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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000087_pilon:1209529..1229492+ Legend: exonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11883.1.p1 ID=MSTRG.11883.1.p1|Name=MSTRG.11883.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=19964bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000087_pilon:1209529..1229492+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aaatgaATCATTGCCAACCATTGCAACGCATTCAGGTACTTTTCAATCAT
TCTCAAGTTTGCTTTTGACGTCATGATATCTTTTTATAAGCTGAAAATTG
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GTCGTGCGTTAATGCGGTTTAGATGCGTTTTGCTTAAGATTCTACTTCTC
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TCTCCCAGGATAGCTGGCATGAAATTGGAAAAGGtttttttGTAAAGGTA
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ACCCGGAGTCCTGGTTGTTTTCGACTAGAAAGTGGCAGAGGAAACTTTAT
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TCTTATAATGTGGAATCTTATTCAAAAGGACAGTAGATATCTAACAAATG
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TGTAGAAAGAAACAGACAAAATAACACAGTGACTTTATTGATGTTTTCTT
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AAGCTGCTAGGCATTCTTGGCTCAAAATCCATAAACCCTTTTTAGCTGAA
ATCCGGAAAATCCTTAGCAGTTTTCAGACCTGAGCCAAAAATTGgtgttg
cttataaaaaaatgtgtatctgAGAAAACATATAAGGCTCATTAGACAAA
AATTTCGTTGCAAGAGTTAAGGGTGATTATACCATCAGTCTGGAGCATCC
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AAACATAACCCGAAGATCAGCATCCttcttagtttttaaataaaaaacaa
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ttcaaccataaactaaatacatttcaaaaaatgtccTGCCACGTATAGGA
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ACACTCATCAGCAGATAAGGCGTGGGGTTTGCTACCAAGTGAAATGTTTA
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GATATACTGGGTCTGCTTGAGATACAGAAAAACAATTAATTATTTTCCTT
CTTACTTTCTCATTTCCATGACATAAAAACACGAAGCAATTTTCTTGTTG
CACAACTTCAAGATGTGAGCTCCATACTTCGGTGTACTTTAATTAGTTTG
TTACTGTGGACTCTTTCAATCCTTTCAATTCTTACAAATTATGCTACTGG
TAATAGAGTTTGCATACATGTTCCAAAAGAATATGCGGTGTGCGTATAGT
TCTAATAAGCGTTTTGAGACATAAAAGCTGAGATTAAAGCAATACatcgt
tgaaaagatagtattgagTGGATTTATGTTTAGAACGTTACATAAAGAAA
CGAAAATAAAGAGATAAGAATTACAGTCCTTCAATAGAGGTCTAAATCGA
CGATAAAACGTCTAAtcaatgttcaaaaaatttttcaatttttaattata
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GTAACTTTCCATTCCACAGTGCTGACAAAATCTTTTGGGTGCTTTTCTCA
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GTCTTAGACTGTAATAATCTCTCGCTAAgattcatacacgtttttttcat
ccaaaatttttgaagccttcggatgttcttaactttttcagatttaagcc
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atactgagaaaatttttttcgcgtgtatttaatttcgcggttttgtaatt
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GTAAATTTGCGAATAGTGGGGGATGGTGATAATAATTAACACATGATGAT
GGGGCTTATTGTTGTTCATTATGTAGCAGCCCACACAACATTGTCAATCT
ATTAATTCGCTTCATAATAGCCAAAGCTCCATGTCAtttttttGTTATAA
TCTCTTTgcaaattactttttttaatcaaaaggaTGTCAAAGTATTTTGG
ATAATTCACCTCTATACTGAACTTTGTGctgatattcttatatttttatt
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ATGAATGCTTTTTTGCAAATTATactttcaaaattggaaacTACTACCTC
GAATTTTGGCTACACTTTAGCTTTTAGATTTCAATGATATTAAAGTTAAT
GTATGAAATTCCAAAGCTTTTAAAATTGGAGCTGTTGTGGTATTAAAAAT
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TCTGGATATAAAGGATGTTCACTCGTCAAATTCAGATGAGGACGATTTAG
