MSTRG.11918.11.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11918.11.p1
Unique NameMSTRG.11918.11.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000088_pilon:279490..295916-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11918.11.p1 ID=MSTRG.11918.11.p1|Name=MSTRG.11918.11.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16427bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000088_pilon:279490..295916- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000088_pilon:279490..295916-

>MSTRG.11918.11.p1 ID=MSTRG.11918.11.p1|Name=MSTRG.11918.11.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2298bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000088_pilon:279490..295916- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CATCTACAAAAACATCAATCTGAATTTGACGACCTTCGCTCCAAAGGACA
AATCACTGAAAGAGAGTATCTAACCATTTTCCCAGCTGGCAAGAAAGAGA
CTTATTCTCAGGAATTCTCATTCCCGCTTTTCCAAAAATTGTTACAAATG
TTTGACCGAGCAGGACTTGATGCGGAAACAGCAAACTCGGATGACGAGCG
AAACGTATTTTTGCAAGAAATGTCGAAATTTGAATACATATTGAAAGATA
AGAAACTGGTCAAAAAGATTAACAATTCTGATGAGACTTTCAATGAAATT
TGGGATGACGTCATTCAGATCTTGAAAAATGTCAAATATGATATAACACG
AATCGAATCCTTACGAACAAGCGATCTAGAAGAAAATAATAAATTCCGAT
TCGCTCTCTTAAAATCCGAAGTCAACGCTTTATTGTGGGAATGTGATGAT
TGTTTCAAGACTGTCAAAATGAACCATCTAGCCTTGGATCGCCTCAAAGG
GAACTTCCAGGCTGCACTCTCTGAAGTCAAAACAGAAAATAACAACGCTA
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AGACGAGTCGGTGATTTGTTCAACACCGTATCTTTCGATATCATTCACCT
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TTGACCGAGCAGGACTTGATGCGGAAACAGCAAACTCGGATGACGAGCGA
AACGTATTTTTGCAAGAAATGTCGAAATTTGAATACATATTGAAAGATAA
GAAACTGGTCAAAAAGATTAACAATTCTGATGAGACTTTCAATGAAATTT
GGGATGACGTCATTCAGATCTTGAAAAATGTCAAATATGATATAACACGA
ATCGAATCCTTACGAACAAGCGATCTAGAAGAAAATAATAAATTCCGATT
CGCTCTCTTAAAATCCGAAGTCAACGCTTTATTGTGGGAATGTGATGATT
GTTTCAAGACTGTCAAAATGAACCATCTAGCCTTGGATCGCCTCAAAGGG
AACTTCCAGGCTGCACTCTCTGAAGTCAAAACAGAAAATAACAACGCTAA
AACAGCTAACGAGTTAAAAGAACTGAATACAGTCACAGATGAACTTCAAA
AATCTGAAAATAAAATCATGGTTCAAAAACAACAGCTAAACGAAATTGTT
CCAAATATTAAATTTTGGCGGGAAAAGAACATTGAAGGTGACGTCATCAT
TTGTGACGAGAACATTTCGAAATTGAGACATGAAGTAAATGAACAGACCA
GACGAGTCGGTGATTTGTTCAACACCGTATCTTTCGATATCATTCACCTG
AAGGAGCGAGCATACAGTGCGACTGGAGAAGCTAAAAACATCGGACTTCC
TTTACATAAATCGCATTGAATGCAGAAATTTGTGACCACAGCTGGTAGAT
CACAAAGCAAAGATTCACTGCTGGCAATTGAAAGCCTTTCTGACCATG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11918MSTRG.11918Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11918.11.p1MSTRG.11918.11.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11918.11.p1.exon3MSTRG.11918.11.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11918.11.p1.exon2MSTRG.11918.11.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11918.11.p1.exon1MSTRG.11918.11.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000088_pilongenomesc0000088_pilon:279490..295916 -