MSTRG.11918.9.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11918.9.p1
Unique NameMSTRG.11918.9.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000088_pilon:279475..296747-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11918.9.p1 ID=MSTRG.11918.9.p1|Name=MSTRG.11918.9.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=17273bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000088_pilon:279475..296747- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000088_pilon:279475..296747-

>MSTRG.11918.9.p1 ID=MSTRG.11918.9.p1|Name=MSTRG.11918.9.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2298bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000088_pilon:279475..296747- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATTTGCACCAAGCTGTGTTATCAAAAGAAGAGATGACGGTTTTCCAAGTC
AGTGGTGCTCTTCAATCGCACGAGAGTTACATCCGCATCATGACAGCCAT
CAATCATGCCGGACTTGAGCTCTACTTCAAAGCGTTCCATCACAGGGACG
AACTACCCGGTGGTCTTGGTCTTCCAACAGAACCGGAAAAACTTTACAAG
CATCTACAAAAACATCAATCTGAATTTGACGACCTTCGCTCCAAAGGACA
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CTTATTCTCAGGAATTCTCATTCCCGCTTTTCCAAAAATTGTTACAAATG
TTTGACCGAGCAGGACTTGATGCGGAAACAGCAAACTCGGATGACGAGCG
AAACGTATTTTTGCAAGAAATGTCGAAATTTGAATACATATTGAAAGATA
AGAAACTGGTCAAAAAGATTAACAATTCTGATGAGACTTTCAATGAAATT
TGGGATGACGTCATTCAGATCTTGAAAAATGTCAAATATGATATAACACG
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TCGCTCTCTTAAAATCCGAAGTCAACGCTTTATTGTGGGAATGTGATGAT
TGTTTCAAGACTGTCAAAATGAACCATCTAGCCTTGGATCGCCTCAAAGG
GAACTTCCAGGCTGCACTCTCTGAAGTCAAAACAGAAAATAACAACGCTA
AAACAGCTAACGAGTTAAAAGAACTGAATACAGTCACAGATGAACTTCAA
AAATCTGAAAATAAAATCATGGTTCAAAAACAACAGCTAAACGAAATTGT
TCCAAATATTAAATTTTGGCGGGAAAAGAACATTGAAGGTGACGTCATCA
TTTGTGACGAGAACATTTCGAAATTGAGACATGAAGTAAATGAACAGACC
AGACGAGTCGGTGATTTGTTCAACACCGTATCTTTCGATATCATTCACCT
GAAGGAGCGAGCATACAGTGCGACTGGAGAAGCTAAAAACATCGGACTTC
CTTTACATAAATCGCATTGAATGCAGAAATTTGTGACCACAGCTGGTAGA
TCACAAAGCAAAGATTCACTGCTGGCAATTGAAAGCCTTTCTGACCATGA
TTTGCACCAAGCTGTGTTATCAAAAGAAGAGATGACGGTTTTCCAAGTCA
GTGGTGCTCTTCAATCGCACGAGAGTTACATCCGCATCATGACAGCCATC
AATCATGCCGGACTTGAGCTCTACTTCAAAGCGTTCCATCACAGGGACGA
ACTACCCGGTGGTCTTGGTCTTCCAACAGAACCGGAAAAACTTTACAAGC
ATCTACAAAAACATCAATCTGAATTTGACGACCTTCGCTCCAAAGGACAA
ATCACTGAAAGAGAGTATCTAACCATTTTCCCAGCTGGCAAGAAAGAGAC
TTATTCTCAGGAATTCTCATTCCCGCTTTTCCAAAAATTGTTACAAATGT
TTGACCGAGCAGGACTTGATGCGGAAACAGCAAACTCGGATGACGAGCGA
AACGTATTTTTGCAAGAAATGTCGAAATTTGAATACATATTGAAAGATAA
GAAACTGGTCAAAAAGATTAACAATTCTGATGAGACTTTCAATGAAATTT
GGGATGACGTCATTCAGATCTTGAAAAATGTCAAATATGATATAACACGA
ATCGAATCCTTACGAACAAGCGATCTAGAAGAAAATAATAAATTCCGATT
CGCTCTCTTAAAATCCGAAGTCAACGCTTTATTGTGGGAATGTGATGATT
GTTTCAAGACTGTCAAAATGAACCATCTAGCCTTGGATCGCCTCAAAGGG
AACTTCCAGGCTGCACTCTCTGAAGTCAAAACAGAAAATAACAACGCTAA
AACAGCTAACGAGTTAAAAGAACTGAATACAGTCACAGATGAACTTCAAA
AATCTGAAAATAAAATCATGGTTCAAAAACAACAGCTAAACGAAATTGTT
CCAAATATTAAATTTTGGCGGGAAAAGAACATTGAAGGTGACGTCATCAT
TTGTGACGAGAACATTTCGAAATTGAGACATGAAGTAAATGAACAGACCA
GACGAGTCGGTGATTTGTTCAACACCGTATCTTTCGATATCATTCACCTG
AAGGAGCGAGCATACAGTGCGACTGGAGAAGCTAAAAACATCGGACTTCC
TTTACATAAATCGCATTGAATGCAGAAATTTGTGACCACAGCTGGTAGAT
CACAAAGCAAAGATTCACTGCTGGCAATTGAAAGCCTTTCTGACCATG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11918MSTRG.11918Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11918.9.p1MSTRG.11918.9.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11918.9.p1.exon3MSTRG.11918.9.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11918.9.p1.exon2MSTRG.11918.9.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11918.9.p1.exon1MSTRG.11918.9.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000088_pilongenomesc0000088_pilon:279475..296747 -