MSTRG.11910.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11910.1.p1
Unique NameMSTRG.11910.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000088_pilon:168020..216551-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.11910.1.p1 ID=MSTRG.11910.1.p1|Name=MSTRG.11910.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=48532bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000088_pilon:168020..216551- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAAAGAACGTACCGGTAAAATCGATAGCACAGACTCCATGCGTGTGATGT CCTTTTAATATGGAGATAGCTTGTAATTTTTCAACATCCCAAATATGTAT GGTTGGTTCTCGTCCAATCTACTACAACGAAAGAGAACCAGGTAAGAAAT TACTTCGAATAAACACCTCCCTTCTTTTAAACGCCCCTCCCAGAAGAAAA GTTATTCGATAAACTGGGTTGTTTTAAAAGGTGATGCCGTACCATGGGGT ACCCCAATGGTGTACCTTATGATCTACCCCGAAAAAAATTTACAGACCAG ACTGGAAAATAATACGCGAATGATACAACCCTACCCTTATGAAATGGGCC GGGGAAATGGGTTAATTTTCACTATTCAGCCTATTTTATTCATCAATTTC CCTGAGGATAGTCATGGTATTGAATTTTAGTGCAGACAACATTTAGCCAA GACTACAATTGGCAGAATTTTCGCCTAAAATCAACCTTGGTTAAATTGAA GTGTGAGTGCTTTTCCAAGGGAAAAATGGGGAAAAATTTTGTCTCAAACC GCATGTCATTAAACGAACTTCATTGGTCTAAAATGATGTAATCTTTGATC AAGCCAATCAAAATGATGGAACTTACTAGCCTGTGGTCTTTTGATGCACA AAAAATAGCAGGCTGTCTAACCCGAATCGGAAAATATCGGGAAATAACAT AAACAATACGCGTTTTCTGGTCTGTAAAATTTCAAAGCCCGCGCAAAGAT TTTTTGTGAAACAACAGCGCTACATGAGATTCTTCCGCGTATGGTACAAA AAACAAGAAAATGTTGTTTTTTCAGCGAAATACTTATCCTGGAACCATTT TTATTGCTATTGGGGAGTATTTAAAGCTTGAACAGTCAGTTTATTTACGA AGATAGTAAGTTATCATGCTGTGGGAATGAGAAATTAGGGTAGACCATAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000088_pilon:168020..216551-

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CCGTTTACGATAGAATTAAAGTAGAGTTTACAGAGGGTTTCATGCAAAAT
GAACCTTCCTCCGATGATGGGAAAGAATCTAAGAGGAGAGAAAAGGAAAC
TGATCATAAGGACCATGAAAATGTTACAACGAGAGATACACAGCGCGAAG
ACGGTGATCAGATTAACAAATGTACTGAGAGCAAAACGAAACTGATATCT
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GTTATTTTTATCGTATCAAAGCCAAACTGAGATGTTGACCAACATGGTTG
CAGTGTTCGTGTTCAAATGGTCAATGACACATGTCAGCATCACATTATCT
GCCACCATTGTTATCTTAGCTTTTGTTATGTTCTTGGTTGAACGATGGTT
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TTGCTACGATGACGGCGAATAGTCTTTTAATGTTTTCTATAAGCATATCT
GAAATTGGACTATTTTATCAAACTATCTTGATTGGAGCGTTACTGACGTT
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TTTTTATCACGCCGTCAGACTCCGCAAGTACCGTTGAATCGTACCGTAAC
GTCGTACAACAATTCATGTTAGCTGTCTCAATGTTCCTGGCTAGTCATGT
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CTATTTTTCTTATGTTGCTATGCTGGTATAAGAAGAGATATTTTCAACGG
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GTTGGTTCTCGTCCAATCTACTACAACGAAAGAGAACCAGGGGAATTTTC
GCGTGTTTACAGACAAGACCAATTAGTTGGTGTTTTATCTCGCTACACAA
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ATCTTCGCTTCAGGACTTGTCAGATGTATGGTTGGTTCTCGTCCAATCTA
CTACAACGAAAGAGAACCAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11910MSTRG.11910Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11910.1.p1MSTRG.11910.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11910.1.p1.exon5MSTRG.11910.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11910.1.p1.exon4MSTRG.11910.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11910.1.p1.exon3MSTRG.11910.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11910.1.p1.exon2MSTRG.11910.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11910.1.p1.exon1MSTRG.11910.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000088_pilongenomesc0000088_pilon:168020..216551 -