|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000088_pilon:581493..584948- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11941.1.p1 ID=MSTRG.11941.1.p1|Name=MSTRG.11941.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3456bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000088_pilon:581493..584948- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TGCAAATGAAGCCAATTCTTTCTCACTGCAAATGAAATTTGGATAATAAA
TAGGGAACCTTTGAATGTTTTAACATCAGTTTTCACAAATTCAGTAAGTG
ATTCAGCTGTTATCAAAATGATCAGAATTTTTCTGCTTGTCGTATTTCTT
GCCATTGCTTCTGGTAAGTTCATACGAATTTCATAATTTACGAAAAGTTC
ATAATAATTTGACATTTTCAACGGATACGATCTCATAAATCATTCTCCAT
TCTAAGCATCTGACGAGTACAAGTTTTGTTTATAAGAACAATTTTATAAA
AACACGAGCCTGAAAACTGATGAAAATCTTAGAACAAATTAAGAACAATC
TGAGCCTCAGATTTCGAAATTACTAAAAAAGTACTGATTTTAACAGATTT
AAAGTTGAAACCCATTTTTAAGAACATCGTAAGAGCATTTATAAGACTTA
AAATTTCAAAAAAAAATTAAGAACCAACTCAGCCTGACCAACAATTTACT
AGTTCTTATAAAAAACGTGTATTAAATTAGATATTTTTGGACGTTTTCGT
TCTGAAATGTTACAATTATTCAAGTCATTAAACGCCAATTTATAAGCAAT
CATTTAATATAATTGAACACGTTTAAGCTATTTTTTGGTATAGGTTATAC
CTTTCACGAAAATTAATTTCTTATTTTGAAGCTAATGACTTGGGAAAACA
TAAGTTCAAATCTTCAAGATCATTATTTGTTGGCTTAATTCTTTAGATAT
ACAAGGAAGAGTACAAGAAAAACATATTATCCATGGAACCGAGTCTAAAC
CAGGTGCATGGCCTTGGGTCGTCTCTGTGCAAATAAGATCACAAGATATC
TGTGGTGGCACTATTTTGTCCAAAACTTGGGTATGTTGTATGCACAAAAA
TTCTAATTATAAAACCCAAAAAATTATTGATTGAAAATATTACACTTTGA
AATTTGCATATAATGAGGGACATCGTTGAACCTCGTTTTAAAGAGTGGGG
AGGGAGACCACCTAGTCCGGGAGCCAATGCCTTCATCTATAATTAGCTTA
ACACTGCATTTCTCTTTTGGAATTCATAATTTTTATACATAATTTTTAGA
AAATTTCTGTATACTTTCTTGAAACTTTGAACTTCGCTAATTTTGATTAT
GTACACAGAATTTTTGTATCCAATTCTTCCATAGATAATGACAGCCGCTC
ACTGCTTTAATCATAAACCTGCTGCTTCAGATATCACAGTAGTTGCCGGT
GCACATAACATCAAAATTCATGAAGACTCCCAACAAACAATCACGGCTAA
AAGATATGTATTGAACCCAGGATATAATCCCAACAGTAATGTAGCAGACA
TTGCTTTGATTGAATTATCGACTCCATTGAAATTCAATAAGCGAGTTGAA
CAAGCTCGTATTCAAGCAAAAGATGAGTACCCAAGTCTCGAAAAAACTTG
TTTTATTGCTGGTAAGGACTTGTTATTTTGCTTATTGATTAAGACCAACA
TTTTAACTTTTCCCATTGTTCATTGAGTTAAAGTCAGAATGTTACTTTGT
TGAGAAAAGAGTATGATTCACTTGATAAAAATTATATTCATGATATGCAC
CATTGCAATGTCTTCAACGGACCCAACAGCTGATTGGTATTGGCAGATTT
TACGTCACTTACAACCAATCAACTGTTGGGTCCGTGATGTAATGTCTGAA
GACATTGTAATGGTGCATATCATGAATTATGGCCCACCCTTGAATTTCTC
CCGAAAAATACAAAACTACAGTTGACGCTCTGAATTTCGATTTTTTAAAG
GAGAATTAGATTTTCATCGAATAGTGAAGCGTATCGAATAGTAGAATGTT
TTTAATAAAAGTTTTTTGTTGACGGTGACTTTCAATTTCAATATTATCGA
ATATTAGAGTGTATTTGAAGTGTAGTTGAACGTCGAATTAGAGAGCGTCA
ACTATAGTGTAGATATGGAAGGACCAACTGCAACTATGACTGCAGCGAGG
GAGGACGTCAAATTTGTTTTATCTTCTCAGGAGCTGCGATAGCCTATACC
TTATCGGGGGGAAAATGTCGGGGGAAAGTGACGAAAATTTTGAGGGGGTG
