MSTRG.1199.3.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.1199.3.p1
Unique NameMSTRG.1199.3.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000006_pilon:115525..186932+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.1199.3.p1 ID=MSTRG.1199.3.p1|Name=MSTRG.1199.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=71408bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:115525..186932+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CGCCCTAGTATTACTTCAAATTCAAACGTCGGAAACTTGGAAGTGAGACT
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GGAATTCATTGCTATTCAACGAAGAGATAATCAACAATGGGCCATCCCTG
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GACGAGATCATTTTGTTACGTAAATGGGAGAAGAGCAGGATGGAGGCTTA
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AAGTGAGACTGAGTAATCTTGAAAAGAACGTCGATCACATCTTAGAGATT
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GCTCGCCTACCAAACTACCCTGGGAACAGTATTGTTAAAAGATTTAAAGT
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CTCTCTACACAGCATCATTTGTTCTCGATGGACCTTATTGGGCTGACGAA
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GTATGACACAGAATGCAAAGTCAACCGTAAAAGTCACATGGGACAATATG
AAGTGGTTAATAAATTACCACGGAATCCTTATGGGCGCACTGGCGTGATT
GGGCGTGGAAATCTTGGACGTTTTGGTCCTAATCATGCTGCTGACCCTAT
TGCTACAAGGTGGCGACGTACGAGCGCCGGGATAGAGATTGATAATGGGA
AACGCGTCTTGGAATTCATTGCTATTCAACGAAGAGATAATCAACAATGG
GCCATCCCTGGTGGTATGGTGGAGCCTGGGGAGAACGTGTCCGAAACATT
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GGAAACGTGATCAATTGTCAGCAAGAATCGACCATTTGTTTAGCAACGGT
GTCGAGGTGTACAAGGGTTATGTGGACGATCCTCGAAATACAGACAATGC
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TTGGTGAATTCCAATTAAAGGCTGGCGACGACGCCCAAGCAGTTCGTTGG
CAACGCGTTAGTGGAAACATACCCTTATTTGCAAGCCACGTTGGCATACT
CGAGCAAGTCGCTAAAATGCATAACGCTGCCTTCTATTGAATGAAGAAAG
ATTGGAAGCTGAAGGTGCCAAATCTGGTCATATCAGTAACTGGTGGAGCA
ATGAGTTTTTACATGAaaccaaatttgaaaaaagcctTTGCGAAAGGTCT
GCTGAAAGTAGCAACATCAACTTCAGCCTGGATAATCACAGctgGTACAA
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GTTGGGATAGATGGATCAGATATCAGTTTGTTGGGGATTGCACCATGGGG
TGCTTTGAGTGGCAGAGAAACACTTGTTAACCCAAATATTGGTAAAAAGC
ATGCACCAGCTGTACAATACGtgataacaaataaaaaaagacctGGTCTC
GACAAGAACCACACCCATTTCATTCTTGTAGACGATGGTACTAGTGGAAA
ATTTGGTACTGAAATTAACTTTCGGTCAGATTTCGAAGCCTTGGTTGCAA
AACAAAATGTCCAAACGAGCTCTTCAGCAGGAAAGGTTGACGTACCGGTA
GTGATCTTATGTTTGGAAGGAGGACCAGGTACCATCAAAACTATGGCAGC
AGCGGTAAACAATAAAACACCTTTAGTTGTGATCGGTGGAAGTGGGAGAG
CTGCGGATGTCGTATCGCATGCTTATGATTTACTTGACagTGATGATCTG
GGTGTAAGTTTCATCAAACCAGATTACATTGATACAGTCAAAGAAAACAT
CCGACAATCCTTGAAAATTCAAGATAACGAAGACCTCATTGAAGTCTTAT
TCAAACAACTTAAAGACATTCTAAAAGATATCACTTTGGTCACAGTCTTT
ATGATGGAAGATGATAGCTCGCAATCAGATCTTGATTTGGCTGTTCTACA
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GTTgcgaaaagtgaaatttttgcttcaaatctccaagaaaataaatttga
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TTGATTTCGTAGACCTTTTCTTACGCGAAGGACTCAATTTGAAAAGCTTC
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GGATGGAGGCTTACAATTATTTACACGAGAAACGTGAAGCAGATACGCAA
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GTTTAGCAACGGTGTCGAGGTGTACAAGGGTTATGTGGACGATCCTCGAA
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ACTGGTGAAGTCTTTGGTGAATTCCAATTAAAGGCTGGCGACGACGCCCA
AGCAGTTCGTTGGCAACGCGTTAGTGGAAACATACCCTTATTTGCAAGCC
ACGTTGGCATACTCGAGCAAGTCGCTAAAATGCATAACGCTGCCTTCTAT
TGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1199MSTRG.1199Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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MSTRG.1199.3.p1.exon3MSTRG.1199.3.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1199.3.p1.exon4MSTRG.1199.3.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.1199.3.p1.exon6MSTRG.1199.3.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1199.3.p1.exon7MSTRG.1199.3.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1199.3.p1.exon8MSTRG.1199.3.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1199.3.p1.exon9MSTRG.1199.3.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1199.3.p1.exon10MSTRG.1199.3.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1199.3.p1.exon11MSTRG.1199.3.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1199.3.p1.exon12MSTRG.1199.3.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1199.3.p1.exon13MSTRG.1199.3.p1.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.1199.3.p1.exon21MSTRG.1199.3.p1.exon21Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1199.3.p1.exon22MSTRG.1199.3.p1.exon22Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1199.3.p1.exon23MSTRG.1199.3.p1.exon23Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1199.3.p1.exon24MSTRG.1199.3.p1.exon24Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.1199.3.p1.exon30MSTRG.1199.3.p1.exon30Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1199.3.p1.exon31MSTRG.1199.3.p1.exon31Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1199.3.p1.exon32MSTRG.1199.3.p1.exon32Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1199.3.p1.exon33MSTRG.1199.3.p1.exon33Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1199.3.p1.exon34MSTRG.1199.3.p1.exon34Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1199.3.p1.exon35MSTRG.1199.3.p1.exon35Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1199.3.p1MSTRG.1199.3.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000006_pilongenomesc0000006_pilon:115525..186932 +