GTTCAGGTCAGTGTTTTGTCgttaaaacattttatttattcatttctagt
aaaaattagaaaacccGTAGAAAACTTTCTTCTGATGATACGATACAAAA
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ACATTGTTaacaataatttttctttggaactttttgtttgtttaaattGT
TGCCTCTTACATATGAAATcacaatacatgttttttttttctataagaat
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GAAAAAGCCGAATATCTGAACCTTGGCACTCAAATATGGAGGGTTTACAC
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atagaccttttggAAGAGATACAATTTGAAACATTACATCATTCATGTCT
GAAGCATTACGTCATTGAGAGATTATTACTCCTCATGGGAAAATACTTCT
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AGCAtgatagatgtttttttatgagaagtTCTACAGAGCTTGCCAAGAAA
TCAAAGGTTTTACAATGTTTTTTAAATACAatctaactttttttgaaaat
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tcttCATTTCCGAGTATGGGAAAAGAATTCTTGTGGCTTTTCGTCAACtt
tttttCTAACCGAGTTAAAGATCGTTAcagattcaaaaaaaacttctata
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TGGTTGAATAgatttttgagtgaaaatttGTAACGTGGGACATGtatgcc
aaaatattaaaaaaatcgaCGCTtacaaaagtaaaattaaatttcgtaaa
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ccattaaaaataagttgaaaaagttgtttgaaaacccacaaaaaTTCGGA
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ATATTTTAAGTTGGAATTCCAGGGGTAGCTCATACAAAaagttggacctc
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tatttggttttttgtttttcacgaAAGATGTGCTCTGAAACCctctaggg
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TCTTAAAAGATGCGCTCTTAAGCTCTCTAGGTTTACCTAGacaagaacac
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CTAGCTGATTGATTTACGAAGATCTTATATAACAGAAGCCCGGCGGAAGC
GGCGAGATTGGGGAGTCGTTCCGCTGGGCCTGGAACAGATTAAAATTTTC
TAGCTGAAGCATACTCTCAGAGCACAtggggaaaaaatgtcgccTCGCCA
CCGGCTGCTTTCGAACTTTGATGATTGCATTATTTAAAGCATACCAAGTA
TACACATTGTGTTTTAAACCTTCGTTCGTTCATGTAGTGATAACTCTTAA
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GATACCTATGACGAAATCCCCTCATATCTATTTTCCTcttaaaaattctt
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TTTTATTTGCTATCATTAGATATTACATATTGATATTATTGACTTAGTCA
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ttaatttgtttttttctcttggATGTATCTGTAACCGAGAAGCTTGATTT
TTGCTTCTTATAAAGTTTTAGAACCCAGTCTTATTAAAGAAGATAGGTtc
taaacacccccttctcacagaacccactgggaacccttccaaCTGGAAag
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ccacactgaaaataatcaaataaaccaatcctcactgcaaaatattgacc
tattttttccatccccactagaTTTTCTGACAAAAGAACTTAAATTCCCA
GACATAACAGTATGGGTATGTatgtttcagtccgttatttttaggGTAAG
GGGTAAAAACTTTTACGTTTATCATTGGGTATAAGTATGTAGTCACCATA
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ttcttttttaaattcatctaggtttttaagtttttaagtttttaagtcat
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ccattcatttcactttcaactactctactacgaaagaaatttctttttct
cgttttgatcttacattggtttttgagaaagattttactttctgattcat
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GCTCGTTGATGGAAGGTGGAACCGTTGTCAAGTTTCAACAGATCTTCGAA
AGATGTTGTAgtctgagtaaacgattctcaagcattttttatgtagattg
ttgattttatcctctagagccctgctatgaaacatccatatgagaggaca
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CCCCGAACGCGGTGTACCCATTCAGTATCGTCTAGGTTCAGATTATTTGC
TTTATGCAGCCATTCCTTTAGAACTGCTCTTTCAGTTCGAGTCAGGTCTT
CCGTAATGCTTATTCCTTTATAGTCGTCGTTTCCTTTGAGGGCTGACAGG
CTGTGATGGAGGgataacttttctttttctgaaccAAGGACAAGTTTCAT
TGGCCTCTTTTTGTTGGTTTCCTCGGTACCGATTCTTGATACGTTCTTTA