ACGAAATTTTTCCCCGATATCTTATCACCCAACCAAAACTTTTACCCGAT
TTTTTTATCCCCAAGCAAAACCTTTAGACCTATTTTTTAAACCCCAACCA
AAATTAAAACCTAAATTTTTTACACCTTTATTAACCGAAATTAGTGCTTT
AAACGTCAAATTACAAGATCTTTTTTCGAGCTAGTGAAAGAAATCATTTC
ATTTGGACAATTTAGTTGGATGAAAGTGACTAATTTGTAAATTTTGTCGG
GGAAAAGTGACGAATTTGAAATTTTGGTCGGGGGAAAGTGACGAAAATGC
CTCTAGGTGACGAAATTTCTCCCCGACGAAAAAAAACCCCGACTAAATAA
AACTCCGACATTTTTCCCCCGATAAGGTACTAGACGTGTGACGGCTTTTT
CCTACGCGTTAACGTCTATTCCACTTTTTTAGAATGTTTCGAGTCCAGGT
TTTCAGGCTCCAAAAATTCGATTTTTTGACGTCACTTTAAACTTTCGAAG
CTCTTGCAGTAGGGAAAAATTGTCTTTGCGTCAGAAGACTTGAAAGACTT
CTATTTTACGAAAACCGTCAAAGTGGAACTCACTAAGAAACGGAATGTAA
AATCCCGGTTTTTGGTGGACACTCGCTAGAGCTGCGAGGGTTATTATAGA
ATATGACGTCACTCAGATAAAGCTAAAGTATACTCAGTAGGCTGTGGGTG
GTCACACAGGCTTGCAATGATGTAGCTTATCAAATGAAAGTTAAACTAAG
ATTTACCCTGACGTGTGATGACGATATATCTCGGCATCAGTATTTTTGGT
ACGGAACGCGATGACGAGATATCTCGTCATCGGTCGTTAAAGTGTTAAAT
CCACAAGTTTTGACTAAAATACCACACCGACCACAATTATCTTTCATTAG
TTGTGATTAATCTGAAAATCGTAAAAACCACTAATTTCATTTTTATGGAG
GAAAACTAAAGTCTAAAAATTTTTTTTTGACAGGCTGGGGACAAACCAGC
CAAGCCCACATTGATCCAGTTGTTTTTCCTGATACATTACAAGAAGCACA
ACTCCCAATCATTAAAGAACGAAATAAAAAATATATCTACGCTGGATTTA
ATGACGGAGACGAGAAACCTAACGCATGCTATGGTGATTCTGGTGGTCCA
TTGATGTGTAAAACGACCTTTCTTAGAAGATGGGTTGTTCAAGGACCAAT
GAGTCATGTCTTTCCAGCGTGTTCCTTTGAAACTGCAGTTATACCAGTGG
CCAAGTATTTGAGTTGGGTTAAAGAGTACGTTAAAGATCTGAAGACTCAG
AATTGATTAATATATGATATGAAATAAAAATGAATCTACAGTCATATGAT
ATCTTT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000088_pilon:581493..584948- >MSTRG.11941.1.p1 ID=MSTRG.11941.1.p1|Name=MSTRG.11941.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3120bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000088_pilon:581493..584948- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GCTGGGGACAAACCAGCCAAGCCCACATTGATCCAGTTGTTTTTCCTGAT
ACATTACAAGAAGCACAACTCCCAATCATTAAAGAACGAAATAAAAAATA
TATCTACGCTGGATTTAATGACGGAGACGAGAAACCTAACGCATGCTATG
GTGATTCTGGTGGTCCATTGATGTGTAAAACGACCTTTCTTAGAAGATGG
GTTGTTCAAGGACCAATGAGTCATGTCTTTCCAGCGTGTTCCTTTGAAAC
TGCAGTTATACCAGTGGCCAAGTATTTGAGTTGGGTTAAAGAGTACGTTA
AAGATCTGAAGACTCAGAATTGAATAATGACAGCCGCTCACTGCTTTAAT
CATAAACCTGCTGCTTCAGATATCACAGTAGTTGCCGGTGCACATAACAT
CAAAATTCATGAAGACTCCCAACAAACAATCACGGCTAAAAGATATGTAT
TGAACCCAGGATATAATCCCAACAGTAATGTAGCAGACATTGCTTTGATT
GAATTATCGACTCCATTGAAATTCAATAAGCGAGTTGAACAAGCTCGTAT
TCAAGCAAAAGATGAGTACCCAAGTCTCGAAAAAACTTGTTTTATTGCTG
ATATACAAGGAAGAGTACAAGAAAAACATATTATCCATGGAACCGAGTCT
AAACCAGGTGCATGGCCTTGGGTCGTCTCTGTGCAAATAAGATCACAAGA
TATCTGTGGTGGCACTATTTTGTCCAAAACTTGGATGATCAGAATTTTTC
