCTTCAAAATCGACTTCTAAGTCAAGACACCTAGCCCCC
CTGGGTTTATACATGTATCTGTGGTAAATTGTGATATAATGAAACAAATC
ATTGTAGAGTAGATTTAAAAACCATTTAGCCAATTGTCTACAAACTAtca
ttttctctatttttcagAACACCAGATAGAAGGCCATTGCTGGCATTCAA
CAAGTATGACACAGAATGCAAAGTCAACCGTAAAAGTCACATGGGGCAAT
ATGAAGTTGTTAATAAATTACCAAGGTGAGTAGGTTCTTGTCTTGgactt
ttttaatttatttaattaaaAGTCGAGGTTTTAAAATCTCTCATCTACGC
TTTTTATACTGATCATATAATCTTGATTTTCGGATGACTTAGTTTGGCAA
AAATGTTCAACATTAGCCTAATTCGCAGAAATAAGTTCTCACCATAAAtt
tttttCCCTTGAAGGTAGATTTTTCTGTTGGAATTACAATATCAATGGTA
TACAAGTAGTCTAAAGCAAATGGAGAGCTTACCATACGATCTACGATTAT
ATTTGATTTATCTCTTCTTAGGAATCCTTATGGGCGCACTGGCGTGATTG
GGCGTGGAAATCTTGGACGTTTTGGTCCTAATCATGCTGCTGATCCTATT
GCTACaaggtaaatctatttttttttgccttttaaaCTGAATTGTGTTTA
TATAGTTCTTAACAATTATTTGATTTCTTTGTCAAATGTTTTGTTTGCAC
CCTTTTTAATCAAAGAGCTTACTTCTTTCCACCCTCATTTTTTATTCTTA
CACTTTGTCGGGAAAGCTAAAGTCGAAGCAAATCaacttacacccctgtc
tcacagccccggtgaaacttttgtcctcagtagggacaaaaatccctatt
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ACCTCATTTTGAAACTACATTGTCTGTTTTACGAGGCAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000006_pilon:167094..186932+ >MSTRG.1199.8.p1 ID=MSTRG.1199.8.p1|Name=MSTRG.1199.8.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4788bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:167094..186932+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAATTTAACACCAGACAGAAGGCCATTGCTGGCATTCAACAAGTATGA
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AGCAAGTCGCTAAAATGCATAACGCTGCCTTCTATTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000006_pilon | genome | sc0000006_pilon:167094..186932 + |
|