TAGTTGGAGGTGGAATTTTTACCGTCTTGATGTGGCTTTAACAATATACC
TTTTATCACCCTCGTTTTTTATCTTCACCAGTCCATTCAGCAACTCCATA
GATGACGACATTTCTTTGCCGCTGGTCatggtcttttttttcttttatct
cttCGTAGCGAGCCTCTTTTATAATGGACTTTAAACCGCTTGTTGTTACT
TGAGACGTAATTTTTGTTGCGTCAGCGTAGGACGTTTTGGCTTTGGTCAA
GGATGACTGGATTTCTTCTAGAATTGAAGATTTAATTGTCTCgccaaaag
ttttaaattgcTCTTGAATCTTCTTGTCTAAAAAGGAAAGCATTGAGCTG
TCTAAttgttttgaaaactagaaactCGAAACTCTGAGGAATTGCCTCGT
GTAGCGAAAgcaattaaagttttttaatgttttttaatgtGCCTCGCGGT
AGATACAAGTCAAGTTTCCATATTAAAGTTGTCTTTGTTTTGTTACTTTA
TGAGAATGATAGAAAGTCGGCTGTGGTATTCGTGAGGACGTTTCAAAGTT
TCAAAGGTTAGTTCTAtttttttAGTCTTCAAATTTCTGCAATGGATCGA
AATCGGAACATCTTTTTTAATCGATAAAAAGAgatcgtcaatttttttta
cggTTTCATGGTTTACGTAATGTTTTTCTGATTAGACCAGAGACACAGCT
TGCCATCCTGGTAAGTCGGTAGACTTCACTTAGTCCTCCATGTTAAATGA
TGCAAGACTAAGTAATAGAAAAACGAGCGATTTACCCCTATTTACGCCCC
ACCCCCGTTTTAATCTCCACAATAAGTCCGTGTGTAAGAACGGTTTTTGA
TGATGAGATATTCGGGAAGTTTTGAGTTTCTAGGCCTTGGGAAGGCACTC
TTGCAAAATTGAATTCACGTAGTGTATTTCTCAAATccgacgataatcaa
gaaaattttttaaaataactaAGAGACTTTGTAATAAAGAGGAAATCATT
TCATGCTATTTTATAGCTGCTAAATGAGACTCATTTATTCTAGCGCTAAT
TTATTTCACCAACAACCTTTCGACTGGATAATTATTGTCCCTTTTTTCCG
TGATTATAACTTTTGAGATAATGTTGATGTTTTTATTCGCCGAAGTTCCT
AATGTTTATATTTTAGATTAAGTTGCATTCTAACCTCCATTAGAATCTCG
CTGAAAGAAAATGAAGGCATATTTTTAATCGTCAAGggttcagatttttt
ttctctcaatcTCGAGCAGTTTTCATTGAGAAATGCAACAGCCTGAAGAC
ATTTTTAACGGcgattcttttattttcattttcattatttgaTGACAATT
AAAgctgagaaaattttattatcCACTGtgagaaatttcaagtttttcct
cttctctttatttttcaatttttaggatTAAAACTTACGCCATTTGATTA
TACGTCGGTAACTTTTGCGTAAGATTTCACGTGTTAAAGATGCTTTAATA
GGTTGTTGAGGAAGAAAATCATTTCGTTTTTGTGTAGACATTATAGCCAG
GCAACCAGTGGGTAGCCTGGTAGCAGAACGTCTCTTTTTGAAATGAGAGA
AGTTAAACATATGAAAtgaaaggaaaattttattttgcattATGTTCTTT
ATGCAGTTTTACTAGTCGTAAAGGAGAATTTAACGTGACGGTTTTCAAAT
GAAAGATCCGTAGGaggaaagaaaggaaaattttttttttgagaggaAGA
ATAATTTTTTCGTTCCAATTCGAAGAGAAGACAAAATAACCTAAATTCAT
ATAAGGAactgtcacttttttcttgtttttgtgaattttatttatcattc
ttttCCGAGTATCAAAGATGATATCTATAGCTAGGATCTCACAGTTGTCA
GTTGTAAAATACTGAATGAATATAACCATTTTATTCTTGATATCGGAAGG
TTTATACTACACTCAacgtttattgatttttattttacttggttttgaca
cttcaaaaaatatttattgaatcGACTATATTCATTATTTGCATTTCTGA
ATAAGGAAATCCGAACGATCTTAAAGATTGAAACTTGAAATCCGAAATTA
AATTTTACCGAGTTGACGGAAGAAGAAAAGAATGGACGAAGAAATATTCC
TTCGACAGAAACGCAAAAAATATCGTTTACGAAATTTCAATCTTCGAAGT
AAGAACATATGGTTTATTCGTCTTTGAATTGTTTATTTATATGAAGTCTT
GGTATGGAAGAAATTAGTACAGGCGACTCTCTctatttcgattttcaagg
gacagAAAATCTTTTCCGAATTATAGAGATCTTCGAAATACTTTCCTGCT
GAAAGGGAGCGACGTTTTTTGCtcgaattttaaaaagattcgaattaaag
agactcGCGGAATAGAAGAGAGTTGACCGAACTTGAAGCCATTTGGAGTT
CTGAACTTTTAAACTCAACGGTATGATAAATGTTCAATGTTCAATGTTCA
AATTTTAGCAGAACTCGAAAAATTCTACAAAACacgctttttatataaga
atacctacactttataagaatgtccaatatgaaaatggccaaaaaactaa
gaataatgctaagaatatcaccatcatggaagtTTGCTACTctagctaag
aatgccatttttagagcattttcgattataaattgtcaattacccccaag
acGCCAAGTAAGGCTCATTTCTTTCCCAAAATTGCCATTTTATGGTTGAG
aagtatgtactaaatgttaaatctagtctgaattggGATCCtataaccta
agaatgctgtaagaatattttaggatgattttcccaaaaaagttaagaat
atccatgatgaaatggatttacaccattcttataaaaaaaagcgtgtaac
aaaACCATAGTATTTTTTAGCTGGGATGTTTGCTAACAGCGTTTGTCTTC
CGCCTAAATCTTCTCTTAATTTGATAAAACTTTGGCTTATAATCttaatt
gtttttgttgaaaatggtTAAAGGGAAATGGATTTCATGATGGAAACCAT
TTAACAAAGGTACCAGCACATTAGAGATCGTGAAAGTACTTCCATGTTCC