TGCTTGTCGTATTTCTTGCCATTGCTTCTGGCTGGGGACAAACCAGCCAA
GCCCACATTGATCCAGTTGTTTTTCCTGATACATTACAAGAAGCACAACT
CCCAATCATTAAAGAACGAAATAAAAAATATATCTACGCTGGATTTAATG
ACGGAGACGAGAAACCTAACGCATGCTATGGTGATTCTGGTGGTCCATTG
ATGTGTAAAACGACCTTTCTTAGAAGATGGGTTGTTCAAGGACCAATGAG
TCATGTCTTTCCAGCGTGTTCCTTTGAAACTGCAGTTATACCAGTGGCCA
AGTATTTGAGTTGGGTTAAAGAGTACGTTAAAGATCTGAAGACTCAGAAT
TGAATAATGACAGCCGCTCACTGCTTTAATCATAAACCTGCTGCTTCAGA
TATCACAGTAGTTGCCGGTGCACATAACATCAAAATTCATGAAGACTCCC
AACAAACAATCACGGCTAAAAGATATGTATTGAACCCAGGATATAATCCC
AACAGTAATGTAGCAGACATTGCTTTGATTGAATTATCGACTCCATTGAA
ATTCAATAAGCGAGTTGAACAAGCTCGTATTCAAGCAAAAGATGAGTACC
CAAGTCTCGAAAAAACTTGTTTTATTGCTGATATACAAGGAAGAGTACAA
GAAAAACATATTATCCATGGAACCGAGTCTAAACCAGGTGCATGGCCTTG
GGTCGTCTCTGTGCAAATAAGATCACAAGATATCTGTGGTGGCACTATTT
TGTCCAAAACTTGGATGATCAGAATTTTTCTGCTTGTCGTATTTCTTGCC
ATTGCTTCTGGCTGGGGACAAACCAGCCAAGCCCACATTGATCCAGTTGT
TTTTCCTGATACATTACAAGAAGCACAACTCCCAATCATTAAAGAACGAA
ATAAAAAATATATCTACGCTGGATTTAATGACGGAGACGAGAAACCTAAC
GCATGCTATGGTGATTCTGGTGGTCCATTGATGTGTAAAACGACCTTTCT
TAGAAGATGGGTTGTTCAAGGACCAATGAGTCATGTCTTTCCAGCGTGTT
CCTTTGAAACTGCAGTTATACCAGTGGCCAAGTATTTGAGTTGGGTTAAA
GAGTACGTTAAAGATCTGAAGACTCAGAATTGAATAATGACAGCCGCTCA
CTGCTTTAATCATAAACCTGCTGCTTCAGATATCACAGTAGTTGCCGGTG
CACATAACATCAAAATTCATGAAGACTCCCAACAAACAATCACGGCTAAA
AGATATGTATTGAACCCAGGATATAATCCCAACAGTAATGTAGCAGACAT
TGCTTTGATTGAATTATCGACTCCATTGAAATTCAATAAGCGAGTTGAAC
AAGCTCGTATTCAAGCAAAAGATGAGTACCCAAGTCTCGAAAAAACTTGT
TTTATTGCTGATATACAAGGAAGAGTACAAGAAAAACATATTATCCATGG
AACCGAGTCTAAACCAGGTGCATGGCCTTGGGTCGTCTCTGTGCAAATAA
GATCACAAGATATCTGTGGTGGCACTATTTTGTCCAAAACTTGGATGATC
AGAATTTTTCTGCTTGTCGTATTTCTTGCCATTGCTTCTGGCTGGGGACA
AACCAGCCAAGCCCACATTGATCCAGTTGTTTTTCCTGATACATTACAAG
AAGCACAACTCCCAATCATTAAAGAACGAAATAAAAAATATATCTACGCT
GGATTTAATGACGGAGACGAGAAACCTAACGCATGCTATGGTGATTCTGG
TGGTCCATTGATGTGTAAAACGACCTTTCTTAGAAGATGGGTTGTTCAAG
GACCAATGAGTCATGTCTTTCCAGCGTGTTCCTTTGAAACTGCAGTTATA
CCAGTGGCCAAGTATTTGAGTTGGGTTAAAGAGTACGTTAAAGATCTGAA
GACTCAGAATTGAATAATGACAGCCGCTCACTGCTTTAATCATAAACCTG
CTGCTTCAGATATCACAGTAGTTGCCGGTGCACATAACATCAAAATTCAT
GAAGACTCCCAACAAACAATCACGGCTAAAAGATATGTATTGAACCCAGG
ATATAATCCCAACAGTAATGTAGCAGACATTGCTTTGATTGAATTATCGA
CTCCATTGAAATTCAATAAGCGAGTTGAACAAGCTCGTATTCAAGCAAAA
GATGAGTACCCAAGTCTCGAAAAAACTTGTTTTATTGCTGATATACAAGG
AAGAGTACAAGAAAAACATATTATCCATGGAACCGAGTCTAAACCAGGTG
CATGGCCTTGGGTCGTCTCTGTGCAAATAAGATCACAAGATATCTGTGGT
GGCACTATTTTGTCCAAAACTTGGATGATCAGAATTTTTCTGCTTGTCGT
ATTTCTTGCCATTGCTTCTG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000088_pilon | genome | sc0000088_pilon:581493..584948 - |
|