ATAAGGAACTCTATTTAATATGTACTCAGTCGTGCTGTTCTAAATCAAGC
AAGCCAAACGATATCTCGTGGTTGCTCTTGAAGGGACAGATGAAATAGAA
AAGACATTTTTACTAATAGGTACGAATTATTTTTATGCGAAAAGATTGGT
TACATGTTTAAAATGGTCACTAGGATCGAATCTTTGTAGAAGCTTGCACT
ATTTCAACGGgtaaacttttatatttttgaaagatcTACCGTACGTCGAA
TACTTAGAATAAGTATTGGAGTTACAACGTCATGAAAATTAAGGAACTTG
TAAAACATATTTTGAATTAGATTTTCTATTCCTCaactttttgtttgaaa
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GGGAATCGCTCCCACAATCAATCAGTAAGGGAACCAATTGACTTTATCTC
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TTATTTATTAAGTGATACAAATTTGGGCATGGTTGAACCTTTGGGCGTGG
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ttcaaacaaacgagaagtaaaaacctttctttttaacaattattaatttg
ttttaaaattcgac Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000087_pilon:1209529..1229492+ >MSTRG.11883.1.p1 ID=MSTRG.11883.1.p1|Name=MSTRG.11883.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3336bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000087_pilon:1209529..1229492+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CGATATGCGATAAAGCGATTCGTCATCGAATGACAAAAGCCTCTATCGAT
CATTCTCCGATCAAAAGTCCGAAACTTTACGAAACGCCGTCCGAGAAAAC
AATGCAATGCGTAAAAGATATGATTGATTTGATAGTCTCTTCACATCCGG
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TGCGATTGGGCAACGTTATTTATCGTGATGAGACTGAAAGATTGGATACA
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TGGAAAATCGCCATTTCCAATGCAGTGAAACCTGAAAAGGCTGCTCGTTT
TGCACTGGGATTTTTCATATTCTTAGCTTTGTTACTAATAACATTCTTTA
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ATTTATAGAGACTGTTAAaatgaATCATTGCCAACCATTGCAACGCATTC
AGGAGCAGAAGAAATGGTTGCCACAAAGAAATCACAAACTACACTCTGGA
TTTATTTGTATCGTTGTTCGAAACTCGGGCCTCGTTCTTTATGGATCAAA
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GATTCGTCATCGAATGACAAAAGCCTCTATCGATCATTCTCCGATCAAAA
GTCCGAAACTTTACGAAACGCCGTCCGAGAAAACAATGCAATGCGTAAAA
GATATGATTGATTTGATAGTCTCTTCACATCCGGAACTCTATACGGAAAT
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CGTATAGtgaGTTTGCTGAGAATCTGTTCAAGCGAGGAGTTTCATGGCCG
CTCATCATTTCACTGTTGTCGTTTTCCGGAAGTCTAGCAGCGGAGTGTAC
GCGGAACGGGCGGAGTATTTTAGTACGACGTATTTGCGATTGGGCAACGT
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GTTTCCTTCAGATAAACTCCAACAATTAAATGAGTGGAAAATCGCCATTT
CCAATGCAGTGAAACCTGAAAAGGCTGCTCGTTTTGCACTGGGATTTTTC
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GTGCAAATCTGGAGGCGTTAGAAGCAAGTTTAGTATTTATAGAGACTGTT
AAaatgaATCATTGCCAACCATTGCAACGCATTCAGGAGCAGAAGAAATG
GTTGCCACAAAGAAATCACAAACTACACTCTGGATTTATTTGTATCGTTG
TTCGAAACTCGGGCCTCGTTCTTTATGGATCAAACAATCGAATTGTGTCT
TAGAAGAACTAACCAGAACGATATGCGATAAAGCGATTCGTCATCGAATG
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TAGTCTCTTCACATCCGGAACTCTATACGGAAATCACATTCAAGTTAAAC
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TGAGAATCTGTTCAAGCGAGGAGTTTCATGGCCGCTCATCATTTCACTGT
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ATTTTAGTACGACGTATTTGCGATTGGGCAACGTTATTTATCGTGATGAG
ACTGAAAGATTGGATACAAGATAATGGCGGATGGgatGGAATGTACGAAT
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TACTAATAACATTCTTTAAAAGCACATCAACAGAGTGCAAATCTGGAGGC
GTTAGAAGCAAGTTTAGTATTTATAGAGACTGTTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000087_pilon | genome | sc0000087_pilon:1209529..1229492 + |
|
